MSTRG.15420 (gene) -

Overview
NameMSTRG.15420
Unique NameMSTRG.15420
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15420 ID=MSTRG.15420|Name=MSTRG.15420|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9218bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCATCTCAGATCTTAAGTAATCTCCGAAGAACAAACAAACATGAAGGTC ATCATTTTCACCGCTTTCTTAGCTGGTAAGTACTTCTTGCAGCCCTTTTT AAGAAAATAATGTCGTTGTGTAAAAGTATTGATTTTCAGAAGCATCCCTA TACGAATAAATTTTTTCACAGCTTACTATTCAAGGTTTAATAATTTATCA AAATTTAATGGTATTAAATGTATCTAAACGTTCAATTATCTAAATCTTTC AGTTGCCGCAGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCACACCACCAG CTGTCCCATGCCCAGACTCCCTATGTAAAGGAAGAGCTGATGGAAACTAC GAATACTACTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTCCAATGCTC CAACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTTGGAATTCA GCGAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAATGTGTCACC ACACAGCCATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGTCCAGACAAATGCCC AGCCCGTGGACCACACTTCAGTGGAAACATTAAAGACGACCACAACCCAC ATCAATACGTTGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTTGGATGCATCGCTTGC CCAAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTCTGTACCAAGG AAAATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAATTGTTTTCA GTTTTTTTAAGTAAAAGCGAAAATCCTTCTTTTTTTGTCTTTTTTCCATC CTTTTATCCACATTTCTAACTTCTGCAACAATTTTCCTAAACTTCTTACT TTCTTTATATGTCTAAATTTTGTAATTTTTATAAATTATTTATATTTTAC GAAATAAATGCCTTTAATAATACATTAACTTGAATACGGCTGTTCATTTT CTGCTTCTAGATTTACATAGAACTAAAACCTTCTTTTTTTAATCGTAAGT ACAAAAATTTAGTTTGTTTTTTTAGAGTTTAAACATTCGAGCTTCGAGTC GAACCCGATATAACTTTAATTTATAAAAATCGATCACATTATTCACTATA AGATTACTTTATGCTGCCCCTTGATTTAATTCGATCTAAATAATAAGTCT ACTTGCTTTAGGTGTAGTGGAGTGGTGGTCATCGTTCTTGACATTCGTCT CGGAGGTTCGAGTTCGATTCCCACTGTAGGGCTACGCTAAACGTTCACTT GGCAAGTAAGCATACCTTCACCCGGGGGTCAACTCATACCATGTGAGGGA AATCGGGTAACACTTCTCCGATACAAGAGTATGGGTGATATTTCAGACAT TGTGGTGTGTGGTGTCACTCATCCCGTTCTGCAGCTGTGTCGAGCTATAT GCTCTTCCTCGTAATTCGAGTGTCGTCACTATGCCTTATGGTAATCTGTT TGTCACGTTCACAGAACAAGCAGTGTCTGGACAGTGCTAAGCGTTCCGAC TTGAAAAAGGAGGAATTCCTACTTTGCAAGGAGTAGGACCTATTCCCCAA TGGGGAGAGCTCATATCATCATATCACTTGCTTTAAGCGTAATGTTACTA ATATTTGTTCACGATGCTCATCTCTCATATACAGTGAATTTTCTATAAGT CGAACACACATAGAGCACGCAAATTCAGTCAGGATTCAAAGGATTTGATG ACTGAAGGAACCATATAACTTTCAGCTAAGAAGACATTTGAGTTATATAG GCTCAAAAGACTCATAAGACGCTGTAATTCCTTAAAAAGTATAATTTTCT CTATAAAGAAATTTTATAGGTCTTGGTGTCTTTGTTTCTGTTAACAGAAA TCAGTGGTCTCCCCATAGCTATCTGGTACTTTGAAGAGTGGTATAGAATT TCCTGAACTTATGGAGCTTTCGACTTTTCACCAATGATTTAGATATTCAC TATCTGAAACATAACCAGAGAGGTTCAAATATTCTAAAAAGATTATACAC GCTTTTTTAAAAGGTGGTCGTTAACACTTCTGAGATAGGATCATCTTTTT CGGGTCGATTTTTTAATTTTTGGTTTAAATTAAAGTTTGAACCTTACTTA ACAATATCCTGAAGTTTTATTTCATATAAAGAAGTAGACAGGAACCCGTC TGCGTATTTTTTTTAATCTGATGAATACTTGACGGGTCAGAGCTGTGGGT CCGATTTTGGCCTCAAAAAAGTTACAGTGGGAAATTCGAATTTAGCGCTG TCCTCGCTTACTAAAATAAAAATCAAATTTCGGAACTTGCGCTTTCTTTA AGAAAGTGTGACCAGTGAAACAATAACAGAATTTGATTGGCTGTGTTTTC AACCGTTATTAGGATATGGGAAATTCAAACTGTCAGCCCATACCATGCTA TATATTTCGCCATCAGTATATAGAATAAGAAATCATAGCATGGATCTCCA GGCTAATAAAGAAGAGGAAAGTAGAAAACTTTAGGTCTTTAGACACGTAC CTGAGCAGATCTTGCGGCCCGCCCCTAAACGCCCACCCCGCCGCCGATCA CGAAAACCGGAATATTCGCTCTTCTGGTCTGGAGCGACTCCAAATTTTTA CTGTCGCTACTTGGAGCCACAAAGAACATTTCCGGAAAGTTTTACACCGG TACTGTTAACAGTTCCGGATTTATGACGACCAAAACAAACCCGCCTGAAT CTCGTCCAATTTCAAATGTGGTTTTTTGCTGGTTTTTGGTAAAGGGAATG ACTGTTTCATGGCTTATTTTCTTGTAGTAAGTGATGGTTTATTGCTTCCA TTTTATATAAAGAGCTTCTCAAAACTCCAAGGAACATTTTTACTTGATAA TCTTTCAAATTTCCTTCCCATTGGGATCAAATTTCAGCGCCACAAATGTG TGACAGGTACGTGAAACGTTTCTTCTGTTTTCTCTCTCTTTTTAAGTTAT TCAAATGATAATTTATTGTTATAAACGTCCATAACTTCTTCTTGGAACTA TCCATATACCTTTAGTTGGGTTTTAATAGTGATATAGTTGATTTTGGTGC ATTTCGGGGTTTTCTCAAAAGTGAAAGTGAAAGTGCTCTTTACTAGACTT AAGCGCAGCTTATATTTCAAGTAATGGGGATATAGAAATGTTCTTTTCTA CAGTGAAATGGGTTACTTTAACCAATTAAAAGGTTAGGCAATACTATTTC ATGAATTTTCACCAAATTTTAGCTTTTTCGCAGGCAAAAGTAAGGTTTAC GCAACTTTTTTGTATGTTTGCGGTAATCTCAGGGTTCTATGCGAAGCCAT GATTTTGCTGACACAAGCAAAAAAAATGGCTTTACTTTCTTTCTTAAATT GAAAATTGGATTAGTGCATCAAGTTCAACTGAAATCTGTCAAAAATCCCA TATTTCCTCTTTTTACAGCAATAAATAGTTTTAAGGCCAGTTTACGCAAA ACAGCAAAACCGGGGTTTTTTTATCTCTTGGCGGAAAAATCTCAGGATTG GATGGTTTGATTGACTTGAAATTTTCAACACAGCTTCCCCTCATAGAAAG GTGTGATCAAGGACACTTGTATAGCGTAGCTACGCTATACAAGTGTCCTT GGTGTGATCGGAATGAAACAGATTTTTGAAAAAATGTTTTGTTGATTTTT ATAATTATAAAAAACAGTTTTTTTGGGTTTTTACCCCCTGATTTTATATT TTTCAAATTTTTTTTTCACTCAGATCACAGAAGGTCACTAGGGTAACATA ACTGCCAAATATCAAAAGCTAACTCCTTCTGGTTGCTGAGATTTTTCTGC CAAGAGATTTTCGAATCTATTTTTAGAAGTGACGTCATGACCCCCGTCTT TGATATTTCAAATTATTTTTTCTATTTTTAGAACGACATAATAATGAAGT ATCATCATGCTTACCATCAAGTTTCAACAATATATATCAAAAAGTTTTTG AGATATTCCATTTTGAAATTTTTTGGACTTTTTAAAAAAGTTTGTTAACG ACCACCTTCTTAATCATAAGAACAATCAGATTTAGGCCCTCAGAACAATA GCTCTTTTGTTTGGAAGGATAAAATTTAATCTCGGCCAAAATTTACTGTA GAAATGAATCTTCTTAATTTTTCAATTTTTCTAAAATCTTATCATTTAGA TTACGATCCCCGAAAATATCTTTCTAACGCAACGGTATACAACTTTTCAA CATAGCATAACGTGGCTTTTGAGAAATGATTAGAGAAAGAAAAAAGCCCA CATAATTTTTAGACAGACTGTATGACTATGAGTGTAAGATAATGTTACTG TATATATCGGGAGGTACAAAGAAGCTAAATATTTTTACTTTCGAATTATC TGATTCATGGTTGAGTTGAATTGATTGATTTGCATGGTTGAATTGCAAAT CCTATTTGCTCGCCACAGTTATAGAACCGAAATATGAAAAACAAGCAAAA ATCAATAAATATCATATTAAGGTAATGTTAATATTAACCCTTTGTGCGCT GTCTTTTTAAAAAAAGTTCTAATATTTCTTTTTGAAACTTAAAACTTTAA AGTGCCATAAAAGTTTGTAGCTTATGATTTAGAAGATGGTTTACTGGTAG GTACCATTGGAAAGGCTAATTTTATACTCTTTCTAAAAGCATTCGGTTTA TGTCCATTTAAATCAAGTGGCCAGGAGCTATGGCCTAAGTCTGACACTCA GTATTTTGGCTTGTTTTGGACGCATATACGCGTCCCTTGTGATCTAAGGG TCAAGGTATAAGCTCCATCATTCATATAAGACCTACAGGCCAGGCTAACG AAAGAAATGTAAATCCAGAAACAATAATCAACCAAAATAAAGTTAAGAAG GTATTACTGGTATTTCGTAAAATATAAACAGTTTGATAATTTATATAAGT TACAAATTTAAAGAAAGTAAGGAGTTTAGGAAAAATGTTGAAGAAGTCAG AAGTGAGGATAAAAGGGTGGAAAAAAAGACAGAGAAAGATTTTCGCTTTT ACTTAAAAAAACTGAAAATAATTTAGTGTTTTGGTGGGGATTCTGGTTCG GTCTTGTATTTTCCTTGGTACAAACAGGCGTTCCATTTCTCGTTGAATTG TAATCCTTTTGGGCAAGCGATACATCCAACAGTTTGTCCGTGGAAGCAAG CAACGTACTGGTGTGGGTTGTGGTCATCTTCAATGTTTCCGCTGAAGTGT GGTCCACGGGCTGGGCATTTGTCTGGGCACTCGAAGGTGGTTGCTGGTTC CCATGGTTGTGTGGTGACACATTCGTCTTTTCGGTTGTATAAACATTGGT TGCATGGTTCGCTGAATTCCAAGGACAATGGCCAGCAAGCTTGACAGTAA GCTAATCCGTTGGAGCATTGGAGGAAGTAGTGTGGGTTGTATCGGCTGTA GTAGTAGTATTCGTAGTTTCCGTCAGCTCTTCCTTTGCAGAGAGAGTCTG GGCATGGGACAGCTGGTGGTGTGGTACCAGTTTGGGTTCCAACCTCGAGG GCGGCGGCAACTGGAAATTAGATGTAAAAAATATTTAGATATACCAAGCT ATTAGCCTTTTAAGTCAATGAAATCAATCGATTATTGATCAAAGGTCTTA ATTTTTAAACTTGAGATTTATCTGTTAAAAATAATCTTTAAATTTAGTAC TTGCTTTATTAAGAAAAGTTTAAACAAAGTACTTACCAGCCAAGAAAGCG GTGAAAATGATGACCTTCATGTTTGTTTGTTCTTCTGAGATTACTTAAGA TCTGAGATGATGATTTTCACCACCTTTTCACGTCTATTTATACGAAAATC TTCGAAACTGTTATGAAATATTCAATTTCCTTTATCAATGAACAAATCTT AGATACTATGTTTGTCTTCCAATATCGTGGTGTTAAACGGAAGGTGTATA ATTAAAATTCTTTTGTTTGTCAGTTTAAAGTAAATTTTATATCCATATTA TATAACTGCCTGAGGAATAAACTTCTTGAACTTGCTACATATGTCTTGCA TATCTAAACCGTCCATCAATAGGATTTAAAACACCCTTAGAGAGTTTTTT AAATGTGTAAAAAGGTACTCCTGCCACTCACACATACCCGGTCAGTACTT TTTTTTTCTAAGTGGCCGCCTACCCAACTGCTTGGAAATTTACATCCCTT TGAATTTCAACTGTCCATTAAAAAGTAAGTATTTTGTTTCAAAATTTGGA CTTCAATCTCCAGATTTGCTAGGTTACATCAATTGTAAAATTACGGAAAA GGTATTGAGTGCCCTTTTGTTGCAAGCGCTCTGAAAATTCTTTCCATTAC GACTGAATTCCATACCCAATGAAATAATTACTGAAACTTCTACCATTCTC GCTATATTCGAATATAATCCCGGTTCAAACTGGCGGCTCACTCCATTGTC ATCTCATGCATTGAAAACTTGCAATGTGTTAAGATTATGTGTAAATATAG TTTCTGGCAACCTTCCATATTTCTCCTATTCAAAATCTGAATATGTTTAT GGTTCTTTGAATGTATGAAGCCCATAAAGAATTGTTTTAGATTTTCGTTG CAAGTTGGTGTATTAAATTTGTATCTCAGCAAAATCATTCTTGAATTGCA TTGAAATTGCGATCTTTACGATTGTTATTGGTCTTTTTGGGGTGTAGAAA CAGGATTTTTGGTGATTGGCTGATGTAAGCGAGGTAAGGTGATGTGTTTC TTGAGGTTTTGACCACTAAACTACGGTAATGAGAATTCCCAGAAAGACTT TTTTTTTTCCCGCTCATGTCATAAAAATTTTCCCTGAGTCATTTAATGGT GCATTCAGCCGCTACGGTGCGCATCAAGCTTATAGGTTTAATTTTCGGCC GATTCGAAATTTCGTACTTAGCACTTAGTAGATATTTAGCAATAAAGTGT ATTTGATTGATGAATTTAGTTTGCATCCAGGGTAAAACAGCGGTGCACTA CCCTATCTTTGGGTAGATTGCAATAGCGAAGCCTTCAGATCACCTCCACC CGCAGTCACATGACGTACCTATTTTTTATGTTGGCTAAAGATTTTTACTT TTTTAAAGATTTTAATCCCGACCAAAGTAATCAAAATCCTTACTTAGAAA ATTGGTGAACAGTCTATGTGATTTGATAACTTTGCAATTAGGAGAAATTG TATATAAACCACAGAATGATAATGAGGCTTATTAGAGTAATTGGGATGTA ATACAGGATATTATACAAGAATTGGTTCACCTGTATTTTGTTACGAGAAC AGTTAGATTATCCATAGATAGGAAGTATAATTAATGCGATTACTGTAAAG GGTGTGTCTAAATCGTATGATTTTTTAAACAGGATTTCGTTTATAATATT TAAAGGAGTAGGTGAAAAACCTCTTCCCGAATTAACAGCGAGTGCAGGAC CCACGCCACCCGGACTTTTTTGCAAAGTAAAAATTTTGGTTGCGTCTAAG GACTAACTCTAAGGACTTAGACTCTATACATTGCCCCCCCCCCCCGCCGA CTTTCAATTTCATGCCGTGGGTCCAGGAGTTTATGTGTTTTCTGTAACCA AGGTGGTTATTTTATTTTAATTTACATACCTTATATCGGCCAAAACTTAG TCGGCCTTAATTTTATTCGGCCTTAATTATTAGTCGGCCCCAATTTTAGT CACCTCGTCAAAATTTAGTCACTATGGGCCGACTAAAAGTTAAAACCGAT TAAAGATTTGGGCCATTTCTAAATTTAAAAGCATGCAGATGGAAAATAGG AGAAAGCTTAAAATACTGGAAAACAAGGACAGATTAATTATAAACTTTAA ATTTGGATCATATTTTTAGTTGGCCCTAATTTTTGGTCGGCCCTAATTTT AGTCACCAAGCCTAAGACTAAGACTAAGTTTTGGCCGATAAGTTAGTTTA AGCCAAACCAATGAACCAAGTTCATTAGCCTCCAAAGACAGGATGTGGCA GAATCAATATGATATTCACTTTACGCAAACGCAAATTTGCAAGAAAAACT GAAGCAAATACGTCTCTGTAAGATACAATTGTCACCAAGTTATTCTCTTA AGAATTCTAAAAAAATCTTCAAAGTGATACTAATCTGTTATAATTCAGAT TTAAAAAATAGCTAAAAATAAAACTTTCTTGGGATAGTTATATAATATTC TTTCAATGTAATTTAATTTTGACAAAGGAAATGAATTTATACAATTAGAG TTCTTCCCATCTAGCGCCAAACAATTGGTTGACAAACAAACTACTCGAGA TTTGTTAATTGATAAAGGAGATTGAATATTTCATAACACTTTTCAAAGAT TTTCGTATAAATAGACGTGAAAAAGATGGTGAAAATCATCATCTCAGATC TTAAGTAATCTCAGAAGAACAAACAAACATGAAGGTCATCATTTTCACCG CTTTCTTGGCTGGTAAGTACTTCAAACAACTTTAAGAAAATAATGTCGTT GTATAAAAGTATTGATTTTTAAGAGCAAACATTACTGAATTTATTAACTC ATTTCGCAGATCACTGAATTTTGAAGGTTTTAATTCATTGCAATAATCTT CATCTTTCAGTTACCGCCGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCAC ACCACCAGCTGTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAGAGCTGACG GAAACTACGAATACTACTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTC CAATGCTCCAACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTT GGAGTTCAGCGAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAAT GTGTCACAACACAACCATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGCCCAGAC AAATGCCCAGCCCGTGGACCACACTTCAGCGGAAATATTGAAGACGACCA CAACCCACATCAATACGTCGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTCGGATGTA TTGCTTGCCCAAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTTTG TACCAAGGAAAATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAAT TAATTTTAGTTTTATAAAAATCAAAAACGAAAACTTTTTTTTTCAATCCT TTCCTCTTTCAACTCTTCTTTTTCACCACTTTACCTAAACTTCTTATTTT TCTTTGAAATTTTGTAATTGTATGAATGATGAAATTGTTTATATTTTACG AAATACCTTTAATAGAAC
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15420.1.p1MSTRG.15420.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000136_pilongenomesc0000136_pilon:220015..229232 -