MSTRG.15380.2.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.15380.2.p1
Unique Name	MSTRG.15380.2.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+
coding sequence from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+

mRNA from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.15380.2.p1 ID=MSTRG.15380.2.p1|Name=MSTRG.15380.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=61954bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATGGGAAGTCCGTAGGGTTTCAACTTGTCGTAGCCATCTATATGCCACG
CGTCATTAGGGCCATCAGATTGATAAACACGCCTTCTTAACTTTCTAGCC
TTCCTCGTTACGGTGCCCTCAGGATCGATCTCTCTTAAGAGTGTCATTAC
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TTCCTCGATAACCAATTTGGGAACCTGGCCCTTCAATCTCATTACTTATG
ATTTGCCGAAGTTGATCGTCGCTGGCTTCACCACCAGCTTTACTTAGCCC
ATAATCTCTCAATCTTGTTTTCAATGTGCTTAGACTTATATTCAACGCAT
GGTTATGAGCcaaaaacaataagaaattGATTCGTATTGAAAGCCCCTTC
TGAAATAGTACTCAATTATATCTCTTTCTGTTTCAAGAGTGTTGACGATA
ATGTTCCGCTTTTGTGTGCCACAATTGCCACAAAAGATGTCCCTAATTTC
ATTGCCACATTATGGCAAAACATCGTTAAAGAAAAGCTTGGCACGTGGAC
TTTTCACAAGTGGATAATAATAGGGTGATTCCCCCACTGTAATGTACGAC
GCTTTTTTGGAagctcgacagtttgaaagaattctcgacaacttgaaaga
aatctcgacattttaaaagaaatctcgacaacttgaaaaaaatctcGACA
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tctcgacagtttgaaagaaatcgcCAGATGACCTTTCCCGGCTTCCATAT
ATCTTGCTACACATCCGtatcaattcaatatcaaaaagcttgtagattaa
aattgatgagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaatcttta
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GATTTCGTTTTAGCAATTGTCACTTCTTCAGGATTTTATGATTCTAAACT
CAAAATTACCGATCAAGGAGGAGCAGAAAATTATCATCGAATCGATCTTT
GGAATTCCACAGATTACGATGGTCATCTTTGCAAATACAGTGGAACACAA
GTCGCAGTCAAAGGTAACATATAACTTAAGAAATTCATGCCAACAAAACA
CATCCTATCCTTACaaactttaaaaactaagaaaatgaaagtaaggtaaa
aaggtggctaagaaatagccaaaaaaTATGGCTCTGACTCTTTTCTGATT
ATTATACTTTTCGCAAGAGAGCCAGccagaacgacatatttcgcctTTTC
ATCTCTGGACCATTCTTTGTCATTTGACGTGATGTAGAGAATTTCCAAAA
GCTATTACACGTAAAATAATtgctttctcgagatttctaCAATCCCCACC
GTAATATTTGActcaaaaggggaattccctcaagtgattttaagtgcttt
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gctgagaatatagcctggaggcCACCTAACACCTCCCAAAtagaaaaatc
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aattctgacaaatattaaaatacccaaaagtgCCAACGTATTTTGATGGG
GATTTCTAGATCTCTCCTGGTGTTTAAATCCTTTTCTGAAACCATCGTAA
AAATCAGAAAGATTGAATTCGGCAAACGGATTTTCGTCGCCAGATTTCCG
GGCTAGCTGAGAAATTACGTCATTTAGCCCCGCAAGAATCGCCtatgggg
ccgtccacatagtacatACGCACTAAAATCCCTGTACGCAAGTGtgcgca
aatggctataccccctggcAAGTTACGTACTTCTTCATTCATTTCTCTAC
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tctttctatttttagaCCTTGCAGTCATCAAATTTCCAGCATATGCCTTT
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GTCATGTGAAATAATTCCCTTTCTTTGGTGTTTGGTATTTTTtcgagagg
ggggggggtacttaggcatAATGGGTGGCCGGGTGCTGGGtgccctcgaa
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GTTGAAAGACGTTAAGAAAATCCACTGTTCAAAATAACTCCTTAGACATG
CGGAAGGAATGCTTATCTATGCGCTGTAAAAATTTCCGACTCCTCCTCCG
TCAAAGGCATTTCATTAATTCATTTTATCCCTATTTTTAGAGTATCGACT
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TTTTGGAACAAAGATAAGTCTGAAGAAACGGTTAACATTTTATCAAGGTT
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ctctAAGCGCTCACGAAAGGTTTGTATCAacgtaagtaagtaagtatatt
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TGGACATTTGATGAACCCTTCGTATGATCCAAGAGCTCGACCATGGTAAG
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GCTTTTTTGGGTCGatttaaaaatgctgacgtcagcaaaaaatgtaCCGT
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TTTGTATGTCTGAAATAATTATGTTGAGTAATATTAGATGATTTGTGGTA
GAATAAAAAGGTTTTTCAACCTATGTAGACGAAAACCTGGCAAAGTCCAA
GAACTTATTTTTATGGATTGGTGAAATGAGTAGCTCGTGTAACAAGGAGC
TTTCAACTAATGATTATAGTAGGGTTGAAAGCGTCAAAGGGGTTGCCTTG
GTAACTCAAACTTCCATCTCTGTATTTTCTTTAAGAAACATTTTTCCTTA
GATAATGAGTATCTCAATCAAGAAGTCAATGTTGCTTGCCAATATAAAGA
ATGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+

>MSTRG.15380.2.p1 ID=MSTRG.15380.2.p1|Name=MSTRG.15380.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=90675bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:434775..496728+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGAATCATTGCGTCATTTATTACGTCATCATCGTGTTATCTTTATT
TCATTGGCCAAACGTAAATGGTGAAGATGTTTTATTAAATCGATTGAAAG
ATGgttccaaaaattttcaacaagaaTTGACAAAACTCGTCAAATTGAAT
CTTGGCTATCAAACTCTGCAGgaTCAATTTAACCAAATGTCTCAGGAGAA
GAACACAATTCAATTTGATGCAcattcaaagttaaaaaatTTTGTCAGAG
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TATTGAAAGTTGCTGTCAATTTGATGAATCTAACCTAGAATTCAATTCGA
TTTTCGGAGAAAAAATTTCGATGGATCATATTTGTGAGCAGACACCAACA
AGCAACTCTGATATTTGTCCAACTCTTGGAAGACCAAAAAGTTCTGAAAA
GGTTCATTTGCTaaacaaaaagaagattttggatTCTACCCGAAGCATCT
ATGAAAAAGAAGCGAAAGGCGAAGCAAGGAACATCCAATACGACTCTTTA
GATGGTTATTCGTTCACTTATCCTGCTTATCAAGATCCTTCACCAATGGA
ATGCACATGCGCACAAAGGGATCCCAGATTCAGTTCGCGATTGGCAGAAA
CTTTAGCAGGTAACAAAGGTAGACATTTTTTGATTGTTCTCGATTACTca
gagaaaattcaaaacacCATTGCCATCATGAGGAAAGTTGCAACGACATT
GCTTAAACTGGTTACTTCCAAAGATATGATTTCAGTGAAATTTTATCATG
AGGATAATTTGGTACCAGGGGACAATAAAGCagattgtttgaaaatttca
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GCAAGGAACATCCAATACGACTCTTTAGATGGTTATTCGTTCACTTATCC
TGCTTATCAAGATCCTTCACCAATGGAATGCACATGCGCACAAAGGGATC
CCAGATTCAGTTCGCGATTGGCAGAAACTTTAGCAGGTAACAAAGGTAGA
CATTTTTTGATTGTTCTCGATTACTcagagaaaattcaaaacacCATTGC
CATCATGAGGAAAGTTGCAACGACATTGCTTAAACTGGTTACTTCCAAAG
ATATGATTTCAGTGAAATTTTATCATGAGGATAATTTGGTACCAGGGGAC
AATAAAGCagattgtttgaaaatttcatcaaaagctACTCCTTATCTTAA
AGATAAAATTCTCAAAGAAATTGAAACTAAACAACCAAAAGGAGATGCAG
CAAGCTATTCCAAGATTTTCCGCGAATCTTTTACTGCTCTCAAGAATGAA
CACAGCAATCAAACTGAGAAACATTTCATCTTTGTCACAAGCGGTTATTA
CATTGACAGTTGGTCAGAAGTTCAAACAGTTTTCGAAGAAGGGAGAGAGG
ATTTCGGATGCGATTTATCCTTTTCGCTGTTATTACTCtataaagATGGC
GATTGGGGTACAACAACGTATAACAATAACAAGAACCTTAAAGGTGTTGG
ATGCAATGTTAAGggTCGTGACAACTTTATGGAGTTTGAACTTGGAAAGG
ATAATAACCATTTCACCATCAATTCCAAGATATCTGCCATTTTATCCTCC
GCCAAGAATTTCAACGACTTCAACGACAAAGTTCATTACATCATGCCTAT
CTCAGATCGCTTTGGTAGAGGCACAACGATCGACGCATGTAAAGCAGTGG
TGGATAAAAGTTCATCTTCACAAAATCCAATGAAAGGAGCCGTTTGTCTT
TCCTTTTTGACCAATGAATTTATTCGTGAAGAATGGAGTCAAACGGAAAA
TTCTTATTGGTTCCTTATCAAGAAAAACGGTCAAACCTTCATTCATCCGA
AATTCGGACAACCACTTGGATCAGATGAACTTTCTCGGACAGTTAGTATT
TTACAAATCGAATCTtcacaaagtttcaaagatGAAGTCTACGATGACAT
GATAAGTGGAAACTCTGGCACAAAGATATTGCTTCAAGTAATAGCGCCGA
AAGGTAGAGGACCATTTGGTGCATCTTCTCATAACACGACTTTGACATAT
ACATGGAGAGCGGTGCCAAAGTCTGATTTCGTTTTAGCAATTGTCACTTC
TTCAGGATTTTATGATTCTAAACTCAAAATTACCGATCAAGGAGGAGCAG
AAAATTATCATCGAATCGATCTTTGGAATTCCACAGATTACGATGGTCAT
CTTTGCAAATACAGTGGAACACAAGTCGCAGTCAAAGaCCTTGCAGTCAT
CAAATTTCCAGCATATGCCTTTCTCAGACCAAGTGTATATTacaaattag
aaaaagaaattgaacttgTACAACAGCTAAAGCATCTGTGCACACCTGGT
AGTACTACGTTACCTCCTGCAGGTTTTTTCAGGAGTATCGACTCTTTTAA
AAACTTATGTCTATCAGCCAAAGCCACGCATGGAATGAACGCATTTTGGA
ACAAAGATAAGTCTGAAGAAACGGTTAACATTTTATCAAGATACGTTGGT
ATGGAGAATGGTTTCTTTCGAGCCTATCCTGGACATTTGATGAACCCTTC
GTATGATCCAAGAGCTCGACCATGGTATCGATTGATGATTGCACAAAAAG
GAATAACTTTAACAACACCCTATCCAGATGCCTTTACCGGTGAAATTGTC
ATGACGCTAGGGAAAGTTCTACTGAAAGGAAAGAAGTCAGTAGAAAAAGC
AGGGAACATTGCTATGGATTTCAAACCACTCTACTTCAAAGAGTTACTAG
AAAGATCGATCAAAGAGTGTGCATCTGGAGCATGTGTTGTGATTGATCGA
AACGGCTTCGTAGTTTATCAATCGAGTTTTATGGAAGAGAATGAAAATTC
AACCCTCGAAAATCAACACATCGTGAAGATGcatGGTAGACTCGCAAAGA
CGATGATTGAGAATGGagttatgataaaaaattattgtttgGAATTCCGA
AACAATGTAACCGTAAAAGAATGGTTTTACTCTCTTGACCACGTGATAGA
AGCGAAATCGTATAGCAAGGGGTGTTTGAAGGATTATCATGTGGTACCGA
TTATCGATTCCAATCTTTTATTGTTGTATGTTAATGATCGATGTGATGTT
AAAGAGAAATGTACTTGCAGAGAACCGATAAACGGGGAAAGATTTGGAAA
TTGTTCGAACGATATCAGCGAAACAAATTGTGAATGTCCTTGCATACAAC
CCGTTACTTGTCTCAGTGATCTTCGAATTACATCCAATACGCTTGAATGC
AATCCAgaagataaaagaaaaacagattTCTCAGGGATATGGTACACAGG
TGATGAAACTCAGTTAGATCTTTGTATGGATCCCGAATGCAAAACACGtt
ATACTTTGAGCGAATGTAATCGTTTCAAAGCTGGTTGCAATTGGTGTCAT
AAATATCCGAACGGAGCGTCTGCGACTGACGATAAAAAATATTGTGAATA
CTCCGACAAACCATGCTTCCCAGATTTAATTCCTAAAACAAGCCCTTCAC
CCCCAAAGAAACCTGGAGATAAAGATGGACTTTCCAAAGAAGAACTAGCT
GGAATAATAGTTGGCTGTTTGATATTCATTTTCATTATCTTGGCAATTGT
TTACTTTAAACGGAAGAGCATCAATTGTGAACCATCAGCAAAATCTGAAT
CAACAATCGAAACGAATAACAACGCTGTCAGTAACGCACCAACACTACCT
CGACAACAAAAAGCTTTTACCAACTTTGCTTATGTTGATCAGAATGACCC
TGATTCGTTTTCACCGACTGGTGCACCAAAAACACCGCTCCCACCAGAGG
AAGATCCAGTTGCACAAGTTGACGAGGACCAATCTAATATTAAAGATGGC
AAACTTCCCGATGTTGTTATGAAAAATTCTAATGACAGTGAATTTGGAGC
TTGAATGAGGAATCATTGCGTCATTTATTACGTCATCATCGTGTTATCTT
TATTTCATTGGCCAAACGTAAATGGTGAAGATGTTTTATTAAATCGATTG
AAAGATGgttccaaaaattttcaacaagaaTTGACAAAACTCGTCAAATT
GAATCTTGGCTATCAAACTCTGCAGgaTCAATTTAACCAAATGTCTCAGG
AGAAGAACACAATTCAATTTGATGCAcattcaaagttaaaaaatTTTGTC
AGAGATTTTGAACGAAAAACAGAAATAGCTGAAAACGTATTGAACCACAT
GGCGACTTATATTTTGGAAGACTATAAGACGAATAACGTTGGTGAACAAA
GATCTATTGAAAGTTGCTGTCAATTTGATGAATCTAACCTAGAATTCAAT
TCGATTTTCGGAGAAAAAATTTCGATGGATCATATTTGTGAGCAGACACC
AACAAGCAACTCTGATATTTGTCCAACTCTTGGAAGACCAAAAAGTTCTG
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TGGAATGCACATGCGCACAAAGGGATCCCAGATTCAGTTCGCGATTGGCA
GAAACTTTAGCAGGTAACAAAGGTAGACATTTTTTGATTGTTCTCGATTA
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GTTTGAACTTGGAAAGGATAATAACCATTTCACCATCAATTCCAAGATAT
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TTAGCAATTGTCACTTCTTCAGGATTTTATGATTCTAAACTCAAAATTAC
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TGTATATTacaaattagaaaaagaaattgaacttgTACAACAGCTAAAGC
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AACATCCAATACGACTCTTTAGATGGTTATTCGTTCACTTATCCTGCTTA
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TTGATTGTTCTCGATTACTcagagaaaattcaaaacacCATTGCCATCAT
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TCGCTTTGGTAGAGGCACAACGATCGACGCATGTAAAGCAGTGGTGGATA
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TTGGTTCCTTATCAAGAAAAACGGTCAAACCTTCATTCATCCGAAATTCG
GACAACCACTTGGATCAGATGAACTTTCTCGGACAGTTAGTATTTTACAA
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TCCAGCATATGCCTTTCTCAGACCAAGTGTATATTacaaattagaaaaag
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ATAAGTCTGAAGAAACGGTTAACATTTTATCAAGATACGTTGGTATGGAG
AATGGTTTCTTTCGAGCCTATCCTGGACATTTGATGAACCCTTCGTATGA
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CGATCAAAGAGTGTGCATCTGGAGCATGTGTTGTGATTGATCGAAACGGC
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CGAAAATCAACACATCGTGAAGATGcatGGTAGACTCGCAAAGACGATGA
TTGAGAATGGagttatgataaaaaattattgtttgGAATTCCGAAACAAT
GTAACCGTAAAAGAATGGTTTTACTCTCTTGACCACGTGATAGAAGCGAA
ATCGTATAGCAAGGGGTGTTTGAAGGATTATCATGTGGTACCGATTATCG
ATTCCAATCTTTTATTGTTGTATGTTAATGATCGATGTGATGTTAAAGAG
AAATGTACTTGCAGAGAACCGATAAACGGGGAAAGATTTGGAAATTGTTC
GAACGATATCAGCGAAACAAATTGTGAATGTCCTTGCATACAACCCGTTA
CTTGTCTCAGTGATCTTCGAATTACATCCAATACGCTTGAATGCAATCCA
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CCGAACGGAGCGTCTGCGACTGACGATAAAAAATATTGTGAATACTCCGA
CAAACCATGCTTCCCAGATTTAATTCCTAAAACAAGCCCTTCACCCCCAA
AGAAACCTGGAGATAAAGATGGACTTTCCAAAGAAGAACTAGCTGGAATA
ATAGTTGGCTGTTTGATATTCATTTTCATTATCTTGGCAATTGTTTACTT
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TCGAAACGAATAACAACGCTGTCAGTAACGCACCAACACTACCTCGACAA
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GTTTTCACCGACTGGTGCACCAAAAACACCGCTCCCACCAGAGGAAGATC
CAGTTGCACAAGTTGACGAGGACCAATCTAATATTAAAGATGGCAAACTT
CCCGATGTTGTTATGAAAAATTCTAATGACAGTGAATTTGGAGCTTGAAT
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ATTGGCCAAACGTAAATGGTGAAGATGTTTTATTAAATCGATTGAAAGAT
GgttccaaaaattttcaacaagaaTTGACAAAACTCGTCAAATTGAATCT
TGGCTATCAAACTCTGCAGgaTCAATTTAACCAAATGTCTCAGGAGAAGA
ACACAATTCAATTTGATGCAcattcaaagttaaaaaatTTTGTCAGAGAT
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TTATATTTTGGAAGACTATAAGACGAATAACGTTGGTGAACAAAGATCTA
TTGAAAGTTGCTGTCAATTTGATGAATCTAACCTAGAATTCAATTCGATT
TTCGGAGAAAAAATTTCGATGGATCATATTTGTGAGCAGACACCAACAAG
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TTCATTTGCTaaacaaaaagaagattttggatTCTACCCGAAGCATCTAT
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TGGTTATTCGTTCACTTATCCTGCTTATCAAGATCCTTCACCAATGGAAT
GCACATGCGCACAAAGGGATCCCAGATTCAGTTCGCGATTGGCAGAAACT
TTAGCAGGTAACAAAGGTAGACATTTTTTGATTGTTCTCGATTACTcaga
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TTATTACTCtataaagATGGCGATTGGGGTACAACAACGTATAACAATAA
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TGGAGTTTGAACTTGGAAAGGATAATAACCATTTCACCATCAATTCCAAG
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CTCTCTTGACCACGTGATAGAAGCGAAATCGTATAGCAAGGGGTGTTTGA
AGGATTATCATGTGGTACCGATTATCGATTCCAATCTTTTATTGTTGTAT
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Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15380	MSTRG.15380	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15380.2.p1	MSTRG.15380.2.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000135_pilon	genome	sc0000135_pilon:434775..496728 +

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MSTRG.15380.2.p1 (mRNA) -