MSTRG.15084.5.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15084.5.p2
Unique NameMSTRG.15084.5.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:890018..909115-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15084.5.p2 ID=MSTRG.15084.5.p2|Name=MSTRG.15084.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19098bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:890018..909115- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGTGCACTTTTTCCCACTTGCTCACAAATCAACCCTTACAGTGCACTTTC CAAAGTCCAAAAAACCTACCCTTAAGGGCCGCACGTCCGGTAGGTCACTT ACCTGGAGTGCCCCCTCCCCCGGGCTTGGAAGCCACAGAGCACTTGACTT GAAAATATAATTTGCAGTTTTAAAATTTTGAAGAGACTACCCCTTTTTCT GAAAGATTATGACTATTTCGAATGCACCGGGTAAATTTTTTTTGTGCGAC CAAACAAAGGTAGCTCAGCTATTTGGTTGTGTACAGTAGTTTCATTTCAA AATTCCAAAAACAATAACAGAATGTTTGTCACAAAAAAAGTACTCATCTG TAACATACTGGACGCGCCACCATTCATAACCACTGGAATCTGTATCTCCT TTGTCAAATTGCAAGCGTTCTGCAAAGTCCGTGGGATGCAAAAGAAATAG AGAAACAGTAGTATAAACTGGTCTATTAAAGCAATCGACCATTATTTCGT TTTCCAGTTCATCTCCATACTCAGATTCTTTTCTTGTAGAAACAAAAAAT ATCGAATTATTTGAGCAATTATCGAACTCCTTTTTTACGAAAAAATATTT TTCTGTCTTATAAACTTCTCTCTTGTCACCCATCATGATAGTAACGGCTT GATACCAATCTGAATATGAAGGATACAAAAGCAAAGACTTCTTGTCCTCT TGATAATATTCTGGTCCCCATACCAAATGATCAATGATTGACATTGTCTC ATTAGAAACTTTAGCAATCTGGTCCTGGTTTTGCATGTTGTCGCTAGCGT GAACAACCTTTTTGAGAATCTCAATTTCTTTACGCAAGCTTTGGATGGCT TCATCTTTCTCTTTATTTTCTTTTTCCAATTGAATGATTCTCAACTTATC CTCGTTGTTCGATTCTAGTTGTTGGATTTTGACTTCCAGTTTCTCCAGTC TAGATTCCATGTTTAGATATCGTAATTTCTAAAAAGTTAAAATTGACACT GCTTTTTCATACACACGTAATATAAAAACTTAGTTCTCTCTTTTTTAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:890018..909115-

>MSTRG.15084.5.p2 ID=MSTRG.15084.5.p2|Name=MSTRG.15084.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:890018..909115- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCAAAGGTTCTTGGTACATACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAAC
ATTGAAAAGCAAGAAAACTGGCAAAAAATGATTTATGGTATGAAACCAGA
TTTGACTCGTGAGGGTGGAAGCATCCCACCCATTCTGACCCTCCAAGATG
CGACCAATTCAAGTGTCATGATGTTACCAATTGGACAAGCCGACGATGGT
GCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCGGAGAGGAATTACATTAATGGGCG
TCAAAGCAACTGTCTCAGTGAAAGCCTGGCTGAGCGACAACACTGATGAT
AATTATGCTGCTGGGATGACTGCACAGGAAAGAGGTTATGGGAAAGTTTT
CCATCCGTTTGGTACCAAATCAAGATGCAGCAGATATTGATGCCAAAGTG
GAAGCCTACATTCGCAAACTTCACCAACAAAGTGGAAGCAAAAATGACAT
TGATATCTTCTTTTTTCCATTACAGGTTTTTACGGAGCTGCCTATGGTAT
AGCAGATGTCACCAGCATTCCCAAATCTGCAAAGGTTCTTGGTACATACC
TCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTGGC
AAAAAATGATTTATGGTATGAAACCAGATTTGACTCGTGAGGGTGGAAGC
ATCCCACCCATTCTGACCCTCCAAGATGCGACCAATTCAAGTGTCATGAT
GTTACCAATTGGACAAGCCGACGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAA
TGTCGGAGAGGAATTACATTAATGGGCGTCAAAGCAACTGTCTCAGTGAA
AGCCTGGCTGAGCGACAACACTGATGATAATTATGCTGCTGGGATGACTG
CACAGGAAAGAGGTTATGGGAAAGTTTTCCATCCGTTTGGTACCAAATCA
AGATGCAGCAGATATTGATGCCAAAGTGGAAGCCTACATTCGCAAACTTC
ACCAACAAAGTGGAAGCAAAAATGACATTGATATCTTCTTTTTTCCATTA
CAGGTTTTTACGGAGCTGCCTATGGTATAGCAGATGTCACCAGCATTCCC
AAATCTGCAAAGGTTCTTGGTACATACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCA
GAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTGGCAAAAAATGATTTATGGTATGAA
ACCAGATTTGACTCGTGAGGGTGGAAGCATCCCACCCATTCTGACCCTCC
AAGATGCGACCAATTCAAGTGTCATGATGTTACCAATTGGACAAGCCGAC
GATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCGGAGAGGAATTACATTAA
TGGGCGTCAAAGCAACTGTCTCAGTGAAAGCCTGGCTGAGCGACAACACT
GATGATAATTATGCTGCTGGGATGACTGCACAGGAAAGAGGTTATGGGAA
AGTTTTCCATCCGTTTGGTACCAAATCAAGATGCAGCAGATATTGATGCC
AAAGTGGAAGCCTACATTCGCAAACTTCACCAACAAAGTGGAAGCAAAAA
TGACATTGATATCTTCTTTTTTCCATTACAGGTTTTTACGGAGCTGCCTA
TGGTATAGCAGATGTCACCAGCATTCCCAAATCTGCAAAGGTTCTTGGTA
CATACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAA
ACTGGCAAAAAATGATTTATGGTATGAAACCAGATTTGACTCGTGAGGGT
GGAAGCATCCCACCCATTCTGACCCTCCAAGATGCGACCAATTCAAGTGT
CATGATGTTACCAATTGGACAAGCCGACGATGGTGCTCATTCACAAAACG
AAAAAATGTCGGAGAGGAATTACATTAATGGGCGTCAAAGCAACTGTCTC
AGTGAAAGCCTGGCTGAGCGACAACACTGATGATAATTATGCTGCTGGGA
TGACTGCACAGGAAAGAGGTTATGGGAAAGTTTTCCATCCGTTTGGTACC
AAATCAAGATGCAGCAGATATTGATGCCAAAGTGGAAGCCTACATTCGCA
AACTTCACCAACAAAGTGGAAGCAAAAATGACATTGATATCTTCTTTTTT
CCATTACAGGTTTTTACGGAGCTGCCTATGGTATAGCAGATGTCACCAGC
ATTCCCAAATCTGCAAAGGTTCTTGGTACATACCTCAACGAACTTGGAAA
AGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTGGCAAAAAATGATTTATGG
TATGAAACCAGATTTGACTCGTGAGGGTGGAAGCATCCCACCCATTCTGA
CCCTCCAAGATGCGACCAATTCAAGTGTCATGATGTTACCAATTGGACAA
GCCGACGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCGGAGAGGAATTA
CATTAATGGGCGTCAAAGCAACTGTCTCAGTGAAAGCCTGGCTGAGCGAC
AACACTGATGATAATTATGCTGCTGGGATGACTGCACAGGAAAGAGGTTA
TGGGAAAGTTTTCCATCCGTTTGGTACCAAATCAAGATGCAGCAGATATT
GATGCCAAAGTGGAAGCCTACATTCGCAAACTTCACCAACAAAGTGGAAG
CAAAAATGACATTGATATCTTCTTTTTTCCATTACAGGTTTTTACGGAGC
TGCCTATGGTATAGCAGATGTCACCAGCATTCCCAAATCT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15084MSTRG.15084Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15084.5.p2MSTRG.15084.5.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15084.5.p2.exon5MSTRG.15084.5.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15084.5.p2.exon4MSTRG.15084.5.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15084.5.p2.exon3MSTRG.15084.5.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15084.5.p2.exon2MSTRG.15084.5.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15084.5.p2.exon1MSTRG.15084.5.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:890018..909115 -