MSTRG.1485.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1485.2.p1
Unique NameMSTRG.1485.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:706108..787130-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1485.2.p1 ID=MSTRG.1485.2.p1|Name=MSTRG.1485.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=81023bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:706108..787130- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTATTTATTTTTTCCCTACAACCCTTCCCTCTCCCCTTATCAACAATCAA TGATGAATTTATTGCGTCATGCATTTTCGCTAAACGCTATATTTTCTGAC TGATTTTTTTCTCCTCGCATTGCTATCTAACTTTCATCATGAGGTAGGTC CATTCAGCATCTAGGTTGTTTTCGATATGGTTTTCATTGAAGTAACTTCG TATAGACCTTTTGCACATTTTGATAAATAACAAGATTGCTCACAGGAATT TTTTGACCTGCATCCCGTGCGATCGTATTTAATCGCCCGCGCGTGTACGC TCTGTCTACTGTATATGGGTACCGTGTGCAAGAACAAGTTCCTCTCTTCA GTCTTTTGAGACTTTAAAGGATATTGGAGAGTGTCCTAACCCCTCAGATG GAAATTTCTAATTTCATAGGTACTAGCAGCTTTACAGCCCGTTTGCTGCA GTCATCTTACTGAATTGGAATAAGAGTCGAGTCACTCGACAACTAAAAAA GTCCTGAAAATCTCGATGATTGATCGGCTCTCGCATGTTGGAAATAATCT AAAATAATTTCTTTAAGAAGTTAATACCTTGACAGGGTGATAAAGGTATT GCCAATTTAATCATTGTCGGGTGGCCGAATGGTAAAGGCGACGAGCTGTC AATTGAGAGGACAACTTTCTTGAGGGATCGAATCCTACACGGTGCGTCGT AGTGTGTGTTATTTTGTCAGTATTGACCAAACTTTTTCTGAATTTATGAG CTCTTATTGATATTTTTGAAAATCCCCGTTAGAATTTTAGGAAACAAAAA TTTTCTAAGTAGTGTCACCTCAGTGCAGTTTGACTCAAAATTATAGTATT TCAAAATGGATCAGGTTGGTTAGCGGGTGGAGAGTCAAGAGTCATGTCTT TCCCTTCTCTCTTGAATATCCAGTGTTCAACAAACGACTTTCAACAAAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:706108..787130-

>MSTRG.1485.2.p1 ID=MSTRG.1485.2.p1|Name=MSTRG.1485.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:706108..787130- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTCTCAAATCACTTTTGATGATCAGAAAATGGACTACCCTGAATGCCAAC
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CACAACCCTATTCGCTGAAAGATCTTTTGAAAGATGACACAAATTTACAA
AGATTTGTTGGCGGTACAATTTATCAAGGCTTACTCACTCCACATGTTTA
TCATCGATTCCATGCACCCGTATCGGGCACCATCATACGATCCGATGTCA
TCCCAGGCCTTTGTTTCTCTCAAATCACTTTTGATGATCAGAAAATGGAC
TACCCTGAATGCCAACCTTATCTAGCGCACGTGGCAACCCGTGGGGTAGT
TCTTATAGACACCAAAACTCCCTTGGGAATGGTAGGTTTTATTGCAATTG
GGATGACAGAAGTTTCATCGGTTGAGCTGTCAATTAAAACAGGTGATAAC
GTCATGAAGGGACAAGATATCGGAGCTTTCCATTTTGGAGGTTCGTCGCA
TATCTTGATGTTTGAAAAAAATGTAAACGTTCATTTTGATTTGCAAGGGA
TAAAGCCAGACCCAGTCCACGGATCAGAGTATTTAAAAGTGAACACAAAA
ATAGCAAACTTTGTTGGAAAATATTCATAACGGAGATCCAAGAAGCTGCC
GATCTCAAGCCGTCCATAGTAGAACTTCTTGAGGCAATGGACAAAGATAT
GCATGTTGGTCAACTTTTGGTGAAAATGTTTCGCGAACAAACGCATCCAC
ATTCATTGAATACACGAGATTCACTGTTCTTGATCAATAGATGTATCCGA
AAATCACCAAGATTTGTTTCCAAAGACTCAGCTGCTGGTGAGACCACGTT
CAGAAATAAAGTACGTAATGTGGAATCGCCAATAAAGACAAAATCTTCAC
AAAATATTATGTCTGGGAAATGGTTAGCTGAAGATCAAACAATTGTATTA
AGTTGGATCCACCGTGAAATGATCAACGCACGTCTCACCAAGGAATATAT
AAATTTCAAACAATTTTTTCCTGATGTCCAAAGTGTGGATGAAGAAATAA
GAAATTTTGTGAACAGCGGACATAAAATAAATGACGTCAACAAGTTTTCT
TCGTATTTGCTGCACATCGCACCTAAGGAGGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1485MSTRG.1485Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1485.2.p1MSTRG.1485.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1485.2.p1.exon7MSTRG.1485.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon6MSTRG.1485.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon5MSTRG.1485.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon4MSTRG.1485.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon3MSTRG.1485.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon2MSTRG.1485.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1485.2.p1.exon1MSTRG.1485.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:706108..787130 -