MSTRG.14839.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14839.1.p1
Unique NameMSTRG.14839.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:392004..413313-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14839.1.p1 ID=MSTRG.14839.1.p1|Name=MSTRG.14839.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:392004..413313- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAATATCCAAAAGTTTGAAATCTCAAGATGAATCAAAGCCGGAAGCAG ATGGTGCTTGAAAAGTCAAAGTTTCATTGCATCAATTTCCTGTTAAGTTA TGAGACTGGTAAAGTTGTGGAGATTCAAAATAAGAAAGTTGCTTTTTGGT ATCGTCTCATCCAACTCAGTGTTATCATTTATGTTATTGGGTAAGTGAAA GGAGAATTTTCACATTTTTTATTTGAAATTTCTTTTGCAAGTAGCCCTGG CTTATATTGGTACACTTTTTTTTTTATAAGAACCAGTAAATTTTTGTTGA GGCTCGGCTGTTCTTATTTTTTTGGCACTTCGAGCCTCAAATTGTTCTTG TCCTTGTATTTTTGGGTTTGAACCCTAATTTCATTAATTTGGCCCTTATT TTACCTAAAACTCAGCAACTCCAGGCTCAGGATTGTTCTTAAATTGTTCT TATTTTTTGGCATTTTTGAGCCTCATTGTTCTTATAAAATTGTTCTTATA AAAAAAAGAAAAGTGTATTCCTGATATGCATCACTGGAATGTCTTCTGAC ATTAAATCATGGACCCAATAGCTGATTGGTTGTAAGTGACGTAAAACCAG TCAATACGTCACTTTACAACCAATCATGTCACGATGGTCTTGGGTTGAAA GAATTTAAGCTTCTAGGTGACTAAAATTAGTAAAACACTTCTGATTTCGT TAAGGAAATATATGTGGAGGTCAGATCCTAAAGAACTAGACATTCCAAAA GCTTTCTACCTTCCCTGTCTCGGAGCTTGTCTCTCCATATTGCGACACTC AGTGGAATCAAATCTCTGAAAAATGAGCATTTTTTAAACTTTCATTTTCA TATTATCCTCTCTTCATTTAGTTACGCCATCATTTACGACAAAGGTTACC AAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTCCACCAATACCAAAGTCAAGGGAATC 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TTAATTCCCTAACCTACCCCCCTCCTTGGCCGCCGCCCACCACGCCCTTC CTAAATCGGGCGGCGCCGAAGGCGCCCAAAAGAAAGAAGAGACTCTAAGC TATCCAATGAGCTATATACGAGCTTCTAATTCCTTCTAGATCAGGAGATA TAAGCCCTTAAAGTTTGAACTAGCGATTTTTTAAAAAAAACTTAGAAAAA AGGACCCTGGCACTCAAAGGGTTAAAGGATATGATTTTGCAAAAAAAATT CAAATTTCAAAAAATTTTCAAAATTCGTGCCCAGTCCCTTTTTAGCAATT TTTCTAAAAAATCTGAATTCAAAAGTCAGAATCAAACCTTTAATCTGCTT CAGTTACAAAGAGCATAAAATTCTGCGTCAGAAAATGGGGTCATTTTTTA TTCTAGGATAATCTGGTCACGAGATATCGTAATTTAAAATTTTTTGGAGA CTGGGACGAGGTTGCTAAATATAAAACCATAAAGTATTCAGGGGGTAAGG TCGAAAATTGTTCAAAATTCGTTTTATTGGCTTAAACAACTCGAACTTAT CTATATTTTCAGCCAAACAACTTTTAAAGCCCATTTAAGGTTTATTTCTT TCTGAATACTCAGGTTAATATCGAATTTATGAGGATTTCTACCAGAAATA AAAGTTTAAACAAAAACTCTAGTTTTTGAAACATGGGACCCTATTTAAAC ACCCTCTTAGGGTTGTCGAAAAATCGTCAAATTTGGTAGGTAGGTTCCCT ATGATGAAAGAACGATTTTGAATTTTAGAATTTTTGAAATTCCGATTTCC CGATTTTTAATTAACGAAAAACCCAAATTTTACCCCCGTCTTTTAAAAAA AGCAACAAGAAAAATGCCTAAATTGAAAAAGTCTAAAATTCAATTTTTTT ATTTTCACTTAGGCTTGCTTCATGCCAAATTTCAGGTCTCTACGATGTCG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:392004..413313-

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ATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAA
ACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACGTTAC
GCCATCATTTACGACAAAGGTTACCAAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTC
CACCAATACCAAAGTCAAGGGAATCACACATGTTAATTTTGGGAATTTCC
CTTCGACCTTTTTTAATGGGAGGATGATTTATGATCCGCAAGATTACGTC
ATCAAACAAATGAATCAAAGCCGGAAGCAGATGGTGCTTGAAAAGTCAAA
GTTTCATTGCATCAATTTCCTGTTAAGTTATGAGACTGGTAAAGTTGTGG
AGATTCAAAATAAGAAAGTTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACTCAGT
GTTATCATTTATGTTATTGGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAA
AATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGTGTGACTTTAT
CGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATTTGCG
AGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGT
GATACAAAGCAGGCGGGGAAGTTTAGCTTCATACCATTGATGTTGAACTT
AGGAGCTGGAATTGGATTACTTGGCATTATATGCAGATTATTATGTTGAG
AATGGGACGAGATATCGAACATTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGA
ACTGGTCGTTCATGGAGAGGTTGGATGACGTTGACACACCACTTTCGCAT
GGCTACAATTTCAGGGAGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAATGGGATTGT
AATTTGGATCACTCATTGGATGAATGCTATCCTGAGTACAAATTCAAGAG
GAACAATATCGTCCACCACCAAAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGATGTC
GTTACAACTCGACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAGAT
ATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAA
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CAAATCCATTTCCCCAAATTTAAAGTTACAAGGAGAACGTACCGGACGTT
GCGTACCATCAGATCGAAATTCATCAATGACCGTATGTGAAATTTATGGC
TGGTGTCCGACTGAAGTTGACCAACTTCCAATGCCAAATAATAATTTCAG
GATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACA
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GGAGATTCAAAATAAGAAAGTTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACTCA
GTGTTATCATTTATGTTATTGGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGG
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TCGTTACAACTCGACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAG
ATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAA
AACGATACCGCTTTTGGATGGAACGAAAGATTCGACAGTCTTGATCAAAA
ATCAAATCCATTTCCCCAAATTTAAAGTTACAAGGAGAACGTACCGGACG
TTGCGTACCATCAGATCGAAATTCATCAATGACCGTATGTGAAATTTATG
GCTGGTGTCCGACTGAAGTTGACCAACTTCCAATGCCAAATAATAATTTC
AGGATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAA
CAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTG
TAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACG
TTACGCCATCATTTACGACAAAGGTTACCAAGAAATAGATTCTGCAATCA
GTTCCACCAATACCAAAGTCAAGGGAATCACACATGTTAATTTTGGGAAT
TTCCCTTCGACCTTTTTTAATGGGAGGATGATTTATGATCCGCAAGATTA
CGTCATCAAACAAATGAATCAAAGCCGGAAGCAGATGGTGCTTGAAAAGT
CAAAGTTTCATTGCATCAATTTCCTGTTAAGTTATGAGACTGGTAAAGTT
GTGGAGATTCAAAATAAGAAAGTTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACT
CAGTGTTATCATTTATGTTATTGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839MSTRG.14839Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.1.p1.exon12MSTRG.14839.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon11MSTRG.14839.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon10MSTRG.14839.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon9MSTRG.14839.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon8MSTRG.14839.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon7MSTRG.14839.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon6MSTRG.14839.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon5MSTRG.14839.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon4MSTRG.14839.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon3MSTRG.14839.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon2MSTRG.14839.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.1.p1.exon1MSTRG.14839.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.1.p1MSTRG.14839.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000126_pilongenomesc0000126_pilon:392004..413313 -