MSTRG.1467.24.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1467.24.p1
Unique NameMSTRG.1467.24.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:560979..575949-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1467.24.p1 ID=MSTRG.1467.24.p1|Name=MSTRG.1467.24.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14971bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:560979..575949- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTGTTTTTTCTGAAAGCTAGATTTCCTAGTGTGACTAACTGACTGATG CAAGTTACCCAATCTCACGGTAGACAATAGACAGATAGAATAGATAGCCA GTTATCTGGTCTGGGAGATTGAAGAATCTCAAAAAAGATCTACTCACCAA ATAAAAAAGTCAAAAAGTTTAACCAAGGATAGATAAAGTATAATATAACC ATCAAAAAATCAAAAAATTCGTGCTGCTGATCTGGGTGTCTTGTGATGAA GTACTTGACCAACAATGAACAAGTAATAAGGGTTACTCCGCTGAACGTAT GACGCTTTTGAGTCTAGATACGCACCAAACTCTTTGACTGGACGTACGGC GTTTTTAGCCGGTCAAATTTGGAACGGGACTTAAAACTCTTCAGAAAATA CGTTACAGTTTAGTCAAAGTGCTCCTTACTGTATATACTTTCGCTTCCGA GCACTAGAGAAAAACTGTGTGGGTGTGAAAATTTCAAGGAAAAAGCAAAA TCGCCGTTTTTATTTAGTACTCTTAACTAAGCCATTAGAATTTTTGCTGA GATGACACTTTCAGTTTGTCGACTTTTGTGGCAAACCCAGTTAAAAAAAA CATGACAAATAGGAGGAGATGATTGATGAAACCTTCTCTCTGTCATGTTG CAAAGCAGACACAATTCATTTTGGAGAGGTAAGTTGTTTGTTATTGATAC GGTACAAGTACAAGGTAGTCTTATTATAGAGAGAGGGAGGATGCATCATA TTCATGTTTGTGGCTCCTGTATTTTCTGGTAGAAACACGTAGAAAATTAA ATGGTAGATTTGTTTTCAGATTCTAAGCCTTAAGTTTCCATTTAAAGCAA AAGTAAAGTCTATATCCCAATTTACCTTCTCTCACCCTCATGTTTTTAAA AAAGACCTCAACCGTAAGTTGGTCTAATGTCAACATCCCTCTTCTAATAA 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GCTTTTATATGAATATAATTATTTATACTGTATTTTATTAGAAATCTTTT TGTAAAGAAAATTTTATGACCTACCTGGAGGTCCTTTAATTTGACCGTTG TCCGTCTGTTCGTTTGTCTGTTATAAGCTTACCTCAGGATTGCCTCATTA GTTTGTTTTTATTTTTTGTACAGTGATGCAATGCCTTAAAAATGTCACGG AGCCCAATTTTTGAGAAAATAAATTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTGC CTAAAGATATGGTTTTTTGTACTTTGCGCAAAATGGCTTCATTAGCTTTA CCTGATTTTTTGCAGAAAGATCGAGTGCTAGTTGGCTTAAATGTGGGTGA AGTGGTTTTCCTCAGAAAATTTTTTTTCGTCGTAAGGCAATTACTTTTTT ATTTTCTGGTTTACGGAATCGCCGACGGTTTTTTTTGCAAAAATAAAATA AAAATAAAATTGGATTTTACAGTATTTTATTTATTTATGCTCTTCCGACC TTGTACTGAACAGCCATAAAAAGGAAACTTTATAGAAAATTACATTTTAT AAAAGCAAGAAGGGCAAGTAAAAGGGTCAGTGTCCAGTTCTTAATAACTA ATAACTTAAACACAATTTCCCTACTAAAAACGTTCTTTAATGTATGTAAG TTTTCTCAAAACATATTTTTTTTAATTTTTTACAACATTAAAGTTTGAAA AGAGCAATTTTATTTTTATTTTTTTTCCATCCTCCGGTCCAAAAGATCAT CTCCAAATGTCCGTAAACCAGAAAATAAAAAAGTAATTGCCTAATATACG GATTTTTGTTTTTTTGGGAAATTCCCTTTTAAATTTTTCCTGTTAACAAG CTTATCTCGGGATCGGCTCATTAGCTTTTTCTGACTCTTAGCACAAACAT ACAAAATGGTAATTCCAAAATGTAACAGAATCAAAAAAACGCTTTTTCTT TTTTTCGGGGGTGGGGGGAGAATTTGGGCCAAAAATGCCTAAAAATAGGG TTTTTTGGACTTTAAGTAGTTTTTTTTTTCAGGAAAATTTTTTTACCGTA AAAATCAGATTTTCTTATTTAGGGAAATTGCCTTTAGTCACTTTGAGGGG AAATGAGCATTTCTCGCGATTGGCTTGGTATATTTTTCTAATATTTTCCT TAGTGATATAAAACGGTAATATTTATATCCTGGAAATGTGATTCTCGAAA ATATAATGTTTTTCTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAGTGCCTATAAA TGGGGTATTTTGGACTTTTTGTGAACTGAAATTGCTTCATTAATTTTTTT CTGATTTTTTTTGCATAAACATAAATGGGAAAGGTTTTCAGGAAATTTTT TTCTTGCCATAAAATTCCGATTTTCTTATTTTAATGAAACAAAAATACCC TTCAGTAAATTTATGGGGAAATGAATATTTCTCGCGATTGGCTTGGTATT ATTTTCTGATTTTTAGTTAGTCTGACAATTGTTGCCATTTTTTCTATTTT TTTATTACACTATAGCCTTTAGGTAGGGATGGCTATTCAGTATGTAACTT GTTATTTTTGAAATATCTATTTCTCCTGTAATTATTTTATCTTCATTCTT ATTCTTCTCACAAAACAAATCATAAAAGTGATCGAATTCGAATTTTCGAA TCATGGAAAGAAAAATGTTACAATCTAAATTTATTGGTTTTACATTGTTT CTTTACTTTCTATGATCAAAGAAAATTAAGTTAATTTTTTTATTTGTGTA TACAAAAAAGAAAGAAACAAACAAAAGAATATTAAAAAACAAATTTGATT CAAGACCCTTCAACATTGTAATGGCAGAATTAGATAGAAAAATGGATGAA TTGAAGTTAGAAAAAAAGAATCCAATAAACCCTGTGTTGCACACCATTTT 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CATGCATGAAATAAAGATCCGAACCAAACTATTAATTCGAAATTCTTTAT AACCGAGGGGGGGGGGTGAAAGAAAAAGTATGTACTTACCAGATGGGGGT ATAGCCATTTGCGTACGCTTGTGTACAGGGGGATGGGTACTCTATTTTCG ACATTTTAGTGTGTACATATGTGGACGATACCTTTGTATGATCTTTGTAA TTACATTCATATTTTTATTTTGTTTTTGTGTAATATTCTTTTAAATGATA TTTAATACCTAAGCACTGTGTATTTGTATTTTTATACTTGAAGCTTATCT TGTTTTTCAACACATTAAAAAATGCAGTTTAATATTGATAATTTTCACTC CAAAACTCAATATTCAATCAAACTACAAATAAAGATTTTGAGCAAAAACA TTCAATTAGGACCTGCTTTTTTGACCAATCTTAAATTGATTTCTCAAACA TAATCCTCAGAATTGAGGCTCTAGCCTCTAGCTCTTTTGCTAGAGCAAAA ATAACTTACATACTTCTCAAAAGATTTTGGCCCCATATTGCGAAATTACA TTTAAAATTTGCCATACATTTGAAATTTTGAATTTAATTTACTTTCTTTT ATTTTTAAAATGTAGATATAGATTTAGAAAAACTTATAAACATCCCTGAT CAGACACAATGGAATATCAAAGATTACAACACATTCAACTCGATCAACAT TTGAACCCAATCGCCAGAGCCATTTTACAAGGAGTTAACGATGAAAACAG TCCATTTTCAAAACTCAATGGTATTCCCCATGTTCTACAAATGATTTGGC GATATATAATTACAACCATGAAGCAGCATATTAAATTTGAACCATCGTGG ATAGATTATTTAGAAGATCCAGTTGATCCAAGTATTGGTGTTTGTGGCTA CATAGAATGTGAACCTATTTCTATATCTTTTCCTGAATCTACTGATATCA ATATAAATATGATGCCCTTTATTATGGAACAAGAATTTGAAAAGACTAAA TTACCAGAATATTTGAGAAAATATTTTGAAACGTTTTTGAGCCCTCTTAT ATCAGAGTATGAGGAAATGGGAAAAGAAATTGATAAAATTTGTTATCTAA CTATACATGAGAGTTTGGTTGAAGAAGGAAAATCACAGAGGAGACCAGGG CTACACACAGAATCACCTGGTATAATTTACGTTAAAAATGGAATGAAAAG TGAGAAAATTAGAGAGCTGTGTATTGAAAAGGGTTCCGGTAGGGGTGATA CAGAAATTCCATGGGTTGTTTGTTGGGGTGGACAATACGGTATGCATGGT GAAGTTTTTACTCCTTCTGGGGGAATCTACATGGCATCTAATGTACCTAA TTCATGTGAAGTTTGGGATTGTCAAATTGTAGCGAATGATAAAGGAGAAG AAATTATTGGGAAGTTTGGAAATATTGAGCACTTGAGGGGCCTTCTGTCT GGCTCCAAGATTATGAAATCTGATAAATTGTATTGGATAACCGATCGTAC ACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACATACAGACAGTTTTTTA GGCTTGTAACACAGAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCATTCAACCAAA AACCCTAATGGTGTTGTCCCTGATCCTAAGATAACAAGAATTCTAAGAGG ATCAAAATTTGATGAAGGTTCTGTAGCCATTGTTGGCTAAAATAACTTTG GTTTCAGGGATAAATATTGATAAATAGAAAGGTAGAAGTCATTTGAAAGG ATTAAGAAACTCATCTATGATTCAAAACTATAAATTTAAGTGATATATTA TAAAGCTAACTTAAGTTATATCAAATGATCAGCTCAATCTTATATACTCG ATGGTATTCACTTTCATATGTACTTTGAATTTGCATTTCAGTTTGCAATT GACATATACTGAATTTTCCCACTTTTGCCGTTTTTCAAATAGAATACTTT ACCAAAGTGGGGTTAATCATATGCATTTTGCCTGGGTGTAAAACAGTTGA ACAAATGATAAACAAAATAGTCTAATTTGCATCATTTTATAATGATTTTA TAGTTTGAATCATTTTATAAAATTTGATTTCTTACGTTTGTATTTATTTT CATGAATTTAAATCTTTTCAATAGTTTTTACAGTGTGGTAAATTTTGCAA AATTTCATCAAAATTCTCACGAGAATAAAGTGTGCCAGCAAAAAGTAAAT GCCTTTTAGATACCTTGGCCTTTGATAGATACTTATTATTGTAAGGTGTG TCCCTTGAACCTATTTTTTACGTGTCGCACATTCTCGCAGTTTTCCTTTT ACACTGCTTAAAATTTATTTATTTTTGTAAAATTCGCCATTATAATACCA ATAATACACATGTAATTCTAAAGAGTTTAGAATGGAAGAGGAATACATAA CTTCAGCTATCATGCTTTAAATTTGGTCCAGAAGTTCAAAAGTTGTAAAG ATTTCTTTGAAGCACCGATGCGCGATTTAATAGTTTTCTTTGAACTTGAT TTTTGTTGTAAATAAGAATATTATGTATTTTATATTTCATTTAAAATTGT CTGGCTTTATTGTAAATTATTAATAGTAAGTGTATCTGGCCCATCTTCAA AAAATAGAAATTTATTTATTTTCACTTTATTTTTATACCTTGAACAGGTT TACGTAGTCAAATATAACAACATAACAATATGTTAAAAACACTAAAAGAG TATAAAAATATTAAAATACAGTAGACAGCTTGCATTGACAGTAGGTTTTG ACATCCTGGACTTCTGACATCCTCGACTTCTGAAACAAATCATTTAGTGT TCCAAGTGATCTTATTACCTTTGTGGTAATTTGCTTCATGCCGAACCTGA TCTGAAGTCAAAGGAGTTAAGGCAGACTTTATTTTTCGGAAAAGGAAGTT TATCCCTTGAACCGCACCATATTTCAAGTTTTTGGTATCATTGTCAGGAT TTTTGTGATCAATGAATTGGATTAAATGAAAAAAGTTCGTAGAAATTCGA TAGTTGACACCCCTGTTAAGTGAAATTTTTTGAAAAAGGGCTGAAAACAA CGAAAGAGAAAGTACTCTTATTGACCGTCATTTTTTTTGTTGACAGCCGT TTATTATGTATTAATGTATTAATAAAGAAACATTTAATGTTATAAATAAA TGTTTCAGACATTCAGTGAAAAACATTGAATATGTGCCTAATGTAGAATA TTTTTTGACTTGATAAAATAATTTTTTCCATTTCATCTTGAAGCACTTTT CTTGGCCTAAAGATGCATCAGTTATTATTTTATTTTTTTACATTTTAGAA AAATACTGTAGAAAAAGGGGCTAAAATAAGAAAAATAAAACATTGACATG AAACCAACTTGACACTCACTATGGATTACCCAAGATTAGAAAACCTCCAG CTTAATCCACCATTGAATCCTATTGCCAGAACCATTTTACAGGGAGTTAA CGATGAAAACAGTCCATTTTCAAAACTCAATGGTATTCCCCATGTTCTAC AAATGATTTGGCGATATTTGATAGCTACACTAAAACAGCATATTAAATTT GAACCATCATGGATAGACCTTGTTGAAGATCGAGCAGACCAAATTGAACC TGATATGACCGTCTGTGGATATATGGAATGCCCCTTTGTACAAATACACT TCCCTGCAACAGATAATGATATTAACATTAATATGATGCCTTTCATAATG TCAAAAAGCTTTGAGGAAACTAAGTTACCAGATTATTTGTTGGAATATTT TGTGGATATGTTATGTCCAATCTTTAATTTTTCTCAGGGAATGTCAGTTG 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AATAAGAGTATTTGGTTTATCTTTTGAATACACAATGATTATTATTTCCA GACTTATCATCAATTCAACCTACGTATTGTCTGAAATAATATTATAGAGA ATTATTGATTTATTCATTTGAACTTTTGATTGTATTTATTGATCACTCCA GTTTTTCATAATCAAATGTTCAAAGAATATGACCAAGATACTTTATAATT ATTAAACTAAAATACATCTTTTATGTCGTTTTAGGGCAACAATATCAACA TCAAAATAAAATAAAATATAGACTTTTGATGTTTTGTTTTCGTGGTTGTT CCATGTTTATTTGAAATTGTCGTTAAATATTTATATGGTTAATGAAAATC AAGAAATTTGGAATTGATAACATCTATGATTATGATGGAAAATCTCTCAC TTGACGATCAATCAACAATTCACCCAATTGCCAAAACCATTTTGCAAGGA ATAAAAGATGATGGCAGCCCATTCTCTAAGTTAAATGGAATACCTCATGT TTTGCAAATGATTTGGCGACATGTGCTATGGGATATGAAATTAAAAAAGT GGAAAAAGCACATTAAAGTAGGCCAGGAGTGGTTTTTTAAAGGCCGAGAT ACACCTTTAGTTAGTGGTGCAATTTATAATGGTCTTATTGAGATTGAGGA TATCGAGTTTCCAGAGCCAAAAGATATTAATATTAATATGATGCCATTTT TGATGAGTGAAGATTTTGACAGCACATGCCTTCCCGACTATCTGGAAGAT TACCATGACAAAATCTTATCTAATATTGATTATAGAGGGCAGGAAGGGGA GATTGGATATCTAACCATTCATGAGAGTTTAGTAGATGAAGGTCAGTCTC AGCGGAGACCAGGGCTTCACACTGAATCCCCTGGTATAATTTACGTCAAG AATGAAGGGAAAGCTGAAAAGGGTGATAAATGTTTTGATGAAAAGGGTGG TGGTAGTGCTGTGGTTTACCCTATGTTAGTTGAGTGGGGACGAGGTGGTT ATGACAGTGAATTGGAATTGGATGGTGGTATCTATATGGCATCAAACGTG AGTAATTCATGTGAAGTTTGGGATTGTCAAATCGTTTCTGGTGAAAACGG TGAAGAAATTATTGGCAAACATGGAGATATTGAGCATTTGCGTAGTCTTT TACCAGAATCAACCAAGTTGAAAGCAAACATGCTTTACTGGGTGACTGAC CGTACACCACACGAATCTTTACCTTTGAAGAAAGGTACTTATAGACAATT TATAAGGGTTGTTACCAAGGATGTTTCTGTTTGGTATAAAGATCATTCGA CTGAAAACCCTATGGGTATACCACCTGGTGATGCTAAAATTGTCAGAGGA TCCAAATTTGATGGTGATGTTTTGACAATAGTAGACTAAAGGGCAAAGAT GTCTGCATTTGGATAATTTATAGTCAATCTTATTGTTATATTTTGATGAT ATTTTATTAATATCAAATAAGTTGATAATTATTGTCAACAACAATTGATA TGTTTTAATTAGATGATTTATAATTTCTTCAAACTAAGTTAGTGAGTATA TTAATCAGGTGGCTATCAGCAGAGCCAGAAGTGTGAGGTCTATCCCTTTT TCAATTTGCGCTTTAGGTGGATATGAGGTGGCGTGCCTCGCCTACATTCA ACCCCCAACTTACCGCCTAGATCAGATTACCCAATTTAAGTTACTCTTTC GCTTAGTTGGCAGTGATCGGGGATCGAAGGAAGGCGAATACTCTACGACT GAGCTAACTGGCTACCCGCTATGATGATATAAAGTTGAAAAGCTTGGTAC CTTCTTGCTTCATTTGCGAATGATACTATTTTCTTTCAATGGCATTTACT GAAAGATATTCAACATTTACCTTTTAAATCGTGGTGACTTCGTTTAGACT CCTTTATTTCTAAACTATTTTGATATGATTTCATCAAGAATATATTTACC ATTATAATATTTTTATAATACATGCATAATTATTTCAATTTTAAGTTCTT CATCTTTTATAAGTCGTATACAGAGTCTACATTAAGACTGATCTTATTTA TTTTAAATACAAATTTAGAATTATTGTTACCTACACTGACCTACATTGTG TTAATATGAAGTTTGGGTACAAACAACCACTTACGTTTGTATATCCCTGG ACCAAACTATATCCGCCATCTTTGATCGGAGTTGCAATGTTAAAAATTAA CGTCTAACGGCGCTACATCATCAAAAGTATTCGAGGAAAATTAGATCCTA GCGCTCGATGCATTTTCACCGCTATCGAGTAGTGCTGCCATTAGGGTACC AATTTCCAAAAAAACTCCGATCAAAGATTTTTGGTGGGCAGGGATTGAGT AACTTGGTCCAGGGATATATGAAGGTCAGTGCAAACAACACTACTTTAAG AAGCTTGCAAGATTTTCTACAGCTTTTGGCGGAACCTTTTTGAAGTGTTC ACGCATGAATGGAGTTTTAGTTCACCTCTGTATTTTAGTGTTTTTTCCTT TGTACGTCCTAATAATAAATTTTGTATTGAATTTGTAAAAAGTTGAGTTT TGCTTGCGAACCTTTTATTTTCTAAAGATATCTCCAATCTGAAGTTTCAG TCGGCTTGTTCCTCAACCAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:560979..575949-

>MSTRG.1467.24.p1 ID=MSTRG.1467.24.p1|Name=MSTRG.1467.24.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1014bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:560979..575949- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTATGATGGAAAATCTCTCACTTGACGATCAATCAACAATTCACCC
AATTGCCAAAACCATTTTGCAAGGAATAAAAGATGATGGCAGCCCATTCT
CTAAGTTAAATGGAATACCTCATGTTTTGCAAATGATTTGGCGACATGTG
CTATGGGATATGAAATTAAAAAAGTGGAAAAAGCACATTAAAGTAGGCCA
GGAGTGGTTTTTTAAAGGCCGAGATACACCTTTAGTTAGTGGTGCAATTT
ATAATGGTCTTATTGAGATTGAGGATATCGAGTTTCCAGAGCCAAAAGAT
ATTAATATTAATATGATGCCATTTTTGATGAGTGAAGATTTTGACAGCAC
ATGCCTTCCCGACTATCTGGAAGATTACCATGACAAAATCTTATCTAATA
TTGATTATAGAGGGCAGGAAGGGGAGATTGGATATCTAACCATTCATGAG
AGTTTAGTAGATGAAGGTCAGTCTCAGCGGAGACCAGGGCTTCACACTGA
ATCCCCTGGTATAATTTACGTCAAGAATGAAGGGAAAGCTGAAAAGGGTG
ATAAATGTTTTGATGAAAAGGGTGGTGGTAGTGCTGTGGTTTACCCTATG
TTAGTTGAGTGGGGACGAGGTGGTTATGACAGTGAATTGGAATTGGATGG
TGGTATCTATATGGCATCAAACGTGAGTAATTCATGTGAAGTTTGGGATT
GTCAAATCGTTTCTGGTGAAAACGGTGAAGAAATTATTGGCAAACATGGA
GATATTGAGCATTTGCGTAGTCTTTTACCAGAATCAACCAAGTTGAAAGC
AAACATGCTTTACTGGGTGACTGACCGTACACCACACGAATCTTTACCTT
TGAAGAAAGGTACTTATAGACAATTTATAAGGGTTGTTACCAAGGATGTT
TCTGTTTGGTATAAAGATCATTCGACTGAAAACCCTATGGGTATACCACC
TGGTGATGCTAAAATTGTCAGAGGATCCAAATTTGATGGTGATGTTTTGA
CAATAGTAGACTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467MSTRG.1467Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.24.p1MSTRG.1467.24.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.24.p1.exon2MSTRG.1467.24.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.24.p1.exon1MSTRG.1467.24.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:560979..575949 -