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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000123_pilon:922011..928685- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14665.1.p1 ID=MSTRG.14665.1.p1|Name=MSTRG.14665.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6675bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:922011..928685- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TAAAGGTCTATCAAGCATAAAAAACCACCCACCTTCTATTTCAGAGATCT
TAAAATGAAAAAAAACAACTTTAAATCCCAATTAAATCAGGAGAAAATAT
CAAATACACAGTTTTGACTGCTCAAGAAATTTATATTCAGTTATATTATG
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ATACATAAACCTCTCAATTTTTTTACAGATTAAATTGGTTGGAAACTTCG
ATTGAACATTTTGGTTTATGCCAGGGAGTCTTTTTTCCATTTAAATTTCA
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GACTCTGCTCTTTTTATTAATATCACTTTAATTTTACGCATACCTAAAAT
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GTCCCCATCTAAAAGTATTCAAAAATTACATTGACCAAAATTGGCAAAAA
CACGCATTATTAAAACAATACGGTTCTAAAGATGATGGTGAAACTACTGT
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CAAAGTTGCTCTGCCAGGCTCTGCTGAGCTCACTAAAACACTAAAAACAC
TCAGAACTACACCAGTAGGACTCGTTTCCTTGGAATTCTAAGTGAAACTT
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GTGTTCAATTCGACGCTTTGTCTTGTTATTTCTAAGGTTGTCAATGGTTT
CGATCGCACCACGCAAACTTGGAAGTTTTATTCAAAATTTCCTCGAGAGG
TTTCCAAAGACATGGAGCATCCCGATCTCAAGAAAAACGGTAGAAAGAAT
CTTGAGTACGCTGCAATGTCGTTTCGCGAAGATTTTTACCTGTCATTTGA
GCCGACGCCCACTTCCGATGTTTGCAACTGTCAGGTAATAATTTTTTTGT
CGATGCTTTGACTTTATATGGCGTTTAGATAAAGACAAGAACTCTGTTCA
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ATGGGAGATGTTTACAGGAAAGCTCCTTTAAATGCTATAGTTACTATCTT
AAGTGGATAAATTTTGGCGTGGATTTAATTTGGCGATTGGCCAAAATACG
ATTTTTGGTGGGGATTTAATTTGGCGATAGATCAATTTCGTAAAATTTGG
CGGGGATTTAATTTGGCGAATTGCCGAATTTGGAAATTTTGGCGAGGATT
TAATTTGGCGAATTTAATTCCCGCCAAAATTTATCCACTTAAGGTAACAT
TTAATTATATTTTGATTTTGAAGACTTTGCGATAATAGATCTCTGCGATA
ATAAACTTTACCAAATTCCTCAAAAATCAAGAGAGTTTCTACTTACAAAA
GCTTTTATGCTTAAAGTTACTTAGGGTTCGCCCAATTTTTTAAATGTTAC
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CGTGTTATCACAACAAAGTGTAATTTTGCTGCCTTTTGTCAAAACATTGA
CCAAATTTACACGTACAGTGGGTCTCCGAAACGTTTTATTTCTCCGAAGA
CTTTTTTGAAGGTTTTTTTTGCATGGGCTAGTAATCAAGGCCGAGAATTC
CGACGGTGTTGTCCTTGGTGTGGCAGTGCTCCTAAAGTCTTGGCTTGCGA
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AGACAATTCGTGACCCTGAAAACGAATTACCAACGCAATCAAGGCGGTTT
GATCGTTGCTTTATCGCATACCCTAAAAAGGCGGGTGGTGAAACTGTCGA
GAGATACGCCGAAAAGCTGAAGAAGTACCGTGAATCCAGGGATTTCCTTA
AGAATGTCACTTCTTCAAATCCAGAAAAACTATCTGAAATCCAGATTGTT
GATAGCCAAAAGAAACTATTCGAATGTCTGCCAACCGATGCCAAATCGCT
GTTTACCATCTATTTCGAGAGTCCAAATGTCCTATCACCTTCTCAGATCG
AATCGACGAGGAAGATCTTTCATTTGCTAGCCTTTGACGCACCTCTAAGC
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TGATCCTGTTACTCCTGAGATATTTTCTGATGTTTTCCTCAAATGTGCGA
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CCGTGAAACACATGCTGGCTACCCTGACGTTCCTGAAGCTGGAAATTTTG
GAGATTACAACCCTGCGGAACGTGGCCAATTTTATTATTTTTCAGAAACT
GGTCAACAGATCAGAGAGAACAGAAATTTTTCGATCAATGGCAAATCAAG
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GTATGAACTTTAACACGTCTATTTGTGAACAATTTAATTCATACCTCCAA
TGTTTGAAAGCATCGGCTAAGCATATGAGCCAGAAACATTTTGTCTTTTA
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AGTATTGGATTTGATTTTTCTTTGGACTAGGATATTAGTTTTCTCAATTT
TTATTAGATTTATAATGTATAAACTACGTTCAACAAAATATTTCGATGTA
TATTGTTTTTCTAAAGACTGTTACT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:922011..928685- >MSTRG.14665.1.p1 ID=MSTRG.14665.1.p1|Name=MSTRG.14665.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=33372bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:922011..928685- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTACCATGGAAGAAAGATGACGATGGGAACCTCATAGTGCTACCCGATGG AAAAACGACCTTTTATACACACACCTTTTATACACACAACTGTGCAATTG ACTGCGATGTCTTTAAGTTAGTTTGTCCCGAGGAAAAGTGTGTCATTCAC TGGGACGGATCAAATGAAAACATTTTCAGGCTCTCCCAACAAGTTGCGGT GGCAGAACAACTTCTATGGGACTTTGTCAATCGTGTTATCACAACAAAGT GTAATTTTGCTGCCTTTTGTCAAAACATTGACCAAATTTACACGTACAGT GGGTCTCCGAAACGTTTTATTTCTCCGAAGACTTTTTTGAAGGTTTTTTT TGCATGGGCTAGTAATCAAGGCCGAGAATTCCGACGGTGTTGTCCTTGGT GTGGCAGTGCTCCTAAAGTCTTGGCTTGCGACGGAACAAAAGTTGGAATA CTTTGTCAAAACCTTCACATTGATCCAATTGAGACAATTCGTGACCCTGA AAACGAATTACCAACGCAATCAAGGCGGTTTGATCGTTGCTTTATCGCAT ACCCTAAAAAGGCGGGTGGTGAAACTGTCGAGAGATACGCCGAAAAGCTG AAGAAGTACCGTGAATCCAGGGATTTCCTTAAGAATGTCACTTCTTCAAA TCCAGAAAAACTATCTGAAATCCAGATTGTTGATAGCCAAAAGAAACTAT TCGAATGTCTGCCAACCGATGCCAAATCGCTGTTTACCATCTATTTCGAG AGTCCAAATGTCCTATCACCTTCTCAGATCGAATCGACGAGGAAGATCTT TCATTTGCTAGCCTTTGACGCACCTCTAAGCACTTTCCTTCCCATTAAGC TTCTGCTATCTATTGAATCTCTTCTTTCTGTTGATCCTGTTACTCCTGAG ATATTTTCTGATGTTTTCCTCAAATGTGCGAAGTTTAATCGGTTGCTTGG TTCTTTTCTTAAATCTTTTCGTCTGGGAAATAAACTTCATATTGAAGCCA ACAAGCTACTGCAGTACCTGTGTAAGCGTGTCCGTGAAACACATGCTGGC TACCCTGACGTTCCTGAAGCTGGAAATTTTGGAGATTACAACCCTGCGGA ACGTGGCCAATTTTATTATTTTTCAGAAACTGGTCAACAGATCAGAGAGA ACAGAAATTTTTCGATCAATGGCAAATCAAGATCAGGTTGTCACGATGAC CAGCCTACCACATCCAGCTGTAACAAAACGTACCCCAACAAATCAAAGAA AGGTGCTTCATTTTTATTCCTTTGGTTCTGTCCTAGTCATGGACATTGCT ATGGTGGCCACATTGTAGACGGTCCGGAGGGCAGAAAAGATCCTGCAAGC TCCTTGTTCACGTACTTGGAAAAGCCACCGGATGCATTGTTTTATGATTT TGCCTGCAGCTTTGAAGAGTATACGTTGAACAGGGAGGCGCTATTCTTCA TTCAAACTTGTTTTTACCATGATTTATTCCATGGTTTTACCCATAATTGT TCTTCACTGTACAGTGCGAAAGGTTTATTCGGTATGAACTTTAACACGTC TATTTGTGAACAATTTAATTCATACCTCCAATGTTTGAAAGCATCGGCTA AGCATATGAGCCAGAAACATTTTGTCTTTTATATCCAGTTTTTTATCGAT TTGTGGAATTACCGTAAAGAACATAATTTCCGTACCAAGCTGGCATGTGC TTTAGCTGGCTCAATTTGAGTTGTCAATGGTTTCGATCGCACCACGCAAA CTTGGAAGTTTTATTCAAAATTTCCTCGAGAGGTTTCCAAAGACATGGAG CATCCCGATCTCAAGAAAAACGGTAGAAAGAATCTTGAGTACGCTGCAAT GTCGTTTCGCGAAGATTTTTACCTGTCATTTGAGCCGACGCCCACTTCCG ATGTTTGCAACTGTCAGTTGGATGTTGACGAGGAAAGAGTTTTCAGGCAT AAACGGCCGGAAACTCAGGTTGGTACGAAGATTGACGATGGTTTGAAAGC TGCATCGTCTGAGGTCCTTCCACTTCCGGCGAGTGCTATGGACATGGAAA AATTCTCTGTACGATCTGACGAGGGTCACCAATTTGTGCATCTTTTCCGT TCGAATACGAAACAAAAAGTATTTGTTATTTGCAAATCTGGTATTTGTTC CAATAACAAGGAGGTCAAACTTCGAACTCTGGATCAAGCGAAGTTGTGTC CCCATCTAAAAGTATTCAAAAATTACATTGACCAAAATTGGCAAAAACAC GCATTATTAAAACAATACGGTTCTAAAGATGATGGTGAAACTACTGTTGA AGTTAATGAGAGCGACGACGATAACAATGCTAATAATGATGATGATGATG TAAATTCAAATCCCCCCAACCTTGCCGATGTTGTCCTAAACGATGATGAT TCGTTCAACCACTACGCCACTGTCACATTAAAATCGGAAAATTATGTGAC AAGCGTTACTTGCAGTTGTGGCGTGCAAAAAGCCCTCGAAACTGCGGCCA ACGATTCCCAATGGGATGGAATCAAGTGCTGTCATATAAGACTTCTTAAA GAAATAGTTCGTGAGAAACGGCGTACTTGCAATCAAACTCACCGGCGAAA AGTATTGGACAAGACGGCTTTGCTAGAGCATCTTGACCACCCTAATTTTG TTCAACCTGTGTATGAAAAGTTGGATGTTTACCCAAATTTTCGATACAAT ATTTTCAATCACGGGACGATCGTTTGGCGTGAACTATCACAAAACCAACA TGTTGTGGTTATGAATGATTACGACTCCGATAATATTAACGGGAACGTCA AGATTTTACTTGATTGAGGGTCTTGGTGCATCCGAACTCTGGTTTAGAAA CTTTCAAGATTATGGAACCGAACATCCAAACGACCCATATCCAACCGTTC TTGAACAGTTCAAAGGAAAAGAAGAACTTTCACTGATCGAGCAATTCCAA GTTTTATCCCATGTCCCGAATCTTCATTCTTGGGCTTCTGAATCAAAAAG TGGAACGAAAAAAAAACAACAATATTTTGCTTCAAATGGTTACTCCCCTC GAGATATCATCTTACGTGCTCTAGATGACATTCATTCTGACATGGAAGAA AAAGTCTCATCTATAACACCTATCTACTCGCTGATTTTATCCAAACAATA CCATGTCCCGAAAGTGTCTATCCACAAACAAAATGGACTAAGCATTCAAC AACATTTAAAAGGCTCACAACACTCGATAAACATTCAATCGATAAAACCA TTAAATCAGCACACGACTCTTTAAAGGAAACATTTAAAAGTTTTGCACCT GGTTTTGTATTTTATTGCCGTAGAGACATGTCTCATACAAATCGAAATAC TGATCCCAAAGATAACCAGTGTTTTGAGTCGGGTGTGTACAAAGGCTACT TTGATCAAACTGAAATGTTTGGTGAACTCATGGATCAGTATGAAATCACC AAGAAGTTTGTCATCAGGATATACACAGAGTGGGATGTTCTTGCTGTTTA TCACACTGAACGAAACAAACATAAAAAGGATGCTCTATCAAAAAATAATA AGTGACAGCATCACTGATCTCCAATCTCAGACCCCTCCACTTATACTATG TGAAAGGAAATTGCTGACTTTATCTAGTCATGTTGGGTGTACGGATGGTA TTCTGTATGCAATGCCTTTGATAGCAGAAATTAATGGTGAAAGACATTTA TACATTAGCTACCATGGAAGAAAGATGACGATGGGAACCTCATAGTGCTA CCCGATGGAAAAACGACCTTTTATACACACACCTTTTATACACACAACTG TGCAATTGACTGCGATGTCTTTAAGTTAGTTTGTCCCGAGGAAAAGTGTG TCATTCACTGGGACGGATCAAATGAAAACATTTTCAGGCTCTCCCAACAA GTTGCGGTGGCAGAACAACTTCTATGGGACTTTGTCAATCGTGTTATCAC AACAAAGTGTAATTTTGCTGCCTTTTGTCAAAACATTGACCAAATTTACA CGTACAGTGGGTCTCCGAAACGTTTTATTTCTCCGAAGACTTTTTTGAAG GTTTTTTTTGCATGGGCTAGTAATCAAGGCCGAGAATTCCGACGGTGTTG TCCTTGGTGTGGCAGTGCTCCTAAAGTCTTGGCTTGCGACGGAACAAAAG TTGGAATACTTTGTCAAAACCTTCACATTGATCCAATTGAGACAATTCGT GACCCTGAAAACGAATTACCAACGCAATCAAGGCGGTTTGATCGTTGCTT TATCGCATACCCTAAAAAGGCGGGTGGTGAAACTGTCGAGAGATACGCCG AAAAGCTGAAGAAGTACCGTGAATCCAGGGATTTCCTTAAGAATGTCACT TCTTCAAATCCAGAAAAACTATCTGAAATCCAGATTGTTGATAGCCAAAA GAAACTATTCGAATGTCTGCCAACCGATGCCAAATCGCTGTTTACCATCT ATTTCGAGAGTCCAAATGTCCTATCACCTTCTCAGATCGAATCGACGAGG AAGATCTTTCATTTGCTAGCCTTTGACGCACCTCTAAGCACTTTCCTTCC CATTAAGCTTCTGCTATCTATTGAATCTCTTCTTTCTGTTGATCCTGTTA CTCCTGAGATATTTTCTGATGTTTTCCTCAAATGTGCGAAGTTTAATCGG TTGCTTGGTTCTTTTCTTAAATCTTTTCGTCTGGGAAATAAACTTCATAT TGAAGCCAACAAGCTACTGCAGTACCTGTGTAAGCGTGTCCGTGAAACAC ATGCTGGCTACCCTGACGTTCCTGAAGCTGGAAATTTTGGAGATTACAAC CCTGCGGAACGTGGCCAATTTTATTATTTTTCAGAAACTGGTCAACAGAT CAGAGAGAACAGAAATTTTTCGATCAATGGCAAATCAAGATCAGGTTGTC ACGATGACCAGCCTACCACATCCAGCTGTAACAAAACGTACCCCAACAAA TCAAAGAAAGGTGCTTCATTTTTATTCCTTTGGTTCTGTCCTAGTCATGG ACATTGCTATGGTGGCCACATTGTAGACGGTCCGGAGGGCAGAAAAGATC CTGCAAGCTCCTTGTTCACGTACTTGGAAAAGCCACCGGATGCATTGTTT TATGATTTTGCCTGCAGCTTTGAAGAGTATACGTTGAACAGGGAGGCGCT ATTCTTCATTCAAACTTGTTTTTACCATGATTTATTCCATGGTTTTACCC ATAATTGTTCTTCACTGTACAGTGCGAAAGGTTTATTCGGTATGAACTTT AACACGTCTATTTGTGAACAATTTAATTCATACCTCCAATGTTTGAAAGC ATCGGCTAAGCATATGAGCCAGAAACATTTTGTCTTTTATATCCAGTTTT TTATCGATTTGTGGAATTACCGTAAAGAACATAATTTCCGTACCAAGCTG GCATGTGCTTTAGCTGGCTCAATTTGAGTTGTCAATGGTTTCGATCGCAC CACGCAAACTTGGAAGTTTTATTCAAAATTTCCTCGAGAGGTTTCCAAAG ACATGGAGCATCCCGATCTCAAGAAAAACGGTAGAAAGAATCTTGAGTAC GCTGCAATGTCGTTTCGCGAAGATTTTTACCTGTCATTTGAGCCGACGCC CACTTCCGATGTTTGCAACTGTCAGTTGGATGTTGACGAGGAAAGAGTTT TCAGGCATAAACGGCCGGAAACTCAGGTTGGTACGAAGATTGACGATGGT TTGAAAGCTGCATCGTCTGAGGTCCTTCCACTTCCGGCGAGTGCTATGGA CATGGAAAAATTCTCTGTACGATCTGACGAGGGTCACCAATTTGTGCATC TTTTCCGTTCGAATACGAAACAAAAAGTATTTGTTATTTGCAAATCTGGT ATTTGTTCCAATAACAAGGAGGTCAAACTTCGAACTCTGGATCAAGCGAA GTTGTGTCCCCATCTAAAAGTATTCAAAAATTACATTGACCAAAATTGGC AAAAACACGCATTATTAAAACAATACGGTTCTAAAGATGATGGTGAAACT ACTGTTGAAGTTAATGAGAGCGACGACGATAACAATGCTAATAATGATGA TGATGATGTAAATTCAAATCCCCCCAACCTTGCCGATGTTGTCCTAAACG ATGATGATTCGTTCAACCACTACGCCACTGTCACATTAAAATCGGAAAAT TATGTGACAAGCGTTACTTGCAGTTGTGGCGTGCAAAAAGCCCTCGAAAC TGCGGCCAACGATTCCCAATGGGATGGAATCAAGTGCTGTCATATAAGAC TTCTTAAAGAAATAGTTCGTGAGAAACGGCGTACTTGCAATCAAACTCAC CGGCGAAAAGTATTGGACAAGACGGCTTTGCTAGAGCATCTTGACCACCC 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ATACTATGTGAAAGGAAATTGCTGACTTTATCTAGTCATGTTGGGTGTAC GGATGGTATTCTGTATGCAATGCCTTTGATAGCAGAAATTAATGGTGAAA GACATTTATACATTAGCTACCATGGAAGAAAGATGACGATGGGAACCTCA TAGTGCTACCCGATGGAAAAACGACCTTTTATACACACACCTTTTATACA CACAACTGTGCAATTGACTGCGATGTCTTTAAGTTAGTTTGTCCCGAGGA AAAGTGTGTCATTCACTGGGACGGATCAAATGAAAACATTTTCAGGCTCT CCCAACAAGTTGCGGTGGCAGAACAACTTCTATGGGACTTTGTCAATCGT GTTATCACAACAAAGTGTAATTTTGCTGCCTTTTGTCAAAACATTGACCA AATTTACACGTACAGTGGGTCTCCGAAACGTTTTATTTCTCCGAAGACTT TTTTGAAGGTTTTTTTTGCATGGGCTAGTAATCAAGGCCGAGAATTCCGA CGGTGTTGTCCTTGGTGTGGCAGTGCTCCTAAAGTCTTGGCTTGCGACGG AACAAAAGTTGGAATACTTTGTCAAAACCTTCACATTGATCCAATTGAGA CAATTCGTGACCCTGAAAACGAATTACCAACGCAATCAAGGCGGTTTGAT CGTTGCTTTATCGCATACCCTAAAAAGGCGGGTGGTGAAACTGTCGAGAG ATACGCCGAAAAGCTGAAGAAGTACCGTGAATCCAGGGATTTCCTTAAGA ATGTCACTTCTTCAAATCCAGAAAAACTATCTGAAATCCAGATTGTTGAT AGCCAAAAGAAACTATTCGAATGTCTGCCAACCGATGCCAAATCGCTGTT TACCATCTATTTCGAGAGTCCAAATGTCCTATCACCTTCTCAGATCGAAT CGACGAGGAAGATCTTTCATTTGCTAGCCTTTGACGCACCTCTAAGCACT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000123_pilon | genome | sc0000123_pilon:922011..928685 - |
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