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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000120_pilon:284857..294718+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14436.5.p2 ID=MSTRG.14436.5.p2|Name=MSTRG.14436.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9862bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:284857..294718+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTCACTAATAATCCCTTTTTTAGATACAGTGAAAAGAAACATGAGTCG
ACATAATAAAGAAACATCATTTGTACGCAATGTCCTAGGAGATATTGATA
ACATCAGCTATACCCCAAACAGACTTTATGACAAGGATAAAACAAAGAAG
GGCAAGACCAAGGCTCCACAACGCCTACTTATAAACGTCACGTTTTACCA
ATATCCTGGGGATGGCATAATGTCGTCAAGAAACAAGGGAATCAAAGAGG
CGGTTCTTAAAGTTATTTGCACTGGTACCGCCATTCAGTTGTTTACTGAT
ATGAATGAAGGCCAAGTGAAATCTAAATTAATTGAACATCTAGCCAGAGA
AAAACAGACAGAACTAGACAGCAACAAAATAAAACTAATTTATATGAAGA
GAAAAGGAAGAGGACAAGCAAACAAAGAACTCGTACCCATTTCTTCTGAT
CCTGGAGTTGTTTACGATGGGGTGGCAATCAAAGATATTTTTTCTGGAGC
ATCGGCCAAAAACCTGGTTGTTTTACTTGGTAGCAAAGTAATTTTTCACG
ATGATGACCAAACAACAACATCTACTCCCAGGGTCAGGTCAAATCGCATT
GAGATAAATTCAGATTCGGATTCAAATGATTCAGATGCCTTACCTACTCC
ATTCATAGGCACCACTTTTAGGACAGGTCAAACTGCGTCAAGTTCAAGTA
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AAAGCTGCTAAGAAGGTTTTCTTCATTCATTTTAAAATTAGATGACTGAA
ATTCAATCCAGACTAAAAGATTTTTAGGCACTTTGAACTATATTATAATG
ATGCAATAGCTACAGAGGAGCATGGGTTCATTTATAACTTTTGTATATTG
CTCTTATTTGAATGatcttttacttttcaaattgtgtttttagctcttaa
cttcaaaattttcctCCTCCAGCCAAACCATGGTCGGGTGCTGTGTCACT
AATTTGCATCTTTTTTAGGTTGTAGATGTTGATAATTCCGATTCTATTCC
ATCATTGGAGCTTGACCAACTTGATGAATTATCAAAAAATGGTAGGCTAT
Ttaaagttcttaaaaaataataggggtgttgtattttttttaagaaaaga
atTCTTCTGCTTGTCTGTATGGCACCTGATAGCACATCATGAGGGTATTA
TTTCCTACTCCCTGATTTCTGGTTCAACACTGGGGTGGTTTTTTGTAGAA
GTGTGGTGAATAATTTATTTCATGAGGTTGAGAATTTCTTTCGATTtcgt
gatttcaaattattgccTCCTTTACAGCGATTTACAACTACCATTTGATa
gatttctttcacttttttattgtttttacagTTTATGGTACAATTGACCC
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ATCTGGCATCTTTCTTGGAAGCCTTGAACCTATCCATTGAAAAAGACGGT
CATAATGCAAGCAAGCTTGAACTTTCTTTGGCCCAGGTTAGTTTATGTTT
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ATTGACCCATGTGGTAGTAAAGTATAGCAAAAAGGGGTAGTAATGCATTC
AAACTTTCTTTGAGATCCACCCACCCAAATATGTCCCTGTGCTACAAATT
CCAGTTTGTGCTCtttttttAACGGAAAAACAGTATCccttaaaaaatac
attttaagaGATTtgatttctcaaatattttgtctcaaagctattttata
aaaaacagcAGTAAACGTAAAAAATTTTATAGCTCAATTTAATTTAGAAT
ATGATGGTGTTTGgggaagaaagagaaaaaataaagaaatacagAAACTA
GTATCCACTGCTTTAAGTATTATTTTTAGGTGATGAtattgtttgaaaat
gacaaaCTTAGTGATTGCTGGATGATGGCTTTGTCCGAACTAGCTGCTTT
ATTACACCTTAAAGAAAATAGTGCTAGTGTTGGAGATGTACTCAAAATAT
TGATGAAAGAATTGTGTAATCTTGATAGTGAGGTGTGTACTATTTCTTGG
CATCTTTATTTTTGAATGATAACATTACTTTAatggaaaaaactttcgcg
aggattaaatttcgcggtatAGCTCATCCGCAAAGTTTTAAGGGGAATTA
ATTTGCAGATGACACTATTGGGACGCaacattttcacaattttgtgctTT
TACTGCCAAATTTTGCATATTGACTTGTTGAAATTCGCATTATTAAGGcc
tctttgatgccagtaaacattttaaaagtagTTATTTAACGTTTTCGgag
tttttccaaatttggaaCACTGCACTGGGACTTAAtttgcggatgacacc
caaatccgtgaaatctgcgaaatttaatcccattaaagtatcatGACTGC
CTTGTTAAAGCAAAAGTTTAAACCCCATGATAATTTTCCGTCAAAAAGCT
TCATTAATATTTGATCAAAGTAAGTCAGACCAGTACAGACAGCTAGAGAA
ACGTTAATTAGAGTACAGTTTTGTAATATcactttttattaaaatttaga
cATGGAAAGAATTTTTCATCATCCCCTGCTTATCATCTGAACTTATAACA
GATTACCGTGGAGAAAATGGCTCTGAACAAATTTCTACCAGAAGTAAGGG
ATAATTGTTGGTTATCTTTGTTACTCATCCCATCCATGTTACTCATATTT
GGAAAATtcttgcgtacgtactatatggacgaccccttatgtgaaaataa
atttcagtcATGATATAAGCATCACTGCACTTCTGTCTTTTTATTAGTTG
TAAGTGACTTACTCTTGGTAAGCTAATTGTGGGAGAGGGTCTAATAGCAG
GGTGTGGtcattaattttatttatttattctagGGCATCTCGAATCAAAA
CAGGTTGTACATAAAGATGCAAACTGTTCACAAGCTGTTCCATTCTCATC
ATTTGGGTGCTAATAGCCAGGAGGGGTGGTATTTCAAGTAAAATTTGTAA
ATGCTTTTTGGCTGGAAAAAAGGATGGTGTTCCCTACAATTAGCTTGCCA
AGAGTAACATCATCAGTCACCAATTGCAACCAAACGGTTTTTGGGTCTGT
GATGAAATGTCAAAAGGCATTGAAGTAATGCACATTATGATCTGAATGTG
TTTTGGGAGCCAaatacttttatttacttttcagaCCCTGAAACCATCAA
TTTTGAAGATAACGAAGAAGGTAACTTGAAGGATATGCTTAACAGTTTCA
TTCAAAGGAAAGAAAGCAAATTTCCATATGACGATGACAAATTCGACATT
TCTGagggtaacttttttatttgaaatttaattttcgaatatttctatTA
ATTGCTGTGTGGTGAGCAGAGGGAACATTAAAGGATCTCTGGCTCTAAAA
TATCTAGTTCCCCTGAAATGTTTTTGCCAATGTGCTTTATTTATTCtgtt
caggggggggggtacagccgcagggtactaacccatagggtactaacctg
atttttaagaaaaaccccctttttagtaccgggtacttactttttcttaa
ggaaaaagggacccccaccccccttttagtaccgggtacttacttttttt
taaggaaaaggggacccccaccccctttttagtaccgggtaccgGCTTTA
AAATTACCAAGGAAAATAGGAGACACCACCCTTAAAACTTGCCAAGCATG
GTCCCAATCTTTCAAAAGCCAGCAAAAGCAGCTCTTTGTTGTTATTATGA
CTTGTATATACCATGTTTTTAACTCAGATCCtcttaaaagttctttaaat
caaacacaacttttaattacaaaggtaaaacaaggaaattccttggcaaa
agtaaaatattatatagctgTAATAACGGCAATAAAAGTATATATCTATC
AGAAGAAGTAAAAAtcaagttgataaaaattgaagaatagtATGAAAGCT
TGGATTGGAtggatttccttatttttttcttcaaaagattggtaatttat
tcaaattattcaaaactgtatcaatcttatgaaagaagttgaaatagAAA
AAGTTGCATTGTTGGCTCTGGTTGGCTTTGCTTAGTTGACCTGCCTCCGT
CTTAATTGTCataaacagacaaacaaacaaacaaacaaatataaacagaa
ataagctatagggtataatataaactgcaataaactaaaataaactaacC
CCTCTAACAAAAACCAGGCTGTAAGAATCATCAGTTTGGataagaatttt
attgtttaaaagacaGATTGTATCACTTTGGATGCAACAGCTTGTAATTC
TTTTCATCAGAAGGCAATGAGAAACATATACCTCGTTCTAACTTGAGATG
TCAAAGCCGAACTATCCTTCTCACTAATTAAAACAATACTGATTTTGAAC
AATAGCTTTCTTTACATTAGCTATTTCAATATTTGTATAACTTAGTGGTC
ATAAAATTCTCCTCTTAGAAAGTAGGGAAAGTACCcatgaatttgaataa
aataattcTttattGATAGAAACATAACagttcttttttctgaaaactat
tGAAACTAACAACCTCCAAACTTCCCTACATACTTGATAAGCAGGGAAAG
TACCTTCAATTGGAAGGGGGAACTTTTCAATACTGTCAGATACTGTCAGC
CATAACAAGGAAatcttttctcatcaaaatcctgaaagttgaagacaaaa
aattaaacaaatgtaCCATATTCAGGGCCTGagtacttgaagaaaaattg
aaatgatacccaccccaccctaaaattggtaccgggtactaacttaaaAT
TGGAGATATACCCACCCCCACCCCAAAATTAGTActgggtactaactttt
ttgaatttccaaattagacaccaccactcggctatgggttagtaccctgc
ggctgtacccccccccctgttctgTTGGGATTTAGGTAATTTTCTAGTTG
GTGAGCTGGTACCAAATTATGGCAACTGAACATTTTTAGTTAACTGTTGG
CTTTTTAGATCCTGAAAATGGTAAGGACCTTTACCATTTTCAGGATCTAA
AAAGCCAACAGTTAACTAAAAATGTTCAGGCAAGCAAAGCGAAAATAATT
AGTACtattatttgttttattgtcaaaatgctgacaaaatgatgaaattt
cttccaaaaatattggcaaaatatttaaatttaattatCGTTAGtcatac
tgcaagtgatgcCTGCGGTATAAAAGAATGTGAACATATGACAGGTGTTA
TATGTATTATACCTATTATATATCatcaaagtcattataaaataccccgg
tctggaagtcttttgtttttttctattgcTAACAGTTAGAGCTTTCGTAT
GTAAATCGatttgttttgcatactttttgatcatgtgactagaaaataaa
ccaatcccaagagtctaaaatggtaacgtgatcaaaaagtatgcaaatcg
caacttgctttttatttacaacaaaagaaaatttgacaataaagctaaaa
caatacattaccagaccagggttttttgtAATGACTATAATATCATCACT
CTCACATTacattttactttcaaaaagaTACTTTTGATCTATGTTATGTA
tttttcggtagccggtaattttttaattCCTCAACTTGAATTTACTACTC
CCCAACTCATGACTAGAATAGTTTTCAAACCCATTTTGTAGGTGAGAGCG
TCTACACGCGAAAATTCTACCAGCGACTTCCAGAACTACTCttcatggaa
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tatttttatgtttaatattttGAGACCCAACTGGATCGAAAGCTGTGAgc
aaatttcgaaaaacttcCAGAATTCTATGTTTAATATCCCTTCCGATTCT
TGTTATTGTTAAAAGAGCCTTTTCATAACCATGGTGCCGAAATTCCAGAA
GAAATGTTAAACTTTAATATCAATTTCACATTCTCTCTTTCcagaatcaa
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CCAAAccttcaacaaaaacaaatacaaTCTTGCTGCTGTAGttgcatttt
caaagaaaaacaaatattttgttgCCATTCGTCATCGAAGTCAGAAGTCT
GTGTAAGTGAATCTTGCTTGTTTTAAAGCCTTTCTTTCTATGTGAAACCA
ATTTTTGCATTGCGAGGTTTGTAAATTTCGGTTTTTTGACAGAAAAACTT
GTGGTGGACAGCTTTTTGCAGAAATTCCTTTTCTCtttcaagtattttca
ataaaaacaacaactaTAAAAGTCGCACCTCGTAGTTGCTTGTTGAAATG
GAACAGTTTGACTGGTCGGTATAATACTAACCGCACACGtgaccaaactg
aaaatttgcaCACCATCTTAGATGGTCGATATCTATCACTTGtggaaatt
tcaagtcaaatgCTTAAATAGTTCCTGAGTTCCGGCAAGGGCTGatgtgt
attttacaaaccGGTCTTcaaagtaccaaatactcatAGGACCAAAGTTG
ACAAATCAGTCTTTAGAAataaatttcagtcaaatcaaaTGATCCAATCG
GTCAATACgtgattttagccaaatttacattctggtctgtaaaataccaa
tcaGACAGGTGGCCGaataaaaattttgcaaatcatcTCCAGTTATCGAT
ATCTGTCACTTGTCAAAATTTAAGgtcatagcacttgtcaatgTTGAGAT
TTTAAGGAAGCAGcccccccTAAGAGTTAATGAACTACCTTGAATATTTA
ACTTCTTTTCAATTTGATagctgaatgaaaattgattttattttttcata
ttaaTCTAGCAAAGTCTATGCAAATGGATGTATCTATTTTACGAAGGTTT
CTCTTGAAACGTTTGCGAAGGAAAACCTCCAGCATTGTCGAAAAGGTATG
ATTCTTCTTTTaggataaaagatttttttgtccGATATTGTACtgacata
tattttttttaaacactgtTAATCCTCTTTCATTTCGTACCAAAACCTGA
GATGAAATCAAGATGAACCAAGTAAAATAGTAGCATTCCACGATAAAGGT
CGGATTATGGAAATTACCAGCTAGCATTAATAGATATTTTAACTATATTT
TATAATAGGAAATATACATTGATTTTCTTTCAGTGTTTGCTATGTACTCT
GGTTCAACTGGGACTGATATGAATTTAAACACTTTGGTTGATGAGCCAAG
TATTGATTCTATTgaaatgtttggaaaatttttatttgaaaggtgATTCT
TTCTTTTCAGTAGCGTAGCTATTATTCGAAAATCTgttcaaatattttat
tatatcTTTCATCATATTTTTGCCATAATTCTCTCTTTTATTAGGTTTTA
CTAACTGAATATGCCCACAAACAAATCAATATATCACTGTAAAATCTCCT
GCCAAAGTAAAGTAGTACTTAGGGAAAGGAACTTTCGAAATTCGCGAAGT
TATTTCcgcgaaaaaaatattttatctctAATTTTACTTTTggtaatgaa
attttctttaaatcgactgaaggcccaaccgcgaaatttaatccccacga
aagtttatcccattaaagtaaaggATTTGCACAGTATGCCGACgtatttg
tattttcttttaggTTGTCAACAAAACAGGCCATTCAAGTTAGTGAAAAA
TCGGTGGGTTAAGTATTTGATTTACATGATTTAGATTATTTACAAAGGTT
TTGTTTGAGCCTAAAATACTCAATTTCGGGGATTTTGCGCAGTCAAAGTT
GATTGTTTATAACATGCCTCGAAATTTCGTATAAATGATGCTTGAGTTTT
CTCAAGATTTGTGTTCATTCATTGCATATTCGTAAAAAGGAACGTGtagt
ttcaaatcatttttgCCTCTTTAGAGTACACAGAAGAGTCGCAACAATTC
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AGAAACAGGTGGAAAGAGACCTTAACCGCGAAAACGAAAATGACACGATA
AGTTCAAGAAATAAGGACCCAGCAGGGTCAATGTACCATGAAGCGGTAAA
CGGGGAATACCGTACAACAACTTTCATTCTCACCAtgtttttcaaaactt
aaagttACCTTAGTCAGTTTTAATATCAATCGCTTCCATATATTATTTCA
CTTTTAGAATTCGAAgaaatcaactcaaaattaAAGTCCCGTCTCTCACT
TATTGAAGGCCAACGTGAGCTCAAGGCATCAATCTTCACATGGGCAAGAC
ATATATTGATGCAGAATCTAAAACGTCAAAACGATGTAGGTTCTATGTCG
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AACCGGAAAAACAATGGTTGCCAGATGTATGGCTGGTAAGTTAAACTTTA
TCAGAACTATATGACTCAAAACTTATACTCTCCTTCATATTTCCCTAATT
TTTTCTGAGAAATATAGATAAAGTTAGGAAGGGAAGAATCCTCAAAATTA
CTTATTTTTCCTATATTTTGGTGAATAATACGATGATTAGATTGTTGCAT
CTCTTTTAGATCCAAATTGATTCCTGAAACAGTTAGTTTAGAAAGTATAC
TTTTGTCCAGCcgtttaaaatttattatttgtttATATCAGGAATCTTGT
ATGATATTGGTTTGTTAGAATCACCGGACATCGTTGAAGTCCAAAAGGAA
GAGATTGTCTCGGGTTTTGTCTCGAGCACGTCAAACAAGTGTCTCGAAGT
GATCAAGTCCGCGTATGGGAAGGTGATGTTTATTGACGAGGCTTACCAAC
TATGCCCTAAGAAGTCAATGCAAAATCATGGTGCAGAGGCTCTGGAAACT
ATTATGAGGTATATGCATCCCTCAATATCAGCTGATATTGTCAACCCGGT
GTTCATTTTTGCCGGGTATCCAGCAGACATGACTAAGTTCCTTACCTCTA
TCAATAGAGGAATGAGTAGAAGGATTAAAGAGCGATTCGAGTTTCTTGAC
TATACGCCAGACGAATTAGCCAATATTACACTACACAAGATGTTGCGCCA
AAGATTGAGCATCCCTTATGGGATAGAAAAAACCCTCGCCGAAGGATTTT
CTGTCATCCCTTCTTCTATTAGAGCAGAGCACAACGGTTCATTGTGCCAA
GATATGTACAGGGAGGTCGTGGTCTGTCAAGAGTCTAGACTCAAATTCAA
CGCCTCAATTGACGAATTGAAATCTTACACAAAGGAAGACTTTGAGAAAG
GAGTTTATGCAAtgttaaagaaatttcaaaggaTCGAGGAAGCCTCTCAA
CGCATGTCAGTCGTCGAGTACTTTAACTCGACGGAGATTGGTGATGGTTT
TAATTTAGCGCTACAGAAATTGTCCGATAAACATAAGCAAAAAATCAATG
AAGGAGATGTCTGGCTCCATATTCCAGGTGTTGGAATGATACCAGGCTCA
CCTGTTACGCCTAAGAAGGAATGAAAAACACATTACGTTTAtgacttttg
tttattttatccaTTTACACGTCCACttttttttGAACTTAATTTTTGAA
CGTGACATCCATGAATTTATTTCTTTACGCATATAAACCTCACAATATAC
ATGAAACCATATGCTGGTTCGGTTTTTCAAAACCGCAATCCCAGTAATaa
aaagggcaaaagaaaaaagaaataaaattggagCACTTATTCGATTTTGT
AGTGCAATTAAGGCTTTTACTTCTTAAGCATATTTCGCATGAATCGAGTA
GCATAACATCAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:284857..294718+ >MSTRG.14436.5.p2 ID=MSTRG.14436.5.p2|Name=MSTRG.14436.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1920bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:284857..294718+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAGAATCTAAAACGTCAAAACGATGTAGGTTCTATGTCGAAACCAGA
AATCATTTCCAATCTACATATGATTTTAAGTGGCAACCCAGGAACCGGAA
AAACAATGGTTGCCAGATGTATGGCTGGAATCTTGTATGATATTGGTTTG
TTAGAATCACCGGACATCGTTGAAGTCCAAAAGGAAGAGATTGTCTCGGG
TTTTGTCTCGAGCACGTCAAACAAGTGTCTCGAAGTGATCAAGTCCGCGT
ATGGGAAGGTGATGTTTATTGACGAGGCTTACCAACTATGCCCTAAGAAG
TCAATGCAAAATCATGGTGCAGAGGCTCTGGAAACTATTATGAGGTATAT
GCATCCCTCAATATCAGCTGATATTGTCAACCCGGTGTTCATTTTTGCCG
GGTATCCAGCAGACATGACTAAGTTCCTTACCTCTATCAATAGAGGAATG
AGTAGAAGGATTAAAGAGCGATTCGAGTTTCTTGACTATACGCCAGACGA
ATTAGCCAATATTACACTACACAAGATGTTGCGCCAAAGATTGAGCATCC
CTTATGGGATAGAAAAAACCCTCGCCGAAGGATTTTCTGTCATCCCTTCT
TCTATTAGAGCAGAGCACAACGGTTCATTGTGCCAAGATATGTACAGGGA
GGTCGTGGTCTGTCAAGAGTCTAGACTCAAATTCAACGCCTCAATTGACG
AATTGAAATCTTACACAAAGGAAGACTTTGAGAAAGGAGTTTATGCAAtg
ttaaagaaatttcaaaggaTCGAGGAAGCCTCTCAACGCATGTCAGTCGT
CGAGTACTTTAACTCGACGGAGATTGGTGATGGTTTTAATTTAGCGCTAC
AGAAATTGTCCGATAAACATAAGCAAAAAATCAATGAAGGAGATGTCTGG
CTCCATATTCCAGGTGTTGGAATGATACCAGGCTCACCTGTTACGCCTAA
GAAGGAATGAATGCAGAATCTAAAACGTCAAAACGATGTAGGTTCTATGT
CGAAACCAGAAATCATTTCCAATCTACATATGATTTTAAGTGGCAACCCA
GGAACCGGAAAAACAATGGTTGCCAGATGTATGGCTGGAATCTTGTATGA
TATTGGTTTGTTAGAATCACCGGACATCGTTGAAGTCCAAAAGGAAGAGA
TTGTCTCGGGTTTTGTCTCGAGCACGTCAAACAAGTGTCTCGAAGTGATC
AAGTCCGCGTATGGGAAGGTGATGTTTATTGACGAGGCTTACCAACTATG
CCCTAAGAAGTCAATGCAAAATCATGGTGCAGAGGCTCTGGAAACTATTA
TGAGGTATATGCATCCCTCAATATCAGCTGATATTGTCAACCCGGTGTTC
ATTTTTGCCGGGTATCCAGCAGACATGACTAAGTTCCTTACCTCTATCAA
TAGAGGAATGAGTAGAAGGATTAAAGAGCGATTCGAGTTTCTTGACTATA
CGCCAGACGAATTAGCCAATATTACACTACACAAGATGTTGCGCCAAAGA
TTGAGCATCCCTTATGGGATAGAAAAAACCCTCGCCGAAGGATTTTCTGT
CATCCCTTCTTCTATTAGAGCAGAGCACAACGGTTCATTGTGCCAAGATA
TGTACAGGGAGGTCGTGGTCTGTCAAGAGTCTAGACTCAAATTCAACGCC
TCAATTGACGAATTGAAATCTTACACAAAGGAAGACTTTGAGAAAGGAGT
TTATGCAAtgttaaagaaatttcaaaggaTCGAGGAAGCCTCTCAACGCA
TGTCAGTCGTCGAGTACTTTAACTCGACGGAGATTGGTGATGGTTTTAAT
TTAGCGCTACAGAAATTGTCCGATAAACATAAGCAAAAAATCAATGAAGG
AGATGTCTGGCTCCATATTCCAGGTGTTGGAATGATACCAGGCTCACCTG
TTACGCCTAAGAAGGAATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000120_pilon | genome | sc0000120_pilon:284857..294718 + |
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