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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:3057350..3079221+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1415.1.p1 ID=MSTRG.1415.1.p1|Name=MSTRG.1415.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21872bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3057350..3079221+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gtccattttgtATTTTGGGGAAACAATAGGTATAATATCAAAATGAGAAA
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ATTATCACTAACTTTCGATAAATAAAAGCAGTTTAATTATTTCATATGCA
TTACCTTCATGATTAACATGTCAGTGTTTCCATGCAAAGCTGGATACGAT
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ATTTCTGTAGGGAACTAGTTTACAATCTAAATATTGAATAATCGAAGATT
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AATTCATATATCCCCAGAAAATTTATACAAAGCAAATTTAAAAGACAACC
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TCTTGTGTCGACAAATATCCCATGAAGACTCAGGCTTTTCGATAGGAGGA
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TCTAAGGTTTTAAGATCAGTTCAGCCTACAGATTATTTCAAGGGGTTcca
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ACtgacaaaatcacaaaatgttttctttttagaagTTTACAGAtacatgt
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TCAATATGGGGAGGAAAAAATACTTCAAGAAATTACACAATATTCTTGAA
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attttcaataaaaaaatgtaattaactgaaattttcaaaaacccaTGATG
TTGAGAGAACACATTGCGaaaaaaaaCTGATGATGAAGACCTCGGTGAAC
AGTAGCATTAAACGATCATCCcccaacttcaaaaaaacttcacagAAATT
GTCGCGTAGAAAgacttgaaaagaaaattaaatttcagaaagacagaaaa
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CTCACAGGTCACAAGAGAGAAATACCGCACTAATATTTAACATGAGTTTT
AAGATTTCCTTATTAATTTCTgatgctaaaattttcaaaattttaaattt
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CTTGAAAATCTGTAGGTGTTACTTTAAAGTAATACTACAGCTAAGCTCGC
TGACGGTACAAAGCTTATCGTGTTGAAGGGGAAGTGTAACGACTTTTACG
CATTTCATAATAAtgtgagaaaatttaaaatggaaCAAAATGTTAGTAGT
GTTTCTAGCACGAATAAGTACAAACCTAATTTCAAATaccttcaattttt
tgatttgacaAATTGAGGTTCCTACGAATTTTTCAcactttaaaatttaa
aataaacttaaaacacgaaatttttcacttaagtGATTAAGCAAAACAAT
TATACAGTCGATCTGTTCTAAAGATAgaaactcaaaaataatttcgaaaT
ATTAGGTTAAGCGACCATTTATGGTGATTTAACCTTCAGATAATGTAATG
AATTTcagagaaagaagaaagatattcGAGCTATTTGACTCTATATGGGC
CCCTATATGGTCCTTTTATGTGTAAAATTCGCCCGAAGGTGTCATATCCA
GAGCACTTTCTCTTGCGGGAAGACTAGTATGGATCCTAAGGGAGGCCACA
TAGGGAGATGTTTTTTAAACACccccatatacaaaaaaatatttttaata
tgtagacttttttcaaataaaattCACTAAATGCATCATGTACAAGAGTA
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GGAACCAATTAAATTTAGCCCCTGTTGTTGTTACGCTTTCCGTGATTTTC
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ACTAACCATTATTTTTAGCTATTTCAAAAGGCATTTCTAAGGCTCTTGGT
TCTAATATTCCTGCCGAAATTGCGAccctgttcttataaaaatgtaatgA
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ACATCCAATAAAATTTCCAGATACAAATCGATTACTTTTAATTCAATAAA
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AATAAAGAAGTATTCGTTGCGGACGTAGAAGGTCTACATATGATAATGAG
CCACTGCTACCTCAAATATATTCCTTATATGGTAATAACTAACCCTCCCT
CATAATTGTTTTTATACTTTGATAAAATAATGCACTTATCTATTTATTTT
AAGAACTAGTAAATTTTTACTGGGgtttggctgttcttatttttagcacT
TTAAGactaaattgttcttatcctgttccaCGTCGAAATTGACGATCTTG
TGCCCATTTTTTACTTCTTTATCACTTAAACTGCTTGattcttaaattat
tcttatttttaagcCTCACTGTTGTTAtagaatttttcttataaaaaaag
agtttacTACTCATAAACATTGAAATGaaataacaatttcaaaaaaatat
atatagtaaGATAGTGATCAGTTAAATTCACGTACATTAAACCCCAACCT
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AGGATTAACTTCATTTCCAGAGACAGTTTACAATGAAACTTTGACGGGAT
TAAAattcagcaatatttttttgattacaCATATTTCTATTcatattgtt
tttttctctgttagtacgaaaaaaaaattgaatatttctaattccaattg
tatttttttttgaattttttgattgtttgtttgaaaagaGTCGAACCTTT
GATAAGCGCCTGTACTTAATTCTCGAgccgaaaaactgaaaaatttgaat
attttacataaaaattcgagaaataaCTTTCAGTGCCCCTTCTTGAGAAA
ACTTCTGTTATCTTTCTTCCTTCAATGCCAGCTCACaaaaaagcaaatct
caaaaaaCATAATTCCCCTAAAGCTTTGGTCTaagaaagcaagaaaaagg
AGGACTTTCAAAGTCTATCCGATTTTTGAAGAGGGTTTAGATATGTTTAA
CTTGTAAGCTTAAGTCAGATCTTTAGGTTTAAACGATTCTAAGTATGACT
TTGTTGAGTAGGATTTGTCAAAATTGGAAAGACTCATCGGTTGATTCATG
TTTTCTCTCAATTATCAAAAAAGTATCGATTACTAATTTCTGTTGACTTT
AGAAGTTAAAGTTACAGTTTAATATGTATTATCTCATAAACACTTTTTCT
GCTTAAAGAGTCTTTTTAAACCGATATAAGAATTTGACAAACTATGCTTG
TTGCTGACTTTAGGTTGTTTCACTTTTATGAAAAGTAGGGGTTCGATATG
AATGGATTGGTACTGTcgagttttttattttgatggatttttattttttt
acataaattagaattataaaattgtttttaaatcgAGCAACAAGAGAATT
CAGAGTGAACTCGCTTAATAATGGCTTCTTATCGGAACCTGAGttttttt
attagagtcgttgaaaattttgtcttaacttattttgaatttatttttag
ttttttttcacaatttctaatttttgattatttcaatgatttaataaaat
tttcaacgCTGCCTTGAAAACAGTTTTAGCATTTGTTTGGTAGCGAAAAT
ACCATAATATTTCCAATTAGAAACAATTTCTCAACAATTGATTActataa
ttttaaaattatatcaaaacCTTTTCAACTTGTTGAGATTAAATTTCAGT
AaggttttgaaataccaaattttcttttttttttagtagGGACTAAAACT
TGTCAAGATAATTCTATGATTATTTTATTTCCGATGTGGGCTAAAAGGGC
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CTTGTACTTGAGGTggattaaaaaaatcttgaattggcaaagaacatatt
tttgtaGTAAATGGTTGCCAGAAAAAGAAACCGTTTCGtttttttGTCAT
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GTTAAGACAAGTTTTTATGTCAACATTGCATCAAAATAAATCCCACTACT
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TTTTCgatgatttctttttaaatgaaaattccGTTAATTGGGCTAAAGTA
GCTCAAAAATGCCGAAAAATAGCGacaaagatatttttcattattttatg
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ATTGggataaattagaaaattttgaaaatttagaagtTCAGgggcataca
cgttttttttttataagaacgttaaaaattttcgaagccttcggatgttc
ttagttttttggatttgaagcctaaaaatgttcttaaaatgttcttattt
tcagtattttttgagcattttgatgtgatttcttaagaaaatgcatcttt
ttaagtctccaaagccttagaatgttcttagaatgctcttaaatttttgg
gcctcgaagccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaaaaaacgt
gtatgacttattaaaggtttttataagaacatcaaaaggtTGAAACCTTC
GGACATTCTCAGTTTTTCAAGGcctctaaattttcaaaaagtgttctTGT
TTTCAGATTGCGTCAtttttttGGTCTAACTTCCAAAGAAATTGCGTGTT
TTAGAGTCTGAAAAGGTTTAGGATTTTCTTGGAATGTTCTAAATGTTTTA
TCCTTGAAGCCTTATGTCcttttagacttttttcttGTATAAAAATACGT
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GGAACTATGAAGGAAAACCAGAAGGCCCAAAATGTTACATACTCGTCGgc
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agaataaaatgTCAGTGATTCCAATAGCCTTCACTTAAGGAGACAGTATA
TTTcaaatacgtcactttttgAACGGTTAGGAAACTACGTGAAAAATCCA
TTACCAATTTCAtgaattgaaatgtttttgttttcttaggaTCTGCTAAA
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caaaaaaggcAGATAAATTTTCAACACGGTTTTATTAATTAGATTTTCAA
GGAATTATGTAccctaaaataaacaaaaaatacccaGAAAATTACAAGGG
AACAATTTgtcaatattttataaaatttcaagTAGTGTAACTACAAAGGG
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CATTATGGAGATAATAATTTATCTCCATACTACGGCCGTTACAGTATTGT
TTTTCCATTGTTCATCGAACACAATGAGCAGATTGTAAGGAGGTTCCCTA
ACGTTGAATACGATAACAAAAGGAAAAAGAatttctctctttctctctaG
CCCAAGAAACTGAGAGAGAAACATAACTATTTAAGACGAAAATCGTTGAA
TTGATTAGATTTCAAGACTCGGTTAACGCGGATAAGACCTACAGGTAAGC
GCTTTAAAACCAATGtttctattttctttcaaatgtcATCGAGAATAAGA
AGGTGTATTTAGAGGGTTGTGTCCTCTTAAATGTGAAACTGATTAGAAGT
AAAAACTACTTCTTATGCTAAATCTTTAACCAGTTAGATCTTCCCCAAGA
CAAATAACCCAACCCCTTTTTAGTTTAAGTATTTTAACCCTGGATTTTCA
TTTCTGAGTATAAAAATTATCTTGATAATCAATGATTAGAAGTATGTTTG
TTAGTTTAAGTAAACTCGTAAGATTTCTCCTAAACTCTTACTTAAGTCTA
AGAGATGTCTGATTTATTCCTTAAGTAAGATTATATTAACGCTAGTCATA
AATCCATATTGTAGAAAATCCATATCTTTAGCTTTGAAATAGAAATCTTA
TTTAAGGTATTAGTTTAATGAGCTACAAGTTAGAGCGATCGTGTCCATAG
GCGAAGCGAGattaccctgcaaaatttatgtgGGAGTGCAGACATTTAGG
Acacattatcttttgataaaacaaagacaataattacagtgtcgtaaaaa
ccgttCTCATCCATAAactttgcagggtatctcgctacgcctatgcttAA
AAGGATGTCATAGAATCGAATACTGTAGTAATGATTGAAAAGTCTGAAGT
GTAGTTTATATTGGTATAACACTGTGGaactttttctaaaagattCCCAT
TCATACATTTAAACGAAAAAGCATAAAAATTTCCGGAGAGGGCAAAATCC
CGGGGCAATTGGGAAAAATTCCTTGGGACAATTTCCCTagaatctttaaa
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AAATAttatcaatcaaagttgaaaactgattttttacgtggtaagaaaat
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attttttacccaAATTGTCATCAAAATTGTATTATAAAGTCAATCATtta
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GGACTTGATGCTTATTAGGCAAGCTTACAAGTGTTACATTATGTGAATCG
GTTTTGTTTATGTTGGTACGGTATACACGAGGCACTTCAATACTTTCAAA
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TTTAGtactaaaataaatatttttcacttatattttgattattttgtcaG
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TTATTATCTTGACTTGCTTTAGCTTAATAATTTCCGCatagaaattttaa
ccaaaaatatTCTACAGTTTCTTAAGTTTGATcggtaaaaataaaatcag
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Cgttagttttttatttcttaaaatcttgtactaaaaaattctaaaataat
ttttcaacaaatacaaatgaaaataatttaacgaaaatcaacaaaaattt
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GGGTTTAATTTAAAGTTTACTTTTCTTGACTgtcaataaaattcaaaaac
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ttTTCGCAATCACAAGTCTTTTAATTTCCAACTCTAAATTAGAGCAGATT
TGTACGACTTGAGAACCAAAAGTAATTTTGTATGAGCGAGTTTAATTTCT
AGATGATAATAAACGCCGATAAGCATAttgtccaaaaaataaaaagcaca
tccaggctcagccataATTACaaagttctaataaaaaacgtgtagcctaC
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AGGAAGTGAGTTATAGATTAAATCCCCCAAATACCTAAAGCTGTTATTGT
AATATAATCATCATGATACTGAAAGATGGGCAACCCAAGTTATCAATCGA
AGCTCTCCAAATTAAGCTGTTTGTTTTAGTATATAATCAAAGGTTTACCG
CATTTAAGGGGAAACTCAAGCCATTTCAAAATGGCGCTGTGAACTGTTAA
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AGGGCACTTATCAAGTACTAGGTTTTGGTATaccataaaatatttcatac
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GGTAGACGTTTAAAACCATATAGATGGGAGAGACAccacaaaaatattga
aattatctactttctttgatttcaaaattttaccatTGCGAGCttaataa
gaaaaatatctGGAGAGCATCATTTTTTGCCACCACAAAGTGTTTAATTG
AAACTTAATGTGTTTGGCTGGTAGGAAGAAGAAGGAATCTTAAAGACAAG
AATGACTTGATACCATAAAGATTCGAATCATTTTTGAAACTTGCCGTATA
CtttttttGATGTGGTCAAAGCGAACAAGTTTTGACTAAGTATGTTATAA
GAGGACCCGAGAGATTAAAGATACCCTCTAAATATCATCaaccaaaaatt
gtttttcttgatAAGTAGCCGATTGCTTTCTGACCACAATAAGCCGATGC
TACACTATTAAAATATTTCTCACGttaaaaaattgtctagtttgcattta
tttaaatttaaattttaattaaaagtacattacttttaaGAAACCATAAT
CAGTCTCAAAGGTTTTCATAACTTGAGTCGAGTAGGTCACCGATTTGCTA
TAAACCATAAAAATAATATGAGAgaacttttgaaatatcttGAAATGTTT
CCGCTGcggggaaattttgaaaggcATTGCGTAGATATAGACGTGACCTT
TAGTTGGCAGTATTTCCAATATGATAACAGGTATTGTGAAGTGTATGCAC
ACACTTGTGGTTGTACTTTCATGTATGATTCACGCTTCTCTGAAAATTCT
CAAGTATGAGAGGACATGCTGAAATGACTGAGGCTTTTTAGCGGAAAAAT
CTTTTACCCCTTAGGCATGcacttttttctgcaatttCATATTTAGGTAA
GGCTCAAAACTCACAAATAACTTAAACAGAGGAAGAATCTCAAAAATAAG
CCCCAGCTTTAATGGtcgaaaatatcatttttgttcAACAGTGGCCAAGA
CCAGTGAAAAGATAGCCAAACTTTATACTAAGAGCACAATAATCTAGGAC
GTTTACAGCATCTTTTGATTATTGCACGAGTCAACCGCATTTTCACCGTG
ACAAGGATATTTTTCCGGTAGAAAATACGCATAATGCAAGGGTAGCTGTG
tttttttAaccaaaaggaaagaaaaatcacTCATTAATTTCTCATCTACT
GTGTGTTTGGATCAACCATGATTATTTTTTACATCAAGTGGATTTAGAAA
CTCCTCCTGTTTAACTAAGTAACTACAACacaaaaccaaaataaattGCG
CTTTCAACTATGACGAGGCATTTATACTTAACACATAAAAAAGAATCTAA
AACGGACAGGACCTAGATGGTATGAGGaaaaaaaaTCGGGaactttactt
tacttttttttcctGAGGAAAATAAGTCTTGTACAGGGGTACTCACAATG
ATCTTACTTAACTTTAGAATCCCATATGGGAAATTTTCCTCATAGTATTC
TTCTGAAAACAGAGGTCATCTGAATCTCAGGGAGACGGTATTACAAGTAT
AGATGTCTCGAATTTAGAAGGGTCCACTTTCCTTTCACCTACGCTCGAAG
GTTAAGAAATCGACTTTGTTTATTATAAAATCAGATTAAATCAAGAGGTG
CGAAGCTATATTCATTTATCGCCGAAAATCTATAAAACGAGGAAAGTATT
TTTGCATGTCCGGCTCATGATATTATAAAGCCTTCTTAAAGTCGTCTGAT
CGTTTTCCTGACTGTTTCAATTTAAGAGcattaaagattttgtcaagcCA
ATctaaaaaaacagttttccaTTTGGATCGCGGTCACAGATATATGACAT
AATTTTGTGATTAGAATATTTTGAGGCACTTTATCTGAGCAAAGCTTTCT
ATTTGAAGTTTAATCTTAGTCTAATAAAGGGATTTTCAGGATTGGAACAA
GTACGAGGAAAAAAGTCGGTACCATTAGCCAAGAGATAAGGATCACCGAC
TCCTTAACTAAAATCTACAAATACTCAAAAAGAAGATTTATAGATTCCCA
TGAGattaaaagtcataaaaaaagttatgaaaacaaaacaaagaaaaaaa
tattacacgtTAATACATCAATCTCCACTAATATTGACCAATGGGagggg
aaagaaaaaaaaacggcAAACTAATTCACTACTACTATGTACAAACTCGT
TGGGTATTTTGGTTTTTTGATTCAGTGAGATTTAACAAGAAGGAAACCGA
AAACTCAGTTTTCATGCGAGAACATGCTCACAGAATACGCCCTCAATCGC
AATACGTAATCATCAGTAGGAAGTTCATGATAGTTTTGACTCATGTATTT
TTCCTATAGATTTAAAACTCTATGTATCGATGCTGAATCAGCATCTTCAC
TGATCTGTTGTTAGGAGTCATCATTACCATAGGAAAATATTGAAAGAGGT
CACCGTGACTTTTTTGGTGCATTAGAAGGGAGACAATATGGACGACAAGG
GTCCTATCCCAGGATAGTTGCACCTATCAGACACCGTCGACCCTGTGTTT
GCAATACAACAAAGCCATTGCGTATCTGTGATTATACTCCAACAAGTGTT
ATTTATGCGAGCAGCGTCACCAGCAAGACACAATGTCCGCCTTACCTCCC
TTTGGGTAATTCAGAGCGATTAGCGGCATTATAAGTCATTGCGAAAATTC
GTAAATTTACGTAAGGCTGCTCCATCCGCTATGCTTGATGACGAGTCTTG
CAATACGTTGGTTTGAAATTAGGCGCGCAAAATGAGGCCACCATGAGAAA
GAAAGGAAGTTTTCGTTATTATTGATTTAGCAGCCCAACGTGGCTATAGA
TATGAATGAAATCGGCCGTTACATTATGCTAATGCAAACTATGTGGCTGT
CTGAGCTGTCAAGGTTGAAATGAATGAACATTTTTCTCAATAAAGTCCCT
ATGTTACCCCCATTCAATTCAAAATGACATAAAGTTTGTACACATTTTCA
AATACAATAATTAAAAGTTTGAATTCctttatttaattttgcagAGACAT
CAGCGAGCCGTGAAATTCAGGTTTTTGTAAAGTACAAACGCTACCGGCTT
GCTTGGCCGCTTTCCGgcagttttatttatttatttacttcttaatttcc
tcttttcgttttcatttaaattaaaagttttcttatacATTGATACATTG
ACATTAAAAGATACAATAGCTCGGCGGTGCTCCTCTACTTactcaaacac
aaaaacaattaaaatcggGTTAAAATTTCCGTATAGCACGTTTAGtttaa
aaagtgtcaattctaGCGTGAGAGAGCGCAATCGGGTCCTGTTTTCCGAC
tttttttttGTCCGTGATTATTTTAGAGGAAAAAGCTACTGATCTTGAAC
AAATAACGTATACTATAGTTCAAACAATGCATGGTCAAAAACAATACAta
tgtgaaagaaaacaaacaatGTTATTTATTTGAACAATGATCAACAACAA
AACGACAAACTCAACTATTGTCTTACATTTATAAAGTACACAAATCGATC
AATCGTAAATCATATAACACTGCCAACCACTTAGATTCATATTTTACAAT
GTCATGGATGCTTAATAGCACTGGTTTAGGGCAGCAGGGTCTAAAGCAAT
TTTGAACTATTAGTTAtttttttAGCCTCTTGACAATCTGACATTTTTAA
AAGGGGGAAGCCTTAGTTGTCATTACTTGCGGTTTAGGAAAGCATTGGTG
ACATCTGTAGGAAAGAAACTTTATTTTACTATATTGCATCCTCTTATGTT
ATTTGAAGGAGACATTCTGTTGTCAGGTTCATTTATGGGATattctttga
ttttaaaagtCTGCAATAGCACTAGGGTTGAATCGCGTCTTTAATTTTTG
TGGATATTCATTTAGTTAGATTGACTTTTGATACAACTCAAGTCAAgtta
acttttaaatttttaaaaactacttGGAACTGCTTAGTGGCTTTTATATG
AAAGTTCCGAAGGTCTGCAAACAGCTTTAGGtttttttGTTCGTTACACT
TTGGTTTAAAAATTGTTACGtttttttACTGATACCGAGGCTACTCAAGC
CAATTTGGGATACAAATCTAGACACCTTATGCCAAAGTCTTTGGAGATTG
ATTAGAATTAGAGGCTGTGGAAATTTAGGAATGGGTCATTATCTTGCTAA
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ATGGCTTGGCCTTCACCTTACAACGGTATACCATCGTATTCACCAATGCC
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AACTCGAGTGATATAATGGACTTCCCAAACGAATATCATCCTCAACAGAG
TGCTCCTTGGTATTCCAGCATGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:3057350..3079221 + |
|
