MSTRG.14088.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14088.5.p1
Unique NameMSTRG.14088.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000116_pilon:40947..89103+

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14088.5.p1 ID=MSTRG.14088.5.p1|Name=MSTRG.14088.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48157bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000116_pilon:40947..89103+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000116_pilon:40947..89103+

>MSTRG.14088.5.p1 ID=MSTRG.14088.5.p1|Name=MSTRG.14088.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=106704bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000116_pilon:40947..89103+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCAAAAGACATCATTCAAAACACCGGGCGCCTTAGTGAGATCATCACATG
GGCGGAACCGAAATTTTCGGACAACGTAGGTGTCCGGCGTGTGATGGGTC
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CATCCACCGGGTTAGACCTTGCCAACGAAAAATGTGCACTGTGTCCTAAG
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TCCTGATGCAACGTGGCTCAAAGAAGGAGGCAATTTACCAAATTCTCACC
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ATCGCTTACTTGTGTGAAGGCTCTTGTAATCTGGTCAGCTTCATTGGTCG
AGGACTCTGTCACACACTAGACATTGCTGTTGGCGTTCTAAAGTTTGCTG
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GAGGACCGAATTGACGTTCAACCCGTACGATAATCCGAATCCGTTTTCAG
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TTCTGGAATAATGCAACGCGAACTTGCAAGCAATGCATTGTGGGCGAATA
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GTTCCTGATGCAACGTGGCTCAAAGAAGGAGGCAATTTACCAAATTCTCA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14088.5.p1MSTRG.14088.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14088.5.p1.exon1MSTRG.14088.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon2MSTRG.14088.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon3MSTRG.14088.5.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon4MSTRG.14088.5.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon5MSTRG.14088.5.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon6MSTRG.14088.5.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon7MSTRG.14088.5.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon8MSTRG.14088.5.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon9MSTRG.14088.5.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon10MSTRG.14088.5.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon11MSTRG.14088.5.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon12MSTRG.14088.5.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon13MSTRG.14088.5.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon14MSTRG.14088.5.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon15MSTRG.14088.5.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon16MSTRG.14088.5.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon17MSTRG.14088.5.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon18MSTRG.14088.5.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14088.5.p1.exon20MSTRG.14088.5.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon21MSTRG.14088.5.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon22MSTRG.14088.5.p1.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon23MSTRG.14088.5.p1.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon24MSTRG.14088.5.p1.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon25MSTRG.14088.5.p1.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14088.5.p1.exon26MSTRG.14088.5.p1.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000116_pilongenomesc0000116_pilon:40947..89103 +