MSTRG.14006.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14006.5.p1
Unique NameMSTRG.14006.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000114_pilon:917632..959023-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14006.5.p1 ID=MSTRG.14006.5.p1|Name=MSTRG.14006.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=41392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:917632..959023- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGCCAATATAATAATAGACAGACAACTTGAACCAACAACAAAGACA CAAAACTTCAAAATACATTGCATGTCAATCAAGTTATCAAAATAAAAGGC ATCAAGCTGTGTTGTTAAAATTTGTAATACAGTAAGTTCTGTTTAATACC CTTTATAGAATTAATATAACTTGTTTGATATTATATCAGTTTTTGACATG TTTTGTTTGCTCAAAAAATGCAATATTTTCTTTCAGTCTTTTATCTTGAC AGATTTTTATGCTTGCTAGAACAGGCATTTTGTGTTCTCATACGGTAGAT TTTAAGATACAGGGTTTTAAGACAAGGTTCATCTACTGGGAAAATGGCTT CAATGAAAAATGTAAGAATTATATCTTTACAGCATTTATTTTTTATGGTC ACATCAAACAGTCTGAGTCTTGTGCCTCTCATAATTCGTCATCTATTGAA TAGATTTTCGATTTTTGTTGTCCGTAATGGGACTAATTACCCGTGAAATT TAAGCCCCAAGGAAGGCTTTCGACCTAAATTGGGCTCTTCCAAAAAAAAT TTGATATATGGGGTGGACCCAACAGACATTAACTGGAAGAGCCCATTTAA GCCTCTTTTACCTCTTTTGGTAGGATCAAAGGAACCCCTAGCACCTGATC TGACAAAACAAAAAACTTTTGACAGTTTTCGATACAGCAAACATGGGCAA GAAGATGGTTAAAATTCTGAGACTTCTGATATATATATTAATTTAGACAG TATATACTGCCCCAACCTGTTTTTGCAGATTATGTCAATGACCTAATGAA AAGGTCAACAGCTCTCAAACTAAGACCAAAACAAAGAGCCTGACAATATA GCTCTAAACATCCTTACCAATTTCTACCAAGTCTGTAGAAATTTAGAGAT GTTTAGAGATAATGTTACTGTTCACAACTTGTTGTTGCTGTTGATTATCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:917632..959023-

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TCTTCCGATGATTTACCACTCCCTCCGCCGCCTCCTCCTCCTGGCGATAC
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GTTCTTCCGATGATTTACCACTCCCTCCGCCGCCTCCTCCTCCTGGCGAT
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ATCTCCACCCCCACCTCCACCACCTCCACCGTCAAATGGAATTTCACCAC
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GAGAAAAGTAAAGATTTGTTGTTGGAGATGGAAGACCACGAATTTGTTTT
GAACACTGCTCTCGATTGGTCAAGAGAAACAGAAAATATGTTAGTGTTTG
CAAACCGGAGAGATAAATATCTTCTCTTCAGAAACCCACAGGCATCCATG
GTGCCAGAATCACCATTTTCACCAGAATTGAAATCACCAGCATCTCCCAT
GTCTCCTGAAGGGCGTTCACCTGCAAAGACGTTCGATTTCACCAACAGTT
CAATCAACACCACAACTCATGGAACAACTGGCGAGAAATTAACACTAGAC
CCTGTGCCACCTGGACGAAAGGCTAGTCAGAAGAGTACAACTTCCACCGT
TAGTGCTGCTTCCTCAGATGGGATGTCGGGCGGTTCTGACACCTTCGGAG
AGGAATTACCACCACCGCCACCGGATCTTCCGCCTCCGCCATCGAACATG
TTTTCACCGGATAGTTCTTCCGATGATTTACCACTCCCTCCGCCGCCTCC
TCCTCCTGGCGATACCCCCTCACCTCCTCCACCACCGCCCCCTCCGCCCT
TCAACGGAACGTTATCTCCACCCCCACCTCCACCACCTCCACCGTCAAAT
GGAATTTCACCACCCCCGCCACCGCCACCACCACTTAGCAGTAAACCCGG
CGGTCCACCTCCCCCGCCACCCTTGAACGCCAAACCAACTCGTTAATGAA
AAATGCTGATGGTACGGTGGAAAGAGTGAAAGGAAAACAAGACGCTTTGG
CTGAAGTTTTTTCCACAGCATGGTCTAAAGGAATTGCAGAAATTGAGTCA
ACCTTGGATCGCAAAGCGAAGATTGGGACAGTGCGTGGTACAGTGCGTGG
TACAGTGAGAGGTACAGTGAGACATCAAGTACGGTTACAATATGTATGAA
GACTATTTGACCACTCAACAAGAAGTTGAACGCGTCTTATTGGCTGGAAG
TCGTTCCACCATCACATCACAAGTCTCGACAACAAGCTCCAACAACACCA
GTAGCAATGCTACGAGAGAGCTTTCATGTTTGGTTCAATTCGAGCACAAC
AACATTTATTTGGGCGTTGGCTACAAGAAGAAATACAAAGCGCCCACTGA
TCATGTCATATGTTTGAAACACCCAAAGATTCAAAACATCAAATCGAAAC
ATATCATTTACCTGTGTGCTGACGACAGCAAAACGATGTATCATTGGTTG
ACTTGTATTCGAATGGCTAAGGAATTTTTCTCCAAAGAAAATACACAAAT
CCCTCAAATCGAAGGTTTGCTATCTGTTCGTAAAGGCGGATCAAAGAAAT
GGGAGAAACATTATGTGGTACTCAGAGCTTCTGGTGTTTATTACAATCCC
AAAGGGAAACAAAAGAACTTTTTGCTTTCCGATTACCACTCAGCAGAAGA
TGCGAGGTTGGCGGAGAAAAGTAAAGATTTGTTGTTGGAGATGGAAGACC
ACGAATTTGTTTTGAACACTGCTCTCGATTGGTCAAGAGAAACAGAAAAT
ATGTTAGTGTTTGCAAACCGGAGAGATAAATATCTTCTCTTCAGAAACCC
ACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14006MSTRG.14006Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14006.5.p1MSTRG.14006.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14006.5.p1.exon15MSTRG.14006.5.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon14MSTRG.14006.5.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon13MSTRG.14006.5.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon12MSTRG.14006.5.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon11MSTRG.14006.5.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon10MSTRG.14006.5.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon9MSTRG.14006.5.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon8MSTRG.14006.5.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon7MSTRG.14006.5.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon6MSTRG.14006.5.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon5MSTRG.14006.5.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon4MSTRG.14006.5.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon3MSTRG.14006.5.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon2MSTRG.14006.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14006.5.p1.exon1MSTRG.14006.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000114_pilongenomesc0000114_pilon:917632..959023 -