MSTRG.13979.6.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13979.6.p1
Unique NameMSTRG.13979.6.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000114_pilon:706519..720942+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13979.6.p1 ID=MSTRG.13979.6.p1|Name=MSTRG.13979.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14424bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:706519..720942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAAGATGCCAAAGTAGGATAACATTACGAGTACAAATTATTAGTTTAAAG ATTGGCAGGAATTCAAAGTGATCTATATTGTATTAGGTGATACGATCTAA CTGCAAGAAAAACTGTTGTAAGTTGATTTCAAGAGAGTTGTTTTGCATTT ATCTCTATAGCTTTGACAGTCTTTCTCGACCTAAATAAAATATCGTGATA TAAtgtgaaaaggaaaattgaaagtATGGTAGTTTTCTGTTTACTGCATT TTTGTAAATACTGGTTTTACAAAAACTCGAACCAAATCCCTTAGTTTGCT TTGGTGTAACTCTGATAGCACCCAGAAAGTTATATCACGTCTATCAGTTA ATCAAAAAATTTGGCGCAAGttgctctgggtacgagattgggTTATACAA TGTATCGGCAATCCCTATAGGAAGACAAATGGTAAATAAGTTTCatacaa atgatttttttttcgttcattTTCAGAATGTGGTGACAAACGAACGAAGG CCTCCATCATACCTCAAACATAGTGTAAGTATTTCTATTGCGGAAATAAT CGGGAAACCGGAAAAGATCTCATCAAATCGTAAAAGATTCAGGCTAAATC AAATCGTTCAGAAAGAGCATTTTGCAAATGAAggcatttcaaattttaga ttCTACTATCTATGGTCAATTTCCTCTTGAGAAAAGGTTTACTTAAAAAT TTATAGCAACAAAATTCTACCTCTACAAACAATGCATGACCAAATAAGCG ACAGCTTTATCATCCAGCCCATGCCAGGGCGGGGTGTCCTTTATGCATCG GTACCCTGTAGGCCTCCTACCGGCCTTCTAGAAACGCAGGTAAAATCGTC GCCGATATCGGGATAAAAGACTTAAAAGCAGTAAATTGAAATTGTGCACA tttttttATGACAACAAATTATATGAGAACataaaaggcttcgatggccg aaatattaagaacgagataagaacattttaaggccaTTGAGGACCATAAA ACacctgttttcttaggaaaatggacaaaaatattcaaaaagctaagaac atcaaAGGCTTCAGAAATTTAATACGTTCTATAGAAACGTgtatcaaaaa aattcattaatcAAATATTCAAGAAGAAACCAGCTATTTCAGAAAGATTA TACTGAATAGAGAAACATCCTCACCATCTATTATTCGTAACATAATAACA TTATGAATAATTTACGGACCAGAATAAATGAAACACTTTTAGACACCTGA GACGCAAAGGGTTTTCAAGTCGCGTCATTTGGTCGAATATTCTTTTTTAT GAGGCCTCACATGGTGCGAATTGAAAACACCAGCCTGCTGCTGTCCATAG ATCAATAATACATTTTGTCACCATACAAAAACTTACAGAAAGGTACGAAA TTCTTCGATtcattgataaaaatttttgctatttttacgattttgtaatg atgcattttatggcttgtttttattggctCTGAGCGATGCAAAATATTCT GCATGTAAACTGGGCAACAACATGAAGtttttgaaatcctgactttttgg attctcatttataatttttgttttgaattctgcattttgCATTACTTTCT ACTCAAGTGCTGGGGCTAATTGTAACAAAATATGACAcatttgaaattta gaaaaattctagTCATTTGATAGGATTTTACAAAGCTTCAATCGATGATT TGAACTTTTTCTAACTGTCTTGTATATAGATTTTGGCCTTTTTGTTATTC TAATAGTTTGTTTGGATTAAAGTCTAGATAGGTGATTTGTTATATCGTTT ACCAGCGTTTACACTGACCTTAATAAATTatggaaattatgaaattttta ccTTTTGGTTATAATTGGGATAAAAAATCAGCTCATTAGTTTAAGGCACA TTAGTAGAAAGTTTCCCCAAATGGAATCAGTTTTACATTTAATTGCAAGA ATCAACTTTCCTGTACATCAATGACGCAAATTGTGCATTAACAAAGTTTG CGTCATCGATGAATTTTTTCGTATATTCGCAAATCTGCGATAGGTTTTGA CAGGTTCAAGGTGCTCTAATATTCAGgagaattaattttctttaaaaata taccaaaataacaaaagtttataataattttgaaaatcactCCAAGTGGA AACTATATGACCAAGATGCTgtactgaaaaattatttaaggTAGCAAGGA TCGTTTCTAAAGAAGGAGTACCTCTCTTAAAAAATACATCCCCTTAATTA TGAAATACCTAACTTTTCTTCTTCTGATCAAATTTCTATTTGAAGTTATA CCACAAGGTTTAAAATGGCTGACATCAGCTTTTTAATTAGTACTCATTTA GAGGTTTTAATGACCACCAATGGTTGGAGCTCATTAAAGAAACATTATTT AACTGTTGTTGTTGCCATTTACGTAATCACTCGGCATAGTGAAGGTTTTG TACACAATTTTCTTGCGTTACATCTCTTATAAAATTCATGATTTAATAAG AGCTCTGGAATCTAAAGCAAAGGGACTTTGAAACGTCTAAATCTAATGTT ATGAGAATTTCTATATGGAATATAGTTTAAGCCAAATCTATGCTTCTGAG AACGTCAAAACTAAGATATAACTACACTTGGtcataaatgaaaattgaat tgaaactTTGGTAGAtttataatgttcttataaaactatTGTTCTTCGTT CAGTGAGAAATGCACTTAGTTATATATAAGTGATACAAAAATGATGATTC TCCATATTAAAGGATATCATTTAGTTTTTAAATTGCACCAAAAGCAGTAG GTAACTTTTGAGCTTGCTGTTTCATAAGAGTCGATTCAAATATTCTACCG ATATGTTGGTTAAATTGATGAAACCAGCATTGGGTGTTCGGAGCTTTTGT TTAGTCAATGGAAATTTATTGTGCAGtttttttCTGTATACAGGGTTGTG GAATCCGACGAATTCGTTTGGATATTAGCCTCTCTAGCGTAGATAGTCCA AAGCCCCTTTAACTCGAAAAATGCAAAGAGGCTagaattattcattattt ttcatgcTAGAAAGTTATCTAGGTACTCGTTCATTTATTTAGAAGTTCTA TAAGTTTACTATAAAAATGAATAGAAGGAGAATTTAGTTTTTGAAGGTAC AAATTGTACCCTTTCATTAGCAAAGCGAGTCCCCTTTTaaactgcaaaaa aaaacacgaaatgAATTTAGAACAATTTAAAAGCTGGGACCTTGATTTTG AAGTATCGGGAGTCAACAAGCTTATCATTTGGGAATTAAAACGCTCAAAT tatgtttaaaagaaaataaagtggaaaacatttgaaaaattccaaCAGCA TCAAAGTTCATTAGAAACGAAGGGCTAAAAGTGTGAGCAAAATTATCACT GCAGCAATGCAAagaagcaagaaaaaaatttgaatatagtTGATGAGATT TTCGTGTGTGTGCTTAACACAAAAGGGGATTAAGAACTTTAAGGTAATTA AGTATGTAgtaaaaaagtaattaaatgATCAAGCCTTGATGGTATTATTA ATTAGGAGGTACTTGATGATAGTTGTGGGTGAACGAAGAAAAATGTTGGG TGGTATTTTATAGCAGACTGtacgaaaaaacaatttttatgctgcattag tttgtttttgtttgacgTGAAATTCGACGGAGGAAGTTGTCCAAAAAGTA ACAATAAGGGAACTGGTTAAGCCCTCTGAGCCTAAAAGGTTATACAACAA TTGCCTCAATTTACTCTGTGTGGAAAGACTTATAAAGGTGATCGTCAGTA CGCCCTCGATGGAgggcgcccccccccccccaagttaCCCATGAAACAAC AGTATTTTGACGTAGGAAATGTTTTGACTTCAAGGTTGACAAAGAAACAG AGGGAAAGAAAGTCATTTTGTTAAAAGCTTTTTGAGTTTGGACTTCAGAT AAGATTGATATTGAACACGataaaactttattttaaaatgtaatttttat aTGTTGGAGtctgatttttcaaaacattcgagaGACAACAAGGACTTCTT GGGGAGAATAGATAGGTAAATTTACTTCTAGTAAAGTTAGAGGCTAGTCA ATACATAAGGAACAAACTTGGGTTTGTGagcgaaaattaattcaataaaa acttttaCCGAATATTCATTTCACGTCGAAATGTTGGCTACCTGAGGGTG GGGAGGAGGTTCAAGCTTCATGACGGAGAGTCCTTATTAACTAATAAGAA TTGTGGCTATATGTAAGAGAAACGCGTTCCGTCAAAGATGCTTGCTGCAT TGGAATATAATATGAATACTGTATACGAAGCAGATTTTGCCCCTccttat tttttcgaaaatttcaggTTTTGGCCGAATTTTTGCCCGAGTTCTTAAAA AActgttcttatagaaaagcgTGTTATTTAGCAAAGTGGATAGTATTGCT TTCCTATTCTCATAATCTTTTTGGTTTAGTGAGGACTTAGAATTGGAGGC CTACAAGGAATAAGTTTACATGGATTACAACAGGATCATATAGCATATGG TTTTAGGGATAAGAAAAAAGtagtttctcaatttttttctgaaattgaag aaaaaaatgaagaaaaattgaagcacAAAATTTTCGGACTCCTGAGATGA TCATGTAGAGGAAACTGTGCTTAAgttaacttaattttttcttactACTT TTTTATCCGGAAGAAAGATGTTAACCAGGGCGTCCTGCTTTTTGAAAGCT TTGAGAAAGTCAAGGGCTTGATTGAGTTTTTGAATAATGATggttgagaa aaatatttgtagaatgacaaaagaaaggcCATAAAGACAGAGAGATATAT CAATATATTTAAAGAAAAGTtattatcgaaaaaaaaatacgaTTAAAGCC TGCAAGTATGAGAGAGTTGAGTCAATGTAAGATATCATAAagagtttctt tttttcttttttagaggTTCATACAAGGGGTGACAGTTTCCCTTAGAGTT TTTCTTTGCATAGCGTGAAATGTGAAGTAACAGTGGGTACACTTACTAgg agaaataaatgaaaactgTGACCCTGTTTTACAGTAGAAAGGTACATGAA ATATAGAGGTTGCAATGGAgaatattttttgtgtttttttgttgttagAT GAGAGGTTGTACAAAAAATCacgttttcaatttttaatacaaTTTCTCTA TAAAGTcacatgaaataaaaattacaataacttttattttttctttgaaa ataattttcaaaaaaggaaaaaatagaaaatttgaaaaggaaaacaaaag gaaacaaaaagaaaagaagacatTAAGACCAACCATAATTGGTAACTTTG TTACAATTTGCTTTATTGGGGACAatcaagaaatcttttacaaCCAATTG GAAAGGTTTAAGTTATTTTGTTGAACAACAATCAATAATGGAAGTTGAAA TGGAATTATCAGAATCCATGGTTAGTATTTATCATCATTGTAGCACCTGA GGAGAGTCAGGGTATTTGCACCCTGAGGATTTCATGTTCCACCTGCCCAA ATCCCAAGGGGactttttaaataattaataaacttttttcttatattatg ttgtatttcattcttttttcaaataatttcaattttcatttttatttttc aagtcgagatttttccttttggaaattctcttttGCAAAGAAAAGTGAAG AATATCAGAATCTCAGCTTTTGTTTTATATATGAAAAGTTGCAAAGGCAT AATtatgaaaagagaaaatatcgtgaaaatttgattttaaaaatgttcaa ttttgagGACCACCGTAAATTTATTGGATGTTGGAGTctccttttggaaa aaaatatgattGAATTTAGAAAGTTTGGATGGTTGATTCTTTAGGAGGCG AGGGAAGGTGCTTCAGGGAATTTTCTTCAACAGCTTGGAGAAGTATATTG TAAAAATTGCAGAGTTTAAGGATAATGCACTTAAAAAATAAGTACTAGCT CAGCAATAACTTGGCTTGAATACCAGCTAGGAAGTCTTATCTTTAAAACT GGTATTCGTATAAAAGGAAATCATTTTAAAATAGCATTACTATTTGGGAA TACGTAAgagagatatgttttttttctcataagaaaaccttCTTCGACCT GAAGCTTGATTACTTTAACTTGCAAACTTCATTATTCAATAAAATGGGCA AGACTCCCAATATAATTTGCGCAATTCAAAATATCTGTCTACATAAATGC CTTTGGTATTGATTTTTGATGTATTTCAAATTGATCGCTTCATCTAGTAG GTCATATGTTAGACCAGACTATTATAGAATCTAGACCGAATCTAGATTTT TGTGGATCAAAATTATTGAACATTATATAATCAAACGAGACTAGGTTTGA ATCAACCTACGAGAGCAGAGAGATTAAAACAGATTTCAATCTAAAAAGCT TCCCGAACAATGAACAACAATATCGGATCACATCGACAGTTTCATCTCTT GAAAGATTAAAAAAGGCAATAAACCCCAATGTCTCGATCTCTCCATAATT TTTCAATAATACTTTATACTAAGGAATGTAGGCTGACAATTTTTCTGtgt aagaaaattaaaataccAACTCCCAATTTTCTCACTGTATTGACTGTAGT GTTTAGGAAAAAGAGTAAttattaaagtagtaaaaagtACTATTTCATTG ACGGATATGGAGGTCATTATGAAAAATCTTTGGAGGAACAGAATTCTGAT ACGACCTTCTTGTTctaagaatttcattttttgttgaaattgattaTGTT CTTACAGGGAAAAATAGTGAGGTCAAATAAAATATAACGGATTTAAAGAT CACATATTTTAAAGACGGATAAAATCGCtcataatgaaaacaaaaatttt gatcaatatAGACTTGGATTTCCAGATTTGTATTGGTTTATATTCCAGAA AAAAGTACATAGTGGCTTGATGGAAAGATTCAAAGTGTGCATGACCTGAA AATTTGTGGAAACTGGAGTTCGTAATGCATATAATGATAAACAAGAAAAT AGCAGTCAAACTAGTTTGTGGGACctaatagaaaacaaaaattcctCAAA TGTTAGGTTTTGGTAAGAAATCTTACAAACAAAGCCtcaatttatttact tttcactttttccaATTACCTTTTAGAATGTGATGTTCCGGTGATGCTCT GAATGTATTTTGATAAGGTCAAGTGTATTTATTAGTAAGGGGGAAAAAGC TTAATATTTTATGCTTTCGAAAGTTGCTTCAATTCTACCTGAAACTTcct tttttgaatatctttctCTTAAGAGTTTACCATCCCCGtcacaaaaaatt ttctttcgtgatatattcgaaatttttttgaggagAAAGATGTGCGGACC AGTTTCCAAATAAAACGTCGGCTAGTTCTGTCGGCTGTAATATGTACACA GTTTGttgttaaccctttgagtgccagggtccttttttctaagttttttt ttaaaaaatcgctagttcaaactttaagggcttatatctcctgatctaga aggaattagaagctcgtatatagctcgttggatagcttagagtctcttct ttcttttgggcgccttcggcgccgcccgatttaggaagggcgtggtgggc ggcggccaagggggggggtaggttagggaattaaagcagtcaggcccgct gcgcggacctgactgaactgatgaaaaggtgcccagtggtaaaatttcaa atcaattcactagaagacagaataaagtaaaacagggccaaatttggagg ttcttggatcactcgttgaccaaaaatagtcaaaaaacggtcagaatctc aaaaaagtgaatttttgtcaattttttgcatttttttgacttttttgctt aaaatttcgctggaaagactcacttttgaatttttttttgcttgaccata aaggacaatctaattcctacgagttcgaccaaaaataacgatttctaact caaactgggcattacaggagggcttcgccctcctatatagcccatgtcgt atatatacgacatcggcacttaaagggttaatgaaGGGGTTGCTAGTTAT TAAAAGCtcattttttttccattcaaaatattctttaattAAAGCAAAAG TAATAAATGGAACAACAAACGGAAAGAGGAattaaaattaatcatcttTT AATTACGTTGTTGTAAGcgaacttacttacttactcaCTTTTCAAGTGAA CGTAGAGGAGAGATAATTAAACATAGAAAACATCAACGACAAAACGAGGA GAATAAAAAACTGCCTGTGGCTGTAGTGGTTGATTAAAAAGcacaaacat tcaaaaaataaagatggtATTTTTGAAGAGGTTTCGCAAACGACATGATG AATATAGCTTTGAAGGTGAAAACGAGAACCTAGCTGGGGAACCTGATCCA GAAGCTCAACAAGCGGTGAGAGCAGACCCAGAAGAAGGTCTAGCCTTGAA TCCAGAAGCACAGTCTCTCACGTGTGGAGAAGAAGTTGAAGATGTGAATA TTGTAGGTGTAACACTTTTAGGCTATACCAAATTAAAATATTAGTTATTA TAGTAAGACTTATTCTAACGTACAGTATGAAGAAAGCTATTTTGAGTATT CATTAAACTTTGGTACAAGCCTGATGAGATAAAGACAGATAAATAATTAT GAATTGACCCTTcggatttttttatataaggttGTCATCTGAGATTCTCA AACAGGTCAAATAATGATATTATATCAGCCTGTATCGGAGTCAATCTCAG TCTTTGGTCTAAAACAGGAGGGATATAAATGAGCACAGTATTCAAGCTTT GACCTACGAAAAGGGCATGGTTGGTAGAAATTGTAACAATGTACAGTACC TTAAAGCTTTCGAAAGGAAAGGTGAATTGAGGTTTCACGGATAACCAAAA TCTAATTTATCGAAATCTATATAAATCTGAACTTTTTTAACAAGGACGAa aattaatgaatttttttcacaacttTTTCTTGAAACCAAAAGTGGATCAG GCGGTGTTCGTTTAAAAGCATTGCAAAGGGTTTATGTATGATCAGCTTAG AAATGATTTCATACTACaaaaaaaaTGTGATCCCTCTTAAACATTATAAT CATAATATAAATATTCAACTTTAAGATCAATAAAGAATAGAATTTTCTGA TGCTTAAAGGACATTTAAGGGTTTTCAAAGCTTAAGTTTTTTCGTGTGTT AAGCCTTTGtcgttttataagaaccaattaGGTTAAAGTGAGCTTCATTA ATGATCTTAACTATCGACCAGTCTTTAATATTCTTAATGAAAATGTACGA AAATAACATAGAAAAGAAGACAAATAAAGACTATATCAATCAGCATAATA CATTTTCGCGCGcaaatttattttgtatataCTATTATGCTGAataagca ctttcgttttcatgaGCTCTGTGCAGTCAACTGTAACAAAGAGgatcaac aaaagaaacacaaactaaaacgaggctaaacaaaaagagaatacAGTCTG TTttggaaatttaaaatttctggaATAGACATTTGACATTTGAGTCTCTT TTACATGCAACATTTGTGATTTCCAAAATGTTATTTTGTCGTGAAAACGA GACTGAAAATATGGAAACTAGTTTTAGCATGCTGGTAAGCCAATTCAATT CTATCTATCAAGGCTCTACGAAAAATTCTCAGTTCCTTGGTTTGACAAGA ATCATAATTTATATTATGAGATGATGTTTCTTAGCTTGTTAGTTACGTTA TTTCTTAACTGTCTACTGCTGTACTATATGATAGAAGAGGTCAGTTCCTT AGATTTACCAGAAATTACGTGAGATTATGACATTCAAAAACAGGGAAGTT GTTTTTCTAAAGCTTTAAAATAGATGTGGAGTACTATGTATTGAGATTGC TCATAAAAGGGAGTTCCAGACTTTTATTCTcataaattaatttcaaaata aatggtGGTGGTTGACACTGtaagttttttcaaacattttccacatcCGA TATGGAGTAAAATGAACTAATAAATTTCCTGCAGACTTTATCACTGTATG GTCACAAAATAATAGAGACGTAATGCGTCAACCCTCTATTGATAGAAATT TCCATTTTATTATAAAGACTAGAGAGAAAAAATTTGTCATCGCATCACGC TTACACAAAGATGTAATCAACTCAAAATTCATTTCACTGTTAAACTTTGT GGCAAACtttattgataaaatttatGTTTGAGATAGACCTCGTATTTATT ACTCATGGTATGGGATTGACTTTTCAATTTTAAGTTTATTGATTTGGTTG ACAAGACAGAGATCAACATAGAAAGTTTGGAATTGAACTAGGCTAGGGCT ACTTCCAAAGGCCCTGTTTAAAAGGTGGGTGTGCATAAATTACAGTAACA AGCAattgtgaaattaaaaataaaagtaacatGAGTATAATGACTTTACC AGCAGAATGCTATTTGttatgaaatttcaaatataaaaCTAGCGTTAATG TATTTAACAGCGCAGTACGAATGCAGCAAtcgaaaatagtttttttcagA CATTTTGTATAGAAATAACTTTTATTCGTATAGTTCGTTCACCAAGTCAT GTCATGCAGTTTCAGTGACGTTCGGATggacaaataaaattttttatttg gttaatATTTTGTATGGATCTAGGTCAGAATTGCGAGGTAATATTTTGGA ATGTATTTTACTTACATGGAGTTTTAACGAGGATTGGGATCTAGTTTACA GCACCGAGCACGAAGAAGATGTCATTGCGCATTCGACACTATTGAACTTC TGGGGCGTTAGGATTAATGAGTGTTTTCAAACATAAGGCTTGTATTTTCA GTTGGaattcaaaaaaggaaaattcaaaacataaaacttGAGAGAATTAT AGCTTTTGCAATATAACAATAGCCGACATCCTGGCGTGTTGACAAATTAG GATTTTTGCAGCAGTACAGCTTTTCATGTTACTAACAAATACAATAGTGA TTAGCATCAGAGCTAGGATCTGATTAAGAGGGATCATATAAGTTCCTAAT GTgtacataaaaaaaattgtatgcGCGTGTAGaaaatgctaccaaaaata ccttgaaaatctaaaagaaagtaaaacctgtaaagaccaaagTTCATTTT AATGCAAAAGTCATTAATAGCTTTGTTTGAATACTTCTGCTTGTAAAGAT TCGGtttaaaaaagtcttttttagTGTAGAAATTCTTAGTACAGTAGTCG GAGACAGTAGCTAATTGAGTGTATTATCGTGTCTTTCAGTAATCAGGTAC AgtttatcattaaaaaaacttaaatcaTGAGAATATTGTTTATTTGATGT TACTGATGAGTTCAAAATCTCTACTTCTGCAACAGTTACAGACGGACAAT AActctacattttttaaataggtGAAACAACAATCTCTCTCTCAAAATTT TAGTACAAGGTGATGAAATACATGTTACAAGACAGTTGATATAGAAATAA CTCAATTATCACTTTTTCCCTAAAGGGAGTGGTAATACAAAACGGAGATC GGCGTTTTGATATAAATAATGGGGCACAAAGCGTTCTCGATCAAGGTGTT GAACAAAGTGTCAGATTTAATATCAATTTGTCAACCGTTTCACCAAACAA AACTTGACTCTAAAcatatatacaaaaaaattgtttgaaagttGTTAACA ACAAAAAACTGTCAAATAATATGGAAGACATTAAGACTTCTAAAAACTTT TGTGGTTTTTTAAAGAGATCAATTCGCTGTGAATGAAAAGATAAAGGATG ACACACTAtgaatgaatttcaaaaaaaatacatttgagTGAATTTGGaga gattttcgaataaaaaactAATCTTGAAGAAAAGGAATAAATCTCCAGTG TCCGGCAAAGTTCTGAAAACAGTACTGGAGCTTTCAAAGCAACAAGGCAT CTTAGACTTTTAAAGAAGACCATTCTACTCGTGTTTGCTAGAGTTTTGAC TTGTTTAAGCGGTTGCTAAAAAGTCACTAAAGACAAGTATAGACTTAGAG AAACAAAAACTTAAAGGCTatgtttgtttctttttttagcCTGCAGTATC GCCACCACCGGAGAAGAAAGGAATCAAGATGATCCGGACTTGTCAATTGT TCTTGGTTCTCGTCCATAGAACATTCTTATTTGCAGCTGTTCTCATTGGA GGAACCTACGCCATCAGAGCTATCGAGAACCACTATCGAGAATCGATTTC TCATATGGAGCTGAAAGATGCAGCTGAATATTGCTATACCATTCTAACGA CCATAGGTAAGtcttaatttaaaatttgaatgttaAAGAATGTTAATCAT GACAGTAGAGCCATCGCTTTAATCAAGTTGGAGAATAAAAGAAGTTACTG AAACAACATAAGAGTTTTGTAAGGAAAACAGTATTCACTACaaaaaaaCT TATTAAAATTTGACCATTTCATATCAACACCAAGGGAACTCACAACTTGA CATCACTTCACTTGCTAAACTTGAGCTTCCAATGCCGTGATAgcaattga aaattgatccctCTAGTATAGAAATTCTTGGCTACCAATtatctcaaagg taacgaatcaaATTTACACAACTACTTAGTAATCATCTTTTGCTCGTTCA ATTATTTCAGGTTACGGCCGTGAGAAAACCCTCCCTACATCAGACTGGGG CAAAGTGTTCACCATTGTCTACGCAATCATTGGTATACCAGTCGCCATTT TCACTGTCGGAGCATACGGAGCATTCCTGAAGCATTGTGTGTTGAAGTTA ATCATTGGTTTAGAGCACTGTTGTTGCTCATGCTGGCAAGGCAAGAAAAT GAATCTCAAAGTGCTTATTATATTGATTCTCCTTTTCATTGcagagttct tttgttttggagtCTACGTTTGCTGGTTGGAAGACAACAACCAATGGAat tatttagattctgtttacAGTTGGTTTCTCACCATGACAACCATTGGATT TAAACAACACAACCCGTACCCAGACCACTTGGATCTGTTACACGCCTTGG CCTACCTGGTTACCAGTCTATTCAGCATCATAACTCTGGCCGCCATCTTT CAAACCGTTCAACAAATGATTGACGCTGTCCACAACCAAGATCGCAGCAT CTGCGCCATGTTGTTTTGTTGTTATAGCAACAATAAGAAAGATGCATACC CAATGGATAAATACAATTCGAATCATAGTATGCGATATGCAGAATATCCT CATGAATAAACAGACCATTAAAGCACTTATGTTGAGAAAATATTAACCAA AATATTTATGGATGGTTGGCTGGAGATTTCTGGAAGtgaataattctaaa aatgggattttaagactttcagacttttaagagtaaaaaaacaattattc aAAATGGACAAAAGAGCTGAATCGAGAGTCaagatttttcatgaaattat tcaacatgaatTAAGCTGATGAATAATGATTAATAACTGTAACTgcaaac aaatattttcataacATATGGTCTTGGTTTGCAATTTGAGTTTGAATTCA AAAGTTCACACCTGAAAGTTGCATTCAAGAAGCTaaactttcaattaaaa agcTATAATAGAGTATGGTTTTAGATATGAAAACGTATCAATTTCCTAGA TTAATAAATATAACAAAAGTTAGATAGTCGTTAATTGTAAAGAGTAATCT TAAAAACTTCCATCATTTTTTGAAGCGTTTTGAAAACTTGAAGACCTTAG tttttttGATCAATAATGCAATATGAAACGAAGCCAAATTTGATCAAATC TGGTATATCTTgaagttgtgatttttttgcattggtatttaaatttaaaa gatcCCTTGCATTAATCAGTGACTTCAAGCTGGGTACAGTTGAATGAACC ATaaaaaaaCTTGCCTTTTACTGGACTTTTAAGCCAAAAAGGCACAAAAA GAGTAATTTTGCAGCAAAAGTAGAACTTATTTTGAAATGACAATAAATAT CATaacaatttagattttttttatcaaaagatgtattatattataaaaga agaagttattataaaattttagaataaccaTTTTTAAGCAGTTAAAACTG CCTTGAAATAGTTGTGTAGCCTCTTGGTATAACACTTGctgtacaaaaat ttttgttttgctttgtcgtttttgctttttttaagaatagaaattttagt ttcttttttctcattttatttgtttttttattgataatgtgAATATATAA CAAATTTAAACAAGGAAAACATGGAAGGTTATTCATATTTAATGACATAA AGGGATAAACCAGCCACACTAAAATTTAGTCAAATTCTTAGGACAAAAAC ACATTCATTTAAATCCAAAAAGCT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:706519..720942+

>MSTRG.13979.6.p1 ID=MSTRG.13979.6.p1|Name=MSTRG.13979.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:706519..720942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCCGGACTTGTCAATTGTTCTTGGTTCTCGTCCATAGAACATTCTT
ATTTGCAGCTGTTCTCATTGGAGGAACCTACGCCATCAGAGCTATCGAGA
ACCACTATCGAGAATCGATTTCTCATATGGAGCTGAAAGATGCAGCTGAA
TATTGCTATACCATTCTAACGACCATAGGTTACGGCCGTGAGAAAACCCT
CCCTACATCAGACTGGGGCAAAGTGTTCACCATTGTCTACGCAATCATTG
GTATACCAGTCGCCATTTTCACTGTCGGAGCATACGGAGCATTCCTGAAG
CATTGTGTGTTGAAGTTAATCATTGGTTTAGAGCACTGTTGTTGCTCATG
CTGGCAAGGCAAGAAAATGAATCTCAAAGTGCTTATTATATTGATTCTCC
TTTTCATTGcagagttcttttgttttggagtCTACGTTTGCTGGTTGGAA
GACAACAACCAATGGAattatttagattctgtttacAGTTGGTTTCTCAC
CATGACAACCATTGGATTTAAACAACACAACCCGTACCCAGACCACTTGG
ATCTGTTACACGCCTTGGCCTACCTGGTTACCAGTCTATTCAGCATCATA
ACTCTGGCCGCCATCTTTCAAACCGTTCAACAAATGATTGACGCTGTCCA
CAACCAAGATCGCAGCATCTGCGCCATGTTGTTTTGTTGTTATAGCAACA
ATAAGAAAGATGCATACCCAATGGATAAATACAATTCGAATCATAGTATG
CGATATGCAGAATATCCTCATGAATAAATGATCCGGACTTGTCAATTGTT
CTTGGTTCTCGTCCATAGAACATTCTTATTTGCAGCTGTTCTCATTGGAG
GAACCTACGCCATCAGAGCTATCGAGAACCACTATCGAGAATCGATTTCT
CATATGGAGCTGAAAGATGCAGCTGAATATTGCTATACCATTCTAACGAC
CATAGGTTACGGCCGTGAGAAAACCCTCCCTACATCAGACTGGGGCAAAG
TGTTCACCATTGTCTACGCAATCATTGGTATACCAGTCGCCATTTTCACT
GTCGGAGCATACGGAGCATTCCTGAAGCATTGTGTGTTGAAGTTAATCAT
TGGTTTAGAGCACTGTTGTTGCTCATGCTGGCAAGGCAAGAAAATGAATC
TCAAAGTGCTTATTATATTGATTCTCCTTTTCATTGcagagttcttttgt
tttggagtCTACGTTTGCTGGTTGGAAGACAACAACCAATGGAattattt
agattctgtttacAGTTGGTTTCTCACCATGACAACCATTGGATTTAAAC
AACACAACCCGTACCCAGACCACTTGGATCTGTTACACGCCTTGGCCTAC
CTGGTTACCAGTCTATTCAGCATCATAACTCTGGCCGCCATCTTTCAAAC
CGTTCAACAAATGATTGACGCTGTCCACAACCAAGATCGCAGCATCTGCG
CCATGTTGTTTTGTTGTTATAGCAACAATAAGAAAGATGCATACCCAATG
GATAAATACAATTCGAATCATAGTATGCGATATGCAGAATATCCTCATGA
ATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13979MSTRG.13979Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13979.6.p1MSTRG.13979.6.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13979.6.p1.exon1MSTRG.13979.6.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13979.6.p1.exon2MSTRG.13979.6.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13979.6.p1.exon3MSTRG.13979.6.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13979.6.p1.exon4MSTRG.13979.6.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000114_pilongenomesc0000114_pilon:706519..720942 +