MSTRG.1396.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1396.3.p1
Unique NameMSTRG.1396.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2780522..2827719-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1396.3.p1 ID=MSTRG.1396.3.p1|Name=MSTRG.1396.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=47198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2780522..2827719- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGGATTAAAAATTTTTCAGAGAGGTACATAACTGCTCTGGGAGAGGGATA CATAACTGCTCTGGGAGAGGGATACATAATACAGATCAGAATGTAAATTT GACCAAAATCGTGTATTGACTGATTGACTCGTTTGATTTGACTGAAATTT GTTCCTGAAGGCTGGTTTGTCAAATAGAAGAGACTAGTGACAGAAAAATT CGTTCACATGAGTGTTTGGGACTTTACAGACCGGTCTGTAAAATACACGC TGACCACCAGCCGGAACTCAGGAACTGCTATTGTGTTTGACTTGAAATTT TCACCAGTGACAGATATTGACCATCTTGGATAAATTTCAATTTAGTCACT TGAGTGGTTGTTTTTTTACAGACCGGTCCGTTTTCTACCTAAAATGCTCA CTTTCAGCATAACCACTGGTCCGATTTTTGCTAAAATTTTGGCTGCAAGC TTGTATCATCAATACCTAACATACCTAACACTTATCAAAATTTCAACTCA ATAGCATTTTCCAATCACTAGATACAGTTTTCTAAGGCTGTTTAGGCAAA AAAGGGCAATTTTGAGCCAGTCTGTAAAATACACGATACCAACAGATGGT AAAAATTTGAAAATACATGTCACGTGGAGTTGCCACACAAATTTTTGCAA AAAAAGTTAGAGGGGGGGGGTCCTATTTTCACTATTTTCAATGAATGATG ACGTCGTCAGGTGGCGATGACGTCATTAATAATGTCTAAATTTTTACCAA AGATGCCAATTCATATTTGGTGCACACTTGCAAAATTTTAAGTCAATTGG ATAAATATTTCAAAAGTTATCAAAAAAATCCTTGAAAAGGGGGACCCTTT GCCCGACCTCCCCCCTCAAGATGCTCAAAGGTTTAAAATAACATACAGCA TGAATATTATAGTACCTTCTTTATCTTTATTTATTCTGCCAAATTACGAA 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TAATGGTGATATTCTTACCATATTCTTAATTGTTTGACCAATTTCATCAT AACTATTCTTATAAAGTATATTCTTATAAAGTATATTCTCATCGAAACAC AACTTTTACTAGAACAATCTTATCAGAACAATATGGTTTAAAGACACCAA AAAATAAGAACAATTAACAAATCCCGACCCTGGAATTAGTAAATTTAAAT CAAATGATAAAATTAACGGAAAACGGTATTTTAAAATCAGAAGATGACGG TATTAAGCCTTATTTTTGTCATTATGCCGGTATTTTAACCTCTACAAACC GGTGTGACGGTGGTGTTATTTTTTCAATTTTCGGGATTTTGGGATTCATT AAAAATTTTGACGGGAGAATACCTCCCCCCCCCCCCTTTTATAGCGCTAC ACATAAAATTGGCCACAAATTTTTTAATGACAAAACAGGAAATTTCGAGA TCATTTCTCCAACACGTAAGTATTGACATTTTTTTAAGTGAAACGAAACA CAAAAAAGGGTTTATAGGTGTTAATGTACTAACGGATATTGGTAGAACAA AATTCTTACACGAAATGTCTGGAGCAGAAAAAAAGTATTTTTAGTCATCT TATTTGTATACATGCAGATGAAAGGAAGTGATCTATGAAGTTAGATCGCC GCCAAAATTCGATCCTTCAAGTCGTCCCGTCGTACTAGAAGTTGTCACGT CGCACTAGAAGTCCGCAGGTCGCATTAGAAGTGCGCAAGTCGGAATCTTT TGAAAGTCGAAACATTCCAAATTTTAAGTCGAGTCGTTGCCTCAGAAGTT GACTCGTCGCAAATTTCGGCAGTCGACTCATCCCAAAGAGTTGGACTCTA GGCTATTCCGAAAAAAAACTTTATTGTTTCGTATATCAAAATCAAAATAT TGTGGAGATAATGTTATGTTCGTGTGGTGTGCAATGTGAATTTATATTTA 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AATATTTTTTGTTGGAATTGAAAAAAGTCTCTCTTTTTTGTTTTTCAACC TGATATTTATGGATTGTGACAGTATAACTAATATAAAACAAAATATTAGC TCGATTGATTACATACTGATTTGTGGATTTGATAGCTCTTTATAGGCCTC AACTCCTCTACAGATCTCTGTGAAGTAAAAACAAGTTTGTAGCCATTATT GGCTTTCCCTTAAAAAGATCAAGTATTACTAAAAGAAGTCTTATTACAAA AACCGCACTAGTGAATAGAAAATATTTTTAGAGGCGGAGCACTTTCGTCT TATTATGTTCGAGTCATTAATTTCCTTCCATTGACACTTTTGTTGTATGT GTTATAACATAAAGAGAAAAAAAAAGTCACAGCCATGACCATACCATTTC TCAGCCCAGTTTCTTTTTTAGCTAGTCTTTCCTCAATAAAAAACTTTGTT TCTCTTTAACACTATCAAAAGTAAACAAGGAATCATAAATGAAAAAACTA AACAAGAATATTTCAGTGTCTGCTATGGTAAACATAATTTTTTTCCTTCT TTCGCAAATTTTCCCTATGTGGAACAAAAAATTTCTTATTTCTAAACATA AAAAAGTAGAAAGAACTAGAAAGAAAATTTTGTTTTGTTTTTGTATATTT TCTACAGTGACTGAAAAGAAAGCTAAAAACCACATGAGGCGCTACAGCAA GAAAAATCATCACCTATCAGATATAAGAATGGAATTCAATCAAAAATTTG ATTGACAGCTCTAGTCAAAAGAATTCTTATACGTACTGAGCGAGAACAAT AAAAATGATTTTGACCTGTCAATCAAACACCCATTCTCTCCTCCTATTGG CTCAAAACGGATTCTCTTTATTTTGTTTTATTTTTTTGTATTGATATGTA GTAATGAGCCCGTGCAGCTGGCCTCTTATTACATTTTGAGAAAACAATCG ACTGCCATTATAATTCATAACACGCTGAGTAATTTTGACGAAAGATTCGC GCGGAGAGAAAATCATTTGAAAAGAAAGAAGGAGAGGGGAGGGAGAGAGA AAGAAATATCTCGTGCACACATCTATATACTTCTCCTCTTTTTTATATTT TCTCAGAATTAATTCGCCAAACGGCCGTCGACGACTACAGACGTAAAAGT TATACAAAAAAACATCAGAAGAATGCGTCCCTACGCAATCAAGAAAGACG ATGCGAAACTCGGCACTAATATTGCCCATACCACGGTATGTACTTAATCC ATTAACTTTTTTTTACCAACATAATAAAAGAGAGAGAGGGGGAGAGAAAG ACTCTCCTTTTTTGTTTAAACTAGGGTTAGCAATCATCTCAGACATTAAA AAACCACCCCCTTTTTAACATAAATCTCCGCCCCTAATATTGGAGAGATC TGGTTTTTCTTTTCTCAAATTATTTTTTTTAATATAAAAGTGTTTTGATT TTGATTGCAGAGTATTCAACCGTCACCATTGGCCCTGCTGGCAGCAACAT GCAGTAGAATTGGTGATACGTTACAAGAATCTCATCCAGTCTTCACTCAA AAGAACTTAACAAATTTCATTGAGAAAAAGATATATGATGCGAATACGAG ATCGTCAATTACTTCATCAACAACACAACATTTTAACATCGACCAAACGA ATAGGACAACAAACCTTCCACAAAACACAAACTGTTTACATCACTGTCAA CCAACCACCGAAACGCTGGATCTACCAAATACAAACACGACCCAATCTTT CCACCACCACACACCGTCTAACAAACAACTCACATCATCCAACTTCAAAA TCAAAATTGAAGATTTAACACCGCAAACAACGGCTGGAACAATCCCAACG AACAATACTTTAGACTATAATCAAAATTATACAGAAAGTATGCATATATG TCCTAACATTGTCAACGAAACGAGAATGTTTGAACCTCAAGCAAGGCCTT CGTTTACGCATTCTTGTCGCCACGAGCCCGCCCATTCAACCTCAAGTTGT GAACATCAAACATCAAGTGCTATTCAGATTCAACATCAGTCTTCGTGTCA ACACAGTGCTAGTGAGAACACTTCAACTTTAACTCATATCCCGTCTGGTG CAGTTTCACCAGCCAACTCGAGCACATCGTCTTGTTTATATCAACCATCA TCTACTGGTAGCTCAACCAGTCATCAACAACTTTCACCGAGCTGTGGTCC TGGTATGACAACATTGAGTCATTTACCAATTTCTACCAACGCTTCATCTA CGCTTAACAATAATAATCTGTTCGCTGATAATTCGTCTTTCGCTCGCACT AAATCGACAACATCAATCAACCCTTGGCAAAATCAATCGGTTCATCGCTT GGGAACACAAGAGACAATACACAAACCATCCTGTATGATTCACGAAAATT CTTCTTTCACCGGGGGCCAAACTACCCATAATACGGTACCATCAAGTCCT CAAGAGAGAGCCTTTCGTACCTATTCGCCACCTGAACAATTTTCCTCAAG TTTCAGAAGTCCTGAATATGGACCTCCAAGCGTCGAAAGCCATCATTCAG CGCCTTCTCATTATGGTTCTTCAAGTCAACCTATCCCGTCGCCCCACCAT CATCAACAACAACAGACTTTTGACGGTTACGGCGCACCTTCAACTTTCGA AAATATGGATGTCAAGCCAGACCCGTACGCTTTACAAAACATGAGAAATT CTTCAGGTATGAGTTACGATTCACATCCTCATAATATGAGCACTCCTCCT GAATCTATGCCCTTACAAAGTCCGCATTACATGACTCATGGACATCCAAC TATGGACTACGGAACGGGGTATCCTGGTAGTTTTCCTATGCATCAAAACC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2780522..2827719-

>MSTRG.1396.3.p1 ID=MSTRG.1396.3.p1|Name=MSTRG.1396.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2780522..2827719- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCAATCAACCCTTGGCAAAATCAATCGGTTCATCGCTTGGGAACACAAGA
GACAATACACAAACCATCCTGTATGATTCACGAAAATTCTTCTTTCACCG
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AACGGGGTATCCTGGTAGTTTTCCTATGCATCAAAACCCGGACATGGTCG
GAAACCCGATGGCTGGTCCACCGGATATGATCCCACCACCGAACTTTGTT
GATTATCAATATCAACAACAAATGTTTTATTCACGTGAAAACCGTAGACC
ACGCCGTATAGCTTGCACGTGCCCGAATTGCCGTGACGGAGAAAATAAAA
CTGTTACAACCAAAGACGGGAAACAACGCAAACTACATATTTGTCATATA
CCTGGATGCGGTAAGGAATACGGGAAAACGAGTCATTTACGTGCGCATTT
ACGGTGGCACGCAGGCGAACGGCCCTTCGCTTGTAACTGGTTGTTTTGTA
ATAAACGTTTTACGAGGTCAGACGAATTGCAAAGGCACCGACGTACTCAT
ACTGGTGATAAGAGGTTTGAATGTAACGTTTGTTTGAAGAAATTTATGCG
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CTAATATTGCCCATACCACGTATTCAACCGTCACCATTGGCCCTGCTGGC
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TCACTCAAAAGAACTTAACAAATTTCATTGAGAAAAAGATATATGATGCG
AATACGAGATCGTCAATTACTTCATCAACAACACAACATTTTAACATCGA
CCAAACGAATAGGACAACAAACCTTCCACAAAACACAAACTGTTTACATC
ACTGTCAACCAACCACCGAAACGCTGGATCTACCAAATACAAACACGACC
CAATCTTTCCACCACCACACACCGTCTAACAAACAACTCACATCATCCAA
CTTCAAAATCAAAATTGAAGATTTAACACCGCAAACAACGGCTGGAACAA
TCCCAACGAACAATACTTTAGACTATAATCAAAATTATACAGAAAGTATG
CATATATGTCCTAACATTGTCAACGAAACGAGAATGTTTGAACCTCAAGC
AAGGCCTTCGTTTACGCATTCTTGTCGCCACGAGCCCGCCCATTCAACCT
CAAGTTGTGAACATCAAACATCAAGTGCTATTCAGATTCAACATCAGTCT
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CATCGCTTGGGAACACAAGAGACAATACACAAACCATCCTGTATGATTCA
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TGTTTGAAGAAATTTATGCGTTCTGATCACTTATCAAAACATATGAAAAC
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CTAATGATAATAATGCTATTGAAAAGAACATGGCTGCTGTCTCTAAAGGC
ACTCCAATAAATAAACAACAAACTATGATCACCTCTGATCATCAAGCTTC
GGTCGTTCACCATCATCATCATTTGGACCAAAAGTCAACAAATAATTTAG
GATTAATGCGAAACTCGGCACTAATATTGCCCATACCACG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1396MSTRG.1396Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1396.3.p1.exon13MSTRG.1396.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1396.3.p1MSTRG.1396.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
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