MSTRG.13771.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13771.1.p1
Unique NameMSTRG.13771.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:965638..980602+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13771.1.p1 ID=MSTRG.13771.1.p1|Name=MSTRG.13771.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:965638..980602+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aacataaaatgaaaatactcACAAGCTTCGGAAGATTCAGATATCTCCTC TTCCATTTCTTGAAAATAGATTTATGGCAGAGTGAAATGATGCACAGTCA GACTTTCAGAAGTGTAATCTGGCAATCTCGTCTCAAAACGAAAGTTCGTA AAAATTTTGGTACCATTATGAATTTTAGGAAGCTCATTCAAAAAGTACTA CCTTAGCTAATTCCAGGCATTCCAGGCCGTTTTGAAAACTTCCATACTTT TGAAGTACACTATCTTGAACTTTTTTGTTGACAAACAAAGCGAGTCTTCC cgctgtttttattttatcggtCGTCATTATAGCCGGTTCTCCCCCTCCCC CTCTAGTTTTAATGTCAAGATGGCGGCGAAGAAGTGCCTGAATTTTGAGA TTGATTATTTTGTTGACATCGCACGCCAAATTGCTTACAAAAGGTTCATA CACAAAAAGTATTGGTGAGTGTTCTTAATGTTTTTAGACCTTTTAGCTTT TCTGGTTTATTGGGTACCGTGAAgtcttgcatcagtggagggtaacTTGC ATGATGTGAAGTCGGGtataatataggtatataaacttagtatatatata AACTTGCATATCAGTCGatatcagtggaggctaacatgcatagccctcaa atgaatgacctggatggtccttaaaatacaaagttaaatcaaaacaaaaa tggtatagtagagctgcgagcggagctgcgtggttcatttgttttgaaat tttgctgctttgttttgattggtcagtcatttcaGGGCTATGCATGAGCA Tgtttagcaactccagaagatctttttcaaaatctatcctatcttttaga gctttgaaaaagaaagaaaatgaggggtcataggcctccagaggattagt ggttgtaaagatattcaaattttagtgtcaaaaatttgactaataatgtc 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:965638..980602+

>MSTRG.13771.1.p1 ID=MSTRG.13771.1.p1|Name=MSTRG.13771.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4095bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:965638..980602+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATATTTTTATGAGCCAGATGTCGGGAATTTTCATTACGGTGTTGGCCATC
CAATGAAGCCACATCGCTTATCACTCACACATAACCTCGTCTTTAACTAC
AATCTGCACAAGAAAATGGATATTTTCCGACCCTACCAAGCCACAGCGTA
TGATATGACTCGCTTCCATTCTGAAGATTACATACACTTCTTGCAGCGTA
TTACACCCACTAATAAAGCAGGATTTGCATCGTCTTTCCATAAGTTTAGT
GTTGGTGATGATAGTCCTATCTTTCCTGGATTGTTCAATTTCTGTTCGAT
GTACACTGGAGCTTCTCTACAAGGTGCTGTCATGTTAAATAACAAACTAT
GCGACATCGCTGTTAATTGGTCCGGTGGTTTGCACCACGCCAAGAAATTC
GAAGCGTCCGGATTTTGTTACGTCAATGATATCGTGATTGCGATTCTTGA
GTTATTGAAATATCACGCTCGTGTTTTGTATATTGATATTGACATTCATC
ATGGCGACGGCGTGCAGGAAGCTTTCTATTTCACCGATCGTGTCATGACA
GTCTCGTTCCACAAGTATGGGAATTTCTTTTTCCCTGGTACCGGAGATAT
GTATGAACTTGGGGACGAGACGGGAAAATATTATTCATTGAATGTGCCGT
TGCATGATGGGATTGATGACCAGACTTACATAGCATTGTTTAAACCTGTT
ATTCAGGGAGTCATGCAGAAGTATCAACCAACCGCTATCGTGTTGCAGTG
TGGTGCTGACTCGCTAGCCCATGATCGGTTAGGTTGTTTTAGCCTGAGTA
TCAAAGGACATGGAGAATGTGTTAATTTTGTGAAATCTTTTGGCGTGCCG
CTTTTAGTTTTGGGCGGTGGCGGGTATACAATACGTAATGTTTCTCGGTG
TTGGACTTATGAGACCGCATTATTGGTCAATGAACCGGTAGACGAGAAAA
TACCCATCACTACAGACTATTATGGATTCTTCGCACCTGACTATCAACTG
TGTCCAGCTATGAGCGGAAATTTCTCGAACCAAAATAGTAAATCTTACGT
GGACAGCATCCGACAGACGGTTTTTGATCATTTGAAGTTTGTCCAAAGTG
CACCCAGCGTTCAGATGCAAGACACGCCACCCGATATTTTTTCCTTCGAG
CCGGACAATGAGGATGATAATTTAGATGAGAGGCTGGAGACTGGGAAGCG
TGAAGCAAACAACGAATTTTACAACGGTGAACACGATGTCGACAAAACCA
ATACCGAGAAACCTCATCCATCCGCTCTTTCCGCTGCTCAAAACAAACCT
AAAGAAATAAATAGTGAGAAAAGCAAAGAGAAAAATACAGGCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13771MSTRG.13771Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13771.1.p1MSTRG.13771.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13771.1.p1.exon1MSTRG.13771.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13771.1.p1.exon2MSTRG.13771.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13771.1.p1.exon3MSTRG.13771.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13771.1.p1.exon4MSTRG.13771.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000111_pilongenomesc0000111_pilon:965638..980602 +