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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13737.1.p1 ID=MSTRG.13737.1.p1|Name=MSTRG.13737.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8224bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTTTAatccttttttcatttcagtaaGTGTAAATTTTTAACATGAATGGA
ATCTGTAACAAGAAGATGATAATATGAATCGATTTTTGTTTTCATCGGCA
TCCATCTTAAGGAGAGAGGTGTTGATTGCTCAGAGGGGGATTGTCACTTG
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CTTTATTGAGTGTTTATATTGGCTAAGAACTGTGGTGCAggggtagagca
tccggctacgattcacaaggttgtgggttcaacccgcagcagccaggtca
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TGGATtaggtttctaaaatttaatCTTGAATTCAGTATTTTGGCTAGTAT
ATACGAACATAAGTTCTTAGAAAAGTCCctgctttttcatttttattgta
cTGTAGACTAATTGAAATATACTATTTAATGAACAAGTGATCCCTTATGA
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taagattttgctgGTCAAATAATacaagtggagcaatccagagagaaaga
gtggcgacctcccctaccttcgggtgaatagctatcgaaagaagagcctt
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GATGGTGAATGGTCTTCTATTCCAGCTTTCAATCCCTTTGAATTTCCTTG
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ttgtttttatgatTGTGAttatcttttgaattctatcaaCACACTGGTAA
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ATTATATAGTACTCTAAGAGGCGCATCtgttaaaagtaattttttatttt
ctttaccaAAAGTTACTTTAGCCCCCTAGGAggggggggcttattcttaa
aaatccaAAAGAAGTTGGGGGCTGGAGCTGTTTACAATATTTCGGGCATT
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TGGGAGAAAAACCTAGGCTGACGCTATGAATTTTGCAGATCTtcttttca
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ttgactttcaaagAGCGTCTAGGTCAAAATGGCTTTACTTACTTCAATGC
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GGAGTCTCAAGAGACGGTAGGATTAATTATTTTACTGATTACAACTAAAG
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TGCTAACATCTGACAAACAACAAGACATCGTCTTTGAGAATGTAGCTTTC
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ATCTCGATTATTCCCCAGGTAGGAGACGCTTTTGAATGATAGTTATATtt
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AGTTACTGCAGAATCCAGACTCATACTACGGTTATTTATgggaaaaacaa
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GTAGGGCCTATGATCTGATTTGGAGTGTGTATGGCTACTGGAGCCTTATG
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CTTATGGTCGATTTTCGGGTTTTCCTGAATCAGCCAGCcttattttcttt
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CAATAGATTGAGTTGATTTTCCTTCTAGTTTTTGTACCGTCATTTCGTTG
CATTATTTACCTATCACTTTCTATGAGATTCAAGGGAAACAGTTCAGTTA
GGATATTGATTATATTTGTTTCAGACCCACCAAATCTACTAGTTGATTTC
AAGCAAGGTTTACAGAATTATACTTTTGGTTTCTAAATCATTTTTAGata
tgttttttgaaattgtatttAAAATAGTTAGgctttgaataatttttttt
tacaattttacatacaaattggatgagcttttctgttttaatttcgtgtt
tttctttgattatattttgtttta Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ >MSTRG.13737.1.p1 ID=MSTRG.13737.1.p1|Name=MSTRG.13737.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=26637bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAATCGATTTTTGTTTTCATCGGCATCCATCTTAAGGAGAGAGGTGTT GATTGCTCAGAGGGGGATTGTCACTTGCGTCAATTATAATAATACTGGTG GATACAATTCAACTACAAAGCAAATATCAAAGaATTACAATGGACATGGA CTTGGAAGAACTCCTTTATACATTGGCCTTCGTCACCACAGTGGGGTCAC TGTTGATAGTGACAAAATGGATAAAGAGCTAGATACAGTCAAAGTACTCA ACACCCTCGGGAGCCAAGTGTGGCCTGCTGGTAAACCTGCAATAAAAGCT AGGGTTGTTACAGCTCTCAGCTTATTAATAGGATCAAAgCTTCTCAATGT CCAAGTACCCTTTTTATTCAAATATGCAGTAGATTATTTGAATAGTAATC CCGTAGCCATTGGAGATGTCGAAACTGCCATGGTATCAACTGCTACTATT CTCATACTTGGCTATGGAGCAGCAAGAGCTGGTGCTTCTTTATGCAATGA AATGAGAAATGCAGTGTTTGCTCGTGTTGCTCAAAACTCTGTTCGAGAGA TGGCACAACAGACCTTTCTCCACCTACATTCTCTTGATCTAAGCTATCAT CTCAGTCGCAAAACTGGAATGCTATCCAAAGCTGTTGATAGGGGCACTAG aggAATATCTTTCTTCCTCAATGCCATGGTATTTAACATTGTGCCAACTA TATTTGAGGTTTCACTGGTCAGTGGTATTTTGGCATACAATTGTGGATTA CCATTTACGATAACTGCTTTGACGTGTCTTGCTGCATATTCTACATTCAC ACTTTCAATAACACAATGGAgaaCAAAATTCCGAGTCCAAATGAATAGAG CAGATAATGAAGCAGGTTCCACAGCCATCGATTCTTTGATCAATTATGAA ACAGTCAAATATTTTAATAATGAAAAGTATGAAGCTGAAAGATATGGCAA ACTGTTGCATCAATATCAAGAAGCATCTTTAAAGACGACAACTTCTCTAG CTTTCTTGAACTTcggtcaaaatttcatcttcTCAAGCGCATTGACAGTG ATGATGTTACTGGCTAGTCAAAGCATTATGCAAGGAACGATGACTGTAGG TGATTTAGTGATGGTGAATGGTCTTCTATTCCAGCTTTCAATCCCTTTGA ATTTCCTTGGTTCAGTGTATCGTGATTTGAGACAATCATTGATCGATATG CAAAGCATGTTCCAACTGATGGATGAGAAAAGTAAAATCAAGGAAATACC GGATGCACCTCCACTGATGCTAACATCTGACAAACAACAAGACATCGTCT TTGAGAATGTAGCTTTCCAATATGAGGGTGGTGCACCAATATTCAACGAT TTATCGATGACCATCCAAGCTGGCAAAAAGACTGCCATTGTTGGAGGCTC TGGTTCTGGGAAATCGACCATCGTTCGAATGCTGTACCGCTTCATGGAGC CCAATAGTGGTACAATCCGAATAGGTGATCAAGTCATAAGTGACGTCACT TTATCTAGTCTCAGAAAGAACATCTCGATTATTCCCCAGGATCAAGTCCT TTTTCACGACACAATATTTTACAACATCAACTATGGTGATTTAAATGCGT CCGCCGAGGACGTCTTCGCAGCCGCCCGAACTGCTGATGTTCATGACAGC ATAATGCGTATGCCCGACGGGTACGATACGCGGGTCGGTGAGCGTGGTTT GAAATTGTCGGGAGGCGAGAAACAACGTGTCGCGATCGCACGTGCTATTT TAAAGGATTCGTCGATCATTCTGTACGATGAAGCAACTTCCTCTCTGGAC TCAATAACTGAAATGAACATTTTGAAATCTCTACGTGAAATCACTAAGAA TAAAACATCATTATTTATTGCACATCGATTATCAACTGTGGTCGATGCCG ACGAGATTATCGTTCTCGGCAATGGAGGTGTTGCGGAAAGAGGTACCCAT CAACAGTTACTGCAGAATCCAGACTCATACTACGGTTATTTATgggaaaa acaaaatgaaacaaagaTTGCTGAAGAGCAGATTTCTGAAGGTGGCTAAA TGAATCGATTTTTGTTTTCATCGGCATCCATCTTAAGGAGAGAGGTGTTG ATTGCTCAGAGGGGGATTGTCACTTGCGTCAATTATAATAATACTGGTGG ATACAATTCAACTACAAAGCAAATATCAAAGaATTACAATGGACATGGAC TTGGAAGAACTCCTTTATACATTGGCCTTCGTCACCACAGTGGGGTCACT GTTGATAGTGACAAAATGGATAAAGAGCTAGATACAGTCAAAGTACTCAA CACCCTCGGGAGCCAAGTGTGGCCTGCTGGTAAACCTGCAATAAAAGCTA GGGTTGTTACAGCTCTCAGCTTATTAATAGGATCAAAgCTTCTCAATGTC CAAGTACCCTTTTTATTCAAATATGCAGTAGATTATTTGAATAGTAATCC CGTAGCCATTGGAGATGTCGAAACTGCCATGGTATCAACTGCTACTATTC TCATACTTGGCTATGGAGCAGCAAGAGCTGGTGCTTCTTTATGCAATGAA ATGAGAAATGCAGTGTTTGCTCGTGTTGCTCAAAACTCTGTTCGAGAGAT GGCACAACAGACCTTTCTCCACCTACATTCTCTTGATCTAAGCTATCATC TCAGTCGCAAAACTGGAATGCTATCCAAAGCTGTTGATAGGGGCACTAGa ggAATATCTTTCTTCCTCAATGCCATGGTATTTAACATTGTGCCAACTAT ATTTGAGGTTTCACTGGTCAGTGGTATTTTGGCATACAATTGTGGATTAC CATTTACGATAACTGCTTTGACGTGTCTTGCTGCATATTCTACATTCACA CTTTCAATAACACAATGGAgaaCAAAATTCCGAGTCCAAATGAATAGAGC AGATAATGAAGCAGGTTCCACAGCCATCGATTCTTTGATCAATTATGAAA CAGTCAAATATTTTAATAATGAAAAGTATGAAGCTGAAAGATATGGCAAA CTGTTGCATCAATATCAAGAAGCATCTTTAAAGACGACAACTTCTCTAGC TTTCTTGAACTTcggtcaaaatttcatcttcTCAAGCGCATTGACAGTGA TGATGTTACTGGCTAGTCAAAGCATTATGCAAGGAACGATGACTGTAGGT GATTTAGTGATGGTGAATGGTCTTCTATTCCAGCTTTCAATCCCTTTGAA TTTCCTTGGTTCAGTGTATCGTGATTTGAGACAATCATTGATCGATATGC AAAGCATGTTCCAACTGATGGATGAGAAAAGTAAAATCAAGGAAATACCG GATGCACCTCCACTGATGCTAACATCTGACAAACAACAAGACATCGTCTT TGAGAATGTAGCTTTCCAATATGAGGGTGGTGCACCAATATTCAACGATT TATCGATGACCATCCAAGCTGGCAAAAAGACTGCCATTGTTGGAGGCTCT GGTTCTGGGAAATCGACCATCGTTCGAATGCTGTACCGCTTCATGGAGCC 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:244817..253040 + |
|