|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13737 ID=MSTRG.13737|Name=MSTRG.13737|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8224bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:244817..253040+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTTAatccttttttcatttcagtaaGTGTAAATTTTTAACATGAATGGA
ATCTGTAACAAGAAGATGATAATATGAATCGATTTTTGTTTTCATCGGCA
TCCATCTTAAGGAGAGAGGTGTTGATTGCTCAGAGGGGGATTGTCACTTG
CGTCAATTATAATAATACTGGTGGATACAATTCAACTACAAAGCAAATAT
CAAAGGTATTGTTTGAAAAGCTAGTCAACACACAATGGGCGTTGTTTTCT
CTTTATTGAGTGTTTATATTGGCTAAGAACTGTGGTGCAggggtagagca
tccggctacgattcacaaggttgtgggttcaacccgcagcagccaggtca
taccaaagattctcaaaatggtacttgatgcctttctgcttgatgctcag
caattatgagaaggatcaagggtacgtggagaaatccagggagaaagagt
ggtgccctcccctaccttcaggtagatagctatcaaaagaggagccttAG
GGTTGCCTCCAACTGCGGTcgtagacttacttacttattatGTTGCAtgc
tttgttttttataaacctTTGAACCTTATTTAACTAACCTCCAAACATAG
CTAGTTATTTAACTTTGAGTACAGTACTTCTCAGTCAATAGTTATAGAAA
ATATTTGTGTAAGTAAGTATAgaagtttcaattttattattttcaatttt
tcaattttccagaATTACAATGGACATGGACTTGGAAGAACTCCTTTATA
CATTGGCCTTCGTCACCACAGTGGGGTCACTGTTGATAGTGACAAAATGG
ATAAAGAGCTAGATACAGTCAAAGTACTCAACACCCTCGGGAGCCAAGTG
TGGCCTGCTGGTAAACCTGCAATAAAAGCTAGGGTTGTTACAGCTCTCAG
CTTATTAATAGGATCAAAggtaaagaactttttatttttgaccatttatt
tttAGCACATTTGGATTAAATCATACATATTATAATTGGACTGAACTcta
agtttttacaagctcttatttgatttggttggtcgttaagatgtaataaa
agaatcttattactttttctaaagaacgcgtcatctctatcactttaata
aattaccaattagtgaagtatcttgtaaaaactcaagCTCATCCCAATGT
TCAATCTATTGGAGCTAGAATGAATCatcttttattaatttttttttatt
tctccaCAGCTTCTCAATGTCCAAGTACCCTTTTTATTCAAATATGCAGT
AGATTATTTGAATAGTAATCCCGTAGCCATTGGAGATGTCGAAACTGCCA
TGGTATCAACTGCTACTATTCTCATACTTGGCTGTAAGTCATCAAATCGT
AGATGCTATACCAGCTAATTTACTATCACATCACCCTTCAAAAGTAAAAA
CCTTACCTCACTTTCCTGTTCTCGTGGCTATGAACAGATTTTTTCCATTT
ACCCATCTGTTTCCTTCAAGTAAACTGATATTGTATTCATATCATAGATA
ATAAGAATAGATACCAGTGAAAAATATCTGTTTAAAGAATGCTTCCATTT
GCTTTGATTCTTGGTGAGCATTTTATGTTTTGCATATGCTTCCAAAATTT
TAGTTatcatttttgtatatttcATGTTATACtttgttttattctttgta
GATGGAGCAGCAAGAGCTGGTGCTTCTTTATGCAATGAAATGAGAAATGC
AGTGTTTGCTCGTGTTGCTCAAAACTCTGTTCGAGAGATGGCACAACAGA
CCTTTCTCCACCTACATTCTCTTGATCTAAGCTATCATCTCAGTCGCAAA
ACTGGAATGCTATCCAAAGCTGTTGATAGGGGCACTAGGTATGTCAAAGT
GTCCAAAGAGTTTTAGCCTTCTTGACTTTTTAATACAATTATCAATTgta
caaatgttttttttgagttttttgcaaaaaattaattcaaaatattacat
tttccttttagtttaaaaagaaaagtaacTCGCAAACAattgaattatta
tttttgttttaaccGTCTGACAACCCTCAATAATATTACTTCGAAGTAAT
AGAAACAAGTTTAAATCAATtacaaatcaaatttatttttgcatcttcag
ttttaaacaaaactatttttttctttttagaggAATATCTTTCTTCCTCA
ATGCCATGGTATTTAACATTGTGCCAACTATATTTGAGGTTTCACTGGTC
AGTGGTATTTTGGTGAGTCATTTTTCTATATTTAAAAGTCAGCTATTTAT
GGCTAAAGAAAATAATGTTCTGTTGGTAAAATGAATCCATTTAATACCTT
AATACGGATATtacttttcaagccaaaaataattcttgaaattgTGCAGA
TATCCccttgaaaaattgtaaaacttCTGAAAAATCCCAACAAAGGATTC
TATTGCtgcccttggaaaaattctctggaaatttgaaagattttctttga
aCCTTTGGAATATAAATCAGCTTCACCCCTGGaaatgtatggatataaaa
tagaACGACCCATtagattaaatttttcttcaagaatTCATTTTTTGTAT
ACAGTAATTCATACTTCCTCTTTTTTAACCAGGCATACAATTGTGGATTA
CCATTTACGATAACTGCTTTGACGTGTCTTGCTGCATATTCTACATTCAC
ACTTTCAATAACACAATGGAggtttgatatttgtttttaaatattttttg
tttgtcaTTATGCATTTGGgagcataaatttacattaacTTGACTCAAAC
CCCCCAGAATCCATCAATATTACTTAACAATTTGGTTCCATTTTATCAAT
CTTTCAAGAGAGTCATAATTGCTTTTAATCCCAGTAGAATCTGATACCCT
GCACATGGCACCTATTCACTCTAAATGCCATGCCTGTGTCagagaatctg
cccaggttggCACACTGCTTTTGAAGTAATAATTGCctcataatttcttt
ttcttagaaCAAAATTCCGAGTCCAAATGAATAGAGCAGATAATGAAGCA
GGTTCCACAGCCATCGATTCTTTGATCAATTATGAAACAGTCAAAGTAAG
AAATTATTTGAGAGTTTAAATcctcaaaagcatttttttaaccCTCCCTG
TTCGTCCTCACGCTCATAGCTTAAATTTGTCCTGCAAGTCTATATGACCA
ATACAGTAGTTGTCTATGTGAGAAGATTTGTACGGtattagtttaaaaaa
attatcgagAATTATTATACATATTGGGAAATattcagaaataatttttt
agatATCTGTAAATGACATAACAGCATTTGATACCGTGTATGGTATAAAC
AGCTCCAATGCTAGGATGATTTATTCGTTTGTTCTTCAAATTTCAAGGAA
TTAGATTTAATTCAGGATTCTTGTTCCTTTTCTTTTGTAGTATTTTAATA
ATGAAAAGTATGAAGCTGAAAGATATGGCAAACTGTTGCATCAATATCAA
GAAGCATCTTTAAAGACGACAACTTCTCTAGCTTTCTTGAACTTcggtca
aaatttcatcttcTCAAGCGCATTGACAGTGATGATGTTACTGGCTAGTC
AAAGCATTATGCAAGGTATTTAGTCTACTTACTATCGTGTATTAGTTCTT
AAAATATTCCCAGATCATCTACCAAAGTCTTACTACAACTAGGATGGCTG
TTAATTTAGCCTCATGAATTAATTAGTATTCCTtgcagggatttttctaa
gcactttgagctgTGGATCGTTTTTGTAAATTCAGATTGAGTTTCTAATC
TGGTTAGCAAAGCTATATGCATCCATAAAGCTGGGAGTTTGGGGACGCTT
CCGCCCTTCCCCTgatagttcggaccccccccctttcttaagggggggat
gataccttccaaaaaagtaaagaaggggtatcagaaattttcattaaaaa
gggggaTATCAAGGAGGGGGCGGGATCGTCTAAGaagggggcttacatat
attgtagattattttccagcactgttatgaaatttggtctgcatgaaagg
aagttctttattttcactaaaaagtggtaatatagttgccagacttaatt
tttctttactgtttctcTTCCCattttaccataaaaaaattttaaaggtt
ggggggatgccaagaaggggggggtcatttaagaaggggaggggatcatt
taagaaggggagggatcagacccctttcagcactatgcccccccccccca
gtgggtCGAGCTCCCCAAAAGAATGTTCAGATGTTTAATATGTATATGAA
TTATTTCTGTTTGTATACATCAAGAAGTTAAATTTTGTTAGTAAATTATT
TGGATtaggtttctaaaatttaatCTTGAATTCAGTATTTTGGCTAGTAT
ATACGAACATAAGTTCTTAGAAAAGTCCctgctttttcatttttattgta
cTGTAGACTAATTGAAATATACTATTTAATGAACAAGTGATCCCTTATGA
CTCTCTATGTTATTAGCTAGGTATTTTTCTCTGCGTTGCaagttttctga
atttttaaatttcttgtcATCTTCAAGGTTCTATTTTCAACgaaactttt
taagattttgctgGTCAAATAATacaagtggagcaatccagagagaaaga
gtggcgacctcccctaccttcgggtgaatagctatcgaaagaagagcctt
cgggtcgcctccgactgtggtcgcagacttacttacttacttaatacGTT
CTTAATACGTTCTTTTGTTGTTTAGGAACGATGACTGTAGGTGATTTAGT
GATGGTGAATGGTCTTCTATTCCAGCTTTCAATCCCTTTGAATTTCCTTG
GTTCAGTGTATCGTGATTTGAGACAATCATTGATCGATATGCAAAGCATG
TTCCAACTGATGGATGAGAAAAGTAAAATCAAGGCTAgttacttttttgt
ttgtttttatgatTGTGAttatcttttgaattctatcaaCACACTGGTAA
AAATTGCACTGACTGAAAAATGTCCACTCAGACCCTAGATCTGTACGTCT
ATTATATAGTACTCTAAGAGGCGCATCtgttaaaagtaattttttatttt
ctttaccaAAAGTTACTTTAGCCCCCTAGGAggggggggcttattcttaa
aaatccaAAAGAAGTTGGGGGCTGGAGCTGTTTACAATATTTCGGGCATT
CTAAGAGAGGGTGCTGGGATTTGAATTTGAAGGGAAGACTGGATAACTAG
CTATAGTTGCTTGTCAATTATGAGTTCTCGTGTTTTCGTTCTtatctttt
gtattttcatctttggtcttctttgaatttttattacTACCTCCTCTAAG
GGTGCTTCGAACTCTTCACGGAAAGAGCGAAATCAAGCAGGTAATGGAAT
TGGGAGAAAAACCTAGGCTGACGCTATGAATTTTGCAGATCTtcttttca
aatcttttcaGATGATACGATCAGTTCTTGTCCATAAggaatttcgaaaa
ttgactttcaaagAGCGTCTAGGTCAAAATGGCTTTACTTACTTCAATGC
TTATAGAAATTTTTCCCCAGCTCTACCAGGTTTGGaaaaaaaGTGGTTTG
GGAGTCTCAAGAGACGGTAGGATTAATTATTTTACTGATTACAACTAAAG
TtgtaaaaatcattattttatgCAGGAAATACCGGATGCACCTCCACTGA
TGCTAACATCTGACAAACAACAAGACATCGTCTTTGAGAATGTAGCTTTC
CAATATGAGGGTGGTGCACCAATATTCAACGATTTATCGATGACCATCCA
AGCTGGCAAAAAGACTGCCATTGTTGGAGGCTCTGGTTCTGGGTAAAATA
TCAATGAACGTTTGatgtgttttgatttctttcgtGATTATTTTTCAGAT
CAtattatttacttttgaagTTCAAAATACATTAATTTCACTAATTGTTT
GACTACCTAAACAGCATAACAGGGAGTTTGTTTTTCGATGTCATGATAGA
TTTAAAGCCCAATTTTTAAAACTCGTGTACCATTCTAGGAAATCGACCAT
CGTTCGAATGCTGTACCGCTTCATGGAGCCCAATAGTGGTACAATCCGAA
TAGGTGATCAAGTCATAAGTGACGTCACTTTATCTAGTCTCAGAAAGAAC
ATCTCGATTATTCCCCAGGTAGGAGACGCTTTTGAATGATAGTTATATtt
taccgaaaaaaaatcaaccagATATGCTTGCTCTTGGTTTGATTGTTTTT
GTATTCAATATTGATACCATATTCGTTTCATCGATACGAAACGACataat
tctgcataattcagaCAACACGAAAACTTGCATTACCCAATGTATTTTTT
CACCTGCAAATACCGAAAATCTAGATCTACTTTGTTGATAAAGTTTTCTC
CAATTATTTAACAGGATCAAGTCCTTTTTCACGACACAATATTTTACAAC
ATCAACTATGGTGATTTAAATGCGTCCGCCGAGGACGTCTTCGCAGCCGC
CCGAACTGCTGATGTTCATGACAGCATAATGCGTATGCCCGACGGGTACG
ATACGCGGGTCGGTGAGCGTGGTTTGAAATTGTCGGGAGGCGAGAAACAA
CGTGTCGCGATCGCACGTGCTATTTTAAAGGATTCGTCGATCATTCTGTA
CGATGAAGCAACTTCCTCTCTGGACTCAATAACTGAAATGGTTAGTGGtg
tttttactgattttttttgcatgaactGTCTGCAGAATGAGGAATGATTA
GACCCTTTCCCGTGCCAATGTGCCAATGGTTTTATCGACATTTGTTACCA
ATTTACTACATATATTTTTaaccggttttttttttttgatgcgGTCTGTA
TGTGTTTTTACGATGCAATGcgattggttgttttttttcgcatgacgacg
ggtaTTTATAGAGCGGAGCGttgttaggaaaattcatttctgacgtcaga
aattcacacaaactttttatctttttcagtCGTCTTTCTAGTCTTTCTCG
TTGTAAAGTACaaaaaaaTCGACCGAgttagaaaaaggaaaagagccctt
gattcttgaaaaaatagtaTCCTTGAAAGACTTTTAGTTATATAAAGCTA
TACGTTTACTTTAAAGAACATCGACACAAATATTTGAGGTAAATCTATAT
TTCCTTTTCAGAACATTTTGAAATCTCTACGTGAAATCACTAAGAATAAA
ACATCATTATTTATTGCACATCGATTATCAACTGTGGTCGATGCCGACGA
GATTATCGTTCTCGGCAATGGAGGTGTTGCGGAAAGAGGTACCCATCAAC
AGTTACTGCAGAATCCAGACTCATACTACGGTTATTTATgggaaaaacaa
aatgaaacaaagaTTGCTGAAGAGCAGATTTCTGAAGGTGGCTAAGAGTA
TGAATCAATGATATACTGGTGATGTTAAAGTTTGATGGTCAGGCTATGGT
GTAGGGCCTATGATCTGATTTGGAGTGTGTATGGCTACTGGAGCCTTATG
GTTTACTATCAGAGTATCTCTAAAGTCGTTTATTCATGCAAGGAACATTT
CTTATGGTCGATTTTCGGGTTTTCCTGAATCAGCCAGCcttattttcttt
ctcacaaaattactcgaaaaaaacaaatttttaacagTTAACTGAGGACT
TTCCAGGGTaatttccaagcacttttccttACCGCCGTTTTGGTCTTAAG
AATTGAGTTTCAATGCAGTGGTATTAATTGTCGCCCACCATAATTGGGCG
ACTAATGACATTTTTGCCCTCTAAACGTCCTAGGTGATTTCTAACTTGAT
TATGAGAAAACAACCatgatttgaaatgttttggagGAGTTTAATGTGAA
TGCTGATGTCAATTCTTATCTTTTGATACAAGTAATACTTTTATTTTGAA
CTAAATAAACTTATCTCTCTACCTTCGAAAACTACTAGTTAAACTCGTTA
CAATAGATTGAGTTGATTTTCCTTCTAGTTTTTGTACCGTCATTTCGTTG
CATTATTTACCTATCACTTTCTATGAGATTCAAGGGAAACAGTTCAGTTA
GGATATTGATTATATTTGTTTCAGACCCACCAAATCTACTAGTTGATTTC
AAGCAAGGTTTACAGAATTATACTTTTGGTTTCTAAATCATTTTTAGata
tgttttttgaaattgtatttAAAATAGTTAGgctttgaataatttttttt
tacaattttacatacaaattggatgagcttttctgttttaatttcgtgtt
tttctttgattatattttgtttta
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:244817..253040 + |
|
