MSTRG.1369.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1369.2.p1
Unique NameMSTRG.1369.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1369.2.p1 ID=MSTRG.1369.2.p1|Name=MSTRG.1369.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+

>MSTRG.1369.2.p1 ID=MSTRG.1369.2.p1|Name=MSTRG.1369.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=49881bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATTTCGGACAGATATGTATTTTTTGGACACTCTTTGCAGTTGTTGC
AGGACAGAACAgCTCACTTATTGAGGTATCGGGAGCAGAAACACTCCCAC
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ATCCAAATCAATTCACGTGTTCTTAACAATGGCTTGGGGAAAATATCATG
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CAATGTAAACCCATTAGAATCCAATATCCAATATCGGGAAATGGAAAAAG
GGGATCCAAACTCAGCTGATCTATTTGCAGCCTTGAATAAAGAGATTGGC
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TGTATATGTCAAGCTCAATGAGTCCAAGTGCTTCCTTAGAGATGAGTAGC
TCAATGTCAATGATTCCAAGCGTATCATCAATGGCTCCAACAGAGTCTCT
AGGAATGTCTTCATCCATGAAAATGAGTTCTTCAGTATCGGTTATGCAAT
CAATGGCGCCAAgctcttcaatgggaatcagcTCTTCAATGATTTCACCA
TCGCCAAGTCCATCTGTGTTACCAAAACCAACTGTCGTGTTATCAACCAA
GCTGAATGGCGAAAAAGTACCAATCGTCAACACAAGCAAAGCCTTTGAAT
CACATACACATCATATAAAACAAGCCGTAAGCCAAAATGCAAACATCTTC
GCTGAGGTTGAGTATAAGAAACATCCGGTACAAGTCTTCCTGACAAATCT
TGAAATGAATGATAAGAAATTCTCATACACCTTTGTACCTGGTATTAAAG
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GATTTCATTGGCCATCGTCAACATATCCAAAGTAGCTTCAGGAATCATTT
CTATAGGCCAGGACAAGAAAATTGCGAAACAGTATCATTTTCTCCAGTCA
TGGCAAGTGTACCAAGCGTTAAAATCACACCAAGAGCATATCCTCCTCAA
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TACGCGTGAGCACTTTACATTTTGCGTCCGTGAAGTCATCCCGTACGGTG
ATCTTGTTTTTGCAAGAACCAATTGGGTTGCTGTATCTTCAATGATCACT
GATAACTCTAGCTTCGTTGAGAATTACCATATTGATATCCCAAAAGGTGA
TCATTGTGTTAAACAAGTCCTTCATCATCGGTATTTAAAAGAACCAGTTG
TTTTTGTGTCTGCGGAAAGTGCAATAGATAAACAATCTTCAATGGCTGCA
CCTTTAGCCTGGGTTGAAGAAGCTGACGACAATAGAATTGAGGTTTGCCT
GAGATCAAGTAATTCAGATTGTCCTGACTCAGAAATCCACGGTAAAGTTC
ATGTCATCATAAAAGGACAAATGAACCCTTGTGACAAACTCACTTGCGAA
GATGGTGTTTCAGAATGTAAAGTGGACGCTGATGGTCAAGGCTATTGTGC
ATGTCTAGAGTCGGGCCCAGCCTTCCATCCTGTTTGTGGATCAGATAGAA
ACACATACAAGAGTTCGTGCTTCTTGGCTAAACATAATACAGAACATAAG
ACCAATGTTGAAAAAGATCACGATGGACAATGTGTTCATTCACCAATGCT
GTCAGGAAATGCTCAACTCAAACGAGATGCTGAACTACCAGATGTCTATT
GTAACTACATAGAATTCCCTAAACATGCTTTCGTTCCATCCAAATCAATT
CACGTGTTCTTAACAATGGCTTGGGGAAAATATCATGGTAACCAATCAAT
GAATGACGCTGCTGCTAGTTGGTCAGAAGATGTGACATCATCCGGATTTC
AAGCATGCGCAGTCGTGGCCGGTCGCCATTCTTTGTCTTACAATAAGAAT
TTATCTGTATATTGGGTCGCTGTGCAAAAAGATACCCCTGAACAGAAAGT
TGGTGCTGTCAATTTTGGAACCTGGTATACTGGTAGCCGATGTGAGAAAC
TGCCAGAAAGCTATGTGCCAGGAACTTACATTTGGTCATCAGTTGAACAC
ACCAAGAGACGAAACTTCATGAATGCAATGACTGTATGGATTGAAGAACA
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CAAGACGCAACACACGTTGCACCAGTTGTTTCGGCTTTTACACCAGTAGA
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GTAGCAAGTGTCATTTTCAAGGGCTCTATGGAATCAAGTCCTTCGGTCAG
ATTCTCAAAGAGAGATCCTGTTTCATGGGTTCAGGATGTCAACGATTCTA
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CGTTCGAGGCTAGTCAATTATGTCCTTTTAATCACAATGCTGGCCATATG
ATGGCTCTAGAAAGTGAGATAGAAGGATCCTACATGAAGTACAGACTTGG
TGGAAATAACCAAACCGTATGGAATGACTTGGGTGTAGATAACGGAGTTT
GGTCTTTCTCTAGGAGTAATTCACCGTACAGGAATTGGCTGAAGGATGAA
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TGATGGAGTGAACCCAATTGTCTATGGTTGGAAAGCCGACCAATTTGTAA
CTGCAAAAGCTCAATTGATATGCGaaaaaaaGAGTCTTGCATGAATGTAT
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ATGATGGAATGCCAGTTCGAACAATAAGAAAACCTTTCAAGTTATTCAAC
ACTGTTGAAGACAAAATTTTTATTGCGACTAATGGATATATCACATTCGG
TGAAAGTGAAAATTCTCGTGACTGGACATGGCCATCTATCATTTCCAAGA
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TTAGAATCCAATATCCAATATCGGGAAATGGAAAAAGGGGATCCAAACTC
AGCTGATCTATTTGCAGCCTTGAATAAAGAGATTGGCAAACGTCGATTGA
ATTTTGATATTCAAAATGTTATTGCTGTAACCTATAACAATGTTCAAGTG
TATGCTACTGTACATCGAAACAAACATCATACTTTCCAAGTTATTTTTGC
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AGATGACTTCTCCATTTAGTGTTGGAATATCTGGTATTTATGAAGATGGT
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GGGATTTTCTGGAGAACGTTGTGAGATTGCACCATCAACTTCAATTGCTG
CAGTTTCATCATCAATTTCAAGTTCAATGCAAATGAGTTCCCAAATGTAT
TCATCCATGGCTATGAGCTCAGCAATGTCATCAATTGCATCTAGTGAAAT
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ATGAGCCTCTATGCATCTATGGATATGAGCTCCACAATGCTCCAGTCAAT
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ATAAGAAACATCCGGTACAAGTCTTCCTGACAAATCTTGAAATGAATGAT
AAGAAATTCTCATACACCTTTGTACCTGGTATTAAAGAGTTGAACGAGAA
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CAACTCAAACGAGATGCTGAACTACCAGATGTCTATTGTAACTACATAGA
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CAATGGCTTGGGGAAAATATCATGGTAACCAATCAATGAATGACGCTGCT
GCTAGTTGGTCAGAAGATGTGACATCATCCGGATTTCAAGCATGCGCAGT
CGTGGCCGGTCGCCATTCTTTGTCTTACAATAAGAATTTATCTGTATATT
GGGTCGCTGTGCAAAAAGATACCCCTGAACAGAAAGTTGGTGCTGTCAAT
TTTGGAACCTGGTATACTGGTAGCCGATGTGAGAAACTGCCAGAAAGCTA
TGTGCCAGGAACTTACATTTGGTCATCAGTTGAACACACCAAGAGACGAA
ACTTCATGAATGCAATGACTGTATGGATTGAAGAACAATACAattccaaa
aacaaaacaactgTTTATTACGCATGCGCAAGagagcttcaaaattttga
tgggaCTCACGAAGGAATCAAAGTGCACTATATGCTTCAAGACGCAACAC
ACGTTGCACCAGTTGTTTCGGCTTTTACACCAGTAGAATTCCAAGGCGGT
AACATTCCAGTCGGTGAACAGATGCCACCAGTTTGTCAGACGTACAGCTT
CAACCAACAATCTCCCAAACTAGAATACCCTAACCTGGTAGCAAGTGTCA
TTTTCAAGGGCTCTATGGAATCAAGTCCTTCGGTCAGATTCTCAAAGAGA
GATCCTGTTTCATGGGTTCAGGATGTCAACGATTCTAACATCACCATCTG
TTTGAAGTCCGTCAGAATGtcagaaatgaaagaaaatttccaTGTGTCCT
TCTTAACATTACCAAAATTGTGTGACGAGAAAGCTCATTATTTCAACGGA
TCCTGCTATCGTCACATGGGTGACACTATGTACGGAACGTTCGAGGCTAG
TCAATTATGTCCTTTTAATCACAATGCTGGCCATATGATGGCTCTAGAAA
GTGAGATAGAAGGATCCTACATGAAGTACAGACTTGGTGGAAATAACCAA
ACCGTATGGAATGACTTGGGTGTAGATAACGGAGTTTGGTCTTTCTCTAG
GAGTAATTCACCGTACAGGAATTGGCTGAAGGATGAACCAAAAtcagaaa
ttcaaaataatggTGCAGCAGTGATTGTTTATGAGAATGATGGAGTGAAC
CCAATTGTCTATGGTTGGAAAGCCGACCAATTTGTAACTGCAAAAGCTCA
ATTGATATGCGaaaaaaaGAGTCTTGCATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1369MSTRG.1369Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1369.2.p1MSTRG.1369.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1369.2.p1.exon1MSTRG.1369.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.1369.2.p1.exon13MSTRG.1369.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:2508494..2522482 +