MSTRG.13687.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13687.2.p1
Unique NameMSTRG.13687.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000110_pilon:397560..417199+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13687.2.p1 ID=MSTRG.13687.2.p1|Name=MSTRG.13687.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:397560..417199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gaaaatttgaaaacaacaatttttcatgtaaaaaaattacTACCGCTTGT GGATTGAAACTTGGGGATAAGAAGATAATTGATGGCCCATTTCTCACCTT TCATCATTAACAAAGATTATTGTAAGTTCGATTATTTTTAAAGcttcttc tcttttttatttaatcaCCTTTTGTTTGTTAAGAAACCTACTGTTCAGAA Gaaagtagacgaaaaaaaatttccgcgaaattacaaaattttccgcaaaa tattctaattttccgcaattattttttcaaaaatgcgcGCCTCATTTTTA TTTGACCCAGTCCACGGTTAAGTTGTTTTGTATTCTGAGTGGAAACTATT GGCAGTACAAACTAAACTACTTCAAGAATCCGTGAGAACTATTTCAAGTG TTTCAAAGCTTTTAATggttaattttttgttcatttgtcAGACAGTGTTT ATGAAATCACTTGAGATTCTTTCTAGAAATATTCAGATCATATTTTTATC GTATTATAACTAGCCCGTGAGTTTTCCTTTTCTGTAGGAGGTCGGACTGA GGTTTTTTATAAGTGTTCTATCACtttttttCGAACAATTGATTTAATTG TTTGGGTTTATATAACTGTACTATAGTACAGCATAGTATAGTAAACTCAT TGTATGAAATTCCGATCAACTCTTGAGCAAGTTTTTTGAGATCTCAGAGA GAGAATATTTAACTTTAACTGATCTTAGCTGCTCATCACTTTCCATATCT ATTTATTAATTAATTGCAATGAgtctatcatttttttttagaacttgtaa aaacttaCATGATAATAgcccaaaaatattcaaaactaTGGAACGAAAAT AATCATGAATGTGGAAAAAGTTCTAACTCAGCATCGACAtgcaaactttc aaaaaaagtcaTATGATCATTTATATTTCTCtcgaaaaagtttctttgaa 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AAGCAAGAAagacttatttatttttttactaaaaGCGACCTGGCTGTCGC TCTTGCTTTCGAAATAAGAGAAGaacaaaattctttattttgaaaaaacg gaGGAATGAAACACgctgtaaatattttttcatatacattgtacatattt tttgtttttttgttgttgtttttaagaTAGAAAAGATAGGGTTTTAGGGA AATTATAATTGCTGTAAAATAGTGTGCGGACGAATTTCTCAGAGGAAAAT ATTGTGATGGAGACCAAAGATTGACAATTTTTCCGTGGTCACACAATAAA AAAGGCTACAGCCTGGTTTCCATACAAAGGTTTATTACTTTTGGGTACTT TTAAAGGTCATGATTAAAACAAGGATGCTTTTGTTGGGATCTATTGTCAA TGATCAAGTTTTGACAAGCTTTAGCCTGCTCCTGCAGCCAGTAGAAAAAA TACTTTCACAATCGTCTTTTATGCTGTTTTTggctataaaaacaatttat gGGTCTTTTGATACTAAACATATCTCTGAGAATAAACCTCTTGAAATATC ATTTTTGGTGAGGACGcatttttaacttattttgttttatcgcaatatat attttgaaagagatattttttaaaagaaatcttttttttt

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000110_pilon:397560..417199+

>MSTRG.13687.2.p1 ID=MSTRG.13687.2.p1|Name=MSTRG.13687.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1854bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:397560..417199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCCATTTCTCACCTTTCATCATTAACAAAGATTATTGTGACCCATC
GATCAATACAACAATTTTACCGACAGTTCAGCCGAAAACCGAGTACGACC
CGACATCACACGACATGCATGCGACAAACGAACAACTTGTACAACAAATG
CACCATCAAACGACGACAAAACCAATTCGaaaaaaaccaagaattttatt
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CTCGCCTATCCCGAGTGAAAGCTATACCGGTTATTTCCCGGAAAGCTACA
CTGCACCACATTACAATAACAATGTTTATTCAACGTCACCTTACAACCAA
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CGAAAACCGAGTACGACCCGACATCACACGACATGCATGCGACAAACGAA
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AAGATACAAGTGCAAGAAACAATCACAAGAATCCAGGCGTGGAATCCACC
CACCGCCCTACGAATGGCCTTCACTCTTCAACCACCAACGTAACGTTCCT
GTCTTAGTACAACCACCATCATGCCCGCCCCATTGTTATCGCCCTTCGCC
ACCATCGGTTAATTTAAACTCGCCTATCCCGAGTGAAAGCTATACCGGTT
ATTTCCCGGAAAGCTACACTGCACCACATTACAATAACAATGTTTATTCA
ACGTCACCTTACAACCAATGGCCGTGCTACAAATGAATGGCCCATTTCTC
ACCTTTCATCATTAACAAAGATTATTGTGACCCATCGATCAATACAACAA
TTTTACCGACAGTTCAGCCGAAAACCGAGTACGACCCGACATCACACGAC
ATGCATGCGACAAACGAACAACTTGTACAACAAATGCACCATCAAACGAC
GACAAAACCAATTCGaaaaaaaccaagaattttattttcacaatCTCAAG
TTATGGAGTTAGAGAAGAAATTTAAAGAACAAAAATATCTATCAGCTTCC
GAACGTGACCAAATGGCATCAAAATTAAATCTAACACCAACACAGGTCAA
AATTTGGTTCCAAAACAAAAGATACAAGTGCAAGAAACAATCACAAGAAT
CCAGGCGTGGAATCCACCCACCGCCCTACGAATGGCCTTCACTCTTCAAC
CACCAACGTAACGTTCCTGTCTTAGTACAACCACCATCATGCCCGCCCCA
TTGTTATCGCCCTTCGCCACCATCGGTTAATTTAAACTCGCCTATCCCGA
GTGAAAGCTATACCGGTTATTTCCCGGAAAGCTACACTGCACCACATTAC
AATAACAATGTTTATTCAACGTCACCTTACAACCAATGGCCGTGCTACAA
ATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13687MSTRG.13687Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13687.2.p1MSTRG.13687.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13687.2.p1.exon1MSTRG.13687.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13687.2.p1.exon2MSTRG.13687.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13687.2.p1.exon3MSTRG.13687.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000110_pilongenomesc0000110_pilon:397560..417199 +