MSTRG.13578.41.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13578.41.p1
Unique NameMSTRG.13578.41.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000108_pilon:1061547..1079113+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13578.41.p1 ID=MSTRG.13578.41.p1|Name=MSTRG.13578.41.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17567bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:1061547..1079113+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCATATTCTTTGGACGAGAAAATTTGATTGAATCTATTCACTTGAAACTT CAACAAAATCAAGCAATTGCTTTGAGTGAAATGGGAGGTGTGGGGAAAAC ACAAACTGCTGCAAAGTTCGTTCAAACGCACAAGGATGAATATCAGAAGA TATTTTGGATTTCTGCTGTCAGCCTCAAGAAATCTTTGAACGAGATTTTG TGTGCATTTGGTTGTAAACAACTAATTCCTGATGAACCTTCAATGGAAAC TCTTGCTTTCATTTTTCTCTCTAAGATTTGTGAAGGCTCCAAAAGATCGC TGGTTGTATTGGATGACGTCACTGATGTTACAAAAGATATCACTTTATTC ATTCGaaatgtgaaagaaaaaatcaacttaTTGTTGACATCTCAATTGAG GGATTGGGAAGATTATGGTTTGATTCAAATTGCGGTTCCATGTTTCCAAG AACAAGAATCCATTGGCTTCTTACAGAATGAACTTTCTTCAGCCAGCCAA CattaaatctttattttagcgaatcgtTTACAATCATTACCTTTAGCCCT TCACCAAGCCATTTGTTACATCAAAAAACATAAAGTTCCTCTACACAAAT ACATCGAACAATTTAAAGTTTGCAGAGAAAGTGTTTTAGGAATGAAAATC AATTCGTTTACTGAATATGACAAGACATTGTTGACAGTTTGGGATATGGC TTTTGCGAAGATTCGGGTCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGGTCTTAGGAA TGATGGCTTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagacattcagttat tttgataaaatagatGAATTTGAATTAAATGAAATCATCAATCTGCTTTG TCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAATGAATGTTTAGAAATTCACAGTC TTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTATTGAACAGAAACAATTTGTTGAG GATGAAAGTCCGTTGACACTTCTtgaagatgttcttttaaaaatcgaggT TTCTGTTACAGATTTGGTTATAAATGCTGACTGTGAGGATTTATGGCACA TTCATATTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCAATCAAAACTGTCAACTTT CATGTTTCTCTGTTGCTGAATATCGCCACAGGCAGAATGGAGTTGGAGAA CTTATACCAAATTTCTGAacttctttcaaaagttttcttaaaacaataTA GGTTGTTTCGAGATGTGGAAACTTTTCACATGTTGTTGCTTGTTCATGAT CGTTTCATAAACGCGTCAATTCAATTAGGTTTACTTAATTTGAATGAGAT TTTTGCTTTCGAAGAAGAGTTTTCCACAGAACTTGAAGAACATTCTGAAG AAGTTTACCGTTGGAAGCTACTACAAGCTCAGGCATATAATAGACATGGA AGAGTGTCGTTATGCAATGATATTGTTCGAAATTTATTCAATGAACTAGT CAAAAAGAAAGGATTTGACTATATTAAATTAATATTGGCGAGTTTTTTCA CGGTAAGGGATGTCGAAGTTTTGTTGAATACCGTTGacacaatgccggac aaaaggttgtagacaaatgaaatttcagtgaaaaatgatgagaaatagag caaaatgactcttctatgtgtctgaaaggggatggaagttaagaaaaaca cttttgaagtcgttgcattgcttttgaattgcttttgagggaaccacaag caaaaaatcagcgttttgatactggtgtaagccagttaatcaagcccttg tggtttgcccttgcggttagactgcagtgggtgactttcaaacaGCTTTG AATGGATTTGAATGgatttggaaagcacccagagcctcttgggaacttgt ttttgatcgatattgaagtattttgcaaatattgcagaagtctaccaacc ttttgtccagcattgcaCAAATAATCTCAGTGACACGGAACTTTTGGTTT ATTATAATGCAAAATGTTCTTTATACATCATGAGCGGTTGCTTTGATTTG GCTGAACAAGTCATGCAGGATTGGAAAGAACGCATACACAGAAAACAATT TCCTCGAATGTTGCActttaatttcacaaaaatgaatTGCTTTTTACTTT ACAAGAAAGGAAATTACAACGAAGCACTACTTGCTTGCGATGAACTTAAA CGAGACAGTGTCTTTACTGATGCTGATGTTTTCATTTGGGAAGCCttgat tttgatcaaattagGAAAGTTCAACGAGGCAGAGGTGTTACTTGATGACT TGAATCAACGCAATAATGCATTTATCATTAGAATCAGCTCATCCCTGAAA TTTCGAAAGCACGACTTTGAAGCAGTAGTAAAGCTCCTCGCAAATGTGGA AGATGAGCGTTTGTCGAATCTTTTGTTTTTGGTAAAGGGATATTTGAAAC TGCATCGACAACTAGAAAATAATAAATCGAGAGGAATGGTTGAACAATGt ttgcaaatgaaaaaaattgtaaatgaaTTATTTCAAGTACAATTGGATTC GATTGATCTTTGAAATCCTATTATATGGAATTATGATTATAATTGGATCT TTGGGAATTACTCCGACTTTTAAGTGCAAGCTATACTGATAATTTTTTCA AGTGCCAGCAATGTAATTTTTGCATTGACTTGGCCTGTAAAATCAGAAGT agtctattttttttaaattatgaaaataattgaGGGGTTGATTTCAGTGG GTActtcccccggggggggggggtactagggctagggcaaaatgggttac ggggatgctccgctggtcagggtatctttttcaacctccacgagtcccag gtagggtcgcaaaaacagggtgcctatttttggaaaatttggggaaaaag tagaaaattttggaatttcagtcccattcagggtcacttttttcgcaaat ttcgagtcccacgtagggtccatttttcggagcggagcacccccgtcggt cgacaagggtagtaccccccagGGGTACTTCCGCCATTCAGTcaaatttt tgtccaatttctGTCACACCGTCAAGATCCAGACCGAAATTCTGCCACTG AAAATTCCCTTTGAacttaattatttttctaaaattcctgaattttgact ttttcttttggttccaacttccgaacgaattttttACGAGTTTAGTATGT ACGAGAAGTTAGGAGGCTTCGTCACTCTACAACACCCTTTTGAAGTGAAA GTGATCTTACTAAAAACTTTGACGTCGCTCAAAATAGCTGACACGTTgat tttcattcttctttttttttatctagaaTTTTCCACAGTGATGGATTTGA AATTGACGCTGAAAGCTGACAaatatgaaattgatttttttcttgaaaat tctagaattttgactttttggtgCAAATTCCGAAATTCCAAGCGATTTTG TTTAACCTTTCCGGCacgctgttttttatattttcacgctGTCTGTGCGC aactatttttgagaaaacgcgGGGTTTGGGAAAAGTgccataactcaaga actagaaatcttttggcaaaaagtaaactatccctgaaaagctaattaaG TTTTGCAGCTTTTAGGTTGGGTACAAGTTCAATTAAAGTATCCTAACTTA AATGGTAGCTTTACATACACCAATGCTTTCTTCCTCATTTTTCGACAATG TcacttttttgggatttttcactttctatgcaaaaaaaagtgggggaaaG TTAATTATTACATCTTTCTTTACTATTTTATCAATATATACTTACTCATG AAGCCATATACCAAAAATTAGCATCCAAAAACAATTCTACTGGTCACAAG GACTTTTCAAACATTGTTCacttttctccaaaatcagtgtttttccgtct gccatcttgaatcagtgtttttatttgaaaggtgCTGACTCACACCGTGA TCATAACATTACATTATTATACCTTCACGGAAAGCTTAGActctctactt tctttttctttctttttcaacgaTCAGAAAGCAAGCCAATTAAAGATATT GCGCGAGAAAGACATGCCTATCAAATTGcgtatatgtacggcattcggAA CATCTCAAGGACGTATATGTACGACATTCGGGTTCAAAAggttaatttca tttttggGACCAAAACAACCCAATTTTCCGTCTTAGACCGTGGACCTAGA TTCTGGACATCCTTCTATATTTCTAAACGTCTTGAATTTTAGTGTTAAAT TAGAGgattaaatgttttgaaatagaATTATGGGTaggcaaaatttttgg atgGCAACATTCCAAGGATATTTTGAACAAAGTCGGTTGTTCGGGAgtaa ttttatcattgatttaTTTTAGATTGGAAATAAAAATGTTGCATATTATT TTGAGATAAGATTTAAATTCacgattttctttgtttcttagCTGGTGGCC CAGCATCACCcggattttcttcttttaataagaataattttgtaagaaca atgAGGTCCCCAATGAGGCGatcgaaaataagaacatttcaagaacagTT ATATGccttataaatttcaaaattatgataaaaaatcaGAACGAAAACAA TctcgaggggggggggtacggtAGTCGAGGTACAGTATGTGATGTGGTAT TTACCGCCCTTCAGGATGCCTTTTTGGAACCTGGCAGTCCCTGTAATGGT Atgagaaatcagaaaaaaatgttttgaaactttaataatttttttattcc gaATAATGTAGTATATACATTAGTAGTATTTTATTCCACTGTCTATGATA ACCATTTTACTAAACCTATTTTATTAAATGTTTCCCAAaatgaccatagt tttgaaactTAGATGTCATAATTTTCCTTTAGAATCTTTGAAGTTTATAG CCCCCTGAGTTAgccttttaaaatgttttttgaaccGAAAGACGATCTCT Gttttttcagacttacatttgttacgttttttatatttttcagtaaaaac aaaagattaagaaaatatagATAAATAAATGAAGAGAATGAGATGAGTAC ACCATTGTACATCCTTCAAAGCGAGTATTGGGTTCGCATCAACCTCGCTT TGGAGAATTGCATCAAAGAAGCCCTCATTGATGTACTTCACAACGTGCAC AAAGACGCTTCTTATACTGGACTTCCAACTTGTCTCAAACAACTTTATCA AATATTCGTGCAATGCAAACAAGACAATAAACACGAGTTGAACAAAGTGT TGAAGAAAGAACAATGGCAAATATTGTGTCCACAAAATGGATCATCCAAC CCAGAGGATTGGGATATCACCTTACTGATTGCTGTATTGAGGTCAGTGGT TGGATTGCAACCTGCTGGAGGATGGAAAATCAAATCTCTTCAATCCAACG ATCAATCTATTGGAGCTTTCTTGTTTTTGATcagaaatttaagaaatgaC TTAATACATGGTTCAGTCAATGCAGTACCAAATTTACAAGCTTTCAAACA ACTGAGATCTCGAATGGAGAACATTTTACTGGGATTGAAATACAAGAATA TGCAAATGTTTTATGATTTGGAAAGTTGTCCATTGGATAAACATGTGTTG GTTATTTCTCGAATGGTCACCAATTTGGATCAAGAAGTGGATTTGTTGCG AAATGAAGCGAGCGATAATTCGAATGCTATGAAAAATATCGAACAACATA ATCAATGGATCAAAACTTATTTGAAACAATTATCTTCCGTAAAAGCTGAC AAAACTGACGTCGAAGGTGAGTTGCATTGGTTTTAATGTCGTCGAAAGCA CATTTACTTTTTTACCTCTGTTGAATTTATGACATCCTAAGAGCTGAATC TTGTTAACTTTTAACCTCTTGACACTGAATTCTGGTGTCATTGAATATca gtttttgttttactttagaTCTAGCCAAGTCAATGAATATGAAAGCTGAT AAAGATGAAATGGATggtatgttttgtttctttacTTGTTTTATATTTTG GAGGAAATTGTAACCTCAAAAGCATATCTGATAATTAATATCTAATAAAA AGTTGGAGGCTACCCGGGTATCTACCTTAAAAAGCCTCTCTGAAGATTGT CTAATAAAAAGTAGGAGGCATCGCCAAGTTGACGTTCTAAATAAAACTGA TCCTTTTGAAAAATATTCATTTCTTCTTGTTATATATGTTACAGTTTTTA GACATCCTCTGTATTATAAGAAGCTTTTTGTAATATATTTTCACTATCTT TCTGTCTGAATAGGCATTTACCGATAAAAATCACTATTTGTTTTACTGCA GGTTTAGCCAAGTCAATGGATAGTAGACTGAATACGAAGGCTGATAAAGA TGAAATGGATggtatgttttatttatttacttattttatAGTTTGGAGTA AATAGTATCCACTTTAAAAGCCTATCCGATGATTGTCTaaaaaaaTTAGG AGACATCGCCAAGTTGACGTTCTAAATGAAATCGctccttataaaaaata ttgaatttttctgtttgaataGACATTTCCCGATAAATATCACTATCTTA TATTTACTATTTACTTTAGGTTTAGCCAAGTCAATGAATACGAAAGCTGA TAAAGATGAAATTCatggtattttttgtttgtttaattctttttggacct acctccgggtgccccggtggaggttctataaattaacccatgtccgttcg tccgttcgtccgttcgttcgtccgtctgttcgtccgtctgttaccagctt ttctcaggattggctcattagttttttctggttGTTTGCagaatgatgca aaatggcaatgcccagaacgtgacggagcccgatttttgagaaaaaattt atttgggcaaatttgggccaaaaactacctaaaaatagggttttttgaac tttgtgcaaaatcctgttattacttttttctgattttttgtacaaagatg gagggcaagattctctaaagaatggctgaagtggtttttcccggaaaatt cttattcgcctgaaaaaacggattttcgtattttgggggaaattcccttt aaccaaataagaaaatatagcttttaagaatgttgactcattattttttt ctgattttttgcacaatgatgcaaaatggcaatgcctaaaatgagTTGGA GCCCGgttttcgaataaaaatatatttgggcaaatttgggccaaaaactg cctaaaaatagggtttttggactttgtgcaaaatcctgtttttacttttt tctgattttttgtacaaagatggagggcaagattctctaaagaatggctg aagtggtttttcccgggaaattcttattcgccttaaaagacggattttcg tattttggggaaattccctttaaccaaataagaaaatacagcttttctca atgttgactcataatctttttctgatttttttgcacaatgatgcaaaatg gcaatgcccaaaatgtgacggagccagatttaaaaaaaaaataaattatt ttgggcaaatttgggccaaaaacagctgaaaaggtttttttgggcctaag tgattttcgtatttggggaaattcctttttaccattttacaagCGAAATT GACGTTGAAGGCTGACATGTGCCAAATTGATGGTAAAGTTATACCAGATA AATTTGTTGTGTTTGTCGAATGTTTTTTCCTCCTCTTTTGAGGTGGTCTG CTAGcaacttttttcatcaaaataaaactttagCGTTATTCAGATTTCAA ATGCTTCTAGTCGATGAAAAATGTGTGTTCCGAGACCTTTACAAATTTCC TCTGTTGTCTACACgaagtttatttttattcttttaacgGAATATTGCTG AATAAGAAGGCCTTTTctgataaatataatttttggacctaccccggtgg ggtgtaggtcctataaattaacctgttttcgttcgttcgttcgtccgtcc gttcgtccgttcgtctgttaccaacttttctcaggattgagtcataggaa ttttttgatttttggtaaaaaaggTGCGAAAtggtgatggccaaaatgtg acggagcccgattttcaaaaaaaagttttggggcaaatttggaccATAAA ACGGCTAAAgaacggtttttttggactttgtgaaaaattggatcattaat tttttcggattttttgcatgaaagtagggtaccatcataggtaaaagatg gctcaagcagatttttgcaaacaaattttgttggctcaaaaaacgcatgt gtatctataagaatcactattaataagcatacatcaatgttcgtagtcaa attactcaattttttatgagatagatgtttttttgctcatgagggcttac ttttgaagaatgaaattttggctgcttgacgtgtttttatagaaaaactg gccaaattcgatatctttttataagcacattatcaataattacttaggta ttagcttttcaagagattggctctttcattcttaatgattttttgcacaa agatgcataactataaaccctcgaatgtgacggagcccgattttcgaaaa aagtgtttttgggcaaatttgagccaaaaaaaggctaaaaaaacgggttt gattttttgcatgaaagtaggtaaaagatggttcatttttgtgaaaaagt gaattttcagctcaaaaaacgcatctttatctataagaatcactattaat aagcatacatcaatgttcgtagtcaaattactcaattttttatgagatag atgtttttttgctcatgagggcttacttttgaagaatgaaattttggctg cttgacgtgtttttatagaaaaactggccaaattcgatatctttttataa gcacattatcaataattacttaggtattagcttttcaagaaattggctct ttcattcttaatgattttttgcacaaagatgcataactataaaccctcga atgtgacggagcccgattttcgaaaaaagtgtttttgggcaaatttgagc caaaaaaaggctaaaaaaacgggtttgattttttgcatgaaagtaggtaa aagatggttcatttttgtgaaaaagtgaattttcagctcaaaaaacgcat ctttatctataagaatctttattaataagcatacatcaatgttattagcc aaataactttttttgctcacgaagtcttgaacatgaaagaatatttcaag agcatataagaaacaaacgattAATTTTAATAGATAGTCACTATTTCTTC TGAATAATTgcttaatggtcacgctcacgtagatatcaattatatatgtg ttaaatgcataaccaggtaggtccataaaagtatcacttgttttttacAG AATTAAGCAACAAAGTTGATCAGCTATCAATGGAATCAAAATCTCTAAAG GGTAAAGCTTTAGCTATGATTGCTATTTTCTCTATCCATGCTTAACCCTA ATCGTACTAAggggggggTTGCTTCTGTTTGGAGGTCAGATTAATGGTAA TAGCTATATATAATAGATTTTAGACTCAgccaacttttttctaaagcctt tgttagattGCATTAgctatttataaaaacaaaggaaattttcagcagaa agattttttgtcaaaagttgccttaTATGACAAGGTTCTTGTATGCCAAA TTTCATTCCAAAAGAACCACTAAATCAAAAGTTAATGGGTGGTACAAGAA AacccccctagttttgaactgCCCCTAAATTTATTCAAAGAAACTTTATT TGTTATTTGTCACCTTTTTTGTATTCATTCTAGACACAACAAAGACACAT TGGAATTTGCCAGACCCTGTTTCCATCTTCTTTGGACgagaaaatttgat taaatcCATTCACTTGAAACTTCAACAAAATCAAGCAATTGCTTTGAGTG AAATGGGAGGTGTGGGGAAAACACAAACTGCTGCAAAGTTCGTTCAAATA CACAAGGATGAATATCAGAAGATATTTTGGATTTCTGCTGTCAGCCTCAA GAAATCTTTGAACGAGATTTTGTGTGCATTTGGCTGTAAACAACTAATAC CTGATGAACCTTCGATGGAAACTCTGACTTTCATTTTCCTCTCTAAGATT TGTGAAGGCTCCAAAAAATCGCTGGTTTTATTGGATGACGTCACTGAGGT CACAAAAGACGTCACTTCTTTCATTCGaaatgtgaaagaaaaaatcaact taTTGTTGACATCCCAATTGAAAGATTGGGAAGATTATGGTTTGTTTCAA ATTGCTGTTCCATGTTTCCATGAACAAGAATCCATTGGCTTCTTACAGAA TGAACTTTCTTCAGCCAACCAACATGAAATCTCCATTTTAGCGAATCGTT TACAATCATTACCTTTAGCCCTTCACCAAGCCATTTGTTACATCAAAAAA CATAAAGTTCCTCTACAAAAATACATCAAACAATTTGAAGCAtgcagaaa aagtgttttgggAATGAAAATTAATTCCTTTACTGAATATGACAAAACAT TGTTGACAGTTTGGGATATGGCTTTCGCGAAGATTCGGGTCGAATCAAAG AATGCTATTTTGATCTTGGGAATGATGGCTTTCATGGACAATtgcaaaat caacaaaaagacATTCAGTTATTTTGATAAAGTTAGCGAATTTGAATTAA ATGAAATTATCAATCTGCTTTGTCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAAC GAATGTTTAGAAATTCACAGTCTTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTAT TGAACAAAAACAATTTGTCGAGGATGAATGTCCGTTGACACTTCTTGAAG GTGTGCTTTTGAAAATCGAGTCTTCTCTTGAAGATTTGGTTGCAAATGAT GACTCCCAGGATTTATGGTACATTCATGTTTTTCGTTTGATCATGAGTGG TGCACTAAAAACTTTCAACTTTGATATTAACCTGGTGTTAAATATCGCCA CAGGCAGAATGGAGTTGGAAAACTTATACCTACTTGCTGAacttctttca aaagttttgttaaAACAATATCGGTTGTTTCGAGATGTGAAAACTTTTTA TACGTTGTTGCTTGTTCATCATCGTTTCATAAACGCGTCAAGTCAATTAG GTTTACTTAATTTGAATgagatttttgcttttgaaaaagAGTTTTCCTCA GAGCTGGAAGAAAATTCTGTAGATGTGTACTGGTGGAAGCTAGAGCAAGC TGAGGCATATAATATACATGGACAAATGTCGTTATACGAAGATATCGTTC GAAATTTATTCAATGAACTGGTCAAGAAGAAAGGATTAAATgatattaaa ttaagtttggcGAGGCTTTTACCAGTAAGGGGGGATGTTGAAGTTTTGTT GAATTCCGTTGACACAAATAATCTCAGTGACGCTGACTTTTTGGTGTATT ATAATGCAAAATGTTCTTTATACATCAGGAACGGTTGCTTTGATTTGGCC GAACAAGTCCTGAAGGATTGGAAAGAACACATACACAGAAAACCATTTTC TCGATTGTTTCACTTAAACTTCACAAAAAAGAATTGCTTTTTACTTTACA AAAAAGGAAATTACAATGAAGCACTACTTGCTTGTGATGAACTTAAACGA GACATTGTCTTTACTAATGCTgatgttttcattttcgaaGCCTTGATCTt gatcaaattaaaaaagttcAACGACGCAGAACTGCTACTTGATGACTTTA ATCAACGTAATAATGCACTTATCATTGAAATCAGTTCATACCTGAAATTT CGAAATCACGACTTTGAGGCAGTAGAAAATCTCCTCACAAATGTGGAAGA TGAGCGTCagtcaaatcttttgtttttggtAAAGGAATATGCGAAACTGC ATCGACAACTCGAAAATAATAAATCGAGAGAATTGGTTGAACGATgttta caaataaaaaaaattgtaaataaattCTTTCAAGTACATTTCGATTCGAT TGGTTTTTGAaatgctttttaatcgaattatGATTAGAATCGGATCTTTG GGAATTACTCCAACTTTTATGCTTAGGCTAAACTGATAAGTGTTTCAAGT GACTGCAATGTAATTTTTGCATTGACATGCCTGTAAAATCAGAGatagtt tttttcttattatgtaaatattcagggggtacctgatTCCGCCATTcggt caaatttttgttcaatttccgTCACACAGTCAAGATCAAGACCGAAATTC CAccaccgaaaatttcctttgaaattgattcttttctcgaaaattccgga tttttgactttttggtgcaaattccgaaattcggaacgatttttcgccaa atttcattttttttgtcttcTGAGGGCAAAATTCATAATTGATATTTGTG GTCGCATTCCCAAATCTTTTTGTCAAAGTTAAGGTTATTTTGATCAATAG GTATAGGGATTTATAGGTATGTTCCTTAAAATGcttgaataataaaattt tattagatGTTTCCCAAaatgaccatagttttgaaactGAAACAAATTTC CTTTAGAACACTCGAAGTTAGCCCCTGAGTTAGCCATGTTTTTCCTTTAG AAGCTTTGAAGTTAGccctcaaaaaatgttttttgaaacgaaagacgacc tctgttttttcacacttttatttgttatgctttttatatttttcagtaaa aacaaaagattaagaaaataaaaagaaataaatgaagAGAATGAGATGAG TACACCATTGTACATCCTCCAAAGCGAGTATTGGATTCGAATCAACCTCG CTTTGGAGTATTGTATCAAAGAAGCGCTCATTGATGTACTTCACAACGTG CACAATGACACTTCTTATACTGGACTTCCAACTTGTCTCAAACAACTTTA TCAAATATTCGTGCAATGCAAACAAAACAAGAAACACGAGTTGAACAAAG TGTTGAAGAAAGAACAATGGGAAATATTGTGTCCACAAAATGGATCATCC AACCCAGAAGATTGGGATATCACCTTACTGATTGCTGTATTGAGTCAGTG GTTGGATTGCAACCTGCTGGAGGATGGAAAATCAAATCTCTTCAACCCAA CGATCAATCCATTGGAGCTTTCTTGTTTTTGATcagaaatttaagaaatg aaTTAATACATGGTTCAGTCAGTGCAGTATCAGATTTACAAGCTTTCAAA CAACTGAGAGCACGAATGGAGAACATTTTACTGGGATTGAAATATAAGAA TATGCAAATGTTTTATGATTTGGAAAGTTGTCCATTGGATAAACATGTGT TGGTTATTTCTCGGATGGTCACCAATTTGGATCAAGAAGTGGATTTGTTG CGAAATGAAGCGAGCGATAATTCGCATGCTATCAAAAATATCGAACAAAC TAATCAatggatcaaaagttatttgaaaCAATTATCTTCGGCAAAAGCTG ACAAAACTGACGTCGAAGGTGAGTTGCATTGGTTTTAATTTTGTCTAAAA CTTATTTATTTCCTAGCATCTTTTGAATTCATTGTAATGTAGGAGCTGAA TCTTGTTAACCTATGGTATGTTTTATTTCTTCATTTCCTTTATATTTTGG AGAAAATGGTATATACCCTCTAAAGCCTATCTGATGATTGTCTaaaaaaa TTAGGAGGCATCGCCAAGTTGACGTTCTAAATAAAATTGAtccatttgaa aaatattgatttcttCTTGTTATTATAGTTTTTTGACTTCCTCTGTACTA TATAAGAAGTTTTTGTACTATCTGATTCCTCTAACGCCTAAGATTTTTTA CTCTTATTTTCACAAAGGAATCTGATGAATAACACCATTTGTTTCCTTTA GATTTAGCCAAATCAATGGAAAATAGAATGAATGCGAAAGCTGATAAGGA TGAATTGGATGGTATGTTTGTTTATGTTCTTTTGCAAAAAGTGAATCAAA CGAACAAGAAAAGTCGACACAACTAACTACCCCAGGAAGCTCTCCTATGT TTATTATGTACGAGAAGTTAGGAGGCTTCACCACTCTGCACCCTTCTGAA GTGAAAATGATCTTTATAAAGATTTTGACGTCCCTCAAAAAAGCTGACAC GTTgactttcattctttttttatctagAATTGTCCACAGTGATGGATTCG AAATTGACGTTGAAAGCTGACAAATTCCAAATTGATGGTAATTATCTTGT tgtatttttcaatcttttccacTTCTCATCTTTTGAGATGGGGTCCATtc gatgaaaaatgtttcaagtgtTCCGAGACCTTTACCTATGATTAGTCTtc gcaaaatttgttttattcatTTAAAGGAATGTTGCTGAATAAAAAGGCGA GTATCAtttttttAACAGAATTGAGCAACAAAGTTGACCAGCTATCAATG GAATCAAAATCTGTAAAGGGTAAACttttagctatgatttttattttctc tatccacgcttattattatttttattcttttgaagGAATGTTGCTGAATG AAAAGGCCTTTTTGATAAGTATTATTCAATTATAACAGAATTGAGCAACA AAATTGACCAAAGGGTAAAGCTTTAGTTATGatttttctataaattaacG TGTGTTcatccgttcgtctgttaccaaattttctcaggattgaatcatag gaattttttgagttttggtacaaagttgcaaaatggtagtggccaaaatg tgacgaggcccgattttcgaaaaaaaaattttggggcaaatttgggccaa aaaactgcttaaaaacgtgttttttggactttttgaaaaattggatcatt aatttcttctgattttttgcatgaaagtagggtaccatcataggtttttt gcatgaaagtagggtgcCATCATAGGTAAATAATGGCTCTagcatatttt tgaaaaaaggttttgttggctcaaaaaacgcatgtttatctttaagaatc actattaataagcatacatcaatgttcttaatcaaattactcaatttttt ttatgagatagatgcttttttgctcacgaagtcttaaatatgaaagaata tttcaatagcatgaaattttggtttctaaacgtttcattttataagaaac aaacgactaattttaatagatcgtcactgtttgtgttctgaatgattgtt tattggtcacgtcacgtagatatcaattataaatgtgttaagtgcataac caggtaggtccataaaagtatcacttgtttgttATTTGTTATCCTTGTTT TGTATTCCTTCTAGATACAACAAAGACACATTGGAATTTGCCAGAGCCTG TTTCCATCTTCTTTGGACGAGAAAGTTTGATTGAATCCATTCACTTGAAA CTTCAGCAAAATCAAGCAGTTGCTTTGAGTGAAATGGGAGGTGTGGGGAA AACACAAACTGCTGCAAAGTTCGTTCAAATGCACAAAGATGAGTATCAGA AGATATTTTGGATTTCTGCTGTCAGCCTCAAGAGATCTCTGAGCGAGATT TTGTGTGCATTTGGTTGTAAACAACTAATTCTTGATGAGCCTTCGATGGA AACTCTGACTTTCATTTTCCTCTCTAAGATTTGTGAAGGCTCCAAAAGAT CGCTGGTTGTATTGGATGACGTCACTGATGTTACAAAAGATGTCACTTCA TTCATTCGAAATGTGAAAGAAAAAGTCAGCTTATTATTAACATCCCAATT GAAAGATTGGGAAGATTATGGCTTGATTCAAATTGCTGTTCCATGTTTCC AAGAACAAGAATCCATTGGCTTCTTACAGAATGAACTTTCTTCAGCCAGC CAACATGAAATCTCCATTTTAGCGAATCGTTTACAATCATTACCTTTAGC CCTTCACCAAGCCATTTGTTACATCAAAAAACATAAAGTTCCTCTACACA AATACATCGAACAATTTGAAGCATGCAGAGAAAGTGTTTTAGGAATAAAA ATCACTTCTTTTACTGAATATGACAAAACATTGTTGACAGTTTGGGATAT GGCTTTTGAGAAAATTCGGGTCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGATCTTGG GAATGATGGCTTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagacaTTCAGT TATTTTGATAGAGTTGACGAATTTGAATTAAATGAAATAATCAATCTGCT TTGTCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAACGAATGTTTAGAAATTCACA GTCTTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTATCGAACAAAAACAATTTGTC GAGGATGAATGTCCGTTGACACTTCTTGAAGATGTTCTTTTGAAAATCGA GGTTTCCGTTAAAGATTTGTTTGCAAATGCTGACTACGAGGATTTATGGT ACATTCATATTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCACTCAAAACTATCAAC TTTCATGTTTCCCTTGTGTTAAATATCGCCATAGGCAGAATGGAGATGGA GAACCTATACCAAATTTCTGAacttctttcaaaagttttgttaaAACAAT ATAGGTTGTTTCGAGATGTGGAAACTTTTCACAACCTGTTGGTTGTTCAT CGTCGTTTCATAAATGCGTCAAGTCAATTAGGTTTACTTAATTTGAATga gatttttgcttttgaaaaagAGTTTTCCTCAGAGCTTGAAGAAAATCATG TAGAAGTTTACCGTTGGAAGCTACAGCAAGCTGAGACATATAATATACAT GGAAGAGTGTCGTTATGCAATGATATCGTTCGAAATTTATTCAATGAACT AGTCAAGAAGAAAGGATTTGATTATATTAAATTAAGATTGGCGAGTTTTC TCACTGTAAGGGATATGGAAGTATTGTTGAATTCCGTTGACACAAATAAT CTCAGTGACGCTGACTTTTTGGTGTATTATTATGCAAAATGTTCTTTATA CATCAAGAACGGTTGCTTTGATTTGGCTGAACAAGTCATGAAGAATTGGA AAGAACATTTACACAGAAAACAATTTTCTCGATCGTCTTATTTTAACTTC ACACAAAAGCATTGCTTTTTACTTTACAAGAAAGGAAATTACAACGAAGC ATTACTTGTATGCGATGAAATTAAACGAGAtttttttACTGATGCAGCTG TTTTAGTTTCGGAAGCCttgattttgatcaaattagGAAAGTTCAACGAC GCAGAAGTGTCAATTGATGACTGGAACCAATGCAATAATGCATTTATCAT TAGAATCAGTTCATACCTGAAATTTCGAAAGCACGACTTCGAGGCCGTAG AAAATCTCCTCACAAATGTGGAAGATGAGGATTtgtcaaatcttttgttt ttggtAAAGGAATATGCGAAACTGCATCGACAACTAGAAAATAATAAATC GAGAGAATTTGTTGAACGATgtttacaaatgaaaaaaattgtaaatgagT TATTTCAAGTACAATTGGAttcgatttatttttgaaatgctATTTTATCG AATTATGATTAGAATCAGATCTTACACTGACAAGTTTTTTCAAGTAGCTA CAATGTAATTGTTGTATTGACTTGGCCTGTAAAATCTTAACTGTGTAGCC TTTTTGCTTTAGAAGTTGTGTTTTTTCCATTATGgatatttatatttttc caaaaaatcataCTAAAATAAGGCATTTTAGGCAATCTTTCCAAAGAGAA TTTATTGCGATTTGCAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:1061547..1079113+

>MSTRG.13578.41.p1 ID=MSTRG.13578.41.p1|Name=MSTRG.13578.41.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2982bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:1061547..1079113+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAATCAATTCGTTTACTGAATATGACAAGACATTGTTGACAGTTTG
GGATATGGCTTTTGCGAAGATTCGGGTCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGG
TCTTAGGAATGATGGCTTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagaca
ttcagttattttgataaaatagatGAATTTGAATTAAATGAAATCATCAA
TCTGCTTTGTCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAATGAATGTTTAGAAA
TTCACAGTCTTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTATTGAACAGAAACAA
TTTGTTGAGGATGAAAGTCCGTTGACACTTCTtgaagatgttcttttaaa
aatcgaggTTTCTGTTACAGATTTGGTTATAAATGCTGACTGTGAGGATT
TATGGCACATTCATATTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCAATCAAAACT
GTCAACTTTCATGTTTCTCTGTTGCTGAATATCGCCACAGGCAGAATGGA
GTTGGAGAACTTATACCAAATTTCTGAacttctttcaaaagttttcttaa
aacaataTAGGTTGTTTCGAGATGTGGAAACTTTTCACATGTTGTTGCTT
GTTCATGATCGTTTCATAAACGCGTCAATTCAATTAGGTTTACTTAATTT
GAATgagatttttgcttttgaaaaagAGTTTTCCTCAGAGCTTGAAGAAA
ATCATGTAGAAGTTTACCGTTGGAAGCTACAGCAAGCTGAGACATATAAT
ATACATGGAAGAGTGTCGTTATGCAATGATATCGTTCGAAATTTATTCAA
TGAACTAGTCAAGAAGAAAGGATTTGATTATATTAAATTAAGATTGGCGA
GTTTTCTCACTGTAAGGGATATGGAAGTATTGTTGAATTCCGTTGACACA
AATAATCTCAGTGACGCTGACTTTTTGGTGTATTATTATGCAAAATGTTC
TTTATACATCAAGAACGGTTGCTTTGATTTGGCTGAACAAGTCATGAAGA
ATTGGAAAGAACATTTACACAGAAAACAATTTTCTCGATCGTCTTATTTT
AACTTCACACAAAAGCATTGCTTTTTACTTTACAAGAAAGGAAATTACAA
CGAAGCATTACTTGTATGCGATGAAATTAAACGAGAtttttttACTGATG
CAGCTGTTTTAGTTTCGGAAGCCttgattttgatcaaattagGAAAGTTC
AACGACGCAGAAGTGTCAATTGATGACTGGAACCAATGCAATAATGCATT
TATCATTAGAATCAGTTCATACCTGAAATTTCGAAAGCACGACTTCGAGG
CCGTAGAAAATCTCCTCACAAATGTGGAAGATGAGGATTtgtcaaatctt
ttgtttttggtAAAGGAATATGCGAAACTGCATCGACAACTAGAAAATAA
TAAATCGAGAGAATTTGTTGAACGATgtttacaaatgaaaaaaattgtaa
atgagTTATTTCAAGTACAATTGGAttcgatttatttttgaATGAAAATC
AATTCGTTTACTGAATATGACAAGACATTGTTGACAGTTTGGGATATGGC
TTTTGCGAAGATTCGGGTCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGGTCTTAGGAA
TGATGGCTTTCATGGACaatcgaaaaatcaataaaaagacattcagttat
tttgataaaatagatGAATTTGAATTAAATGAAATCATCAATCTGCTTTG
TCAATATTCATTGGTCAACGAGCGGAATGAATGTTTAGAAATTCACAGTC
TTGTGCAAAAAGTTATCCGATATCGTATTGAACAGAAACAATTTGTTGAG
GATGAAAGTCCGTTGACACTTCTtgaagatgttcttttaaaaatcgaggT
TTCTGTTACAGATTTGGTTATAAATGCTGACTGTGAGGATTTATGGCACA
TTCATATTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCAATCAAAACTGTCAACTTT
CATGTTTCTCTGTTGCTGAATATCGCCACAGGCAGAATGGAGTTGGAGAA
CTTATACCAAATTTCTGAacttctttcaaaagttttcttaaaacaataTA
GGTTGTTTCGAGATGTGGAAACTTTTCACATGTTGTTGCTTGTTCATGAT
CGTTTCATAAACGCGTCAATTCAATTAGGTTTACTTAATTTGAATgagat
ttttgcttttgaaaaagAGTTTTCCTCAGAGCTTGAAGAAAATCATGTAG
AAGTTTACCGTTGGAAGCTACAGCAAGCTGAGACATATAATATACATGGA
AGAGTGTCGTTATGCAATGATATCGTTCGAAATTTATTCAATGAACTAGT
CAAGAAGAAAGGATTTGATTATATTAAATTAAGATTGGCGAGTTTTCTCA
CTGTAAGGGATATGGAAGTATTGTTGAATTCCGTTGACACAAATAATCTC
AGTGACGCTGACTTTTTGGTGTATTATTATGCAAAATGTTCTTTATACAT
CAAGAACGGTTGCTTTGATTTGGCTGAACAAGTCATGAAGAATTGGAAAG
AACATTTACACAGAAAACAATTTTCTCGATCGTCTTATTTTAACTTCACA
CAAAAGCATTGCTTTTTACTTTACAAGAAAGGAAATTACAACGAAGCATT
ACTTGTATGCGATGAAATTAAACGAGAtttttttACTGATGCAGCTGTTT
TAGTTTCGGAAGCCttgattttgatcaaattagGAAAGTTCAACGACGCA
GAAGTGTCAATTGATGACTGGAACCAATGCAATAATGCATTTATCATTAG
AATCAGTTCATACCTGAAATTTCGAAAGCACGACTTCGAGGCCGTAGAAA
ATCTCCTCACAAATGTGGAAGATGAGGATTtgtcaaatcttttgtttttg
gtAAAGGAATATGCGAAACTGCATCGACAACTAGAAAATAATAAATCGAG
AGAATTTGTTGAACGATgtttacaaatgaaaaaaattgtaaatgagTTAT
TTCAAGTACAATTGGAttcgatttatttttga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13578MSTRG.13578Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13578.41.p1.exon1MSTRG.13578.41.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13578.41.p1.exon2MSTRG.13578.41.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13578.41.p1MSTRG.13578.41.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000108_pilongenomesc0000108_pilon:1061547..1079113 +