MSTRG.13498.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13498.4.p1
Unique NameMSTRG.13498.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:730349..751168-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13498.4.p1 ID=MSTRG.13498.4.p1|Name=MSTRG.13498.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20820bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:730349..751168- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATTTTTTTCTGAAGGTCTTCAAGGTCTTTAAACTTGAGTCGCATTATC TTTCATGTCTTCCATTTTTTTCATATTGCATTTCCATTCCATTTAGAAGA ATGATATCAAAGTAGTTTAACAGAAAGCATGGAAAAGGCGAAATATATTT TCTGTGTTATACTTGCTCTTCACATCCGAGTGATTGATGGCCAGTATTTT ACACATGATTTCAATGTCACAAATGATGGATTGGAAAAAGTATTTTTGAA CTTGAATGTATCGAAAGGTTGTATGAAATCACTTCTTGGATTATTGGCAG ACGAGACTAAGGCTATAAAATGTAAGTTTTTCTTTTCATTGAGACTGCTT TTTCTTATAAGAATATTCATAATGAAATTGGTCAAAAAATTAAGAATTTG CTATAAGAATACCATCACGAAGTTTGACAACTGAACGAAAGAATGTCATT TTTAGAACATTTTAACTGTAAATTCCTAATTATCCCCAGGTAAGGATCAA AGCTTCGACAAAAATGCCATTTTATTCGTCAAGTACTAAACTTTGGTTGA ATTTCGATCCTAGCCTAAGAATGCCGTAAGAGTGTTTTAGGATGATTTTT CCCGAAAAGTTAATATTTCAAGATGAAATGAAAAACACCATTCTTTAAAA AAAGAATTTTGGAGTTTTTGGACCTTTTCTGCTGAATCAGCAAAATTTCA AACTCAAATATCTAAAGATCTAGCCATGGAAACCCTAAAAACTATACCTC TAATCGATAGTAGTTTTCGAGACGAATCTGTTGAAAATTTTATCAAAAAA TGTTGACGTCAGCATAAAAATTCTTTGTTGTTATAGATATTGATGCTTCT GGTAAACCAGGGCCTGGAATTTTACAAGGCAACATCTGGTGGATGGGATC TTACGACGAATGTATTTCAATAGAAGAAGCTCATTTTTGCTCGATGACCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:730349..751168-

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TGATGTTATTGTTTCAATCATTTCAAAGTGCTATCATTGTCACTGATCAA
ATTATGACTGCGCACGTGATTGGTTGGTGTATATCTGTCCCTATTGCTTT
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ATACATCATTGCTGTATGCATCGAATACCCTGTCCTCAACTTGGAAAAAC
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TTTGTGCAACACAAGTGTTCCTAAAGGAGCTATCACGTGTCTGAATGGAA
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TTGTTCTTGCCATTGAGTCGTTTGACATACAGCGTCTATTTGTGGCATAA
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GTCTGTTGCTGAGAATGAAAGCTATGGTATTCTGTTCCGAATGACATGGG
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TACATGTCCATCGCTGTTTTATCGATGCACGTCATCTCCAACGGTGTCTT
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GGCTCTTGTATTGAGTTGGGTCATCTATGCTTGCCACAATAACCATGGAG
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GCTTCATCGTCTATTTTATTGGTCTGGTTTTGGGTTACACACTTTTCAAT
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AGTTCCTCTCAATGGTGGCATTGCTGTCGATACTTTCTTCCTGCTCAGAG
CCATTCTATATTCGTTTCCTTCAATGTTTTTCAATGGTACGTAACTCACG
TGCTTTGTGCAACACAAGTGTTCCTAAAGGAGCTATCACGTGTCTGAATG
GAATTCGAACGATCTCCATCACGTGGATCATCATGGGACATTACGTCATC
TATTTCTCTGAAATGTCACCTACAGGTAACTTGACGATTGTAGATATGAG
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CACACTCGTCGATGTAATACAATCCATCTATCAATCATTTCGAGACTGGG
TTCCACAATACGATGATGACGTCATGCATAATAAGAAATACATTTTAGAA
GATGAATATTTGAAGTATGATCGTCCATCTTCGCCTGCAGCGGACACTCA
AATTTCGGACAAAGTGAAGAATGACTTGAAGGCCATCTCGATACGCAATG
TTCAAATCGATAAAGAACAGGTTGATTCAAAGGTTGGTACAAACATTCTC
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TTCCAAAAGTAAATCGTACTCCACTGGAGCAATTGTCATGCTACCAAATT
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GGGCCTGGAATTTTACAAGGCAACATCTGGTGGATGGGATCTTACGACGA
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TTTCATTTGGCAAAACAAAGATGGAAAAGGCGAAATATATTTTCTGTGTT
ATACTTGCTCTTCACATCCGAGTGATTGATGGCCAGTATTTTACACATGA
TTTCAATGTCACAAATGATGGATTGGAAAAAGTATTTTTGAACTTGAATG
TATCGAAAGGTTGTATGAAATCACTTCTTGGATTATTGGCAGACGAGACT
AAGGCTATAAAATGCATTGGTTTATGTTGCAGTCACCATCTTTTCATTCA
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GAAAAACTGTTGTTGAAATTTTAAGTTACATCAACGACTTTTTGAGTTGG
AAGTTGTTCTTGCCATTGAGTCGTTTGACATACAGCGTCTATTTGTGGCA
TAACATTGTCATGATGTTATTGTTTCAATCATTTCAAAGTGCTATCATTG
TCACTGATCAAATTATGACTGCGCACGTGATTGGTTGGTGTATATCTGTC
CCTATTGCTTTATCCTTGGTTTATGGTCCATACACATCTACCAAACACTC
ATGGTCTGTTGCTGAGAATGAAAGCTATGGTATTCTGTTCCGAATGACAT
GGGCTCTTGTATTGAGTTGGGTCATCTATGCTTGCCACAATAACCATGGA
GCTCGGTATTGTTCAATTATCAAAACTACGTGTACGACAAACCATATTGT
CGCTTCATCGTCTATTTTATTGGTCTGGTTTTGGGTTACACACTTTTCAA
TGAAGTGAAGATAAATCCAAAGTGGAGAAAGATGCAGATGGAAGGGTATC
ACTTACATGTCCATCGCTGTTTTATCGATGCACGTCATCTCCAACGGTGT
CTTGATGTATGAAGAAAATGCAATCTCTCCTCTATTCTATGAAAAAGACT
CCACGTTTGGAAAAGTTGTATCAATTGGGGATGGTACTTGGCCAATGATA
TGCAATTTTACGTTGTCAGTCCATTATTTTTGTATTGTATGTACAAGTTG
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GCTATCAGAAGGTCCTTACTGGGGCTTTGAAAATGTGGGCTTGTGTAGGA
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ATATCCACGGAAGCCTTCCGCTCATCCGCTACTACTTCCATCGATATATC
AGGTAATGTTTTGGCGATGACGAAGCGGTATACTGAGAGATGGACTTTCC
AAGTTCCTCTCAATGGTGGCATTGCTGTCGATACTTTCTTCCTGCTCAGA
GCCATTCTATATTCGTTTCCTTCAATGTTTTTCAATGGTACGTAACTCAC
GTGCTTTGTGCAACACAAGTGTTCCTAAAGGAGCTATCACGTGTCTGAAT
GGAATTCGAACGATCTCCATCACGTGGATCATCATGGGACATTACGTCAT
CTATTTCTCTGAAATGTCACCTACAGGTAACTTGACGATTGTAGATATGA
GAAATTTGCACGATGGATGTCAGGTCTAATCGCTGGTCTATGCCTCATAG
GCACACTCGTCGATGTAATACAATCCATCTATCAATCATTTCGAGACTGG
GTTCCACAATACGATGATGACGTCATGCATAATAAGAAATACATTTTAGA
AGATGAATATTTGAAGTATGATCGTCCATCTTCGCCTGCAGCGGACACTC
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GTTCAAATCGATAAAGAACAGGTTGATTCAAAGGTTGGTACAAACATTCT
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ATTCCAAAAGTAAATCGTACTCCACTGGAGCAATTGTCATGCTACCAAAT
TACGTGTATACGGGTTGTGCATTCCAAAGACATGTGATGTGAAGGATGGA
ACAAATATTCTGAAATTTCTAGCCCAAGATATTGATGCTTCTGGTAAACC
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ATTTCAATGTCACAAATGATGGATTGGAAAAAGTATTTTTGAACTTGAAT
GTATCGAAAGGTTGTATGAAATCACTTCTTGGATTATTGGCAGACGAGAC
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GAAGTTGTTCTTGCCATTGAGTCGTTTGACATACAGCGTCTATTTGTGGC
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CCCTATTGCTTTATCCTTGGTTTATGGTCCATACACATCTACCAAACACT
CATGGTCTGTTGCTGAGAATGAAAGCTATGGTATTCTGTTCCGAATGACA
TGGGCTCTTGTATTGAGTTGGGTCATCTATGCTTGCCACAATAACCATGG
AGCTCGGTATTGTTCAATTATCAAAACTACGTGTACGACAAACCATATTG
TCGCTTCATCGTCTATTTTATTGGTCTGGTTTTGGGTTACACACTTTTCA
ATGAAGTGAAGATAAATCCAAAGTGGAGAAAGATGCAGATGGAAGGGTAT
CACTTACATGTCCATCGCTGTTTTATCGATGCACGTCATCTCCAACGGTG
TCTTGATGTATGAAGAAAATGCAATCTCTCCTCTATTCTATGAAAAAGAC
TCCACGTTTGGAAAAGTTGTATCAATTGGGGATGGTACTTGGCCAATGAT
ATGCAATTTTACGTTGTCAGTCCATTATTTTTGTATTGTATGTACAAGTT
GACACCATCATACGCGTATCTTATTTTCTTCTACGCTTTCCTCTTCCCTG
TGCTATCAGAAGGTCCTTACTGGGGCTTTGAAAATGTGGGCTTGTGTAGG
AAATATTGGTGGACCAACCTTCTGTATATCAATAATTTCTACCCAACCAA
CATCTTAGACATGTGGTACACTTGTTGGATACTTAAGTATGAAGCGGTTT
GATATCCACGGAAGCCTTCCGCTCATCCGCTACTACTTCCATCGATATAT
CAGGTAATGTTTTGGCGATGACGAAGCGGTATACTGAGAGATGGACTTTC
CAAGTTCCTCTCAATGGTGGCATTGCTGTCGATACTTTCTTCCTGCTCAG
AGCCATTCTATATTCGTTTCCTTCAATGTTTTTCAATGGTACGTAACTCA
CGTGCTTTGTGCAACACAAGTGTTCCTAAAGGAGCTATCACGTGTCTGAA
TGGAATTCGAACGATCTCCATCACGTGGATCATCATGGGACATTACGTCA
TCTATTTCTCTGAAATGTCACCTACAGGTAACTTGACGATTGTAGATATG
AGAAATTTGCACGATGGATGTCAGGTCTAATCGCTGGTCTATGCCTCATA
GGCACACTCGTCGATGTAATACAATCCATCTATCAATCATTTCGAGACTG
GGTTCCACAATACGATGATGACGTCATGCATAATAAGAAATACATTTTAG
AAGATGAATATTTGAAGTATGATCGTCCATCTTCGCCTGCAGCGGACACT
CAAATTTCGGACAAAGTGAAGAATGACTTGAAGGCCATCTCGATACGCAA
TGTTCAAATCGATAAAGAACAGGTTGATTCAAAGGTTGGTACAAACATTC
TCAATATAACAGAAACATATGGTGATTTTGGTAGTCGACCTTCAAAATGT
CATTCCAAAAGTAAATCGTACTCCACTGGAGCAATTGTCATGCTACCAAA
TTACGTGTATACGGGTTGTGCATTCCAAAGACATGTGATGTGAAGGATGG
AACAAATATTCTGAAATTTCTAGCCCAAGATATTGATGCTTCTGGTAAAC
CAGGGCCTGGAATTTTACAAGGCAACATCTGGTGGATGGGATCTTACGAC
GAATGTATTTCAATAGAAGAAGCTCATTTTTGCTCGATGACCAATGTTCA
ACTTTCATTTGGCAAAACAAAGATGGAAAAGGCGAAATATATTTTCTGTG
TTATACTTGCTCTTCACATCCGAGTGATTGATGGCCAGTATTTTACACAT
GATTTCAATGTCACAAATGATGGATTGGAAAAAGTATTTTTGAACTTGAA
TGTATCGAAAGGTTGTATGAAATCACTTCTTGGATTATTGGCAGACGAGA
CTAAGGCTATAAAATGCATTGGTTTATGTTGCAGTCACCATCTTTTCATT
CATGGTCGCATACATCATTGCTGTATGCATCGAATACCCTGTCCTCAACT
TGGAAAAACTGTTGTTGAAATTTTAAGTTACATCAACGACTTTTTGAGTT
GGAAGTTGTTCTTGCCATTGAGTCGTTTGACATACAGCGTCTATTTGTGG
CATAACATTGTCATGATGTTATTGTTTCAATCATTTCAAAGTGCTATCAT
TGTCACTGATCAAATTATGACTGCGCACGTGATTGGTTGGTGTATATCTG
TCCCTATTGCTTTATCCTTGGTTTATGGTCCATACACATCTACCAAACAC
TCATGGTCTGTTGCTGAGAATGAAAGCTATGGTATTCTGTTCCGAATGAC
ATGGGCTCTTGTATTGAGTTGGGTCATCTATGCTTGCCACAATAACCATG
GAGCTCGGTATTGTTCAATTATCAAAACTACGTGTACGACAAACCATATT
GTCGCTTCATCGTCTATTTTATTGGTCTGGTTTTGGGTTACACACTTTTC
AATGAAGTGAAGATAAATCCAAAGTGGAGAAAGATGCAGATGGAAGGGTA
TCACTTACATGTCCATCGCTGTTTTATCGATGCACGTCATCTCCAACGGT
GTCTTGATGTATGAAGAAAATGCAATCTCTCCTCTATTCTATGAAAAAGA
CTCCACGTTTGGAAAAGTTGTATCAATTGGGGATGGTACTTGGCCAATGA
TATGCAATTTTACGTTGTCAGTCCATTATTTTTGTATTGTATGTACAAGT
TGACACCATCATACGCGTATCTTATTTTCTTCTACGCTTTCCTCTTCCCT
GTGCTATCAGAAGGTCCTTACTGGGGCTTTGAAAATGTGGGCTTGTGTAG
GAAATATTGGTGGACCAACCTTCTGTATATCAATAATTTCTACCCAACCA
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TGATATCCACGGAAGCCTTCCGCTCATCCGCTACTACTTCCATCGATATA
TCAGGTAATGTTTTGGCGATGACGAAGCGGTATACTGAGAGATGGACTTT
CCAAGTTCCTCTCAATGGTGGCATTGCTGTCGATACTTTCTTCCTGCTCA
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ATGGAATTCGAACGATCTCCATCACGTGGATCATCATGGGACATTACGTC
ATCTATTTCTCTGAAATGTCACCTACAGGTAACTTGACGATTGTAGATAT
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AGGCACACTCGTCGATGTAATACAATCCATCTATCAATCATTTCGAGACT
GGGTTCCACAATACGATGATGACGTCATGCATAATAAGAAATACATTTTA
GAAGATGAATATTTGAAGTATGATCGTCCATCTTCGCCTGCAGCGGACAC
TCAAATTTCGGACAAAGTGAAGAATGACTTGAAGGCCATCTCGATACGCA
ATGTTCAAATCGATAAAGAACAGGTTGATTCAAAGGTTGGTACAAACATT
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TCATTCCAAAAGTAAATCGTACTCCACTGGAGCAATTGTCATGCTACCAA
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GAACAAATATTCTGAAATTTCTAGCCCAAGATATTGATGCTTCTGGTAAA
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GTTATACTTGCTCTTCACATCCGAGTGATTGATGGCCAGTATTTTACACA
TGATTTCAATGTCACAAATGATGGATTGGAAAAAGTATTTTTGAACTTGA
ATGTATCGAAAGGTTGTATGAAATCACTTCTTGGATTATTGGCAGACGAG
ACTAAGGCTATAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13498MSTRG.13498Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13498.4.p1.exon16MSTRG.13498.4.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon15MSTRG.13498.4.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon14MSTRG.13498.4.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon13MSTRG.13498.4.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon12MSTRG.13498.4.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon11MSTRG.13498.4.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon10MSTRG.13498.4.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon9MSTRG.13498.4.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon8MSTRG.13498.4.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon7MSTRG.13498.4.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon6MSTRG.13498.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon5MSTRG.13498.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon4MSTRG.13498.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon3MSTRG.13498.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon2MSTRG.13498.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13498.4.p1.exon1MSTRG.13498.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13498.4.p1MSTRG.13498.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:730349..751168 -