MSTRG.13496.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13496.1.p1
Unique NameMSTRG.13496.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:665927..685293-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13496.1.p1 ID=MSTRG.13496.1.p1|Name=MSTRG.13496.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19367bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:665927..685293- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTTTATTACAGGTTAAAAAAAACTAAAGAAAAAGTCACAGTATATAATG TGCAACGATACCAAAAAATTCCTTATACTTATACTATTTAACTGGATTGG GTTATCATCATGCCAAGAAATCAATCACCAACCAATCGCTGATCGAATAG CATACCACGTGACCAAAAATCTAAATTTCATGCAGCAGTTGAAATATTTT AAAGAATTTCAATTCGATTTTTCACAAGTTGACTCCACTTGTATACAGTA TCCAAAATTGAATTGTTTGACTGAACTTGTGAAGATTTCCCAAGGACCAG ATGTTGGAAAATGTAAGATTTAATTGATACTTTATATACAGATTCTACTC TACCCACCTTAATTACTAAGGCGCCATTCCCCATTTTTCCAAATCCCTGT TTATATCAAACTCCCGTTTATTAGCTCCTTATTAGCTGAATTATAACAGA ACTGCACATAAGGCAAAAATAGATTCTTAGAAATGTGTGGATAACCCCTG GAAAACAGCAAAATTTGCAGAAGAGCCCTTTTCATACCTCAAAGTGAGTC AGTGTTTTACTCTCCTGAAATTTTAGAATAACTTTTAACCTTTTAACCCT GAAAAATGAAAAAATGTTCTTGGTAATTCTTCTCGGGTTACCCCCTGGAA ATGTTCGTCCATCCCCCTGATATAAAATGACTCAGTGTTTCTTTGTATTC TCTTCTTTCATGCACCAGACTTGGACGCATTGGGAAAGCCACCAACTGGT CTGTTTGAAGGGAACGTCAATTGGATTGGTAATTATGAGGAGTGCATGTC TATTCCCAATACGCATTATTGTGACATGAAAAATGTGGCAGTCAACCTAA TGAATAGAGTTACAGTAAGTTTTAATAAGCAGTGTTTACCCAGCTGGCAA ACAACGTTCTTTTAACGTTTATCTAACGTTCACAACGTCCATATAACGTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:665927..685293-

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TGGCCGTTTCCAACGCTTTCGTCTCCGTCGATTCTTTCTTCGTATTGAGC
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TCAATAGTGAAAATGGTGAAGCAAACATGAAAAAGTTCCGGGAGATGCCT
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ACGATCAAACATATTCAAAATATTCTGGCGGAACCTATGCTATGATCCTC
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TGTGACATGAAAAATGTGGCAGTCAACCTAATGAATAGAGTTACAATGTG
CAACGATACCAAAAAATTCCTTATACTTATACTATTTAACTGGATTGGGT
TATCATCATGCCAAGAAATCAATCACCAACCAATCGCTGATCGAATAGCA
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AGAATTTCAATTCGATTTTTCACAAGTTGACTCCACTTGTATACAGTATC
CAAAATTGAATTGTTTGACTGAACTTGTGAAGATTTCCCAAGGACCAGAT
GTTGGAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496MSTRG.13496Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.1.p1.exon16MSTRG.13496.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon15MSTRG.13496.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon14MSTRG.13496.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon13MSTRG.13496.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon12MSTRG.13496.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon11MSTRG.13496.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon10MSTRG.13496.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon9MSTRG.13496.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon8MSTRG.13496.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon7MSTRG.13496.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon6MSTRG.13496.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon5MSTRG.13496.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon4MSTRG.13496.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon3MSTRG.13496.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon2MSTRG.13496.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.1.p1.exon1MSTRG.13496.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.1.p1MSTRG.13496.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:665927..685293 -