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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:655179..658754+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13494.1.p1 ID=MSTRG.13494.1.p1|Name=MSTRG.13494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:655179..658754+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gtagTTGAAAAACAAGCTTCTGAAAGTTAAGCAATTTCATTAAAGATTAT
CATTACCTTTAGAAATAACCGCTTTCAATCTTATGCTGGTTATCCAGGag
gaattaaaattttcaaagattctggaaaattgacaagaatcttagtgtgg
TAATGAAAatcttaccttaagggaagaaatttttgcggaatttaattttg
cggttccAGTTTTGCTGTTGAGAgggttttttgtttaaaatatatggcct
attttgccctTAAAAGACCAATGTTAtagaagattttttaaatcatgaga
atatttgtgttttgaggaatttaatttcgcggatttgttggaaaaaattt
cttcccttaagggaTACAAAACAAAGATATGAATCCAGGGCAAGCAACAG
CAGTAAAAAAGTTTTAGCttcaagggaagaaatttttatgCAGCAAGAAA
ATTAACCTTAAAATTGTCCTGAAATCCCAAGTTATATAATTCCCACCCAT
ACAGCCAATATTTCATGTAtttccaaatttgtgctttttTGAGCTTGAAA
ACAGCCATTTTTCTTATATTATAATTAGCAGCAATATATTGCCAAAAATA
CCTAATGGCCAAATTAAACTCCTATCATATTTATTTTCCAAGGTATATCA
CTATCAGCCAAATTAAATGCCTGCCAAAGATGATTGTGATTTTGTTCAAT
TGAGGTAGTATTGTTTCTAATGTCATTAAAGACATTATAAAGTATGCGGA
TACTTTACTTTTTAAACATCAGGACCCATTTACAAAGTAAAAAGTTATTC
ATCGTTGGAAAGATGTATGAGGGTTGAAtaatctaaaaaaataaaagttt
tttagatattgagaaattatatgacagaaaaattgaaaaatgaagaatct
tACTTCTTGCTTGCGATGACACTAAAGTATATTTGAACATGAAGGATagg
attttgaatttctttctgtATTAATTTTACGTATCTTACTAGGATAAAAC
ATTTACAAGTCCTGTGGAGTAGGGATCTAACACccaaaaatgaacaaata
tAGCAAAATATATACTTTGAGATTTTAAAAATTAGGCAAACTTTCACCTT
ATAGTTATTTTCGATACCACTTTTTTGTGTAGTCCCTGAGTGTTTTTCGC
CAGTCTGAGttttttttGCGAGTCTGAgttttttgtccctggttttagag
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CATATATCCAGTGCCTTAATattttccagatttattttgacaaagatttt
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cagatttttgtatctttctTGGATAAAAATAGGCCTAAGACaaccaaaaa
tgaccaaaaatagcAAGAATAGCCAACTTCAGTCGTTTAATATTATTATT
TCATTCTATGATCTATCTATCCATCTATCATCTATGAATAATCGTGCACT
ATGCAAGATTTTCTACTCCAAGCCGTCtcgtttctttttcaaaagtcttt
ttcaatagtgttgatagtttctcccaatagatacATATgctttcattaaa
atattttttttattttgagcagTTATGTCTAttatgtttcattgtttcat
tgtttcaatgttcattgattagttttgataaccaggtaggtccattccaA
TAGGTCCATAaacataaaagtatcacttgttataaAGTCATTAACCTTTG
TAATTTTAACCATTTAAAATGACTAAGATTTATTAAAGCAAATTATTTAA
ATGCTTTTATAGGGCAGGCTTTTTCATAACATTAAAAACAACTAATCTTT
TTATTAACAAAGAGGACTAAAAGAACCACAAAGTGGCTCATTTTTGCATC
ATGTTCAGGCCAAAATAGGAAAACATCTTTTTGGCCTGAACATAGCAAAT
ATAGATGGGCCTTTGATTACAAAACACTTAAGCAATTTGTGGAGCAATAA
CAAATTACTACATCATACAAAAGCTGTAAAGCTGTAAACTTTGTTTacat
attggaacatttttgagcttttagatcctgagattctaaggtcctaagtc
ttaagtctaatgttaaaactctactttctagCACttaaaaaatcacttgt
ggttttaaagttttgagggaattccccttctGTGTCAGATATTTTGGTGC
CAATTGTTGGTAGAAAACATTGATTTCTTTCAATTAACCTTACATTTGGT
ATTATTACAGGAATAATAAACATGGCTTAACATAGCCATGCACATCAAAT
TGGACTTTCTTTCTAAAATACCTTTTTCTGTTGACtttttttGCTAAATG
AATATAGTATTTAATaattaacaataaaaataaaatttagcagTTGCAAG
ATGAACAGTTTTGGAATGCTAGCTATTATTGTTCAAATGTTTTGGATGAA
CTCAGGTATATATTTTATTATTCCATAATTGTATTCATCATATTGACCTT
TTAAAACTTGTTCTCTCATTTGTAAAGTTTGAACCTCTCTTGTACTTAAA
TActtaaaaaaggttgaaaagttGTATATATATAGAAATTATAGAACAGG
TTTCATGTAAACTGGGCTTATACTGCCGGTTAATAAATATTCATGAAAGT
AATTTTATACCATAGTGAATGCTGAAATTGGATGTTATCAATGTCAGCTT
GGTAATGGTGGCTGTATTAACCCTATCGAAGCTGAACCCCCAATTCGTGT
CGAATATTGTACAGGGAATAAAGTCTGTTCCACTGAAACACGGTATGCAA
GACAAAACTCTTCGATACCATTTGATGAGGAGCCTGTTTTCATTCAACGC
ACGTGTCAGTCAATTGGTTCACCTATGTGTGATTTCACTAAAGAAAAACC
TTGTATTAAAgaccaaaataatgaaaatatgtATGTCTGTTATAGTTGCT
GCAGTAACAACAAGTGTAATACTGATGTACCAGTTTTCAGCCATGCATCT
AAAAATGCCCTTCCAGTACTTGTTATCACTTTTTGTAGTGTCATATTATC
TGCAATCCTGTTTcattaaataaaatgttacATGTTGCTTACAGAtttca
aatattgaaattcaCAACAGTAAGTTTCCAACGTCTAACCCCTCACTCCA
GTTTTTGATACATTAATGATAAAGAATATTGAAGACACTTTAGCCCATTC
TAAATTGATAGCCTTATTAACGTCCATTCGAACAGATTTTAAACAGGTCA
ATCGATCATTATATTTTAAAACTCAATTGGAAATAAGTGTCTGTGAgtca
cttttttaaaaattttgtttttatgtttgtATAGACGACCAGATGATTTG
TTAAAAtggtttttagtttttaattgattcagcatgttatttttttaaga
gccatgtatttttgacgcttagttttttaaaaacttttttattacatttt
cactgtaatttttctagtttaaggtaaaatttttattattgagcattttt
attgctctttttgttcactttttaga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:655179..658754+ >MSTRG.13494.1.p1 ID=MSTRG.13494.1.p1|Name=MSTRG.13494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:655179..658754+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACAGTTTTGGAATGCTAGCTATTATTGTTCAAATGTTTTGGATGAA
CTCAGTGAATGCTGAAATTGGATGTTATCAATGTCAGCTTGGTAATGGTG
GCTGTATTAACCCTATCGAAGCTGAACCCCCAATTCGTGTCGAATATTGT
ACAGGGAATAAAGTCTGTTCCACTGAAACACGGTATGCAAGACAAAACTC
TTCGATACCATTTGATGAGGAGCCTGTTTTCATTCAACGCACGTGTCAGT
CAATTGGTTCACCTATGTGTGATTTCACTAAAGAAAAACCTTGTATTAAA
gaccaaaataatgaaaatatgtATGTCTGTTATAGTTGCTGCAGTAACAA
CAAGTGTAATACTGATGTACCAGTTTTCAGCCATGCATCTAAAAATGCCC
TTCCAGTACTTGTTATCACTTTTTGTAGTGTCATATTATCTGCAATCCTG
TTTcattaaATGAACAGTTTTGGAATGCTAGCTATTATTGTTCAAATGTT
TTGGATGAACTCAGTGAATGCTGAAATTGGATGTTATCAATGTCAGCTTG
GTAATGGTGGCTGTATTAACCCTATCGAAGCTGAACCCCCAATTCGTGTC
GAATATTGTACAGGGAATAAAGTCTGTTCCACTGAAACACGGTATGCAAG
ACAAAACTCTTCGATACCATTTGATGAGGAGCCTGTTTTCATTCAACGCA
CGTGTCAGTCAATTGGTTCACCTATGTGTGATTTCACTAAAGAAAAACCT
TGTATTAAAgaccaaaataatgaaaatatgtATGTCTGTTATAGTTGCTG
CAGTAACAACAAGTGTAATACTGATGTACCAGTTTTCAGCCATGCATCTA
AAAATGCCCTTCCAGTACTTGTTATCACTTTTTGTAGTGTCATATTATCT
GCAATCCTGTTTcattaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:655179..658754 + |
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