MSTRG.13424.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13424.1.p1
Unique NameMSTRG.13424.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000106_pilon:889295..900412-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13424.1.p1 ID=MSTRG.13424.1.p1|Name=MSTRG.13424.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11118bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:889295..900412- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTGATCATATCGAATAAATCAATTCAAATATTCGAACCACTCACATCT CATCATGAAGGTTTTCATCGTCTTAGCTCTTTGCGCTGGTAAGAAACATT TTTTTATCTGACACACAACGTCTCGACAACATCCATCTATCGTCCATTTC ATCAACGTTAAATGAATGTTTAGACAATGTTATGCCCCGATGAGGGGAAT CTTATCTCATCATTTCGAATTTTCCTGAATCATCTCTGTATATTGAAAAG ACAAGGCAGTGTTGCCCGTTGTTAAATAAGGAAGTCTAGTGATTCTCTCA GATAGTTGTCAAATAATCTATCCACTAATTTTGCGGTTTTCGGAACGGCA CCATTTCTTGTTGTAACTGTAATTAATATATAAGCGACCGTAGTGCAGTG GTAAAGCATCCGGCTACGGTTCGCAAGGTTGTGGGTTCAACCCCCAGCCG GGTCATACCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGATGCCTCTCTGCTTGATG CTCAGCAACTAAGAGAAGGATCAAGGGTAAGTGGAGAAATCCAGGGAGAA AGAGTGGCGCCCTCCCCTACCTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGAGGAGC CTTCGGGTCGCCTCCGACTGCGGTCGCAGACTTACTTACTTAATATATAA GGATCTGATGAAGGTAGCATTCCTCTGTATTTTCTAGCGATAAACAAATG AGTGATTTAAATTGTTTTTGACTTTATTGAGCGTATCGAAAAATTCCAAA AACAGTGTAATGATTAATACGCACTTTTCTCAATTCTTTTGTAGCTTCTT ACGCCCTTGAGGTTGAAAAGATCACTGGTACCACACCACCAGCTGTACCG TGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAAAGCTGACGGAAACTTCGAATACTA CTACTATGGCCAATACAGAAGCAACTATTTCGTCCAATGCTCAAATGGAT 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ATATAAAATGTTTCGCTGAATCAGCAAAAACGGCAAATTCTGACTTTTTT TTGCAAAATATAGGAAAAAAATATCTTTAAAGCTTAATATTTTCAGTTTC AGTTAAGCTTTTTTTCTAAAATTTTCACAGCTTATTCCATTCATGAATGG AACTTTTTTCAAAAGAGATTGATTTTAAGACGTTGTTGTTGTAAGTTGTC ATTTTGAAAATTTCTAAATTTTCAGTTTGGACTTTGCAATATCGAAAATC TTGAAATATTTCATAAAAATCATAAATTTTACACCCATCGGGTCGTAAAT TTAAGGGAAAACACAAATATGTTCATAGTTTTTCCCCCAATTACCACTGG GCTTAATAATTTGATTTTAGCTACACCTCCGTTTTGGGGGTCCAAAACCT GCATTTTGACAACCAGGGGTATACTGTAAAAGTTTTATCAAATAAATTTA TGCCCAAAACCCTCTAAATCATATTTCAAAACTATGGTCAAAATTTTGTA TTCATATCTTAAAGATATCTCGAGAAATCGCTAAAATTTCAAACCTCCGT TTTGGGGGCCATTAGAAAAAAGCTACCTATCTTTAAGCGATTGAAAAATA TTTTTGAAATTGAAAATTTTGAAAAAGAACTTCCAGGAAATAAAGTAGAG ATGTTAAAGGTTTTCATGCAGCAAAAATTTTTGTAAAATCTCTTTTCCTC TAGATTTGAGAGAAATCTCAAATTTGATCGCCGTTTTGGGGGCCACATAC TGTACCAAGAATTTTAATTATCACACAGTGTCGTAAAATTTGAAGTTCGT AAAAAAATCAAGTTTTTCGGACCTAGTGATTACACAAATGAACTTTAAGG TCATAAAACCTATACTTTTTAGGTACCTATACTTATGGTAGGTACGAAAA TCTTTTTTTCTTTTCCATGGTTACACGCCAAAAAAATCGTAAGGCCCTCA AAGTTCTATTTTAAAGCTCATTATCGATAGCGCAGTTGGGAGAGCCATCG CCCGGCACGCGAGAGGTCGTGGGTTCAATCCCCACTCGATTCGTTACCTT TGAGAAAACTGGGAAGTACATTAGTGCAGGATCCGTTGATTCATTACCCA TAAGTAATACGCACTTGATTTCTCACAAAGCTCATTATGATAGTGGCCAA TAAAATCTGAAAATCGACTTTCTCAAAACATGGTCATATTGCATACCATA ATGACACAAATTTGATGGAGATTTAGAAAAACATTAGTAAAAATGAAGTG AGTTTTGAAGTTTTGACCCTTCAAAGCCGTTTTTTACACAAAAAAACAGG CGCAATTGCATTATGGGCATGAAATCCTGAAAAATACAAATATTGTTTTG GGAATGGATTTCTAGCAAGTAATTGAAGCAATTGAATCACGGTTCAGCTC ATGAATTGCAATTTCACAGTTTCAGTAAGTTGTGAGTAAGGGATCAATGT TTGTAGGTTTTAAGGTGTAATAGTGTAGGTTCTAAGGTGTATTTTGATTT TAACGTAACTGTTTTGAAAATATTTAGGTTCCAATGATCTAATAATAGCA TTAGTAACTTTGCAGTGAATCACTGTTCAAAACTTGAGACAAAATAGTTA TAAAAAGTTATTCAAGAAAACCATTTTGTAGGTTTTAAGGGTTAAATAGC TAAAATTGCATTTTTTCACGATAAGCAATACAAATTTTCTTAGCAGCTTT TACAAAAAAACATACCCAGGGAAGAAATTCATAGGTACCCTAGACTCACC AAAAAAAGTTTCAGCCCTTAACTTCCTCTCCTAAAAATATCTTTCTTGCT TCCATCTGAACATTTGCTCTTTAGAAAGACACCACTTCACAATAATCTTA CTACGTTACTTTCTCATCTTAACCATTATTTTAGCATTCTTGGTATCACT GAGACAAAGCTTCATTTTACGATCGAAAATACTGAACTCTCCATCCCTGG TTTTAAGTCATTCAATACCCCGGCAGTCACAACAGATGAAGGAACTGCTC TTTTTATTTCTAAATCTTTCAAGAGCAAGCCTCGTGAAGATCTTTCAAAG CTTGTATATTATAATTCTGACAACCTTGAATCCACCTTTGCTGAAATTGT CCTGGAAACCGTAAAAAATTTGATTGTTGGATGTATTTATAAACACTTTC TTTTTGACATTGATCTTTTTATCGGAAAAATCTTAACTCCTTTGTTGCAA AAATCTTGTCAAGAAAACAAAAATCTCGTCCTGTTGGGTGACTTCAAGAT TGATCTTTTGACTTGTGACTCTAAAATCTCTCATTCCAAATTTCTTGACG TCCTTGGTGCCTTGGTGCCTATCAAATTCTTCCATCTATTACTCTTCCAA CGTGGATCACTGATACTACAAGTACTCTCCCATCGACAAGTTTTTTAACT CTCCTCTAAACTGCTCTTCAGTTTCTGGAAACCTAACTGTCAATATCTGA TCATCTTCCACAATTTTTGACTCTTAACACCGATTGTAGTTCTCACTATA AACCTGAACTTCCTTTTTGTCGAGATTGGTCAAACTTTGATGAAGTAGGT TTCAAAGAAGAATATTTGAGAACGTAGATTAAAAAGGTCTTCTTGATATT GAAAGGGGGGGGAATGTTGATTCATCTTTTAACTCTTTTATAACTCGATT TAATTCTTTGTTTGAGAAACATGTTCCCCTGAAACAATTGCCTAGACGTC AGGCTGATCTCATACGGAAACCTTGGATCACCAGAGGCATTCGTTACTCC ATGGAAATCAGAGATAACCTAAACGGGGAAAAGGGAAATGTTGATTCGTC TTTTAACTCTTTTATAACTCGATTTAATTCTTTGTATGAAAAAAAATGCT CCCCTGAAACAATTGACCAGACATCAGGCTGATCTCTTACTAAAATCCTG GATCAGCAAAGGCATTCATTCCTTCGGAAATTAGAGATAACCTTAACAAC GACTATCTATGAGTAAAAGATTCTTCACCTGATCTTAAACAATTTCTTCG TGGTAGGTTTACATTTTATCGAAATTGATAAACTTTGGATGGATAAAACA TTTTGAGCAAGAGGGACATAGGACCGTCCACATAGTACGTACGCACTAAA ATGTCGAAAATCAAGTACTCCCTCCCCTCCTGTACGCACGCGTACGCAAA TGGCTATACTCCCTTGGTAAGTACGTACTTTTTCAATCAGCTCCCCCACC CTCGGTTGAAGAAAATTTCTAATTCAAATCGTTTGGTTAAGAGCTTTATT TCATACATGAAACTCAATGTTTATTAGCCCTATTCATACTAGGCTTTAAG AGGTGGTTCAAAACTAGGGGGGGCTTTTCCTGCACCAGCCCTTAACTTTT GATCTAGTGGGTCTTTTTGGATGAAATGTGGCACACAAGATCCTTGTCAC ATAAGGTAACTTTTGACAAATTTTTTTTTGATAACGTCACTCATCATGCT CAAAGTGAGCAAAAACTGAAAATTTCCTTTGTTCTTATAAATAGCTATTG TATTCTAACAATTTCCTGAGTCTAAAATGCTTATTTTATCCTAAATATTC AATAAGTGATTTAACGATATATTTGGTATATTTGACATAAAAAATAATTT TGTATTGGAAATGTGTCAATTTTTGTGACACCTTACTGTCAGAAATTGTC ATCATGCTCAAGGTGTGAAAATTTTTAGGTGTCAATTTTTTTTATTTTGA AGCTAAATATATGCTGGGTATCAACGGGTTAGTATAAAAAATTCAACGAG GATAAGGATTCTTTTGATACTTGCTCACTTTTCTTCAGTCTTATACATAG AGTAGGCCTTATCTAAAAGCTATCTAATTTCCGAAAGAGTAATCTGTTTC AAAGACAAAAAAGACTTTGCAGCCAGGAAATTCTTACTGAAAAACCTGTT AAAACCGTTGGATTTTCGCAAGATTATCATTGTAAAAATACTGGAAAAGA AAGTAAACAAAAACATACAAACAAGATGAAAAGTAAAATGGAGCTTATCA TATAAAAAATAGAAGACAAAAGAATTATGACGAAAAATGAAAAAGATGTT TGTGATGTTTCATTATGACACGATGGGATATTACATAAGCAATTAGATAT CCCGGTGTTTGTTACATTTTCAAATGACAATACATTCCAATGATTTATTA GCTATAAACAAATTATCCGGATATTCTTCTACAACCATTATATCCAAGAT GAAATGATATAAATAAGAGTTGTTCTAGAATATTTTGATCATCATATCGA AGTTCAAATACTCGGATCACTCACATCTCATCATGAAGGTTTTCATCGTC TTAGCTCTTTGCGCTGGTAAGAAACTTTTTTTTTTCTTTATCCATCTATC GTTCATATCAACCATATTGTTGTCAAATGATTTTGCTACTATTTTTGCGT TTTTTGTAACGGTGTATTATTGTTATTTATTGGCATTTTGTAGCAGTTTT TTTTGGATGATAACGGAAAGTTCAAAGGTAGCGTATGGAGCATAGACATA CGTCCATACTCTTATAAATCTTTTCTATCATTTCTTTTATAGCTTCTTAC GCCCTCGAGGTCGAAAAGATCACTGGTACCACACCACCAGCTGTCCCATG CCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAAAGCTGACGGAAACTTCGAATACTACT ACTATGGTCAATACAGAAGCAACTATTTCGTCCAATGCTCAAATGGATTA GCTGCCTGTCAACCATGTTTCCCATTGTCTTTGGAATTCAGTCAATCATG CAACCAATGTCTTTACAGCAAACAAGGTAAAAAATACTTGAGAAACTTGG TAAACTACACTTCACATAAGACCCTTTACCCCTTCCTAAAAAGTTCCAAA TTAATTTTAACCAATCACTTTTTTAAATTTGAAAATTTTTTCTTTCTATA TGACCCTATTCATAAGTTTTTAGATGCAATGAGTATCAAAATCTCAATCT AAAAACCTCATCCCTAAGAAGATCCATTTTAATATCAGTCCCATATATAT TTTTGAAATTTGAAAAAGTTTTTGTAAAAGCTTCTCTATCTGAAAAGTTA GAGTCCTGTAATTCAAAAGCTTGCACAACTGAAGTCCCAAACCCAATTCA CCCACACAACGTCCTTTCAACGTTTTTCCAATATTCACAACGTCTATATA ACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGTTGTGTGTCAGCTGGGCGTATACTC TCAGGTGCCTAATAAACGGGGGGAGGTTGGAATAAACGGGGGGGGGGTTG GAAAAATTTAATAAACGGGGGGGACCTAATTACCGGGGGGTTGGAAAATG GACCTCTAAAAACCCTAAAAAGGTTGAAAATAAAATAAATTTTAGGATTT TTAGAGTAGAACAAGGAACTCTTCTTTTGGTAGCTGGGAATTTTTTCAAA AATTAATAAACGGGGGGGGGGTCCTATCCTAATAAGGTCTGGGGGAGTTG GAAAAAAATCGAAAAATTAACCAGCGGGGGGGAGGGGCTTTTATTAGGCA CCTGAGCGTACCAATTACTTTAATCGTAGAAATTTTAGCGAGACTAATTT TAGCGCTTTAGCGAGTTTACCCTATTTTCGCCAAAATAAATCTCGCTAAA ACACGCCGAATCGACAGATCGCTAAAATTTATCCGCGCGAAATTTCTGGT TATATTGCCTTGATAAATTTTTATCAATAAGAAGGGTTTCAGTGCAAAGA AATGATAGAAAACGAATTCAGTCAATAATTTAATACAAATATTCGCTAAA ATTTATCCACGCGAAATTTTTTGAAATCGTGATTCGCTAAAATAAATCCA ATAAAAAATCGATTTTTCTGACTCGCTAATATACGCTAAAATTAGTCTCG CTAAAATTTCTACGATTAAAGTACACTTAATTATAAATTAAAGCAAATTT TTGACCTATTGTTATTTCTTTTTTCCTTAGATGATTGTGTTACCACACAA CCATGGGAACCAGCAACCACTTTGAAATGCACTGATATTTGCCCAACACG AGGACCTGAATTCAGTGGCAACCTTGAAGATCCACACAGTCCATTCCAAT ACATCGCCTGCTGGAAGGGAGTCACTGTAGGATGTGTTGCTTGCCCAAGT GGTTTAAAATTCAACGAGAGATGGAATGCCTGTTTATTTGATGGTATCTA CAAGACTGCCCCATCTCACTAAATTCTTTGATATTCCTAAATCGAGGCTT TTTGGATATTGTCCTCAATCAAAAACGAAAATTTTGTAACATTTGATAGA ATTTTTAAAACCATTGCATTTAATCAACCTTTTTTTGAATATACCTGATA CACACTCCCAATAAAAGCTTAGCAAATTGTGAATTTTTCATTTTTTGTCA TATTGGTTCAGATACGTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:889295..900412-

>MSTRG.13424.1.p1 ID=MSTRG.13424.1.p1|Name=MSTRG.13424.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:889295..900412- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGTGTTACCACACAACCATGGGAACCAGCAACCACTTTGAAATGC
ACTGATATTTGCCCAACACGAGGACCTGAATTCAGTGGCAACCTTGAAGA
TCCACACAGTCCATTCCAATACATCGCCTGCTGGAAGGGAGTCACTGTAG
GATGTGTTGCTTGCCCAAGTGGTTTAAAATTCAACGAGAGATGGAATGCC
TGTTTATTTGATGGTATCTACAAGACTGCCCCATCTCACTAACTTCTTAC
GCCCTCGAGGTCGAAAAGATCACTGGTACCACACCACCAGCTGTCCCATG
CCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAAAGCTGACGGAAACTTCGAATACTACT
ACTATGGTCAATACAGAAGCAACTATTTCGTCCAATGCTCAAATGGATTA
GCTGCCTGTCAACCATGTTTCCCATTGTCTTTGGAATTCAGTCAATCATG
CAACCAATGTCTTTACAGCAAACAAGATGAAGGTTTTCATCGTCTTAGCT
CTTTGCGCTGATGATTGTGTTACCACACAACCATGGGAACCAGCAACCAC
TTTGAAATGCACTGATATTTGCCCAACACGAGGACCTGAATTCAGTGGCA
ACCTTGAAGATCCACACAGTCCATTCCAATACATCGCCTGCTGGAAGGGA
GTCACTGTAGGATGTGTTGCTTGCCCAAGTGGTTTAAAATTCAACGAGAG
ATGGAATGCCTGTTTATTTGATGGTATCTACAAGACTGCCCCATCTCACT
AACTTCTTACGCCCTCGAGGTCGAAAAGATCACTGGTACCACACCACCAG
CTGTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAAAGCTGACGGAAACTTC
GAATACTACTACTATGGTCAATACAGAAGCAACTATTTCGTCCAATGCTC
AAATGGATTAGCTGCCTGTCAACCATGTTTCCCATTGTCTTTGGAATTCA
GTCAATCATGCAACCAATGTCTTTACAGCAAACAAGATGAAGGTTTTCAT
CGTCTTAGCTCTTTGCGCTGATGATTGTGTTACCACACAACCATGGGAAC
CAGCAACCACTTTGAAATGCACTGATATTTGCCCAACACGAGGACCTGAA
TTCAGTGGCAACCTTGAAGATCCACACAGTCCATTCCAATACATCGCCTG
CTGGAAGGGAGTCACTGTAGGATGTGTTGCTTGCCCAAGTGGTTTAAAAT
TCAACGAGAGATGGAATGCCTGTTTATTTGATGGTATCTACAAGACTGCC
CCATCTCACTAACTTCTTACGCCCTCGAGGTCGAAAAGATCACTGGTACC
ACACCACCAGCTGTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAAAGCTGA
CGGAAACTTCGAATACTACTACTATGGTCAATACAGAAGCAACTATTTCG
TCCAATGCTCAAATGGATTAGCTGCCTGTCAACCATGTTTCCCATTGTCT
TTGGAATTCAGTCAATCATGCAACCAATGTCTTTACAGCAAACAAGATGA
AGGTTTTCATCGTCTTAGCTCTTTGCGCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13424MSTRG.13424Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13424.1.p1MSTRG.13424.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13424.1.p1.exon3MSTRG.13424.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13424.1.p1.exon2MSTRG.13424.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13424.1.p1.exon1MSTRG.13424.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000106_pilongenomesc0000106_pilon:889295..900412 -