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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000106_pilon:782878..787517- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13418.2.p1 ID=MSTRG.13418.2.p1|Name=MSTRG.13418.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:782878..787517- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTAAAAAATAATAAAATTTAAGAACAAATGACACCAAAATCAATAGCAA
TGACTTACTTATTGTGGATTTTCATAATGTTGGTCAAATCAAAAGAAAGT
TTTCAGATTCTCACCACTCAATCGTCATGTGATTCTAACCAATCAACAAA
GATTTATATCGATCCACAATATGATCAGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAA
CTGTAAACTGTCCATCCTTATATGCTGCTTATCATTCTACTAAACTATTC
GATAATACTTGTATTATACTGAAGAATTCAGTCGAATCGTACCCATTAAA
CGTATCAATACTTATCCATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGA
ATCAAACATCCAACATTGATTGTCAAGGCAAACCCTATAACATATCAATC
ACTCATTGCTCGAATATCAATTTTAAAGGAATTTCATTTACAAATTGCCC
TTCGTTTTCTAACGAGGACAGTATACTAACATTTGACCATAGTATAAATA
TACAGTTAACGAATATCATATTCCATGGAAACGAGAGTCAAAACATCTTG
ATAAAAGACTGTGGGAATGTTGGAATGAATTCACTAAAGGCTAATCGAAT
CCGGATTCTTTACCAAGATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATAT
CAAACTCTAATTTCTCTTCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCC
AAAGCTGCAGAAACCAGATATGGTAAAGGTGGTGGAATTTCAATGTTTTT
GATGAATGATATAAATAATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCG
ATGGTAATTCAGCTATCTATGGTGGTGGACTGTATTTGTATCTTGAAAAA
GGAACTTTTAATAACAGACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAA
CAATTCATCGACTTCAGGAGGTGCTCTTTATATTGCTGATTTCTCAAGTA
GCCCTGATAGTAATCAAATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAAC
TTTTGTGATTTCAATGCAGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTA
TCTAAAATTCTTAGGTAACAATCGTATCGAACAAAATAACGGAACTGCAA
TGGTTCTTGGTGCTACAGAGAGCTACATTAATGGTAACCTAACGCTTGCT
AACAACAGCGGAAAATATGGTGGTGCTGCATTTTTATACAAGTGTGCCAG
GTTCAAAATAACCCCCACGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCAT
CCAGAGATGGAGGTGCGATGTTTGTGTTCCATTTTTTCAAAAAGAAAAGT
TGTAAATGTTTTTTCGCTCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCAT
CAATTTTACTTATAACACTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCAT
CCACCATGAAACTATGTCAGCAATTAAATTTCAACGATACACACAAAGAA
CGTATTTTCTTTACTGGAGAACCTCTAAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGA
TAAATTCACACTCGTATCATCTCAATGGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTT
ATTTTAAACCTGAAATCAACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAA
TCACAAGTTCAAATGATCAGGAAAATTAGAAATACGTCTGAAGATTTAGA
TAATTCTACAAATGGTTTCGGTTTATTGAATAAAAATACATATGTTGTTG
GGCCAGACCACACTATCAATGTGGCTCTACAAGGACAATCATCTCAGAAT
TATACACTTGATTTCTACGTTAGTAGTGAATTAGGAGAATTAACACAAAA
TTTAACAGTGAAATTATCCAAATGCCCACCGCTGTATTATCTACACCAAA
ACAAATGCAAATGTAATGCTAGTGGATTTATTGCTAAATGTACGTCCGAT
AATGCGCTACACATGCTACCAAATTGTTGGATTTCACCACAAGGTAACTC
TTACGCATGCCCAGTAGATTATTGCGCTATATGTAGCGAACAGAGTAAAT
TGTCAACTATCCAAAAATATTGTACGCATAATTTTACACAACCTTGTGAC
GTCACCCGAAATCAAGCATCACGATTATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCA
CAGTACAACCATTGGTGGTCGACAATGCGCAGATTGCCGAGGCACAAATA
ATCACTATTGGACGCCGATCCTTGCTATTGTCATTGTTACCCTTTTCCTA
TTGTTCATCGCTGCATCAAACTATACTACATATGCGTCTTTTTATCTACC
CCTTATCTTGTTCTATCAATTAGTAACATTGGTAATGACGACCACAAACA
GCCTTGGTAATTTTTCAGTTTTCTTATTCACCATTTTCCATGGTGATGAC
AGATTCATGTATCCATTTTGCTTCATAGATGGTCTTGATGATTTACATAA
GATCTGGGTCCGATTCATTTCAGCTGCATTGTGGGTCATCCTTTATGGAG
TTTTATGCTTTATCTCAGCACGGGTGTTTCAGAATCAGATGAATCTCAAG
CTAGCGGTTTTACGATCCTGGCCAATCGTGTTTTTACTGTATTATATCGA
TATCATGAAATTTTCAGTAAATGCTTTAAAAGGGATGACTATTGATGATC
GTATGTGTGTTTTCAACTATGCTGAAGAGGAGTTTAATGGACAAAGACAT
CGTCCATTATTTTGGTGTAGTATTATAACCACAAGTTGTACTGGATTAAT
GATGCTTGGAATCTTCATGTTGAAAGTGTATTGTAAACGAAATCAAACTA
TACACGAGTATGTTCATATTGAAGCCAAATCTTTAGATTCGATTGTCAGT
CGTCGAAAGATAATCTTAATATTCGGTTTCTACACCCTATATGTTACCCT
CTTCACGCTCATCATGGAGCTCACCGGTACGAATGCTCTCTTGTTGATTC
TTTCGATCACTTTCACTGGCATATTTGTTTATAAACAACCCTATCAATCC
AAATTGTATAATTATTATGAGATATTGGTTTATGTTGATTTTATGATCAT
TGGTATTTTAAGTAATAATCCAGATAACGAGCATTCAGCTATGGATAATT
ACACTTCGACTTTTGTTGAGGTTTTGATAGTGTTTCCATTTGTTGGTTGT
CTTGTATGCATGCTGATTACTTACTTTGGAACATGGAAATCAAATCAGCA
GAATCTTGGTAAGTTTAAGCTAACTTAAAGGGATAATCAGATGGTTTGTA
ATATTTGACAGGTAGGATCCTTCTATTATCCTGAGCAAAATCTCAAAACA
TTTTTGCCTAACTATTTTCCAAAGTCGAGATTATTTAAGTTACAAGTTTT
TGCCTATTAGGATGAAAACAATCGAATTTCAACGTAAGAACCGTGTAAGA
ACCCAGTTTTCAAAAATTTCAAATTTTGATATCTCGTTGGATTTTGGAAA
ATTGTACACAGAAATAGTTCGAGGTTTTACTAACAGAAGGTTTCTGCCAT
CTAAATATCTCAAACCATCTGATTATCCCCTTCCAGGACCATTGCTTTTA
TAAGCCAAAAGTAAGAGTTTTTATGACACATCCCCTTCTCACACACCCAG
TGGAGTTTTTTCAGCCAGTGGGGATATAAATAACAAACTGAAACTCGATG
GGGATTGATATTCCCATATTCTTTGTGGCTGGGGATTTCATTTCTTTTGT
TTTCAAGTCAGAAAATTCAATGGGGATGGTAAAAATAGCATAGTATTTCA
CAAATACTATGCTATTTTTGGGGACAAATATTGGAGGGTAATTTTCCACC
GGGGACAATATTTTGGCCAATTTTACCAGTTGGAAAGGGGTCCCAGTGGG
TGGGTCTTTGAGAATTATTATTATGACGAAAACACTTCAAAGAGCTGTAT
AGAGGTCTGAAATTTGGTGAGTAGTTCTTTGGGTCATTTGTTTGGAAAAT
AATTTCAATGATTTTTCATCCATTACAACCGAGTGTGTAATACAAGGATT
AAATTTTACTTGCTATGCAGTAGGGTTATTTAAGGCGAGGTCAATTCGAT
CTGTTGTTTTACGGGCCAAGCTATCCAAAAAATGAGGGTCGGTCGGTCGG
CGAAAAAATAAAAATAAAAGCAGCACAAAAATGTGAAATAGAAAATAAAA
AGGCACAAAAAGGTGGAAATCATGGATAAAATTAAAAATTGAACATAAAT
TTCTCAAACCCTTGGAAAATCTACCAAAATTTTGAAAATTTGGGAATCTG
TAAAGCAATGACAATAAAGATGTACTACTAAAATAAATGTTTCGATTTTT
GGAATTTCAGGGTCGGTCGGTTCCGTAAAATAACTAATCAAATTGGTCTC
ACCTAATGGAACATTATTCATTAGTTCATTTTTTTTTTTTTTCAATTTTA
TATAGGAAATACAAGGAGTCATTTGATCCCATCACGCGTCATGGAGAGCT
TGTAAATTGTGGAAGACATTGTTTACTATGGGCTGTGGTCTGTGGCTGTG
GTTACGAATCGTTTATGTATTAACTGTAGTGTGGTTTAAGGCTGTTTCCA
CTGAGCTTTATATAAACCCTAGGGGCAGTTTCAAAATATCGGCCAAGCTA
AATCTTTCGATAGGAGCTTGGTTGGAGTGTGTTACCCTAATGGTAGTAGC
AGTACTCAATCGCGGTGTTATGCATACCGCTACAATCTAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:782878..787517- >MSTRG.13418.2.p1 ID=MSTRG.13418.2.p1|Name=MSTRG.13418.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6282bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:782878..787517- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAGTCATTTGAATGACACCAAAATCAATAGCAATGACTTACTTATTGTGG
ATTTTCATAATGTTGGTCAAATCAAAAGAAAGTTTTCAGATTCTCACCAC
TCAATCGTCATGTGATTCTAACCAATCAACAAAGATTTATATCGATCCAC
AATATGATCAGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAACTGTAAACTGTCCATCC
TTATATGCTGCTTATCATTCTACTAAACTATTCGATAATACTTGTATTAT
ACTGAAGAATTCAGTCGAATCGTACCCATTAAACGTATCAATACTTATCC
ATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAATCAAACATCCAACATT
GATTGTCAAGGCAAACCCTATAACATATCAATCACTCATTGCTCGAATAT
CAATTTTAAAGGAATTTCATTTACAAATTGCCCTTCGTTTTCTAACGAGG
ACAGTATACTAACATTTGACCATAGTATAAATATACAGTTAACGAATATC
ATATTCCATGGAAACGAGAGTCAAAACATCTTGATAAAAGACTGTGGGAA
TGTTGGAATGAATTCACTAAAGGCTAATCGAATCCGGATTCTTTACCAAG
ATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATATCAAACTCTAATTTCTCT
TCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAAGCTGCAGAAACCAG
ATATGGTAAAGGTGGTGGAATTTCAATGTTTTTGATGAATGATATAAATA
ATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCGATGGTAATTCAGCTATC
TATGGTGGTGGACTGTATTTGTATCTTGAAAAAGGAACTTTTAATAACAG
ACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAACAATTCATCGACTTCAG
GAGGTGCTCTTTATATTGCTGATTTCTCAAGTAGCCCTGATAGTAATCAA
ATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAACTTTTGTGATTTCAATGC
AGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTATCTAAAATTCTTAGGTA
ACAATCGTATCGAACAAAATAACGGAACTGCAATGGTTCTTGGTGCTACA
GAGAGCTACATTAATGGTAACCTAACGCTTGCTAACAACAGCGGAAAATA
TGGTGGTGCTGCATTTTTATACAAGTGTGCCAGGTTCAAAATAACCCCCA
CGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATCCAGAGATGGAGGTGCG
ATGTTTGTGTTCCATTTTTTCAAAAAGAAAAGTTGTAAATGTTTTTTCGC
TCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCATCAATTTTACTTATAACA
CTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCATCCACCATGAAACTATGT
CAGCAATTAAATTTCAACGATACACACAAAGAACGTATTTTCTTTACTGG
AGAACCTCTAAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGATAAATTCACACTCGTAT
CATCTCAATGGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTTATTTTAAACCTGAAATC
AACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAATCACAAGTTCAAATGAT
CAGGAAAATTAGAAATACGTCTGAAGATTTAGATAATTCTACAAATGGTT
TCGGTTTATTGAATAAAAATACATATGTTGTTGGGCCAGACCACACTATC
AATGTGGCTCTACAAGGACAATCATCTCAGAATTATACACTTGATTTCTA
CGTTAGTAGTGAATTAGGAGAATTAACACAAAATTTAACAGTGAAATTAT
CCAAATGCCCACCGCTGTATTATCTACACCAAAACAAATGCAAATGTAAT
GCTAGTGGATTTATTGCTAAATGTACGTCCGATAATGCGCTACACATGCT
ACCAAATTGTTGGATTTCACCACAAGGTAACTCTTACGCATGCCCAGTAG
ATTATTGCGCTATATGTAGCGAACAGAGTAAATTGTCAACTATCCAAAAA
TATTGTACGCATAATTTTACACAACCTTGTGACGTCACCCGAAATCAAGC
ATCACGATTATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCACAGTACAACCATTGGTG
GTCGACAATGCGCAGATTGCCGAGGCACAAATAATCACTATTGGACGCCG
ATCCTTGCTATTGTCATTGTTACCCTTTTCCTATTGTTCATCGCTGCATC
AAACTATACTACATATGCGTCTTTTTATCTACCCCTTATCTTGTTCTATC
AATTAGTAACATTGGTAATGACGACCACAAACAGCCTTGGTAATTTTTCA
GTTTTCTTATTCACCATTTTCCATGGTGATGACAGATTCATGTATCCATT
TTGCTTCATAGATGGTCTTGATGATTTACATAAGATCTGGGTCCGATTCA
TTTCAGCTGCATTGTGGGTCATCCTTTATGGAGTTTTATGCTTTATCTCA
GCACGGGTGTTTCAGAATCAGATGAATCTCAAGCTAGCGGTTTTACGATC
CTGGCCAATCGTGTTTTTACTGTATTATATCGATATCATGAAATTTTCAG
TAAATGCTTTAAAAGGGATGACTATTGATGATCGTATGTGTGTTTTCAAC
TATGCTGAAGAGGAGTTTAATGGACAAAGACATCGTCCATTATTTTGGTG
TAGTATTATAACCACAAGTTGTACTGGATTAATGATGCTTGGAATCTTCA
TGTTGAAAGTGTATTGTAAACGAAATCAAACTATACACGAGTATGTTCAT
ATTGAAGCCAAATCTTTAGATTCGATTGTCAGTCGTCGAAAGATAATCTT
AATATTCGGTTTCTACACCCTATATGTTACCCTCTTCACGCTCATCATGG
AGCTCACCGGTACGAATGCTCTCTTGTTGATTCTTTCGATCACTTTCACT
GGCATATTTGTTTATAAACAACCCTATCAATCCAAATTGTATAATTATTA
TGAGATATTGGTTTATGTTGATTTTATGATCATTGGTATTTTAAGTAATA
ATCCAGATAACGAGCATTCAGCTATGGATAATTACACTTCGACTTTTGTT
GAGGTTTTGATAGTGTTTCCATTTGTTGGTTGTCTTGTATGCATGCTGAT
TACTTACTTTGGAACATGGAAATCAAATCAGCAGAATCTTGGAGTCATTT
GAATGACACCAAAATCAATAGCAATGACTTACTTATTGTGGATTTTCATA
ATGTTGGTCAAATCAAAAGAAAGTTTTCAGATTCTCACCACTCAATCGTC
ATGTGATTCTAACCAATCAACAAAGATTTATATCGATCCACAATATGATC
AGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAACTGTAAACTGTCCATCCTTATATGCT
GCTTATCATTCTACTAAACTATTCGATAATACTTGTATTATACTGAAGAA
TTCAGTCGAATCGTACCCATTAAACGTATCAATACTTATCCATTCAAGTA
TCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAATCAAACATCCAACATTGATTGTCAA
GGCAAACCCTATAACATATCAATCACTCATTGCTCGAATATCAATTTTAA
AGGAATTTCATTTACAAATTGCCCTTCGTTTTCTAACGAGGACAGTATAC
TAACATTTGACCATAGTATAAATATACAGTTAACGAATATCATATTCCAT
GGAAACGAGAGTCAAAACATCTTGATAAAAGACTGTGGGAATGTTGGAAT
GAATTCACTAAAGGCTAATCGAATCCGGATTCTTTACCAAGATGTTTATG
CATCATCTGGTGATATCCAAATATCAAACTCTAATTTCTCTTCTGGGAAT
AATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAAGCTGCAGAAACCAGATATGGTAA
AGGTGGTGGAATTTCAATGTTTTTGATGAATGATATAAATAATACGCTTA
TCAATATCTCACAATGTAGATTCGATGGTAATTCAGCTATCTATGGTGGT
GGACTGTATTTGTATCTTGAAAAAGGAACTTTTAATAACAGACTAACATT
AAATGAAACTTATTTCACCAATAACAATTCATCGACTTCAGGAGGTGCTC
TTTATATTGCTGATTTCTCAAGTAGCCCTGATAGTAATCAAATCATTATA
TGCAATTCGAATTTCACTAATAACTTTTGTGATTTCAATGCAGGAGGATC
TGCTATCTACGCTTACAATGGTTATCTAAAATTCTTAGGTAACAATCGTA
TCGAACAAAATAACGGAACTGCAATGGTTCTTGGTGCTACAGAGAGCTAC
ATTAATGGTAACCTAACGCTTGCTAACAACAGCGGAAAATATGGTGGTGC
TGCATTTTTATACAAGTGTGCCAGGTTCAAAATAACCCCCACGTCTAATA
TAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATCCAGAGATGGAGGTGCGATGTTTGTG
TTCCATTTTTTCAAAAAGAAAAGTTGTAAATGTTTTTTCGCTCCACAGAA
TAGAACCTCTTTTACCGGATCCATCAATTTTACTTATAACACTGCTGCAG
TTTATGGTAGACATCTTTACTCATCCACCATGAAACTATGTCAGCAATTA
AATTTCAACGATACACACAAAGAACGTATTTTCTTTACTGGAGAACCTCT
AAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGATAAATTCACACTCGTATCATCTCAAT
GGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTTATTTTAAACCTGAAATCAACATCACG
AATGAGAAAGATCAAATTGTTAAATCACAAGTTCAAATGATCAGGAAAAT
TAGAAATACGTCTGAAGATTTAGATAATTCTACAAATGGTTTCGGTTTAT
TGAATAAAAATACATATGTTGTTGGGCCAGACCACACTATCAATGTGGCT
CTACAAGGACAATCATCTCAGAATTATACACTTGATTTCTACGTTAGTAG
TGAATTAGGAGAATTAACACAAAATTTAACAGTGAAATTATCCAAATGCC
CACCGCTGTATTATCTACACCAAAACAAATGCAAATGTAATGCTAGTGGA
TTTATTGCTAAATGTACGTCCGATAATGCGCTACACATGCTACCAAATTG
TTGGATTTCACCACAAGGTAACTCTTACGCATGCCCAGTAGATTATTGCG
CTATATGTAGCGAACAGAGTAAATTGTCAACTATCCAAAAATATTGTACG
CATAATTTTACACAACCTTGTGACGTCACCCGAAATCAAGCATCACGATT
ATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCACAGTACAACCATTGGTGGTCGACAAT
GCGCAGATTGCCGAGGCACAAATAATCACTATTGGACGCCGATCCTTGCT
ATTGTCATTGTTACCCTTTTCCTATTGTTCATCGCTGCATCAAACTATAC
TACATATGCGTCTTTTTATCTACCCCTTATCTTGTTCTATCAATTAGTAA
CATTGGTAATGACGACCACAAACAGCCTTGGTAATTTTTCAGTTTTCTTA
TTCACCATTTTCCATGGTGATGACAGATTCATGTATCCATTTTGCTTCAT
AGATGGTCTTGATGATTTACATAAGATCTGGGTCCGATTCATTTCAGCTG
CATTGTGGGTCATCCTTTATGGAGTTTTATGCTTTATCTCAGCACGGGTG
TTTCAGAATCAGATGAATCTCAAGCTAGCGGTTTTACGATCCTGGCCAAT
CGTGTTTTTACTGTATTATATCGATATCATGAAATTTTCAGTAAATGCTT
TAAAAGGGATGACTATTGATGATCGTATGTGTGTTTTCAACTATGCTGAA
GAGGAGTTTAATGGACAAAGACATCGTCCATTATTTTGGTGTAGTATTAT
AACCACAAGTTGTACTGGATTAATGATGCTTGGAATCTTCATGTTGAAAG
TGTATTGTAAACGAAATCAAACTATACACGAGTATGTTCATATTGAAGCC
AAATCTTTAGATTCGATTGTCAGTCGTCGAAAGATAATCTTAATATTCGG
TTTCTACACCCTATATGTTACCCTCTTCACGCTCATCATGGAGCTCACCG
GTACGAATGCTCTCTTGTTGATTCTTTCGATCACTTTCACTGGCATATTT
GTTTATAAACAACCCTATCAATCCAAATTGTATAATTATTATGAGATATT
GGTTTATGTTGATTTTATGATCATTGGTATTTTAAGTAATAATCCAGATA
ACGAGCATTCAGCTATGGATAATTACACTTCGACTTTTGTTGAGGTTTTG
ATAGTGTTTCCATTTGTTGGTTGTCTTGTATGCATGCTGATTACTTACTT
TGGAACATGGAAATCAAATCAGCAGAATCTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000106_pilon | genome | sc0000106_pilon:782878..787517 - |
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