MSTRG.13196.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13196.5.p1
Unique NameMSTRG.13196.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000103_pilon:790206..823295-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13196.5.p1 ID=MSTRG.13196.5.p1|Name=MSTRG.13196.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=33090bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:790206..823295- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATTTTGAAAGGAGGCAACCATTGAGTTTATTGGTTAATTATCGCTTAAT TTGCCGTTACAGTCGCACAATATATTTTCAATTGTTCTTTAGAAATTTTA CGGTTATAAACAAGGTATTTCGATGTTTAAATTTGAATTGGTTTTTCTCA AGCTCCGAGATGTGACAACGTTAGAACGGAGTAATACGAACAAAGTCTCT GAGATATGAAAAACTATATTTTCGCGGTTTTGAATAGAATTACAGTTTTC TATAGAGCAAGTTAAGTCAATTGATACTTTTTATGAATTCAGATTTTAGT TGAATTGAATGTAGTTCATATTTCAGCATATTGTATTCTCGTTTCGCGAA AATAATATCCTCTAAAAAGCCACAGAGATTTTAACTGTAATGGAATTTAA CTATCTTTTGTTGAAAAAGCGTAAAAAAACGCGAATATAATAAAGTCTTT GTTATAAAGATTCTTTGTCTTTATGCTAAAACAATCCAATAACGATTTGT TAACTTTTTTGTACTATTACAGAAAAAGAAAGAAATTGTCGAAAAATTTC GTGGTTTTTTTTTGTTATGATGAAGGAGCGTTAGCAGTAATCTGCTGTGG AAACTTCTTTTTTCAATCTTTGCTAATTTGTTAAAAATTGAACGTAAAAG AGGGAATGAACAAAGAATTGTTATTTTTTTCGCTGTATTTTATTTTTTTG ATATTATCACTTATCTGGTTTTCACAAAACTAAAAAGAAATGGGGTCGCT AAAATAAGTTGAACTAAACTCGAACACAAGAAATGAATTTTTATTTAGTT TTTTACGTTTATCTTCAAGTAAAAACCACAATCGCAAAATAAGAGAAATT TTCTCGATTAGAAAAAAAAACTGATGGTTGTTGGTCCTCTTGATTCTGAT TATATTTGAGGATGGGAAATAAGTTTTTCTAAAAGACCAAAAAAGAGGGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:790206..823295-

>MSTRG.13196.5.p1 ID=MSTRG.13196.5.p1|Name=MSTRG.13196.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2187bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:790206..823295- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATTCACCACCGCCGACTTTCAACGGTCACCTCCATCGCTCGATTAGCGA
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TCGGATTAGGTGCTACAGTGAAAGTATACAGAGAACAATTTCCACGCTTG
AACGAAAGCGTTGTACGCACGTTTCGTAATAAATATAGAGAACTTTTAGA
GAAGGGAGGAGGTATCCCAGCTACCGAGACCATCGAGCGCAAGCCAAGCC
GTCGATCAATATCAACTTTAATTGAAGGTGAAGTTGTCTCACAACTTAAA
CAATTTCATTCTTCACAAATTGAACTAAGTGAGAATTTTGTGATTGCTGT
TGCAGAAAATATCATGGCAACCAAACACCATAAAGAGGCTGAAAACATTA
AAGGAATTATTACTAAAGAATGGGCAAACTCGTTGCTGTGGAAACATAAA
TTGTTAGACAAACCATCTGGTAATGTACAAGGGGTATGTTGTGAACGATG
CAAAACTATTTTGGTATGTCCGAAATGTCCAAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13196MSTRG.13196Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13196.5.p1MSTRG.13196.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13196.5.p1.exon2MSTRG.13196.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13196.5.p1.exon1MSTRG.13196.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000103_pilongenomesc0000103_pilon:790206..823295 -