MSTRG.12921.38.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.38.p1
Unique NameMSTRG.12921.38.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:350528..383461-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.38.p1 ID=MSTRG.12921.38.p1|Name=MSTRG.12921.38.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=32934bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:350528..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:350528..383461-

>MSTRG.12921.38.p1 ID=MSTRG.12921.38.p1|Name=MSTRG.12921.38.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5904bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:350528..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGA
TTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTGAGTGTGATCAAACGAGTGGCCAAGTTT
ATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCA
TACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGGTTAATGGGACTCGAC
CAATTGATATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCA
TTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAAC
CATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCT
TTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTG
ATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCAGCCGTC
ACTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAAAC
AGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCC
ATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAG
GAACCCGTTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCTTGGAT
TTTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGA
ATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAA
CAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCAT
ACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAA
GAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATC
AGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAATTTTATCAACACTGGGAAA
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AAGTTTGAGTGTGATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAAT
ATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAA
ATGAGAGCCAACCCAATGGTTAATGGGACTCGACCAATTGATATGATCAA
TGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATG
TTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATG
TTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAG
CTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAG
AGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAA
AGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTT
AATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAAT
GTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGAACCCGTTGGATGCA
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CAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAA
TACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTATACA
TTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCC
ATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATG
AAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGCATCAATGAAGAA
TGAGCAAAAAGGAAATTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAAAA
ACAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAA
TGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTGAGTGTGATC
AAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAAT
AGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAA
TGGTTAATGGGACTCGACCAATTGATATGATCAATGTAATACGAAACCCA
CGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTA
CACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGAC
CTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGA
GAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATAT
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GGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGAC
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CTGAGGAATGGCTTGGATTTTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTT
AAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGA
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TGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGAT
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TTGCACTTTCCCAAAATCAGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAAT
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TTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAG
CATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGGTTAATGGGACTCG
ACCAATTGATATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTAT
CATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAA
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CTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTT
TGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCAGCCG
TCACTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAA
ACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAAC
CCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCA
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ATTTTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTT
GAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTC
AACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACC
ATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTC
AAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAA
TCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.38.p1MSTRG.12921.38.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.38.p1.exon6MSTRG.12921.38.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.38.p1.exon5MSTRG.12921.38.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.38.p1.exon4MSTRG.12921.38.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.38.p1.exon3MSTRG.12921.38.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.38.p1.exon2MSTRG.12921.38.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.38.p1.exon1MSTRG.12921.38.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:350528..383461 -