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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1316390..1326542+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1287.4.p1 ID=MSTRG.1287.4.p1|Name=MSTRG.1287.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10153bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1316390..1326542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCAAACgaaatttgttcttctttttctgtcTTTTGTTCTAGTTTGTTTC
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cattaattaaaaaaagtttctttgaaaacttagtACAAGTTTTCCAGTTC
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TCATTAAGGAAACTCTGGTGCTAACGACAGTCTTTATTGCTGGGGACCAA
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accaagttttttttataatcattTTTCGTGTCTCTCACTGTTTCTAAGCT
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ATCTACAGAAAGAAAAGCGAGGCTTCGTCTCAACCGCCCTCCGTTTTATA
GAGGAGATCTTTGCTTCCAGGGAGAaaagtgtttgtttaaaaaaaattga
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TGAACAGTCCGAAAGAACAAACTCTAACCAATGTTAATCTCCTCAAACTA
TGTCATTCTATTCTTTTTCAAAGACATAAAATCTCTTTAAAATTCCTAAG
ATATATTTGGGTCAAACCCCCTTCCTTTCATTACTACTACGAGAGAAAAG
CATCTtatgaaatattgtaaatttgattttgttttgtcgGCGAGTTTGTT
TATTGAACTTGTTTAGTTCCGGAAATTCGATTAACTGCGGCACTTTAAGT
CATTCATTGATGCACGTTGGGACTCACTATCAGGCTGGCTTTCTTTTCAT
TGTAACGGGTCGCAATGGTTTTATCTTGCGGTATAAAACCTGTTCATTTA
TGGTGTCACGGCAAAACGGGATCAGTTTTATTATCAGGTACTTTGGGTTT
ACTTTCATCCTTCAAAGTGCAAGCATTATTCTTCTTAACATATTCATTCA
TCAATATGCTTGGACCAATTACTTTCACTTAGAAAACTTATCAATCCCAA
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GAAATTCTCCGACTGACCAATAACAAGGAAAGGTTCCCATGTGCACTTTT
GTCACTAGTTCAATAGTTCCGAATTTTTTAATTGTCAACCACTGCGAACC
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AATATACCCATAGATCCCCTAGCAACAATTATCTTCAGTCTAAAAAACAA
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attGATATGTTTTCTCTTTTAATAGCACTTCCTATATTTAGTATGTCTTC
ATGTTCTGTTACAATTTTCGTTTGAATTATGTATCTTATGGTAGAATGTG
GTATACTAGACTGTGATAATAACATTACTTCTTCAAACATCTCATGGAAA
TTTTACGATTAACCTTTTATTATTATGGTATGTAACATGTTCAATTATTT
CATCATTTACTTGcttaacttttcaaatttaattcttcTGTACCATGTTT
ATGAAGTAGTCAGCCTGAAAATGCTCAGCGATATTCTTGATTCGAAGATT
CAACATCTCTTCTTGTCTGCAAAGGACGATTTGAAAATTAACtccttttt
tctctttttcacttttGATAGTCAGAATTCAGTctcattttcaaccaatt
tcAACCAAGAAGGTTCTATTTTTATCTTGAGTTGAGAAGCTTTTTGGATT
TTCTTGTAAACCACCACAGTCGAGTGTTGAAAGAAAAGTGAGAAGTTATT
GAACTTTTTGGTTTTAAGAATGACAGACTTCAGTTTAGTTgtaattttta
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GCGagagaatttcttttcaaaacataacAGAATCAAGTGGGTGTGTTAAA
AGAATTTCTTCCATACTATTTTAGTTGCTAAGATTTTCTTGGGAGTAAAA
GTAAAAAGTCATCTTTATAAAGTAAACTTAATCTCGACAACATGGGCGTG
TGCAATTATTTCATTGTATCTGCATTTATGAGGTTACTGGTTTTGAAGAA
TAGATTGTTACTGTTTGATTATTCACTTTGTTATGAAGAACGAAAATTTT
GTAATCTTTATTTTTCCGACGTCGTTAATTGATCCATTTCTGACGTAATT
ATTATGACGGAGAAATGAGTCGTCGATAATTATTCAATTTTGAGCTTCCA
AAACAGGAATTTTCTCAATTTCGCACTTGAGTTTGTTGaaatttcaaacc
aaaacaCATTCTTAGACTCCAGATGGGATTTGTGAAGGAATTAGTCAGTT
TGTGTAATATTTAGAAGAAAAACATCTGAGCCAAGTCGTCGATTAGCTTT
GTAGGATCTTtcggaagattttttttttgattcaaGGTGACTTTTTATTG
TGTCAATAACATTATGTGTTCGGTTGTTTTTACGTCGATTAAAACGTGAT
ATCTTTGGTCAGTTTGTTGGACTACTATACTAGTGTGTCTGAAATAAATA
TTCGGAAACTCAAATTATGAAATACGATAGTTTGAAAAGGTGCATTTGAA
GACAAtggttttaattttaaaattacgTTCTATGATTGATTCGATACATA
ATCTTTGAACTTGCTAGAAAACCTTTGTTTAGAGATTAACAACTGAAGAT
TGGACCTCATTTTCTCTCTTTATTTTTCACCTGAAGTATTCATAGTGAAT
TCGAAACTAAAgggttttcaaaaaagtctgcGTGGGTTGGAAGAAAGTGA
CATTTTATGTGGTAGAAAATTTTAACACCGAGAAAAGGGCTAAACATGGT
CCTATTAAATTAAAGATAAATTGATAGGAACAACAAGGAATATTATTGTG
ATAAAAGTCGGTTGAACTTCAAagtaaaattagtaaaaaagaaatatgaa
gGAGAACCAATTACAGAAGAGTTATGAAGTGTACCAGCCACAGTGTATAC
CATATATCCGAATATGTAGTGGTGATGATGAGCTCTCTGGTGAAGTTGAA
TCTCCAGATACTCCTTCGCCACAATTGAAACGACGATCGACGCATTGGTA
TCGCGTGGAAGGTGAGAATCAAACTAATAAGGTATAGCTGAAAGCCAGAA
AGGCGAATCTTCACCTTTTCCCATTCTcggttgtctgtacacaaacccag
atttcaaaattcattgccgtagagggttctgttgtcattgtcttttctca
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gtatAGCTGACGGCGAATCTTCACCTTTTCCCATTCTCGGGCGCCAAAAG
GTATTGATGCTATAAGAATTGCACCGCATTTCGgatgatggattgaatct
aaCGCTTTCTTTGATAACTGTGTGTCTCATCCTTCGAGATTAGTTGTAAT
GGTTACTTTTAATCTAGCGATTGTGTGATCATCGTAATTATTATCACGTG
ATTTACCTAGGGTCATAGTGGTCCATACTAGAAAATATTATTTCTATTCT
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GTAGGAAAGAACCATCATTAAATTTTACGCTGCTTCTCGAAATCAAGGAT
AACCGTAAGAATATATGGCCAGGTTTCATAGGTTTCCGAAATCCTTAGTT
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AAACAAAATTCTAAACATTCATTGATTGTTCTGAGTTTTGTTAGTGATCG
TGTGATCCCTCATGATAATCAAGTTTACTTGGTAAGTCGCGTGatgactt
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TCTTTTTGGTTTCGATAACCTACCCttgtcatttgatttgaaaatactGG
CCGTAGAATTATACGTGCATATTtaaagaacaatgtttttggcCTCATTA
TGTGATACGTCGTAAGTGTAGCGATTCTCCACTtgcgtaaaatatttttc
acttccCAACTCAAATTATGTAATGTGCTGTAATCGCAACCTTCAACCTT
ATGCTTCACATTgaccaaaaaaaatattatcttttttaagaaccagaaaa
cttttttgatgctTAGCTATTCTTTTTCTTGGCACTTTGAACCTTACGTG
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TGTATTATTTCTAATGTCCTTGAAATTTAATCATTCCAGACTAGCGTTTG
TTCATAAATTGATCTCATTTATCTAACGTGTTTGGGCTTCattcaatgtt
cttataaaatagttctaacataaaaaaatattccttaattaaagaattag
taaaaaatatggcacaaaaagaaaatttggtgaATAACAAccatcaaata
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CGTATTTTAGGGGGAAATTGAATAACTTTAGGCGTTTCACCCTAGTTCTA
CTCTTTTAATCCTTAATTTGGTTGTGCTTTCCCAGCTCAATGTTACTCTC
AAActatacgctttttttataagaacaatctgagcctcagatttcggAAA
TTAGCAGATTTTAAACCCGTTTTAGGTTATTAAGTAAATactaagcgtat
taagaacatcgtaaaaACATTTagccctgaaaatttcaaataattaaGAA
CAGCTCAgtctggttcttataaaaaagcttttattCTTTAAGAAAGAGTT
TACTGGAAATTTTATACTGGGCGTTTGACCTTTTGCAGTAGATTTCGTTT
CATTCCGttgttttatttgaaaacacAACGGTTTTTAAGGTACGAATACT
TGCTCCCATTTCattgacatcaatttttgtaTCCAAAATAAGGTATCAAG
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ATCTGTCTAGAGGTTTATTTAGGGTGGACATCTTTAATGAAATTATCGCG
AAGTAGATAAATAGATCCATGTATGCATGGGTCAGTTTTATGGAGTTAAG
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TGGAAAGATTGTTTTAAATGTTCTACCACCGGGACTTGAcatacacgttt
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AATTTCTTGGAAATAGCACCAAAATACTTACAAACCCGCTTagatgagaa
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AATGAGCCAAGGATTAATTATAAATGGCCAGCAAACTTTTCCGGACGCCT
CGTTAAGGATTATTAGTTGTCATGGTGATAAACGGGATTAAGTATCTGCT
TCCTCCTTAAGTTTTACGTTGATTAGGTTTGTTATCTCTAGGTGCGCGTT
GATGTTTACTGTTTACTCAAGGTAGCGATTGATTTGTTACGCTCTTCCCT
TATTGCTTAATAGCAAGCAACTGCATCTTTCTACACTATCGTTTTGGAAC
GAATTTTTGTTATGCTTTATCTTTATCTATTTTTTGGAGGTCATGGAATT
CGGCTTGTttacaatttgattttttcgttGTTTTGTCAAGTTGCTTTCAA
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ATGTCCACCTTACTTCGTTAAGGCATAATAGGCAGTTAATGCAGtagttt
gttattatttttttgcccAGTATGAAGTAAAATATAGCGGTAGTTCAAGT
GTATaagcattttttataagaagcagCAGGTTTTTCTCTAATGatcttat
tttaaattttctatgCTTCTACGGCTTCACATTAACACCTCTTCATagta
actttgaaaaaatgagtaGGTTTCAGGAAAATATAAGCTTTGCAAACGGC
TGAATATTAATCCTCATTCTTTTCTATCAATCTTCAGATAAAGAAAGTTT
GGAGTTTACCATCTCAAAGAGTCCGTTCGACCATCGACGTTCAAAGAGTA
GCTGCAATATCACAACTGTCAACACAGCTGAAAGCACTCCACAGAAAGAT
GAGAAGCGTCAATCACGTCGCATGAGCGATACCATCTTGTCCGATAAACC
AGCTCCCCATCACAGTAAGTGTCCGACAAAATAATAATCAATTTAAATAC
TTCTGTTAGTGCCAAAACGACAAAACGGTTCTTTCCTCTAGAGTCATTTT
TCGTTCTAGGTTTCTCTGtgtaattcaaattttgactgCTTGTTCatgat
ttttcattcaaaaaacattAAGAACAGTGGGAGGCTTTCGATTTTGAAGT
AGATTTTTAATTGGCCTAATTATTCTACACTGATAATTGCTTTTGATTAT
CCAATTACCAGTCAACCAGcaaataaattttgtaattgATTCTTCACGTG
GTTCTTTTCATTTTACCTCAACTAaatttttacacgtttttttatacaag
aacaaactatataagaacataaggcttcgatggccaaaatattaagaaca
aattaagaacattttaaggctttacagactctaaaatggccatatttctt
aagtggacaaaaatgctcacaaaatgttcaaaaaagaacacgtgaagaac
atttttaggcttaaaactcaaaaagttaagaacatcccaagacttgaaaa
cttttggatgttcttataaaaaacgtgtaaaagcaTTCTCTATGGTTACA
AAGAAGATGTGTTATCTCAGTAGCGTAGAAATgtcttgaaatttcatttt
tcactaTTCATTGATTGCTATATTTCTTTTGTCGAGACATTCATTTGTAC
AGGCGTCATTTTAAATGGTCGCGTAATTAATTTCTCAATAATTTGTTTGA
TTCCTGtgggtcctggttttaaacggTTTGCGGAGTTGCCAGGTTAAAGC
GTATATATTGTTATTGAACATGTAAAAAGATAGAACAAAAATGTTTCGCC
CACGTGGAGGAAAGATATAAGGAACAGCTCAATTTCAGacgaaaaagatt
ttgttgtGTATCTTTTGAATATTGATTGATCAAGATTTGAACTTTCCTCT
AAAAATAACATGTTAGTAACATTGTAACATGAGCATGATGTGACTAAGAT
CTTTCACGGTTCTCTTTATTTCGGGCTTTATTTCTGACcattaacatttt
cttttttacctTACAGCTCATTCACCTTCCAAACGATTTATTCGTAAAAT
CTTTTCACCGATGGTTTGCGGcgtgccgtcacccgaccgccGTCACCTTT
TCACCAACAATGGTTCGCTACTCAGTCTCGGTTCGTACGATTCGGCTTCC
GTAATCTCCGACCACGAACAAGACGCGTATCCGCAACTCTTCGATTTCGG
ATCACACGAACTCATGGAAGAAATGACGTTGATTGATAAAGAACTTCTTG
TCAGGATTCCGTGGGGTGAACTCTCAATACTGGGATGGATGTCCACTGAT
AAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1316390..1326542+ >MSTRG.1287.4.p1 ID=MSTRG.1287.4.p1|Name=MSTRG.1287.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=660bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1316390..1326542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCGATACCATCTTGTCCGATAAACCAGCTCCCCATCACACTCATTC
ACCTTCCAAACGATTTATTCGTAAAATCTTTTCACCGATGGTTTGCGGcg
tgccgtcacccgaccgccGTCACCTTTTCACCAACAATGGTTCGCTACTC
AGTCTCGGTTCGTACGATTCGGCTTCCGTAATCTCCGACCACGAACAAGA
CGCGTATCCGCAACTCTTCGATTTCGGATCACACGAACTCATGGAAGAAA
TGACGTTGATTGATAAAGAACTTCTTGTCAGGATTCCGTGGGGTGAACTC
TCAATACTGGGATGGATGTCCACTGATAAGATGAGCGATACCATCTTGTC
CGATAAACCAGCTCCCCATCACACTCATTCACCTTCCAAACGATTTATTC
GTAAAATCTTTTCACCGATGGTTTGCGGcgtgccgtcacccgaccgccGT
CACCTTTTCACCAACAATGGTTCGCTACTCAGTCTCGGTTCGTACGATTC
GGCTTCCGTAATCTCCGACCACGAACAAGACGCGTATCCGCAACTCTTCG
ATTTCGGATCACACGAACTCATGGAAGAAATGACGTTGATTGATAAAGAA
CTTCTTGTCAGGATTCCGTGGGGTGAACTCTCAATACTGGGATGGATGTC
CACTGATAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:1316390..1326542 + |
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