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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:410854..434202+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12775.2.p1 ID=MSTRG.12775.2.p1|Name=MSTRG.12775.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23349bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:410854..434202+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTTCCGTTCAGGTTCGCACTTctaaggaaaattaaaaaaaaaacgtgt
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TGAGAATAATAATCGTAAATTAAGCCCCTATCCAATTCCAGCAAAGCTTT
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ATCTTTGATGAAAGTTATAAGTCtttttttCTCATCATAGTAAATTAATC
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TTAAATTTCTTTGGACTTATCTTTTCAGGCATATTGCTATTGGATTCACT
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TCCTTCCGTCCGTCCATCTGATGcattttctcaggattggctctttcgaa
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GATGGAGCCAGAGTTTGGAGTCTGCACATCCATTTATCTTCGGCTCGTTC
TCTTTCTGCGGAGGATGAAAAGTCACTTTCTAGGATCATCACCTCAAGGT
CAGCAAAGGAGTGGTCGCGATGGAAATGTTCTGCCAACTCTGAATTTTTC
GGTCTCTTTCCAATGTCGTAGCGGTGCTTTGAAAAACGCGTTGACAAGGC
TTCTCCTGTGTGACCAACGTACAACTTGTCATGGATCTTGCATCTGGCTG
CATACACAACGTTCTTCGTTTTGCAGCTACCACCATTGGTTACACGTTTA
GTGATACCATCTTCGTCTGCACATGGCATCCAGCTCTCAGACACCTATCA
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ACAGAATCAATATAGTGTCCATTTCAAATATGAACTGTTACCACCTCATC
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ATTTTCTTGCGAATCAGGAAAGGATATACAGACAAGATTGTGTTACTGCC
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GTATGACAACTGTAATACCATGTGCAATTACTACAGTTGATGGTTTGATA
CAGTTGAAGAATAGTTATGAACACAGATGCTTTCGACATGCTGATAAAGG
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ttatcatgtttttgatgtttttagagtacttaaagaggtttatatttgtt
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TTACTTAGCACTTAGTATTTCACAGAAGAATTCATAGCAGGGGGTGTCAA
TCTATAAGTGATAGAAGCTACCTTTTGATGTGTTAATTGTCAATCGATGA
GCGATGACTAATTATAATAACTAACCGATTGATTGGATGTCGATCGATTT
CGATAATCGATACTATTCTAACCGATAATAGATTAGTTTTTTAATCGATT
GGACTCGATTGGCTGTCAATTGTGATCAATATCGAACATCTTTATTATAA
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tttcagaaaaatatatggtttagtATGTTTAAACCAACTGTTGGCGAGat
ataacgattttaaaatcgaaaaaaagtgctgactcagcaaaaataagcgt
tttaaacgattttaaaatcattatatCTCGCCAACGGCTGATCTAAACAT
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ATTGCATTCTATTAATGGTGACAGGGGGATACTTAGGCATAAATAGGTGC
CAGGTATGTGCTGATGCACACAAGGTTTGGTTTTTAACCTTCCCAAGTCT
CTGAATTATTTAAGGTacgaaaaacttgaaaagtcataaaaatctcTAAG
AGTCACATTTTCGCCTTGTCTCTGTAACTGTAAGGGTAACTTTATTCTCT
ATTTTGTCTATGAATAATCAAAGactttgcgaaattttcgactcttGAGT
CGTCttgtatttttgttgttttctaccCTGCACCATATATGGCTAGGTAC
TAAAATGACTCTTTAGAAGGTCCAGTGTGATAGTGGTCAAGTGGTAGCAT
GCTTGAATACTTGCTGTCGATCAGTCAGTGATGGTAAACATCTGTCACAG
GTCAGTAGATGTTATGTTAAGGTAACTACAATACAATATCTCTCCAATAA
AACAATGAACAATATCTCTCCAATAAAACAATGAACAGTATTTATTCAAT
AACACAAGTAACGTTAActataaaacaataaaacaatgTACAATTTCACT
TGTATAATTCCAAGCTCCTCCACAACCATTATTTTGTTAGTTATTGGTAG
TCTAAAGGTAAAAGTATCACTATGGATTCTTGagattaatgatttttttt
tttacctttttcaaaTCGTATACCCTTCTTGGGAATGTCCTGAAAACTTC
AGGGTCATTGCATAAGTATTTGGGTTACATGAAGCACTTTAGTGCACTTA
GATGCTATAAAAATCGGTCCAGACCGATCGGCCAAAAAGCGGTCAAATAT
CGGCTTTTTAGCTGCCAAGATTTCACTTTTACCGTTCCCGCCTCTATTTC
TATCGGCTATGGATTGGCCACTCTTGTTTCACTTTTGAGGCGATTTTTGC
GGCTTTGCCGATCGGGCTAAAGTCCGGTAAGAAGGCTGGGTCTATGCGTT
TGCCGGCAAcgaaagaataaaaacaatcattttttagttcattctttctt
tctttcataaAGATCAAATTAAAGACAACTGATAGAATTATACAACTGCA
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AGCAAGACCGTTCCTTTGCTTTGTGGTCTTCATTTGTACTCAATTTATTC
TgtctttattctttttttaacgAAAAGATCCCCTGCCCCAATACGAtccc
cggggggtactagggttgcgagacggggaggggggggtgtgccgcccaac
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agcgggactttggaaatccctCGTAAAAAGACAACCCTGTCTCAGTTTGA
CCCAGGCAGAAATGGATGTTGCGATTTTTGTCATCTCAAAAAAGAAGCCG
TTGCATTGTTTTCCGCGCGCGTTCTATTTTGTGCCAATCAAAATGCGTCA
CGTCACGCAttcgaaaaaattcgaaaatgttgcaatcaaaacGAAAAGTG
TTTCATTTGTGactttggctttgaaaagaaaacatgaaCTCTATagaaac
taaaattaaaaaaatattgtgaTTATTTCATCGCAACATTTCAAACAACT
TCTGGAAAAGATCGAAGAACATTTATAAAGTTAATTAAATTGAGATATAG
AAATTGAATGACTTTCTTGtcttcgaaattcagttttcgaaggaagcctt
ttatctttatttttatcaatggtgattcatttttggacataaaaaactcc
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AGTTTGCGAATCAAACTCAGCTCgaggatttatttattttgttgatcaat
gttaaacaaattttagaactttgagtgatatttgttatttttataagaat
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CAATGAAATCGCTAGAATCTTACTTATTTATATATTGTAacgttttaatt
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TTCCCGTGGCTATTGTTCTGTAAGATTGTTGTTGTGGAGCTTGACGTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:410854..434202+ >MSTRG.12775.2.p1 ID=MSTRG.12775.2.p1|Name=MSTRG.12775.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:410854..434202+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAATATGTCCtgcattggtggaaatttgatctTTGGAATAAACTACAAAA
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ATATGAACTGTTACCACCTCATCCACCATTTCTGACCACTATatctttga
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CAAGTTTATTTTCTTGCGAATCAGGAAAGGATATACAGACAAGATTGTGT
TACTGCCAGCAACGCCAACAAGACGTGCTTGCAAACCAAAGCAACATAGA
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TTAATACAATAAATGATAACGATTCGCAAACATCCCTTCCTGACTCACCT
TTTGATTGTATGACAACTGTAATACCATGTGCAATTACTACAGTTGATGG
TTTGATACAGTTGAAGAATAGTTATGAACACAGATGCTTTCGACATGCTG
ATAAAGGAGAAATGTCCAAATGTGACTTCTTCGTGAATCAAGCTCAATTG
GATGCAGAAAACTTTATGAACACAGAGCTTCAAAAGAGAGAAGACATAAG
CAAACGATTTGTTTCCCTCAAAGACTATGACATGCAATTTATTGAGTTTT
GCACTGAAGATGACTCTGCTATCATTTTGATCAATGCATTGGTCGTTTTA
AGAAACACTTCAAAGCCACGAGATGATACTGCGACTAACAATCCCGAACC
ATCCTCGACCAAATTTGATCTATTTGAAGAgcagaaatcaatgaaattag
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TCTCTCAATCAACACAACTCCGTAAAAAGTGGTTTGTTCCTTCATCAAAG
ACTTCTTCAATATCTGTGTTATCAAATCATACTGTATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000098_pilon | genome | sc0000098_pilon:410854..434202 + |
|
