MSTRG.12732.24.p5 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12732.24.p5
Unique NameMSTRG.12732.24.p5
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000097_pilon:960652..977493-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12732.24.p5 ID=MSTRG.12732.24.p5|Name=MSTRG.12732.24.p5|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16842bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:960652..977493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCAGAATAGAATAGGATTGTTATATACCATGTGAAATGACCTCTTTTCTA ATGGGGAATCTCAAGTAGTGATTCTTCATAAATTTCCATTATAGAATTGA AACAAGCAGAACCAGCTAAAGCAGTAGCCTCCAACACGTCCGGTGCAACT GGTGTTCCGGTCAAACCAGACAACGGAACAGCCATCATCAATAGTACATT CACTAAAATCCCAACAAACGAATCGCCATCTACAAACCTTCTGAATTCAA CTACCCAATACCCTCAAGTATCAAACAGCTCTAAACCATTCCAAAATCAA AATTTCACTACTAACGATTACGCGAATATGACTAAAGGTTTGTCGAAAGA TAACAATGCACCTTCTAAACTAACAGAAGCTGAACAACATATCGAGGACA AGAAGTCAGCCATCAAACCTTCCAAGAGATGGTCTTCATCACATACTAGT AGTAAAGGATACAAGAAATCAGCCACCAAAACAGCCAGAGCTTCTACTCG TTCACTCAACAAAAGCAAACGCAGATCAGGGGTCTTGAAGCGAAGTAAGT GTACATTCGCATTATTAGTTTACCTTTTTCGGTAGGTTTTAAAACTTTGA TTGCGTTCGCCTTTATTTTTTATTATTGAGTATTTAAAAAATGTCAATCT CATTGTCATCGAACCCTTTTTAATACACCGACTAGAGACAGCAATCAAAT TTCAGCATCATTATGTCAAAATCTCGTAAGACAATATTAATCAAGCAATG GGCTTAACTGCTATATGAAAGGTCGTAAACCTCTCCCTAAAAATATTTAT CCCACAGATCGATAAAACCCGAAGAGCTAGATATCGTACTTTGGCTGAAA AGTGTGCCGTAGTTCGGTAGTAAATCCTACCCAGGTCATGTCACATTACA TTATAATTTCAGCGCTCTACCAATCAGAAGCTTCGTGGGTTTTAAATTCA CTCCATCTAGCCCTTCGGGCTTCACAGAAATCTGTGATTAATCCATCTAT TAATCTATATCAATCTTTTCTATTTCACCAGACGTGATTGGCCATCGTGA ACATCATACAATGAAAGACCACATCAAGAAATTGATCAAAAGGGTCTTAA AACCAGGTAGGTTAGCGAACTAAAGTGATTTCAAATCTTTAAGATAACAA TGCGAACCTGTTTAAAAAGCTTTTATAATATGTAAACACTGATTGGGAAT ATAATTTGGCAGATGCATAATCCTTTTATAGTAATTAGTCAATCTTAACA AGCCGATGCTATCGTCCGTTAGAGGCATAGTAATCACGGGAAAAATGCGC AGTTGAGTCAGTGCGTTTTACGGAAAATTTAGTGGCGGTAGAGTTTGGAA CAAACTATAAGCACCTCCGCCACTGCTTACTCCTCCCAGGGCTAACCACC CGCTCACAAATTTTTCCCGCCTCCTAAACTATTCCCTTTTTTAGGAATAG GATAGGATCGTCTAGCCCTCTACTCTTCTAAACCGTTTTATAATGTCATT TCAGGGAAACATTTGAAGCATAATTGATCGATTGAAATTCCATACAACTT TCATGTAAATAAGTATTTCAAAAATGTTATTTTTTAACCTACAATATTTA TTTTGACGGAATTATTTTTTATAATGAACTTTCAGTTTTTAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:960652..977493-

>MSTRG.12732.24.p5 ID=MSTRG.12732.24.p5|Name=MSTRG.12732.24.p5|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1200bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:960652..977493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAACTTTAGCAAAAGATTCGAACTTACCAGGTGGCTATAAGAGGAACTT
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ACAAAAAGAGTTGCACCCAGCCACAAGAAGGATAGTCATGAGAAGTTAGC
AAAAGGAATTCACGAGAATGGCAAAAAGAAGTCTTATGCCTCTCATGTTA
TGTCCGCAGGAAGTGTGTATCCCCTTCATGATGATGTTGTTGAAAACCTT
TTCAACTTTACTAATACTTGTATTATGCACTTCTTACATTGTTGCTAAAG
GAAACTTTAGCAAAAGATTCGAACTTACCAGGTGGCTATAAGAGGAACTT
ACAAAAAGAATCTACTCAAAAAGAATTCAACTTTTCCAAATTTAAAGGTT
ACAAAAAGAGTTGCACCCAGCCACAAGAAGGATAGTCATGAGAAGTTAGC
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AAAAGGAATTCACGAGAATGGCAAAAAGAAGTCTTATGCCTCTCATGTTA
TGTCCGCAGGAAGTGTGTATCCCCTTCATGATGATGTTGTTGAAAACCTT
TTCAACTTTACTAATACTTGTATTATGCACTTCTTACATTGTTGCTAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732MSTRG.12732Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732.24.p5MSTRG.12732.24.p5-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732.24.p5.exon25MSTRG.12732.24.p5.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon24MSTRG.12732.24.p5.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon23MSTRG.12732.24.p5.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon22MSTRG.12732.24.p5.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon21MSTRG.12732.24.p5.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon20MSTRG.12732.24.p5.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon19MSTRG.12732.24.p5.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon18MSTRG.12732.24.p5.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon17MSTRG.12732.24.p5.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon16MSTRG.12732.24.p5.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon15MSTRG.12732.24.p5.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon14MSTRG.12732.24.p5.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon13MSTRG.12732.24.p5.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon12MSTRG.12732.24.p5.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon11MSTRG.12732.24.p5.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon10MSTRG.12732.24.p5.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon9MSTRG.12732.24.p5.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon8MSTRG.12732.24.p5.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon7MSTRG.12732.24.p5.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon6MSTRG.12732.24.p5.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon5MSTRG.12732.24.p5.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon4MSTRG.12732.24.p5.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon3MSTRG.12732.24.p5.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon2MSTRG.12732.24.p5.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.24.p5.exon1MSTRG.12732.24.p5.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000097_pilongenomesc0000097_pilon:960652..977493 -