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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000097_pilon:221080..230258+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12695.2.p2 ID=MSTRG.12695.2.p2|Name=MSTRG.12695.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9179bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:221080..230258+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGTTATTATGATAAAACTTATGATTGAGCTTTATATACAATAATAGGA
TTaatgtaaaatggcaataaataATTTATCATGGGTTTTCAGCTTTGCAA
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aaaaagaatatcttaaATTCGTATTTGCTTTTGCTCTACAGAAAACATGG
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GGCGTTGATGAGAAACATCTCTAGTTTATCCAGCTTGAACATGCTCTCCA
TTTGTTTTTATGGACTTTTCATTGTCATTGTAAgtgtttttaataaaatt
gtAAACATTTCTCGAACCAAGTGTCTCGAAGtcgaaatgaaaaaatctaa
atcatgTGTCCAGTTCATTTTATCAAGTTTGTAATTAATACAAAATTGTA
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ATCTTCATGCTTATTCTCTAAAGACATTATGCCAAACCCCTTCGATTGTT
TCGAATACCCTAAGTAGAATTTTGACAGCTGAGTTAAAGTCGCCTGCTAT
CTTTACTTTTACAGATCACTTTGATGGCGTTAccaacttttttatcattt
caatgGGTTCACAAAGCAAAGCTATGGGATCCATCTGCTATTTTCCAAAT
CCTACCCATTATTGCGATGGCCTTTACTTGCCAAACGTAAGTCTTTGTTT
TCCATTCGACTGTTtctctctctctcATTCGAAGCTTTTATAATTCAGGG
GAAGAACCTAATTACCGGTGGGGATGAAAGTGTACCCCTAAATACCTCAA
AATGGGGTGCAGTTGACAGTTaattctcgctaattcgaactcaaacggag
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CTGACGGTTAAGCtaaagagagattcgaattgaGGAGATCTTTGAAGGAG
TCTCTATGAACGGAAACtgagaataagttcgaattaaagaaatattcgaa
taatagaagccCGAATATGCGAAGGTCGACTGTACACTAAAACCAGGCTT
TTCAtctttagagcaaaataaggaaaTCTTATTTTGAcaagttaaaatat
tttcaaaatttaacaaatggggatggaaaaaaaatcggaaattAACAACA
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tatttgaGTCTTTCTGTAGTTTAAACTTTCTTGagttaaattactctctg
tgattcgaatctttctctaattcgacgaaTACTTTTGGTGtcatgaagat
cgaattataATGTGTTTATTGAACAACCATTAAAAGAGTACTTAATACTC
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atccACTGTAGTGAGTACCTGAAAGTACATCATTTGTTCTCTGCACAAAG
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AAATTACAAATGGGTTTTGAGGCGTttagtaagaacatttttttgctctc
tACACAGGCAAGTACTGGTGATGTATGCAGCGCTTCCTGATCCTAACATG
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CTACGTGTCGGTAAGTAAGGCTATAATCACTGACATCTATGTATAGACCC
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ATATTATTTCATTTGATAGCTGACGATTCGATAAAGATGAAACTTGAAGT
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ACTTACCTCTGTAGACCCCTGTGCTTTCTCAACCCTAAGCAAACAAAATC
CTTGGTcggagatttttttaaagtggtaccATGTGGGTCAAAACactttt
taaactgaaaatttcattaaattagATATTTACCCACATTAAAAGGTATT
ACGTTTCTTGAAAACTTCGATCATTCAAAGATGGCGAATGTAGCTTAGTC
TAGGGTTTATAGAGGTCAGTGGTTACAATTAGAGGTTGGAGCGATTGGAG
CCACTAAATATGCTTTGGCTTCAATAATTCTTTCTGTAAACCAAATCGTG
ATCATTTTTAAGTCTCCTCATCTACAAAGTTTTGTCGGTTGACATAAAAT
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cttttccttcttttttgaatttaaatttttgttcacTTGTCATTTCCTAC
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GTTAGTTAAGTTAATGCTAGCGAGTGTTTAAGATTTGTTGTTGAGATTTT
TTCTTGATGCGTCTTTAATACTCTCCCTCACTCACTCTGTTCCAAAGGTT
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tttggaaaattttgtacCAGGTGTTATCACGCAGTTCATCAAGCTAGGTG
AGTGTTCAAACAATCATACTAGATTTTATAAAGTGTTGAACGATATATGA
GATTCTGCGATTTCTTGACTTTCGCACTTTTATACACCAGTCAAGAGAAA
AAGAGAATTTAACCTGACTCTGGCTAattctaacttttatttttcaaacc
attctttaattcgaaccgaCTGTGCCACTCGTGAAATACTTTCTTTAATT
GGAATATTCCTGTAATTCGATCACGATTGGTCGACTTCAAATTAACGACA
ATTATCTGTATCTTGgatattttcaaatctttcagtttcaCGTGTTAGAT
AAAACATTATTGAACAGGGCAGGACGTCCGACTTATTTTAAATTCTCGTT
GaaaaaaaaCCACTGGTTTACAAGGAAAGTATTTCGTCTATTCCTgaTtt
ttTAGGCTGAAATTTTCATCGATGATGGACTGGAACCTGCCAAACTTCTC
CCATTCAAGCCATTTTTTACTACCCAAAGGCCAATTGCCCGCCGTAAGAA
GAAACACACCCCCAGACTTGAGTACTCAGCACTCACCTGACTTTTCTGGA
TTTCTGATTGTTCAatatttgttgattttattttcaggattttGGTGTTC
AGTCATCATCAGTTTTCCGCTACTTTCTTTCCCCGTTCGCTCTGCTATCA
ACTCTCTCGTCTTCTCCAAAAAGAAACAGGTAACCCAGCAAGctcttttc
ttcctttttccctaagggagggttttcgtcttttttgttgttttttaatt
ttatgacaAGGCAGATGTAAGAAACATCCATCGTCTTAAAGGTTGATGAA
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TTTCAACTCCACACAGGGTGTTCTGGAAGACATGATTTCGTCAGCCTCAG
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GTGACCCTCATTATCGGTATTCTCGTTCCGAAAAGTAAGTTTTCTTATAT
GTCTACAGTAGATATTTTCCTTGCCATtgatattttgacatttttttgtt
gGATATAAACTTTAAATATCCAACAGCCAGAAGTTATGTTTAAACGATCG
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TAAATTCTCCACTTCTTTTCATTCCAGTTGAGATGGTGTTATCAGTAACA
GGAGCCTTAGTAGGTACATTCTTATGTTTGATCGTTCCCACGTGTTTGTT
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AAGATGATTATCCTGAAGTTTTTAGCCTCTTAATaggattaaaatatttt
ttttatgataaagAAAGGAGTTGTACCTCTATGCTTACAAAGCAGAGATT
CACGTGCAATATAGcctggggtccacttaaagcttttttatagacttgaT
TTGGGAATTAAGTGGTCCGGTAGTATATGATAGTtctcaatttttagttt
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AAGGCAAtgtttttatatcaaaataacAGATCTGTTATTCATGCTTGTTT
CAAAACAGCTTAATTATCCaagtaccttaagtggataaattttcgcgtgt
actaattttagcgagacgagaatttaaagatttcgcgtggattaaatttc
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TAAACAGTCAACCACAACCACCTCGACTATAAACAAACGCATCACTGATA
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ATAGAACGGTCGGTTCTTGAAATCGCGTTCATCCCTTGCCACAAAAGTAA
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TGTAACTGTTTTTATGGGTGCCGAGAGGATAGGGGCACCCAACTCGATTA
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GGAGCCTAGATTGTGCCAAAACTGTCTTTACAGAATTTTAAGCAATAAAG
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GGAAATATACTTCAGTGCCGACTGGTCTTGCactattttatcatttttag
tcgatattttaaattgaatttttcggTCTAAACCTTTCGGATTGTTTTGG
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TATGTGTGGTGGTATCTGGTAGAAtttttttAGGTACAAAATATAGTATT
TATCTTATCGAAtttttttACGTATTTATAAATAGCTCaaaaaaaTAGAG
ATTTAACAGAGTGCAAtttcttttaagttttgttttttatgagtcatcta
agtaagactttaaaggttttgtttttaaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:221080..230258+ >MSTRG.12695.2.p2 ID=MSTRG.12695.2.p2|Name=MSTRG.12695.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:221080..230258+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGAAAGCGCCAACGTGTGTTATTTTTTCTTGATGATAATTATTGA
GGGTTACGACTGTTTGAGTAAAGAGAACACAGTTCGCGaatttcaagggg
aattggattttcatccgAATAAGGGAGTATGTCGAACGTCGACCAACgtc
atttatgagagttttttgttgacaGTGGCTTTCAATATTGTAACTGTTTT
TATGGGTGCCGAGAGGATAGGGGCACCCAACTCGATTACTAATTCGCTCC
TTGCCtttttttCCACTCAATCtagtaattttcaaattttcaaaaataga
gaaaattacCCAAAAAGCACCGCGCTACCTTCACGCGTGGAGCCTAGATT
GTGCCAAAACTGTCTTTACAGAATTTTAAGCAATAAAGTTTTGCCTGGCT
AA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000097_pilon | genome | sc0000097_pilon:221080..230258 + |
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