|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000097_pilon:220847..230258+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12695 ID=MSTRG.12695|Name=MSTRG.12695|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9412bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:220847..230258+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GAGAATTggaaccattcttgagaaattcaattcttAGTTTTCATGACTTC
TTTTAATCaagtttttaccattttttgcaaaaacgagtgaaaaaaataat
taggttCACACCCATTTATAAACCACTATAGtaacccttcatgttcagtg
atttgtttggtcatttgcAACTTAATAATTATCATGGTAATTTTGACGTA
TTTGGTACATGCTATAACTTATGCGAGTTAAAGAATGTTATTATGATAAA
ACTTATGATTGAGCTTTATATACAATAATAGGATTaatgtaaaatggcaa
taaataATTTATCATGGGTTTTCAGCTTTGCAAACTCAGTCGTTGGTGTG
GGAGTTCTGGCAAtgcctttttgttttgaaaaggtaTGTATATATGGATG
AATATAATATTGGATGAAtagaaaattttatgttttcactGAAAAGACAA
CaaaaaaaCCTTCTATTCGAAATGATATTCCTTTTTAAAGTAACCCTCAA
AACATGGCTGCTTTTTTCTGATAGAAATGATGAGATAATGTTGAATTGAA
TGAATTAGCAATttaatgaacttttttttttttttggtatttcatgGTGT
GTCATTCAGTCAGTTAAAATAACGCCAATCACTGTCTAGAAATAATATGA
TTTTAATGGAAGCTCTATCTTTGGTGTCGAGCACtttttttGTTGACTTG
TTCACCAAACAAAATAATGAtatgtattttattttatttgactGAACTGC
AATTTTTCCTCATTATTTTTAATCTGGTCTGATACTTGCTTCAGGCATAC
TTTTTAACATGCCTTTCCATTATTTTTCAGTGTGGATTGGTGCTGGCTTC
TCTCATGATACTATTTTATGGTTACCTGACCAAGAAGACTTGTGAATACC
TATTGAGAGCTTCCAGTGCTTCAAGAAAGCCAACTTTAGAACAGATCGGT
AAGAAATTTTGCTACTTCTAAAATATAGGTCACTTAAAAAATACACATAC
AAAGATTTGTTAGACTGAGGCAAGTTTGGTTCAAAGAAAAAGAGATGAAT
CTTGTCTTCTTCTTCACTAAGGTTTTAgtagatttttttatatttatgta
CATAATAATTGCTGGTTTTAGTATTTTCGACCTTTGTTGCATTCGTATCG
TTGTCTACATTATGGAAatcttaaagattttaaaactatatgaaacaaaa
ataatttttatcgctattttttcttttattcagcTCAACACAGCTTTGGT
GACCTTGGAAAGCTGATAGTTGAAGTTAGGTAAGCCCCCTTAATGAGAAC
TACTTTTTCTTCATAAAGATTTGAATTGTTTTAATGCATTTTCATGGCaa
tgaaagtaaaataaatagaatcacCAAGCACTTTTCATTTCGAAAGATTC
GAGCAAAACATCGAGAAATGAAGACAATTGCTACATGGTGTTTCATGCCG
GTGCAATCTTCAGAAAATGAAGtgtattgaatattattatggactagttt
ttagaaaaatattatcCAAGAAATACACTACATGCTCTAAGATTGCGCCA
GCCTAAAATATTGTGGAGCAAGTCTGTTATTCTCGTTGAATGACTCTTCA
GAGTGAATCTCTGCGTCCACACGCGGAATCAAATACACAATTTTGCagtg
aaaaaccttttttttttcagtacaaTAGCATTGCTGTGTGGAACGCTGAT
TGCATTTCAAGTTGTCATTGGAGACTTAGCACCATCAGTTGTTCATTCCT
TCTTATCTTTTGAGGTAACTATACAACATCCTAAATATCACTTGATCAtt
gaatttttcctttgaagTTACATACACAATCATCCATAATTTTATCAATC
AAGCAATTTGTGTATTGTGCATGCCCTTAACGTACGTGTAACGTAACGTT
AGGAATTTCTTCATAGTAGATCACTTatcaatcaaaagattttgttcaaT
TTGCTTGAGAGCAATCCCCCGAAAAGATCAAAACAGTTTTTCTGTGTTAG
ATAGTGAAAAAATCTGAActtgaattttggaaaaaaagtccCATTctttg
acagttttttatcgAAGGTTAAGTCTTTTTAAAGGACACCTTTAACGTAG
ATCCTACTATTTGCTTACTCAGCATTTCTTGAACAAAAGAAAGGACAACT
TTCTCCCCATTAGCACCGCACGAGCACAAGTTTTGAGGACTTCTTTTGTT
CAGCCTAGAGACGCACCTCCTATCTTtacaataaaaaagaatatcttaaA
TTCGTATTTGCTTTTGCTCTACAGAAAACATGGACGCTGAGGACGTTTTT
GATGGCGCTGTCTTGCGGTGGCATTCTTCCCTTGGCGTTGATGAGAAACA
TCTCTAGTTTATCCAGCTTGAACATGCTCTCCATTTGTTTTTATGGACTT
TTCATTGTCATTGTAAgtgtttttaataaaattgtAAACATTTCTCGAAC
CAAGTGTCTCGAAGtcgaaatgaaaaaatctaaatcatgTGTCCAGTTCA
TTTTATCAAGTTTGTAATTAATACAAAATTGTAGCGATAGAAATTTCTTG
ATTGTTTTTTGTGACATACtgtttgtttcaaattttcgtaACAACTTCCA
TTATGGCCTTTTAAAACCAGATTAATTATGGTCTACTATTAAATGAAAAA
TACCCTTTTCATAAACTGCCATTTTTCGCGCCACCAACAATCGTAgaagc
tttaaaaaatttaagacAGCTCTTTTGACAGGTATCTTCATGCTTATTCT
CTAAAGACATTATGCCAAACCCCTTCGATTGTTTCGAATACCCTAAGTAG
AATTTTGACAGCTGAGTTAAAGTCGCCTGCTATCTTTACTTTTACAGATC
ACTTTGATGGCGTTAccaacttttttatcatttcaatgGGTTCACAAAGC
AAAGCTATGGGATCCATCTGCTATTTTCCAAATCCTACCCATTATTGCGA
TGGCCTTTACTTGCCAAACGTAAGTCTTTGTTTTCCATTCGACTGTTtct
ctctctctcATTCGAAGCTTTTATAATTCAGGGGAAGAACCTAATTACCG
GTGGGGATGAAAGTGTACCCCTAAATACCTCAAAATGGGGTGCAGTTGAC
AGTTaattctcgctaattcgaactcaaacggagaatcttatttgttcaaa
taagagagagattcgaatttaAGAGGGTTCTCCCTGACGGTTAAGCtaaa
gagagattcgaattgaGGAGATCTTTGAAGGAGTCTCTATGAACGGAAAC
tgagaataagttcgaattaaagaaatattcgaataatagaagccCGAATA
TGCGAAGGTCGACTGTACACTAAAACCAGGCTTTTCAtctttagagcaaa
ataaggaaaTCTTATTTTGAcaagttaaaatattttcaaaatttaacaaa
tggggatggaaaaaaaatcggaaattAACAACAAACGGGGCGAGAAGCGT
TTACAGTCAGCTCGctgtaattcgaacctctattatttgaGTCTTTCTGT
AGTTTAAACTTTCTTGagttaaattactctctgtgattcgaatctttctc
taattcgacgaaTACTTTTGGTGtcatgaagatcgaattataATGTGTTT
ATTGAACAACCATTAAAAGAGTACTTAATACTCATCGTAGGTGAgttttg
aaatataactttatgaagatcgaattagagagaatccACTGTAGTGAGTA
CCTGAAAGTACATCATTTGTTCTCTGCACAAAGCTTTTCATCTTTCATCG
CAGAGCAAAATAAGGAAATCTTCTTCACTAACAAATGGGTCGGGAGTTGG
AcacaaattaataaacggggcgGGGGTGGAGAAAAATTACAAATGGGTTT
TGAGGCGTttagtaagaacatttttttgctctctACACAGGCAAGTACTG
GTGATGTATGCAGCGCTTCCTGATCCTAACATGCTGACAATGACAGGGAT
TATCAATCAAGCTGTTGATCTTGTCTCCATCATCTACGTGTCGGTAAGTA
AGGCTATAATCACTGACATCTATGTATAGACCCCTGGACGATTGGGGATG
TAGCTTAGTCTAAGGTTTATAGAGGTCAGTGGGATATTATTTCATTTGAT
AGCTGACGATTCGATAAAGATGAAACTTGAAGTactataattcaaatttt
gtttttcttctacACTGTACAATTGGGGATAGCCACTAAATGTGTTAGGG
TAAGTTACTCAGAACCTGAATCACGTTACAATCACTTACCTCTGTAGACC
CCTGTGCTTTCTCAACCCTAAGCAAACAAAATCCTTGGTcggagattttt
ttaaagtggtaccATGTGGGTCAAAACactttttaaactgaaaatttcat
taaattagATATTTACCCACATTAAAAGGTATTACGTTTCTTGAAAACTT
CGATCATTCAAAGATGGCGAATGTAGCTTAGTCTAGGGTTTATAGAGGTC
AGTGGTTACAATTAGAGGTTGGAGCGATTGGAGCCACTAAATATGCTTTG
GCTTCAATAATTCTTTCTGTAAACCAAATCGTGATCATTTTTAAGTCTCC
TCATCTACAAAGTTTTGTCGGTTGACATAAAATCATAATCTCCAAGCTTA
AGTCGGTCTAAAATCAGGGAAGtttaccttttccttttccttcttttttg
aatttaaatttttgttcacTTGTCATTTCCTACTCAACTTCGTGTTCCAA
AAGACGCAAATAAAGGGGGTTTCGAAGTAACACGTTAGTTAAGTTAATGC
TAGCGAGTGTTTAAGATTTGTTGTTGAGATTTTTTCTTGATGCGTCTTTA
ATACTCTCCCTCACTCACTCTGTTCCAAAGGTTGGCAGTTTTGGATATTT
GGCGTTTTACCAATCACATATCCATGGagatattttggaaaattttgtac
CAGGTGTTATCACGCAGTTCATCAAGCTAGGTGAGTGTTCAAACAATCAT
ACTAGATTTTATAAAGTGTTGAACGATATATGAGATTCTGCGATTTCTTG
ACTTTCGCACTTTTATACACCAGTCAAGAGAAAAAGAGAATTTAACCTGA
CTCTGGCTAattctaacttttatttttcaaaccattctttaattcgaacc
gaCTGTGCCACTCGTGAAATACTTTCTTTAATTGGAATATTCCTGTAATT
CGATCACGATTGGTCGACTTCAAATTAACGACAATTATCTGTATCTTGga
tattttcaaatctttcagtttcaCGTGTTAGATAAAACATTATTGAACAG
GGCAGGACGTCCGACTTATTTTAAATTCTCGTTGaaaaaaaaCCACTGGT
TTACAAGGAAAGTATTTCGTCTATTCCTgaTttttTAGGCTGAAATTTTC
ATCGATGATGGACTGGAACCTGCCAAACTTCTCCCATTCAAGCCATTTTT
TACTACCCAAAGGCCAATTGCCCGCCGTAAGAAGAAACACACCCCCAGAC
TTGAGTACTCAGCACTCACCTGACTTTTCTGGATTTCTGATTGTTCAata
tttgttgattttattttcaggattttGGTGTTCAGTCATCATCAGTTTTC
CGCTACTTTCTTTCCCCGTTCGCTCTGCTATCAACTCTCTCGTCTTCTCC
AAAAAGAAACAGGTAACCCAGCAAGctcttttcttcctttttccctaagg
gagggttttcgtcttttttgttgttttttaattttatgacaAGGCAGATG
TAAGAAACATCCATCGTCTTAAAGGTTGATGAAGTTTATGCTTTGTAAtt
gttttgttgaaattctTCACTTTGTTGTAATGTGATCAAAACAACGTTAC
GCCAAacctttactcttaggttccaaatgaACAGatggggttggaaaatt
ttcgagattttaataaacgggggaccTAATGGCCAGGAGgggtggaaatt
gtacttctgaaaacccaaaaataaggtagcTATAGGCTAAatTcaggcta
tttagagcaaaataaggggccttctctttgacagcaggaaatgttcttaa
aaattgataaacggggggtcctaataaaacaaggtccggggggttggaaa
attttcgaaaaattaacaagcggggggcgtttatttgaaacctaAGAGTA
CACTaaaaaaaCGAAACACTCTCTCCCTCATTATATCAACTTTACCTTTT
GGAAGTTggtattttcaaagacattgaaACATGTTTCAACTCCACACAGG
GTGTTCTGGAAGACATGATTTCGTCAGCCTCAGATTACATCGCTCCACAG
GTTTTCAACTTGATCACTTTCAGTGCGGTCGGAGTGACCCTCATTATCGG
TATTCTCGTTCCGAAAAGTAAGTTTTCTTATATGTCTACAGTAGATATTT
TCCTTGCCATtgatattttgacatttttttgttgGATATAAACTTTAAAT
ATCCAACAGCCAGAAGTTATGTTTAAACGATCGAAAAGATCTCATGGTTA
ATTTCTTcgtattcattcattcattcattcattcattcattcattcattc
attcattcattgatccattcgtcaatgcgttcgttcgttcgttcgttcgt
tcattcgttcatttgttcgttcgttcatttgttcgttcgttcgttcgttc
atcgttcatctcatttgttcattcactcgtttattcgtttcaATTAATGT
TTTCTTAGAGAAGGGATTTCATTTATTCGCTTATAAATTCTCCACTTCTT
TTCATTCCAGTTGAGATGGTGTTATCAGTAACAGGAGCCTTAGTAGGTAC
ATTCTTATGTTTGATCGTTCCCACGTGTTTGTTTTTGGCCAATGGAGCGA
AGGATAGGGCCAAGAAAATCGCACAGGTTTGTAAAGATGATTATCCTGAA
GTTTTTAGCCTCTTAATaggattaaaatattttttttatgataaagAAAG
GAGTTGTACCTCTATGCTTACAAAGCAGAGATTCACGTGCAATATAGcct
ggggtccacttaaagcttttttatagacttgaTTTGGGAATTAAGTGGTC
CGGTAGTATATGATAGTtctcaatttttagtttttgcttACCGTCCGCCg
aattttagttgtttttggaaggtaaaaaaggATAAGGCAAtgtttttata
tcaaaataacAGATCTGTTATTCATGCTTGTTTCAAAACAGCTTAATTAT
CCaagtaccttaagtggataaattttcgcgtgtactaattttagcgagac
gagaatttaaagatttcgcgtggattaaatttcgcgaatcaagggtcttt
aaaattttcgcgtggattaaatttcgcgaaaatggccttctttatttaat
tttgctactatataaattgtaactagaaaagagatgtgtgttttttaatc
gaacaaagGCAGACAGTGTCACTaaaaagccttcaaaaaacttaaaagaa
aatactttaAGAGGTTACTAGAGTTTACAATTGAAATGGAGAGTTGAACT
TGTAATATGTTTTGATTGTAACATGTTATCTAGATTTCGCaaacttttat
tttcgcgattgtaaaattccatttaatttcgcgtggactaatttttgcga
atcaaaggccttcaaaaatttcgcgtggactaatttcgcgaaaaatggcc
aaatttcgcgaaaaccgcgaaaatttatccgcgcgaaaatttatccactt
aatagtctttcttctgaaattttggtgtttttcattcaaaatggcaacct
cgtcaaatgctccccttgtctacttcactggactcagcatCATCAAagat
tattaaaaaacaaagttcagccagaattAGACTCTATTATACGTAAAATA
TCGATTCTTTTATCTATCTTTACATGCGTTTCATCGTTCTTTCTTTTTAG
TTCATTTTGGTGATCAGTGTTTTCAGCATGGTCTTTAGTACCATTTCTGT
CCTCTCGTCCATCAATAACGTGCAACAAGAACCTGTTGTacaacagcggc
agcaacaacagcagcagcaacaacagcaacagcaacaacagcagcaaaag
caaGTTGAGCTCCAACAGATCCAGCGTGCGATCCCATCAACAGGGAAATT
TGAAATCCATCAAGCTTCTTTACAACGAATAGCTAAACAGTCAACCACAA
CCACCTCGACTATAAACAAACGCATCACTGATAACGTCATAACTTCTGAA
AATATGATTGAGAAAGGAAAAACAGTAAAAGACCATCAAAATGAAGTAGT
TACGAAAGGACAAGGTCAAGAAAGCGAGGGTGTTATAAACATTAAATCGA
GCATACCCCTTGGAAAGCCTTTAGCAGGAAAGAATAGAACGGTCGGTTCT
TGAAATCGCGTTCATCCCTTGCCACAAAAGTAAAGGTTTGATTTTCTATT
TATGATATTCAccacttcacgaaattatgcaacttttctgtttttgttcc
acccaatacgtcactttttctattgtttaagtgacgtattgggtggaaca
ttTTAAGCGTTTTCAAAAGACTCTCTAGTGGCGCATAATCATGAATACAt
cgttttgataaaattttagatattttttcatATACATTTTGTTTCATGAT
GGAAAGCGCCAACGTGTGTTATTTTTTCTTGATGATAATTATTGAGGGTT
ACGACTGTTTGAGTAAAGAGAACACAGTTCGCGaatttcaaggggaattg
gattttcatccgAATAAGGGAGTATGTCGAACGTCGACCAACgtcattta
tgagagttttttgttgacaGTGGCTTTCAATATTGTAACTGTTTTTATGG
GTGCCGAGAGGATAGGGGCACCCAACTCGATTACTAATTCGCTCCTTGCC
tttttttCCACTCAATCtagtaattttcaaattttcaaaaatagagaaaa
ttacCCAAAAAGCACCGCGCTACCTTCACGCGTGGAGCCTAGATTGTGCC
AAAACTGTCTTTACAGAATTTTAAGCAATAAAGTTTTGCCTGGCTAATTT
TTAGGGTCTTCACTTCTCAACCAGTTaagtgttttatacatgaaaagACG
GTCCAAGAACTTTCTATATATTGATTGAAGAAAGGAAATATACTTCAGTG
CCGACTGGTCTTGCactattttatcatttttagtcgatattttaaattga
atttttcggTCTAAACCTTTCGGATTGTTTTGGAACTATCTCGGGGGTCC
TTTATTTACTCTGGATTTGTtgcttttttaatgaaaaatgttttctttcg
aaaaattatatttttcgaaTCGGGTCTTTTGATTATGTGTGGTGGTATCT
GGTAGAAtttttttAGGTACAAAATATAGTATTTATCTTATCGAAttttt
ttACGTATTTATAAATAGCTCaaaaaaaTAGAGATTTAACAGAGTGCAAt
ttcttttaagttttgttttttatgagtcatctaagtaagactttaaaggt
tttgtttttaaa
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000097_pilon | genome | sc0000097_pilon:220847..230258 + |
|