MSTRG.12393.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12393.1.p1
Unique NameMSTRG.12393.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12393.1.p1 ID=MSTRG.12393.1.p1|Name=MSTRG.12393.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10143bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAA AACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAA AACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGT GGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattatt ttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGC TTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAA GCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAG GTAAGTCGTTATAAGGTATATTTTCAGGGAAGGGGGAATGTGATATTTAC GCTTGGCACTATACGTTAGATCAACCAAAAAGGTTGTGATTTTCAAACCA CCAGAGTATTTTGTCTTCCTTTCCAATATCCAGggtatttgtttttgttg agaGCGACATTCTAGAAATTTAAGTTCGCGTCAGAACTCTAAAAAATGTA CATAATGTAATCTAATATAGCCGATCCAAAAACTGCATAAATAACTTATA CTTTGTATTTTACAACTTTAACCATTTTACTTGTCTTTAGGAAGGAGATT GAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGA AGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAG CTACAGGTTTGTGAAACCAATTATAAATCAATCACTTACATTTGGAAAAA ACGTGAAATTTGAGTATATATTAGTTTGCTACAGGTGTATGAAACCCTTA TTCAATCATTATAAAACCCCCCTCCCAAGCCATTTGTGTGATGTgatgat agggacttttttccagtgtgattacgtgatttggaaattatttctttgtg attgcgtgatcagagtTCAAAAAGTGATtgtgatttgttgttttacgtgA TCgcgattgaagacaaaaaattgcgttaTATCGTGAGTTACCACTGGGGA GCCTCTTATAACGTCAGGACGAAGCATTAATTTGGGAATTTCAGCTTTCG CAATcgcattcaaaattttactgaTGTTTCGAGGTGGTAAATAGACGTGT GAAGCATAAAGCATTTTCCTTTCAAAAGTAATCGACTACTTGCAAAAATA TCAaaggggggggtttcacttttacggtatgacggtattgggccttttta cccccggtaaatcggtattacgagaaaaaaacgacgggattacggtattt cattttctaccggtatcggtaaattgcctggttttttgtcggtatttcga tatttttatcaataaaaaacggtatttcggtataaaactatttacctttt agtttcttcatgagtttcatggagaaaaattttcaaaaaagataagtcta ttccgctattttaaccagtaaaattttcttgctcgcttcactcgcacaat cttggatgttctattgacttattgtcatggtaaggtttttcaaaataagc agaactttacgatatctaaacaaatgttttcgttatttttctgcgggcga attttttaatgacaacttttgtgatgcaaatactgcatccaacgaaagag tctagataaaattttctccatcagcactaaatgatatggtcgtctctccc AAAGAGAATATAAAAACCAAGCTTTAGCTTTTAAAGTATCTTTGTcttca cttatattgctactacaatacaatacactgatactgcagtaacttagaga cagtaaaggcggtatttactccttcaatgattagtaaaagtaggtagttc taaaaacatcttgtgcagcatcgaacgattaaaaaataattcacatcatg atgcacatgatgcgttttcaggcaatctaggcattctaaattttaaattt tttcttgggcgaaactcttaGGACGcggcaccgggtacggcaggtacgtc gctcacCGTACCATATTTTTAGCAAGTAAGTAACTTTGGCACGGCAGACC Gaaaatattgctttataaaagctcaaatagctgtaaaagagaccttaaaa agtcgacaaaacgcgagaataaggtcactaaaactagcaaaaaactttat atattggcaaaaatgtttggtataagaataggtcaatctgtttaaaagag accataaaaaggtttaatttagcccaataaggtcacaatctccaaccaaa gatgtaaaagctaAATTGGtgtgtgaacgtgaaaatattttttttcgcgc GTTAATAAGTGAATTGGcaaatttgtgcgtgaatacctgagttgagggtt gactgggggcctcataaagtacaagacttgtttgtacagtttctaatttg ttactacacaatacatttgataactgaaaattgattattttcgaaaaaaa aacataaatttaatatcggtatcggtattaggcttccttcaccaacggta ttacggtatttaacccaaaattttgtcggtatgacggtatttaagacccc tgaaacccccccccccaatcaAAGGCCTTCAAACTGGGAAAATGGAATTT TAGGTTATTTTTCATTGAGAGTCGAATAAAGAGCTGTCAGGGGATACAAG GGTGTCAAATATTTACCGATTctcctttttttttacatttttaggaCACA GTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAG TACAGGTTGGAGTCTTTTGAACTTCTAAAACGTTAAACCAAAAAGTTATT TAACAACTCATAATCTTCTTAAAATTCAGCTACTCCAAGCTCTATATTAT TGTTTTTAGTTGTCCTTAATTTTTacatctacaatcatggtcgatagctc atttcctcgtttttcgaaatttggagttccggcgagaaagtcgattttgg gccatctctcaaatttaatcggatatttcaatttggctcgggtttataga cctccaggctatattatgagccttattggaccatttttgaactttttgat ccTCGGATCCTAAGCTCctcctaagttttaagtctcatgttaaaactcag agttaaaactctacccttccaacctacttcagagcacttacaaatcgatt gtggttcaaaacttcccggttgatttcctttttttctcaaatattacgac catgattgtagtcacAGTAAAGTATAGCATCaaagtaattaatttttttt ttcactcagaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTA GACTTAAGGTAAGATATTTTTCTggtgatttttatttttcaaaatgtggt TCAAAATGATTGATTGTTTCATCAGCCTATATGAATGAAGTTTTAAAAAT AGGTTTTAAGGTAAATTTTACAACAGTTATTTTAAGCTTTCTTCTAAAAG TAAgaaactaccttattacacgaatattactaggcaagtattcaaacggc cttgaaattaacactccaaaaatttaaacaaattttatttgctttttcaa ggttGGTTGTAATTAAGGGGATTTTTAtcaacacgaaatttttcaatagc ATACCGTGGcgaatttttgtaaaacgtcTTATCCTCTagctttgagagaa attttaaatttgatcgccgttttgggggccacatacgattattacttctc tcatttgaccgaaattcaatcccgtcaacctttgcgttaatcatgcttgc acgcaaattacactcaattacaaagaaaaagtaataactttcacgatttt tgaattaaaacaaaaaaggattatGGGAtggaatttcggtcaaatgagag aagtaataatcgTGACATTTGCACGACGAAGCGctattcgtgttaataaa atggctacagtatgtggcccccaaaacggcgatcaaatttaaaatttctc tcaaagctagaggaaaagacgttttacaaaaatttttcttgcatgcaaaa ctttaacatctctactttatttcccgacagttctttttcaaaattttcaa ttttaacaatatttttcaatcgcttaaagacaggtagcttttttctaatg gcccccaaaacggaggtttgcaattttagcgatttctcgtgatatcttta agatattaatacaaaattttgaccatagttttgaaatgtgatttagaggg ttttgggcataaattagtttgataacatttttacaaaaccaggttgtcaa aatgcaggtttggggcccccaaaacggaggtgtagttaaaatcaaattat taagcccagtggtaataggggggaaaactatgaacatatttgtgttttcc cttaaatttacgacccgatggatgtaaaatttatgatttttatgaaatat ttcaagattttcgatattgcaaagtccaaactgaaaatttagatattttc aaaatgacaattttaatttaacaatgtcttaatcaagtttttgaaaacaa atctcttttgaaaatagttccattcatgtatggaataagctgtgaaaatt ttagaaaaaaagcttaactgaaactgaaaatatcaagctttaaagatatt tttctcctatattttgcagaaaatgacagaatttgccatttttgctgatt cagcgaaaattgttatatataatgttaattttttgttataagctattaac tcaacctgataggaatggaattccaagattttttgctgtttttcatattt agaattttcggttttatcaatgctgattctagggtcccaaaatactggtt gacctttaagatgctatatcttttacccatcctctaaattcacagatgta tctgcattttctgaacggcattaggtgtagaaagtttcctataccccatt ttcataacttattttcaatatccaaggatatagagtgagttatatgcaat ttttatctaattgtGGTGTTAAAATATCTCCTTCATACGCAAATATGtca ttttgaatctgtctcaaaccatcaaaaacatgctcattttttagtataac catcattctttctaaataaacaaaaatcgtttaattctgataaatctaca agtcagaatcctcattttataatgacaacctccgttttgggggccgtctc cgttttgggggccatatactgtagtaacattcgtgtaataaggtattttg tttgaaaatctaGGGATTTTGAACCATGGCCAGTTAATATAGGGTAGGAA GATTGCCCAGTTCTGGGTGTGGGCGGTCAACATTGCCGTTACCCAACGTC TTAGAGTATACATATCTACGCCCCTGATGTCTAACAGCTCTGGTGAAACT TTTCCCACAGTGgagataaaattttctattgaaaaacccaatggggataa aaattctagtGCttttttttGGTGTAAAAATTCAGTgagaatggttttgg agtgcaatttttaagcattgaattttgagtagggatgaaatcaaagtcaa tttcccagtggggatgaaattgcAGAGTATTCTTCTCACCGGGGACGaga ttttggttgaattttCAGTGGGACTGggctcccagcgggtctgtgacaca ggggtgtataatcATTTCAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTA TCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgc CCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCGTAAGTTGGTTTTATTA TAATTCCATGAAATTTAGGACTTAATACAAGTTTAATCGACACGaagtag tttttttctgatttttttcgtTGAAAACTGCAAAACTATATTGTTACTCT AGAAATGGCTCAATGGAAAAATCTATTTAGCATAGCTGAAAAGCTCTTGC CATCTGTTTCTTTAAAGCAACTAAggaaattttgatcaaaatttagtCGT TCTGAGCTAATAACTAGTTGGATGGGGAGGTAAATGATCTTATTCAGTCT TTTTGGGAATTTACCGTGTAAGGTTCACAGGATCTTAAGACTGGACACAG GTCATGCTCGGTCAATGGCTAATTTTTTCACAGCCGCAAAGGAATATGGA GTGGCTTATGGAGTGGCTTTGACCACCACATTATTCTTTACCAGTTTTTT GTGTTGGATAGATGGTTTCAGCACGGAAAAGCATTTCAGATTACATCATC TCCTATTCAACAAAAAGATCAATTGtctatttctttgatttttaccTTAT AGAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatca aaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAAT CCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCAC ATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGTCAGTTTTGATACCCTG GGtaccagaggccaagttttcatagTGAAAATATTAACCGATAGTTATTC GAGCTCTGATACTCACGGAACAGTTTTGGGCCCTGACGTATTAGcgattt tttatgtatttgtcttgcacttttgaggacggaggagttataccgtgaaa agcacaggtcgaaatcatatatcgacgctgttccgaccaatccagattct attcaaccatggaggtataaagaaagacaggagaagtatgctattgtaac caagctcgccctacgattaaaaaagttacgatgtatgcatgctcataatc tcatatatcgtgcatttttaatgagctcttttatccataggttaaatctt attggctcatttaagctttagaaattagatgagacgagattcattgtttc tgacatcagtgtaagaaaaatattggactaaaaaaaggcctgtgaacttg gcaatccttcatcaaatgataagatttttcgatcaatgttttctttcagg tgaactctattgcttgatactttcctccaaaattctccagcgactttatg tctacaaattgactctgaaatcgtgtgtgcttataaagaacttttcattt tctggcttgagaaaatatcttttcaaaacaaaattgaacggatagcgaaa tggaacataaatttgtttcgtggacgaagttttatctaattttcgtatat taaaaggctagaatcttcaatactgattattagaatgttcagagcaaact tgagttctactaaaaagtcttatttcatcgggcgagcttagaatttcttt tgattcattttataaaagaaatcaaaagactttaacgaccaattaccgac acattcaactcctgttttctttatacctctatgattcAACGCACAATCAA Cgaagagaaaagtaaccatgacgaccatccaagatcttggatgaggttca aagttgatatttttattgccgtcgttgaaaacagaactaaaaaaaaagtc atctttgctttttaaaaagagtcagtgatagagaatcataacataaagtc tgtctattatttctattcaattaaagtgacatttccataatcaaaagttt agtaattactgttatacatttggggatcatgtaaaagatttctttcgaaa ggaACTCACTTCAAtaacacttggaggtttctggggaattcgtaaatagt aaactgcatactgatacagtctgctagacattaatatggtaatatttcct cttcatctttgattttttctacagtgattagattgacacatgcgcgataa aatttctatgatACTTAGGGTAGAGGAGTTATTGAAGGGACTTAAGGGAC TTTCTTTTAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGG ATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGGTAAGAATAAAAAACGAAATTACTGA CCACGATTGACAACTTTAATCAATCAGTACCATTCAGACTTTGTAATAAG AGCACGCTATCTTCGTCTGTTTAAGAGTATGAGAGGCAAAAGTCGATCGG CACATACCACCCTTAAAACCCCAAAACCTTAGTATTTAGGGCGTCAGATG GGCGTCATGTCGACGATAAGtttcaatttgactgtccttttcttttgttt tgactctattttgtttttgacttttttttgtttttgtatttttcttttct gccttctattttcAAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACC TATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTT GGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCT GTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGGTAAGCGTTTTGGAT GTTAAAGAACAAAAGAATAAGTATAGAAGTTTTTCATATTTGgtaaaaac acccccttctcacagacccggtatgatttttttcagccagtagggGTAAA AAACATAagggactgaaactcgatggggattgatatttccatattttttt atggctgacgatttaaattttttttgttttcaagtcaaattcAGTGGGAT GGGAAAAAAGCGTTATATTTTGCAGTGatgattggtttattttattattt tcagtgagaacaaaaattggaggataattttccactggaaccatattttg gccaatttttccagtgggtctgtgagaaaggggtgtgtaAAATTACAAAG ACCTGAGTTATACGATTTACGGTTGAAATTATTATTCTGAACTTTCTGGC TGATACTGAAAATATACTTAAATCTTGACTTTTTCACTTTTAGCAATACC ATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAAT TCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGA TTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAAC TAAATCTGTTTAAGGTGGGAATACcttagggaagaaattttggccggaat ttaatttggcgggtagctgaaaaagttttttcagagggaattcaATTTAG AGAatggcttgaaaaattaaattttgtatgggaattcaatttggtggatg aaggatatttttggccaaaaatgataaaaataccTGTTTCATAAGACCTG AAAGAGCACACATTCGAGAATGAAtacaataatttaaatttgCCGGGAAC TTACTTTggccaaatctgccaaattttctttccgccaaaatttcttccct taagggtATATAAACTTCTGGATTTTGGGCGGTTTTTGATCCTTAATCCC AAAGACGCCACCTCCTTGTTAATCCTTCCTGAGCATACCCTGAAAGTCTC AAAACTTTAGCATTAACATTACTTATGAACCGTTAGTGTTATATATTTCC CTTGGCAACGGAATGTTGCTAAGGCCTCATTTCCAGATGGTCTCCCACCT TAGCCTTTTTATTTGTGGCTTCTAAGgctcaattttaatttttaaataac tagaaatcagaaatcaactGACAGGAACATTTCCATGACGTTTTCCTGGA AAAAGGCATCCAGTAAAATTTATATTCAAAAGATTTATAAGGTTATTAAT AATACTAATATTGAAAGTAATTATTATACCTTTCCTGACAATTCGATCCA CAAGTTTTTGAACAATATACGATGTGTCCGGGAAAAGAAAGCGAAACAGA TTCTATACTCGAGTGAGAAAAAGAGCTAATTTTTCTAATCGCCTTCTTCT CTTAAAtattttagccttttttccagGTCCAGTTCAAGTCCTCTGTATAA GTTTTGAAATAGTCCTAAAAAAGTTGTGACGGGAGACCCTAGGCTAAGCC CCTTCTAAAAAGGAGAGTTTACCTTTAAAAAATAGCGAGATTTAAGGTCG AGAACTACTCTATATTTACTACCCAGCTACAAAcagcataaaaataaaaa cttcagCCACTAAATTGTTTATATAATCAGTAACATATATTATGATAAGT gcattttttgtagtttttatttaatacaatagatattttatgtacaatag atatttatatatttttgctgACATTATTGTATATGGAGTataaaacccgg ggggggggggcagctgggcaaaaggaccgacgggtatgtgcgg

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+

>MSTRG.12393.1.p1 ID=MSTRG.12393.1.p1|Name=MSTRG.12393.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAA
AACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAA
AACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGT
GGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattatt
ttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGC
TTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAA
GCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAG
GAAGGAGATTGAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATG
GATTCGAAGAAGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATT
CTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTAT
TTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTACAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAG
GCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTAAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGG
AATTTATCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatcc
aaacgcCCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCAGTTACATTCA
CAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatcaaaacataAGAGCT
GTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAATCCAAAGCGAGGTT
ATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCACATGACTCAGAATA
TGATTAACCATGTTAAAAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAA
ACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGTCACAAACAGTATGGGA
CTTTGACGATCGTTACCTATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGG
AATATTATAAAGATGTTGGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACT
GTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAA
AGCAATACCATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTA
CAACAAAATTCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACT
TATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTT
TGGCGAAACTAAATCTGTTTAAatgaaaacgtttACCTTTATACCAAATC
ATCCATTTTACAGGTCTTTAAAAACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTA
GAAAGCCTAATCACGGTATCAAAACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGA
AATTACAATCACCCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAG
TTGTCCACAAaccaaaattattttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgact
ttaaaagaacatttgAAAGAGCTTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATG
GTGTTTTTGGCCGTTATGGCAAGCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGC
CACAACATTTTGACTTTGAAAGGAAGGAGATTGAAACAGAAGACGGGGGT
TCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGAAGACAATGAAGACAATGA
AACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGTGGCA
AAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTACAGa
GCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTAAGAC
AGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTATCGGAAATCAAAGCAGCGTTCA
AACATATAacaaaagaacatccaaacgcCCCCATTATGGTTATTGCATCT
TCTATTGGAGCAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaa
aatcaatcaaaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATC
CTATGGAATCCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTC
AATAAGCACATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGAACAATGC
AGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAAGTTT
ATCAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACCTATGTCCATTA
TATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTTGGTATTGTTTC
GTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACAGAAG
ACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGCAATACCATTACAGAAAATCATGACC
AATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAATTCGGTGGGCATTTGACGTG
GCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTG
AACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAAatgaaa
acgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAAAACGTT
CATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAAAACAAG
AGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGTGGTTTT
CTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattattttgtaa
acCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGCTTGAGA
ATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAAGCAGCT
TTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAGGAAGGA
GATTGAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCG
AAGAAGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCA
GGAGCTACAGgaCACAGTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAAT
AGCTTTGAATCGAAAGTACAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGG
GACGAGGTGTTAGACTTAAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTA
TCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgc
CCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCAGTTACATTCACAAATT
ACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatcaaaacataAGAGCTGTTATG
CTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAATCCAAAGCGAGGTTATCGGA
ATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCACATGACTCAGAATATGATTA
ACCATGTTAAAAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTC
GGGATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGA
CGATCGTTACCTATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATT
ATAAAGATGTTGGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCT
GTTCTTGCTCTGTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGCAAT
ACCATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAA
AATTCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAA
CGATTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGA
AACTAAATCTGTTTAAatgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCAT
TTTACAGGTCTTTAAAAACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGC
CTAATCACGGTATCAAAACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTAC
AATCACCCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCC
ACAAaccaaaattattttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaa
gaacatttgAAAGAGCTTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTT
TTGGCCGTTATGGCAAGCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAAC
ATTTTGACTTTGAAAGGAAGGAGATTGAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTC
ACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGAAGACAATGAAGACAATGAAACCAA
GCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGTGGCAAAGTTT
ATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTACAGaGCTATT
GGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTAAGACAGAAAA
AGTTTCATGTGTCGGGAATTTATCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATA
TAacaaaagaacatccaaacgcCCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATT
GGAGCAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaa
tcaaaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGG
AATCCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAG
CACATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGAACAATGCAGTTGT
CGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGT
CACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACCTATGTCCATTATATGGT
TATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTTGGTATTGTTTCGTTACC
GTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACAGAAGACGACC
CTCTTTGTCGTGGGAAAGCAATACCATTACAGAAAATCATGACCAATAGT
TTACTAGCAGTAGTTACAACAAAATTCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGA
AGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTGAACAAT
ATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAAatgaaaacgttt
ACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAAAACGTTCATAAT
GAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAAAACAAGAGGGCG
TTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTA
TACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattattttgtaaacCTGG
TCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGCTTGAGAATGACC
AATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAAGCAGCTTTCCAC
ACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAGGAAGGAGATTGA
AACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGAAG
ACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAGCT
ACAGgaCACAGTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTT
GAATCGAAAGTACAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAG
GTGTTAGACTTAAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTATCGGAA
ATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgcCCCCAT
TATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCAGTTACATTCACAAATTACTTGG
CAAGAGAAAGcaacaaaatcaatcaaaacataAGAGCTGTTATGCTTCTT
GGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAATCCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTG
GATCAATTTAGTCGTCAATAAGCACATGACTCAGAATATGATTAACCATG
TTAAAAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGGATT
GACTTGGAAGAAGTTTATCAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCG
TTACCTATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAG
ATGTTGGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTT
GCTCTGTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGCAATACCATT
ACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAATTCG
GTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTT
CCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAA
ATCTGTTTAAatgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACA
GGTCTTTAAAAACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATC
ACGGTATCAAAACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCAC
CCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAac
caaaattattttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacat
ttgAAAGAGCTTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCC
GTTATGGCAAGCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTG
ACTTTGAAAGGAAGGAGATTGAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTG
GATTTTTATGGATTCGAAGAAGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAAT
TCTTTTAATTCTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGTGGCAAAGTTTATGTTC
GAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTACAGaGCTATTGGTCTT
AACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTAAGACAGAAAAAGTTTC
ATGTGTCGGGAATTTATCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaa
aagaacatccaaacgcCCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCA
GTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatcaaaa
cataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAATCCA
AAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCACATG
ACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGA
TAGTGTTCAAACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGTCACAAA
CAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACCTATGTCCATTATATGGTTATAAA
GATCACATGGAATATTATAAAGATGTTGGTATTGTTTCGTTACCGTTAGA
AAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACAGAAGACGACCCTCTTT
GTCGTGGGAAAGCAATACCATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTA
GCAGTAGTTACAACAAAATTCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAAT
CATGCCAACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTG
ATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAAatgaaaacgtttACCTTT
ATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAAAACGTTCATAATGAAATT
CGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAAAACAAGAGGGCGTTATCT
CTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTATACTAT
CTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattattttgtaaacCTGGTCTATG
GTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGCTTGAGAATGACCAATGGC
CATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAAGCAGCTTTCCACACACTA
CTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAGGAAGGAGATTGAAACAGA
AGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGAAGACAATG
AAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAGCTACAGga
CACAGTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCG
AAAGTACAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTA
GACTTAAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTATCGGAAATCAAA
GCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgcCCCCATTATGGT
TATTGCATCTTCTATTGGAGCAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAG
AAAGcaacaaaatcaatcaaaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTT
CCTTGGGATCCTATGGAATCCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAA
TTTAGTCGTCAATAAGCACATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAA
GGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGGATTGACTTG
GAAGAAGTTTATCAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACCT
ATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTTG
GTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCTG
TGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGCAATACCATTACAGAA
AATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAATTCGGTGGGC
ATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTTCCACAT
CGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGT
TTAAatgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTT
TAAAAACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTA
TCAAAACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGT
GTGTGGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaat
tattttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAA
GAGCTTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATG
GCAAGCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTG
AAAGGAAGGAGATTGAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTT
TATGGATTCGAAGAAGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTT
AATTCTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAAT
TTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTACAGaGCTATTGGTCTTAACTTC
AGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTAAGACAGAAAAAGTTTCATGTGT
CGGGAATTTATCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaac
atccaaacgcCCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCAGTTACA
TTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatcaaaacataAG
AGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAATCCAAAGCGA
GGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCACATGACTCAG
AATATGATTAACCATGTTAAAAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGT
TCAAACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGTCACAAACAGTAT
GGGACTTTGACGATCGTTACCTATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCAC
ATGGAATATTATAAAGATGTTGGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGAT
CACTGTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTG
GGAAAGCAATACCATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTA
GTTACAACAAAATTCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCC
AACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCT
TCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAAatgaaaacgtttACCTTTATACCA
AATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAAAACGTTCATAATGAAATTCGAATA
TCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAAAACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGG
CGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGTGGTTTTCTTTTATACTATCTCACA
CAAGTTGTCCACAAaccaaaattattttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGA
gactttaaaagaacatttgAAAGAGCTTGAGAATGACCAATGGCCATTGT
TATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAAGCAGCTTTCCACACACTACTGATG
AAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAGGAAGGAGATTGAAACAGAAGACGG
GGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGAAGACAATGAAGACA
ATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAGCTACAGgaCACAGT
GGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAGTA
CAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTTA
AGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTATCGGAAATCAAAGCAGCG
TTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgcCCCCATTATGGTTATTGC
ATCTTCTATTGGAGCAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGca
acaaaatcaatcaaaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGG
GATCCTATGGAATCCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGT
CGTCAATAAGCACATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGAACA
ATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGGATTGACTTGGAAGAA
GTTTATCAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACCTATGTCC
ATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTTGGTATTG
TTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCTGTGTACA
GAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGCAATACCATTACAGAAAATCAT
GACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAATTCGGTGGGCATTTGA
CGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTC
TTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12393MSTRG.12393Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12393.1.p1MSTRG.12393.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12393.1.p1.exon1MSTRG.12393.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon2MSTRG.12393.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon3MSTRG.12393.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon4MSTRG.12393.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon5MSTRG.12393.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon6MSTRG.12393.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon7MSTRG.12393.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon8MSTRG.12393.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12393.1.p1.exon9MSTRG.12393.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:875656..885798 +