MSTRG.12393 (gene) -

Overview
NameMSTRG.12393
Unique NameMSTRG.12393
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12393 ID=MSTRG.12393|Name=MSTRG.12393|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10143bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:875656..885798+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAA AACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAA AACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGT GGTTTTCTTTTATACTATCTCACACAAGTTGTCCACAAaccaaaattatt ttgtaaacCTGGTCTATGGTGTGAgactttaaaagaacatttgAAAGAGC TTGAGAATGACCAATGGCCATTGTTATGGTGTTTTTGGCCGTTATGGCAA GCAGCTTTCCACACACTACTGATGAAGCCACAACATTTTGACTTTGAAAG GTAAGTCGTTATAAGGTATATTTTCAGGGAAGGGGGAATGTGATATTTAC GCTTGGCACTATACGTTAGATCAACCAAAAAGGTTGTGATTTTCAAACCA CCAGAGTATTTTGTCTTCCTTTCCAATATCCAGggtatttgtttttgttg agaGCGACATTCTAGAAATTTAAGTTCGCGTCAGAACTCTAAAAAATGTA CATAATGTAATCTAATATAGCCGATCCAAAAACTGCATAAATAACTTATA CTTTGTATTTTACAACTTTAACCATTTTACTTGTCTTTAGGAAGGAGATT GAAACAGAAGACGGGGGTTCGTTCACTTTGGATTTTTATGGATTCGAAGA AGACAATGAAGACAATGAAACCAAGCCAATTCTTTTAATTCTCCCAGGAG CTACAGGTTTGTGAAACCAATTATAAATCAATCACTTACATTTGGAAAAA ACGTGAAATTTGAGTATATATTAGTTTGCTACAGGTGTATGAAACCCTTA TTCAATCATTATAAAACCCCCCTCCCAAGCCATTTGTGTGATGTgatgat agggacttttttccagtgtgattacgtgatttggaaattatttctttgtg attgcgtgatcagagtTCAAAAAGTGATtgtgatttgttgttttacgtgA TCgcgattgaagacaaaaaattgcgttaTATCGTGAGTTACCACTGGGGA GCCTCTTATAACGTCAGGACGAAGCATTAATTTGGGAATTTCAGCTTTCG CAATcgcattcaaaattttactgaTGTTTCGAGGTGGTAAATAGACGTGT GAAGCATAAAGCATTTTCCTTTCAAAAGTAATCGACTACTTGCAAAAATA TCAaaggggggggtttcacttttacggtatgacggtattgggccttttta cccccggtaaatcggtattacgagaaaaaaacgacgggattacggtattt cattttctaccggtatcggtaaattgcctggttttttgtcggtatttcga tatttttatcaataaaaaacggtatttcggtataaaactatttacctttt agtttcttcatgagtttcatggagaaaaattttcaaaaaagataagtcta ttccgctattttaaccagtaaaattttcttgctcgcttcactcgcacaat cttggatgttctattgacttattgtcatggtaaggtttttcaaaataagc agaactttacgatatctaaacaaatgttttcgttatttttctgcgggcga attttttaatgacaacttttgtgatgcaaatactgcatccaacgaaagag tctagataaaattttctccatcagcactaaatgatatggtcgtctctccc AAAGAGAATATAAAAACCAAGCTTTAGCTTTTAAAGTATCTTTGTcttca cttatattgctactacaatacaatacactgatactgcagtaacttagaga cagtaaaggcggtatttactccttcaatgattagtaaaagtaggtagttc taaaaacatcttgtgcagcatcgaacgattaaaaaataattcacatcatg atgcacatgatgcgttttcaggcaatctaggcattctaaattttaaattt tttcttgggcgaaactcttaGGACGcggcaccgggtacggcaggtacgtc gctcacCGTACCATATTTTTAGCAAGTAAGTAACTTTGGCACGGCAGACC Gaaaatattgctttataaaagctcaaatagctgtaaaagagaccttaaaa agtcgacaaaacgcgagaataaggtcactaaaactagcaaaaaactttat atattggcaaaaatgtttggtataagaataggtcaatctgtttaaaagag accataaaaaggtttaatttagcccaataaggtcacaatctccaaccaaa gatgtaaaagctaAATTGGtgtgtgaacgtgaaaatattttttttcgcgc GTTAATAAGTGAATTGGcaaatttgtgcgtgaatacctgagttgagggtt gactgggggcctcataaagtacaagacttgtttgtacagtttctaatttg ttactacacaatacatttgataactgaaaattgattattttcgaaaaaaa aacataaatttaatatcggtatcggtattaggcttccttcaccaacggta ttacggtatttaacccaaaattttgtcggtatgacggtatttaagacccc tgaaacccccccccccaatcaAAGGCCTTCAAACTGGGAAAATGGAATTT TAGGTTATTTTTCATTGAGAGTCGAATAAAGAGCTGTCAGGGGATACAAG GGTGTCAAATATTTACCGATTctcctttttttttacatttttaggaCACA GTGGCAAAGTTTATGTTCGAGAATTTATTTCAATAGCTTTGAATCGAAAG TACAGGTTGGAGTCTTTTGAACTTCTAAAACGTTAAACCAAAAAGTTATT TAACAACTCATAATCTTCTTAAAATTCAGCTACTCCAAGCTCTATATTAT TGTTTTTAGTTGTCCTTAATTTTTacatctacaatcatggtcgatagctc atttcctcgtttttcgaaatttggagttccggcgagaaagtcgattttgg gccatctctcaaatttaatcggatatttcaatttggctcgggtttataga cctccaggctatattatgagccttattggaccatttttgaactttttgat ccTCGGATCCTAAGCTCctcctaagttttaagtctcatgttaaaactcag agttaaaactctacccttccaacctacttcagagcacttacaaatcgatt gtggttcaaaacttcccggttgatttcctttttttctcaaatattacgac catgattgtagtcacAGTAAAGTATAGCATCaaagtaattaatttttttt ttcactcagaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTA GACTTAAGGTAAGATATTTTTCTggtgatttttatttttcaaaatgtggt TCAAAATGATTGATTGTTTCATCAGCCTATATGAATGAAGTTTTAAAAAT AGGTTTTAAGGTAAATTTTACAACAGTTATTTTAAGCTTTCTTCTAAAAG TAAgaaactaccttattacacgaatattactaggcaagtattcaaacggc cttgaaattaacactccaaaaatttaaacaaattttatttgctttttcaa ggttGGTTGTAATTAAGGGGATTTTTAtcaacacgaaatttttcaatagc ATACCGTGGcgaatttttgtaaaacgtcTTATCCTCTagctttgagagaa attttaaatttgatcgccgttttgggggccacatacgattattacttctc tcatttgaccgaaattcaatcccgtcaacctttgcgttaatcatgcttgc acgcaaattacactcaattacaaagaaaaagtaataactttcacgatttt tgaattaaaacaaaaaaggattatGGGAtggaatttcggtcaaatgagag aagtaataatcgTGACATTTGCACGACGAAGCGctattcgtgttaataaa atggctacagtatgtggcccccaaaacggcgatcaaatttaaaatttctc tcaaagctagaggaaaagacgttttacaaaaatttttcttgcatgcaaaa ctttaacatctctactttatttcccgacagttctttttcaaaattttcaa ttttaacaatatttttcaatcgcttaaagacaggtagcttttttctaatg gcccccaaaacggaggtttgcaattttagcgatttctcgtgatatcttta agatattaatacaaaattttgaccatagttttgaaatgtgatttagaggg ttttgggcataaattagtttgataacatttttacaaaaccaggttgtcaa aatgcaggtttggggcccccaaaacggaggtgtagttaaaatcaaattat taagcccagtggtaataggggggaaaactatgaacatatttgtgttttcc cttaaatttacgacccgatggatgtaaaatttatgatttttatgaaatat ttcaagattttcgatattgcaaagtccaaactgaaaatttagatattttc aaaatgacaattttaatttaacaatgtcttaatcaagtttttgaaaacaa atctcttttgaaaatagttccattcatgtatggaataagctgtgaaaatt ttagaaaaaaagcttaactgaaactgaaaatatcaagctttaaagatatt tttctcctatattttgcagaaaatgacagaatttgccatttttgctgatt cagcgaaaattgttatatataatgttaattttttgttataagctattaac tcaacctgataggaatggaattccaagattttttgctgtttttcatattt agaattttcggttttatcaatgctgattctagggtcccaaaatactggtt gacctttaagatgctatatcttttacccatcctctaaattcacagatgta tctgcattttctgaacggcattaggtgtagaaagtttcctataccccatt ttcataacttattttcaatatccaaggatatagagtgagttatatgcaat ttttatctaattgtGGTGTTAAAATATCTCCTTCATACGCAAATATGtca ttttgaatctgtctcaaaccatcaaaaacatgctcattttttagtataac catcattctttctaaataaacaaaaatcgtttaattctgataaatctaca agtcagaatcctcattttataatgacaacctccgttttgggggccgtctc cgttttgggggccatatactgtagtaacattcgtgtaataaggtattttg tttgaaaatctaGGGATTTTGAACCATGGCCAGTTAATATAGGGTAGGAA GATTGCCCAGTTCTGGGTGTGGGCGGTCAACATTGCCGTTACCCAACGTC TTAGAGTATACATATCTACGCCCCTGATGTCTAACAGCTCTGGTGAAACT TTTCCCACAGTGgagataaaattttctattgaaaaacccaatggggataa aaattctagtGCttttttttGGTGTAAAAATTCAGTgagaatggttttgg agtgcaatttttaagcattgaattttgagtagggatgaaatcaaagtcaa tttcccagtggggatgaaattgcAGAGTATTCTTCTCACCGGGGACGaga ttttggttgaattttCAGTGGGACTGggctcccagcgggtctgtgacaca ggggtgtataatcATTTCAGACAGAAAAAGTTTCATGTGTCGGGAATTTA TCGGAAATCAAAGCAGCGTTCAAACATATAacaaaagaacatccaaacgc CCCCATTATGGTTATTGCATCTTCTATTGGAGCGTAAGTTGGTTTTATTA TAATTCCATGAAATTTAGGACTTAATACAAGTTTAATCGACACGaagtag tttttttctgatttttttcgtTGAAAACTGCAAAACTATATTGTTACTCT AGAAATGGCTCAATGGAAAAATCTATTTAGCATAGCTGAAAAGCTCTTGC CATCTGTTTCTTTAAAGCAACTAAggaaattttgatcaaaatttagtCGT TCTGAGCTAATAACTAGTTGGATGGGGAGGTAAATGATCTTATTCAGTCT TTTTGGGAATTTACCGTGTAAGGTTCACAGGATCTTAAGACTGGACACAG GTCATGCTCGGTCAATGGCTAATTTTTTCACAGCCGCAAAGGAATATGGA GTGGCTTATGGAGTGGCTTTGACCACCACATTATTCTTTACCAGTTTTTT GTGTTGGATAGATGGTTTCAGCACGGAAAAGCATTTCAGATTACATCATC TCCTATTCAACAAAAAGATCAATTGtctatttctttgatttttaccTTAT AGAGTTACATTCACAAATTACTTGGCAAGAGAAAGcaacaaaatcaatca aaacataAGAGCTGTTATGCTTCTTGGCGTTCCTTGGGATCCTATGGAAT CCAAAGCGAGGTTATCGGAATTTTGGATCAATTTAGTCGTCAATAAGCAC ATGACTCAGAATATGATTAACCATGTTAAAAGGTCAGTTTTGATACCCTG GGtaccagaggccaagttttcatagTGAAAATATTAACCGATAGTTATTC GAGCTCTGATACTCACGGAACAGTTTTGGGCCCTGACGTATTAGcgattt tttatgtatttgtcttgcacttttgaggacggaggagttataccgtgaaa agcacaggtcgaaatcatatatcgacgctgttccgaccaatccagattct attcaaccatggaggtataaagaaagacaggagaagtatgctattgtaac caagctcgccctacgattaaaaaagttacgatgtatgcatgctcataatc tcatatatcgtgcatttttaatgagctcttttatccataggttaaatctt attggctcatttaagctttagaaattagatgagacgagattcattgtttc tgacatcagtgtaagaaaaatattggactaaaaaaaggcctgtgaacttg gcaatccttcatcaaatgataagatttttcgatcaatgttttctttcagg tgaactctattgcttgatactttcctccaaaattctccagcgactttatg tctacaaattgactctgaaatcgtgtgtgcttataaagaacttttcattt tctggcttgagaaaatatcttttcaaaacaaaattgaacggatagcgaaa tggaacataaatttgtttcgtggacgaagttttatctaattttcgtatat taaaaggctagaatcttcaatactgattattagaatgttcagagcaaact tgagttctactaaaaagtcttatttcatcgggcgagcttagaatttcttt tgattcattttataaaagaaatcaaaagactttaacgaccaattaccgac acattcaactcctgttttctttatacctctatgattcAACGCACAATCAA Cgaagagaaaagtaaccatgacgaccatccaagatcttggatgaggttca aagttgatatttttattgccgtcgttgaaaacagaactaaaaaaaaagtc atctttgctttttaaaaagagtcagtgatagagaatcataacataaagtc tgtctattatttctattcaattaaagtgacatttccataatcaaaagttt agtaattactgttatacatttggggatcatgtaaaagatttctttcgaaa ggaACTCACTTCAAtaacacttggaggtttctggggaattcgtaaatagt aaactgcatactgatacagtctgctagacattaatatggtaatatttcct cttcatctttgattttttctacagtgattagattgacacatgcgcgataa aatttctatgatACTTAGGGTAGAGGAGTTATTGAAGGGACTTAAGGGAC TTTCTTTTAGGAACAATGCAGTTGTCGAGGATAGTGTTCAAACGCTCGGG ATTGACTTGGAAGAAGTTTATCAGGTAAGAATAAAAAACGAAATTACTGA CCACGATTGACAACTTTAATCAATCAGTACCATTCAGACTTTGTAATAAG AGCACGCTATCTTCGTCTGTTTAAGAGTATGAGAGGCAAAAGTCGATCGG CACATACCACCCTTAAAACCCCAAAACCTTAGTATTTAGGGCGTCAGATG GGCGTCATGTCGACGATAAGtttcaatttgactgtccttttcttttgttt tgactctattttgtttttgacttttttttgtttttgtatttttcttttct gccttctattttcAAGTCACAAACAGTATGGGACTTTGACGATCGTTACC TATGTCCATTATATGGTTATAAAGATCACATGGAATATTATAAAGATGTT GGTATTGTTTCGTTACCGTTAGAAAAGATCACTGTTCCTGTTCTTGCTCT GTGTACAGAAGACGACCCTCTTTGTCGTGGGAAAGGTAAGCGTTTTGGAT GTTAAAGAACAAAAGAATAAGTATAGAAGTTTTTCATATTTGgtaaaaac acccccttctcacagacccggtatgatttttttcagccagtagggGTAAA AAACATAagggactgaaactcgatggggattgatatttccatattttttt atggctgacgatttaaattttttttgttttcaagtcaaattcAGTGGGAT GGGAAAAAAGCGTTATATTTTGCAGTGatgattggtttattttattattt tcagtgagaacaaaaattggaggataattttccactggaaccatattttg gccaatttttccagtgggtctgtgagaaaggggtgtgtaAAATTACAAAG ACCTGAGTTATACGATTTACGGTTGAAATTATTATTCTGAACTTTCTGGC TGATACTGAAAATATACTTAAATCTTGACTTTTTCACTTTTAGCAATACC ATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAAT TCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGA TTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAAC TAAATCTGTTTAAGGTGGGAATACcttagggaagaaattttggccggaat ttaatttggcgggtagctgaaaaagttttttcagagggaattcaATTTAG AGAatggcttgaaaaattaaattttgtatgggaattcaatttggtggatg aaggatatttttggccaaaaatgataaaaataccTGTTTCATAAGACCTG AAAGAGCACACATTCGAGAATGAAtacaataatttaaatttgCCGGGAAC TTACTTTggccaaatctgccaaattttctttccgccaaaatttcttccct taagggtATATAAACTTCTGGATTTTGGGCGGTTTTTGATCCTTAATCCC AAAGACGCCACCTCCTTGTTAATCCTTCCTGAGCATACCCTGAAAGTCTC AAAACTTTAGCATTAACATTACTTATGAACCGTTAGTGTTATATATTTCC CTTGGCAACGGAATGTTGCTAAGGCCTCATTTCCAGATGGTCTCCCACCT TAGCCTTTTTATTTGTGGCTTCTAAGgctcaattttaatttttaaataac tagaaatcagaaatcaactGACAGGAACATTTCCATGACGTTTTCCTGGA AAAAGGCATCCAGTAAAATTTATATTCAAAAGATTTATAAGGTTATTAAT AATACTAATATTGAAAGTAATTATTATACCTTTCCTGACAATTCGATCCA CAAGTTTTTGAACAATATACGATGTGTCCGGGAAAAGAAAGCGAAACAGA TTCTATACTCGAGTGAGAAAAAGAGCTAATTTTTCTAATCGCCTTCTTCT CTTAAAtattttagccttttttccagGTCCAGTTCAAGTCCTCTGTATAA GTTTTGAAATAGTCCTAAAAAAGTTGTGACGGGAGACCCTAGGCTAAGCC CCTTCTAAAAAGGAGAGTTTACCTTTAAAAAATAGCGAGATTTAAGGTCG AGAACTACTCTATATTTACTACCCAGCTACAAAcagcataaaaataaaaa cttcagCCACTAAATTGTTTATATAATCAGTAACATATATTATGATAAGT gcattttttgtagtttttatttaatacaatagatattttatgtacaatag atatttatatatttttgctgACATTATTGTATATGGAGTataaaacccgg ggggggggggcagctgggcaaaaggaccgacgggtatgtgcgg
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12393.1.p1MSTRG.12393.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.12393.2.p1MSTRG.12393.2.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.12393.3.p1MSTRG.12393.3.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:875656..885798 +