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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000092_pilon:978578..992375+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12320.3.p1 ID=MSTRG.12320.3.p1|Name=MSTRG.12320.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:978578..992375+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTactgttttttaataaaacaggCATGCAAAAGGGACAATAAAAAATGTG
CtactttttatttatatattatgGTGTTgctttttgtgttttggttggCG
GTATTGTTTGTGGCGGATGGTTTGGATATGAGCAACACCCCGGTGAAGCA
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CACAGTTATTACAGCCATTATGCTATGTTGCAATGACGGTTTAAGATTAA
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TATTGTTTTTGTCTTTACCTGTCAGCATCCTAAGTATCTGTCGGAAGATC
ATCGATTGGTTAATCATTAGAATGAATATTGAACCCTTTTTAAAGAAAGT
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CACTTGAACTTAACGTCAAGTATTTAGCTTCAGtaaatgacaaaaatatc
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ATCACTCCcttacttaaaggttttatttttacataagtgctcctgtttca
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tgctccacatccatgtcaatccaGTGTTAAAAAGCTtgcgaattaaaatt
gatgagtaagcaaacgatatcactcttacttAGAAACACAACCtttaagt
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CATGAATTATTAACGCATCTTTTACAATTTACTAACACAATacaacgaaa
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TCTATGTGGTCTACTTTGAATATCATAAAAACTAATATCTATATAAGATT
TTAGCTCTAAGAcaatccaaaaatatataaacaatgCTTTGATTCTTCAG
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ggcaaattttccaTTGGGATTCTGGCGTCCCACCGGCTCTGTGAGACAAA
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AATACTCCTTTGTTGCACaaatgtacgtctttaaaaaatgaatggaaaaa
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TCTacagaaagaaagttcttgtgtgtctttattcactaaatttgcaatgt
ttatgaacgtcatattaattgtcatgagacatctttaATGGATAACTTTT
ACAATAaccaattctcaataactttaacgtcattaaaattgtagagaaag
ttaattcttttaatcataatgactgttgtaaatACAATTACTTTGTTGGT
ATatatttcttacattttgttaaacacacgaaacaaccttctactcagaa
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CTCtagttttcatttcttttattGCTGAAAATACAGCAGCAAGTCCTAGT
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AATCATATCACCTCtcacgttcttttataagatcattacaaattttttga
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GCATTTCATAAAAAGAAATGTCTATATACACCATTTTGGTTTCAAggaaa
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GCTACCTTGTAAacataatcttacaatagacgGATAGTGTAAGTAAtcaa
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TTCTAATTACATATTATATAATTACTTTTTCGTTGTTGGCGGGTGttttt
tttGGTAGTGGATTTGCATATGTATTTGGACATAATATGTACACCTCTGA
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CTTTTGCAGCTATTTGTCGTCACTCAAATGGCTTAAAACGTTTGCGTTTA
ATGGTTCTTCAATGGCGTAAGTAAAGATAAATCTCCCTTATTTGATTAAA
AATCTATTCATTTCGCCCTTCGAAGCAGAGGGGGTACGAGATTTTTACGT
CGAAATCTCGAATGGGGAGATGTCATCTTCAATTTTGGAATCTTGGCAAA
ATAGCACATTGAGATCGAAATATCTTGAAGTaactaaatcttttttatac
tGAATTTTGcaagtcttttttctttgtcctTTCTACATTAGAAGTTTGAA
TTTAATATAGGCTTTGTATAGTATCATTTGATCTTTTATGTATTCAAAAT
ATCGGCACTTTCTTTTCTCTGATTTAGAATTTTGTTTGGCTTTGCTTGGA
ATTCTTTTGCTGAAGTCGTTGATCTTGAAATCTATTTTCGGAACATGGGC
TGTGTTGTCATTCGGTCACACAGTTATTGCAGCCATTATGCTATATCGTG
ATGACGATTTAAGATTAAGTTTTGGAGGAAGGTATGGAAGAAGGATTGCT
TGGGAAAACAAAATCCAACAAAACATACGAACAGCGCCTGAATTTGTAAC
ATATTGTGAAGTGAGAGAACCAAAACCGatctggaaattttggaaaacaa
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GAATATTCAGAAGATTGAATTCGATATTCAATTTGATGATGAGGAAACAG
AAAAATCATATCAACAACATGTTCAAAATCTTTTGGACGAGTTACCTGAA
ATGTGTCGGAATGGTGAGATCAAAACAAGACGCATAATCAAACTGGATGG
AATCGACATTGATAGAGAGGTTGTCATGAATTTTAGTTCCACAGAAGAGC
ATCCTTGGTTAGTGGTTTTGTCTTTGCCTGTCAGCATCCTTAGCATCTGT
CGGAAGATCTTCGATTGGTTAACCATTAGAATCGATATTGAACCCTTTTT
ACAGAAAGTGACCATCAGAAAAGTCGTTTCAAACAAAGATATCGAGGTCA
TATAAACCTCAGTTAACTTCATATGTTAAGTATTGTTTTGGACAGATCTG
CATGTTTAACGTGATGATCCAAAACCAGGCATATAAACTCATTTTTCTGT
TCAACTGTAAATACATTCAGCCTTTAAACAATAGAGCTTGTTTCATTAGT
ATAGGACTTTTAGAAATCAACAGACGAAACCTGGTAGACAATGAAGACTc
agtagaaagttttatttaaattttttctttgtaattttttgtttatatta
atGGTAAATGCCCCCTTATCCCCCGGGGgtaataaatttttctttaattc
gaactaataTGTTGTCCTCTCAGCTAGAAATAAGTattaaatactttcta
taatttgattCTTTCTCTAATTAAATTATCATATTTGACTGCAATCTCAG
AGTCTTCTTGGTACTCCTCCGGTAAGCTTTTTCGGAAATCATCAATTAAT
TGTTGGCTCGTTCAAAAATATAGTGTCTCTATTTGctcttcaaaatcaat
tttaaagtttgtaaTTACTCGCCATGTTTTCTTGTAACCTTCAATAGAGC
TTTGATCAGTCAAATCAATACAATTTTCGTAGTCTGgaagtaccttaagg
gaacaaaatttggcggatttggcggatttggtcaaaatcaagttcccacc
aaatttattttttcccgccatccgccaaattaaaattactgcatttattc
ccccaaatgtgtgctatttcagggaTTTTCTTACTTGATTGaagtttttg
gacaaaaatatccTTTATCcagccaaatttaatttttcaagccatccgcc
aaaattaattccctcTGAAAACAACCTGTTCTCACAGAACCGGTAGGATT
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TTCTAATCGccggggatttgaattccattgttttaagaaagaaaattcat
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TAGATTTCATGATCGACGACTTGACAAAAATTGTTCCAATCAAAAGATGT
GCAAAACTCTAAAACCGAGAGAAAAAGAAGTTTATTTACCTATATGAATC
TACTCTATATCCACAACCAGTCAGTAACGCTATAGAGAAATGGTAAGTAT
TAGCTTATCGGGAAATACTTCCCGAACAGGAAGGTCGAAAACATCTTTCG
TTTCCAAATTGGATAAGAAGCAAGTTTCCTGTTTGAGAAAATTGGCTTTA
AGCGCTCCGGAAATGGTCCTAGACAAAAAGATAAATAACTGATCGCCCTT
GTTAAATATATAAATAAGGAGAGTAGCCTCTAAAAGCCAtaaaatgtgtt
aaatcaggaATTTATTTCGTTTTCGAGCATGACGTCTGGGAACTAACTTT
TACTATGGAGAATGGCTATGTGGCTGACTATGGTAGCTCTAGCCCTTTCG
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GCAAACTTCAATCCGCAGTCCTCCcagtaaaattaaaatgtttttatgtg
GCTCTAGGTACCAGATTTAGCACATTGTGCACATAGCCCTCTTCCTTAgg
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GCTGCATAATgtatagtctagcaagctagacgactaattcagacatatta
gaaataaagcaaaaaagtaaattttagtcgtctagaaacctttgtgcact
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CCAAACGTACGCATTTTAAATCAGTTTCGTGGCgacaaaaaaaggcaaaa
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TTTagcgagtctgctaaatcgcgtgccacgcgtgccagcgtgccatcgGT
TTTTaagcgtgccagcgtgccatgcgtgccatgcgtgccttcgtgtcaac
tgtcttggcgtgccggcgtgccagcgtgccaaccGTCTACGCGTGCCAAT
GTGCTAGCGTGCCAATGTGTCttggcgtgccagcgtgcctacgtgccatc
caaattccggcgtgccatccaaattttggcgtgccatccaaattttggcg
tgccatccaaattttggcgtgccaaccaagttttggcgtgccatccaagt
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TCGGAATATACACTTACTACGGTCTCTTACACGGGTTAAGTAGTAGGCAA
GTGAGGGGGagtaagaaaagaaaaagtcaagaaaaatgatGACTTCTGAA
AATTACTTTAGCCCTCGGACAACCATTTAACTAAGCTCCTTATTTTTGGC
TacagctcctgaccacttgatttaaaaaggcaaaaaacgGTAACCATAAA
CTCATGAgctttttggctattttgaagttttaggtttccaaaaaaaaaaa
attccagaaaaaaactttttcaaaaggtttcagaatgaaaagctttttca
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AACCGccccccccAACATGGACCCCCTCAAAAATACCATATGTTTAATTA
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AACGAGGTGACAGGTGAAGAATGGTGGCTCTGAGGCgtgaaaaatttaag
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aaagctgaaaatgagattttgctttgtcaagaaaatgacaggtAGACTAC
TGCCTTTCGCGTGGAAGAAACACGTGTATCtccttcaaaacttttaaagt
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ttttcattgcatgacaatctatatccatttgcaccgccagcatcctattg
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tgataatgccattatttacataatttaagtgtcattacaTAAAATAACCT
TGAAAATGCTTTCCCACTAATTTTGAGGgagtccatattggggtccacaA
TGGGGTCCATATTACAGGGGTCCAAGTTGTGTCATCTTCTCCCCAAGCtt
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ggatggcacgccaaaattcggatggcacgccaaaattcggatggcacgcc
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cacgccaaggcacgttggcacgcaggcacgcatgacacgtaggcacgctg
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AGTAGACCAGGCACGCAAAAGAGACAATAAAAATGGGAGACTCTTTATGT
GGATATTATTATgttgctttttttgttttgggtATTCTTATTATGGGTGG
CGGATTTTTTGGATATATCAACCACCCCGCTGAAGCAAGTGTTGCTACTG
GAGTGTATATTGTCTTCCATTTATTTGATGGAGTTTTTGCAGCTATTTGT
CAAAATGATTTCGAATGTAAACGTTTGAAGGTCTTGCAATGGCGTAAGTA
TACATAAAGTTTTATTGTCATTACGCTCTACAAAAGTAAATGTACCAGAT
GCAGCTTTATATTCAATGCATTTTTTGGGCtcccaaaatatttatttttc
attgtcatCAAAAGCTATGTGTGTGATGCCAAGGAACTCAATCTGGTACC
CAGAGCAActtacaaaactttttaattttactgggAGGACTGGATTGGAG
TTTGCAAAGACCTTTAGTTCATTTGAATTGATCGAGACAGAATTATATCG
AATTGGCTAGAGCTACCATACTTAAAATTAGTAACTATGGTCATGcccaa
aaaagaaataaattccTGATTAAACACATTTTATGACCGCCATTTTCGAT
TTTCCACTACGCATTTATTTCGGGGAAGTAACTGCCaaatcagtgaaaaa
aaaatagacaaaaaaggTATTAAGAAGAGTCTACTCTtcttacttattta
tttaaccAGGGCGAACAGTTATTTGCCTTTTCTCCAGGACCATTTCCCGA
GTGTTTAAAGCCAATTTTCTCAAACAGGAAACTTGCTTCTTATCCAATTT
GGAAACAAAAGATGTTTCGGGATTTTttccaccttcccgttcgggaagta
TTTCCCGTTAAGCTAATACTTACCATTTCTGTATAGTGTTGCTGACTGGT
TGTTGATATAGAGCAGATTCATATAGGTAAATAAAACTTCTTTTTCTCCG
TTTTAGAgttttgttttgctttgctTGGAACCCTTTGTGTTGAGTCGTCG
ATTATGAAATCTATTTTCGGAGCATGGGCAGTGTTGTCATTTAGTCACAC
AGTTATTGCAGCCATTAGGCTATATTGCGGTGACGGTTTAAACAGTTTAG
GATTAACTTTTGGAGGAATCAATGAAACAAGGATTGATtgggaaaacaaa
atcaaacaaaacataCGAAAAGCGCCTGAATTTGTAACATATTGTGAAGT
AAGTGAACCAAAACTGatctggaaattttggaaaacaaGAAAAGTCATTT
GGAGAGAATATAAGACTTTCAAATATAAACATTGGATTGATTTGAGCCAG
ATTGATGAAGTTTCGATTGAGAATATTGAAAAGGAGCAGAATATTCAGAA
GATTGAATTCGATATCCAATTTGATGATGAGGAAACAGAAAAATCATATC
AACAACATGTTCAAAATCTTTTGGACGAGTTACCTGAAATGTGTCGGAAT
TGtgagatcaaaacaaaaagcatAATCAAACTGGATGGAATCAACATTGG
AATCAACATTGACAGAGAGATTGTTATCAAGCTAAGTTCCAGCGGTCTTG
AAAAGTTTCTAGAAGAGTATCCTTGGttagttgttttgtttttgcctgtC
AGTATCCTTAGCATATGTCGGAAGATCATCGATTGGTTAATCGTTAGAAT
GGATATTGAACCCTTTTTCCGAAAGGTAACAATCAGAAAAGTTGTTTCAA
ACAAAGATATTGAAGTCATATAAATCTCACTTGAACTTCACGTCAAGTAT
TTTGTGGACAGATCTGCATATTTAACGTGATGATCCCGATCCAGACATAT
AAAATCACTTTTCTGTTCAACTGTAAATAAATTTAGCCTTTAAACACGAG
AACTAGTTTCGTTATAGGGGCCGCCCACATAGTACGTATGCActaagg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:978578..992375+ >MSTRG.12320.3.p1 ID=MSTRG.12320.3.p1|Name=MSTRG.12320.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:978578..992375+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGCtactttttatttatatattatgGTGTTgctttttgtgttttggt
tggCGGTATTGTTTGTGGCGGATGGTTTGGATATGAGCAACACCCCGGTG
AAGCAGTTTTTGCCACTGGAGTCTATATTATCTTTCATTTGTATGATGGA
GTTTTCGCATCTTTTTGTCGCCACGAAACTGATTTAAAATGCAAACGATT
GAAGGTCCTGCAATGGCAgttttgttttgctttgctTGGAACCCTTTGTG
TTGAGTCGTCGATTATGAAATCTATTTTCGGAGCATGGGCAGTGTTGTCA
TTTAGTCACACAGTTATTGCAGCCATTAGGCTATATTGCGGTGACGGTTT
AAACAGTTTAGGATTAACTTTTGGAGGAATCAATGAAACAAGGATTGATt
gggaaaacaaaatcaaacaaaacataCGAAAAGCGCCTGAATTTGTAACA
TATTGTGAAGTAAGTGAACCAAAACTGatctggaaattttggaaaacaaG
AAAAGTCATTTGGAGAGAATATAAGACTTTCAAATATAAACATTGGATTG
ATTTGAGCCAGATTGATGAAGTTTCGATTGAGAATATTGAAAAGGAGCAG
AATATTCAGAAGATTGAATTCGATATCCAATTTGATGATGAGGAAACAGA
AAAATCATATCAACAACATGTTCAAAATCTTTTGGACGAGTTACCTGAAA
TGTGTCGGAATTGtgagatcaaaacaaaaagcatAATCAAACTGGATGGA
ATCAACATTGGAATCAACATTGACAGAGAGATTGTTATCAAGCTAAGTTC
CAGCGGTCTTGAAAAGTTTCTAGAAGAGTATCCTTGGttagttgttttgt
ttttgcctgtCAGTATCCTTAGCATATGTCGGAAGATCATCGATTGGTTA
ATCGTTAGAATGGATATTGAACCCTTTTTCCGAAAGGTAACAATCAGAAA
AGTTGTTTCAAACAAAGATATTGAAGTCATATAAATGTGCtactttttat
ttatatattatgGTGTTgctttttgtgttttggttggCGGTATTGTTTGT
GGCGGATGGTTTGGATATGAGCAACACCCCGGTGAAGCAGTTTTTGCCAC
TGGAGTCTATATTATCTTTCATTTGTATGATGGAGTTTTCGCATCTTTTT
GTCGCCACGAAACTGATTTAAAATGCAAACGATTGAAGGTCCTGCAATGG
CAgttttgttttgctttgctTGGAACCCTTTGTGTTGAGTCGTCGATTAT
GAAATCTATTTTCGGAGCATGGGCAGTGTTGTCATTTAGTCACACAGTTA
TTGCAGCCATTAGGCTATATTGCGGTGACGGTTTAAACAGTTTAGGATTA
ACTTTTGGAGGAATCAATGAAACAAGGATTGATtgggaaaacaaaatcaa
acaaaacataCGAAAAGCGCCTGAATTTGTAACATATTGTGAAGTAAGTG
AACCAAAACTGatctggaaattttggaaaacaaGAAAAGTCATTTGGAGA
GAATATAAGACTTTCAAATATAAACATTGGATTGATTTGAGCCAGATTGA
TGAAGTTTCGATTGAGAATATTGAAAAGGAGCAGAATATTCAGAAGATTG
AATTCGATATCCAATTTGATGATGAGGAAACAGAAAAATCATATCAACAA
CATGTTCAAAATCTTTTGGACGAGTTACCTGAAATGTGTCGGAATTGtga
gatcaaaacaaaaagcatAATCAAACTGGATGGAATCAACATTGGAATCA
ACATTGACAGAGAGATTGTTATCAAGCTAAGTTCCAGCGGTCTTGAAAAG
TTTCTAGAAGAGTATCCTTGGttagttgttttgtttttgcctgtCAGTAT
CCTTAGCATATGTCGGAAGATCATCGATTGGTTAATCGTTAGAATGGATA
TTGAACCCTTTTTCCGAAAGGTAACAATCAGAAAAGTTGTTTCAAACAAA
GATATTGAAGTCATATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000092_pilon | genome | sc0000092_pilon:978578..992375 + |
|
