MSTRG.11859.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11859.3.p1
Unique NameMSTRG.11859.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:893256..908601+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11859.3.p1 ID=MSTRG.11859.3.p1|Name=MSTRG.11859.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15346bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:893256..908601+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTTTCCATAGCTTTTCAAACAACAAAGTCTGAAAGTATGACTACCCCtg aaaaagatgttgaaaatcaagatgaagaTGGAAAGAAACAGCAGAAGGCT GAGAAGGCGAACCCAGGTGATCAGGAAAAAATGAAGTAAGTACCCACATT GAGTAGttcagaaaacgaaagtgaacaGTCCAGtccagaaaattaaaaat ggcgtcaAAATTTTTTTTGTTAAAAATACGGTTCAGAACAGAAAACAAAA CGTCTTAAGTGTCAGTAATTACTTAAGATATTTTGTAATCAGATTGAAAT AATTAGCGATTATATACCTGCAAACATTAAAGGCTGTGTATTCACTGGGT ATGTATATAAGTTTATTTACTTCAAATTATAAAATCTTGATGATTTTTTA GAGACTTCTTGCTTCTTCTTGTATTGTTTGCTCTTTTATACCCTTCAGCA ACTTGTTTCAGCTCCTTCTTGTTAGTTGCTTGGTCTAATCTCTACAAGCT GTTCCAACTGAATCACATATTGGTCTGTCTCCCCTGTCttttttttATGC AAGAAATATGTTTTGAGCCAGTTAAGTTCCATGCATTTGCCATCCAATAC AATAGGacctatttctatttctatttggttgagttgcaggaggctttaga ggcctattcttgcaactatagacgcttactaatgagcgtcccgtcaacac cttgaactgactacccaattcccctcacatggcatgggttgacccgggcg aaaaaatgttcacttgccaagtgaactgccgtgagtgggaatcgaaccct ggccgcctgcacagaagccaaggtcgactaccactatactacgGCACCCT TAACCTTTTCACCTGTAGCTGTACCTTTCAAGAGCAGCCATCagctagga agtatgaaatatctgttcttgaggtccctttctcctggaaaaaattaTCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:893256..908601+

>MSTRG.11859.3.p1 ID=MSTRG.11859.3.p1|Name=MSTRG.11859.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6936bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:893256..908601+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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aagataaaaaacagttAACAAAGTACCaacaaattcaaaaggaaattttt
catGATGATACTTGGTACAAAAGTTTGGGCGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859MSTRG.11859Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.3.p1MSTRG.11859.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.3.p1.exon1MSTRG.11859.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.3.p1.exon2MSTRG.11859.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.3.p1.exon3MSTRG.11859.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:893256..908601 +