MSTRG.11816.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11816.1.p1
Unique NameMSTRG.11816.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:188700..199855+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11816.1.p1 ID=MSTRG.11816.1.p1|Name=MSTRG.11816.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:188700..199855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:188700..199855+

>MSTRG.11816.1.p1 ID=MSTRG.11816.1.p1|Name=MSTRG.11816.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8415bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:188700..199855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCAAGCGATTGAATTTCGGAGCAGCCCAAGTCTGTGGTTTTATTTATGTC
GTTGGTGGTCATGACGGTCGTGAATATCTTCGAAGCATGGAAAGATTCGA
CCCAGTCTCTAGCGAATGGTCGGTTGTTTGTCCTATGCCGAGCGTGCGCA
GCGGTATCGGAGTCACGGCTGCTCAACATGAAATTTTCGTCTTCGGTGGA
CATAATGGATCACGTTATTTGAGCAGCGCGTACAAATATGATGTTTTTCA
AGATAAGTGGACTTCTATACCTGATATGACTACTGCTAGATGTGACATGG
CCGTTATTTCGATGGACTCGCCAGAAAATTGAATGTTCATTGATCAAaca
cactcacaatttttgctTAACGGACTCTCTTTATTACGCCAAGATGAAGA
ATTATGTGATGTGGAATTGAGAGCTGGTGATACAAAAGTATTTGGCCATA
AAGTTGTTCTTGCAGCTATAAGTGATTATTTCAAGGCAATGTTCACTGGT
AGAATGGAGGAAAGTTTTGTGCGAACTGTGTTCCTCCATGACATCGATGA
GAAAAGTGTTGCTCATTTGGTGGACTTTGCTTACAGTGGGCATATCAGTA
TAAATATAAACAATGTTGAATCATTATTGATATCAGCCAATATTTTACgt
gtttcaaaagttataaaagCATGCTCAGATTTTCTAGTAAGAAATCTTCA
CCCCTCAAATTGTTTaggatttttagaattttcagaGAGACTATCACTTT
ATGAATTACAAAAACTATGTATGAACTTTTCAGCTGAACATTTTACTGAG
CTTGTAAACTATGAGGAGTTTTCATATGCTAGCATTCAAACAATAAAAGA
CATTATTGTACACAAACATCTGAATATTACTTTTGAAGAGGACATTTtgg
attttattgaaaaatgggTTTTATTCGACAAAAAGAATAGAATGATTTAC
TTTGATGAGCTTTTTGATGAAGTTAATCTATCCATGCTTAGTATTCAATC
TCTGGTGGCTTTACTTACACGATCTATGAAAATGAGAAGTGACATTACAA
ACTTAAAATTACAATATATGCTCAATATGAAGCGTAACCCGCAAAGGCTA
GCTGATAAAAATTACCAGAATGGTTATAGACAGAGAAGAGAAAATGACAA
TGTCATTGTCATGGGTGGAAAAGATAGTTATCTAAGCCCTTCATCAACTG
TTAGCAAATTCGACATCAAATCAAACACTTGGAAACCTTGTAGACTCCTC
AATCATGCAAGATCTTCTGCAAGTGCTGCATATCTACAAGATCACATATA
TTTGACTGGTGGTATTTGCGAAAACCAAGATGGAAGAGGCTCAACACATA
CACGATCAGTGTCTTGCTTTACAAACAAATCAGATAAATGGTTCAATATT
TCTTCTATGAGCCAACAACGAAGCAGTCATGTCACTATTACTCATGGGAA
TAAAATTTATGCGATTGGGGGTTATGATGGTCAAATGTCTTTAAAGTCTG
CAGAATGCTATGACCCTTACACTGACACATGGACCGAAACGGAGAGTATG
AACTACCACCGGAGCTCGTTCGCTGCCGTCACCATGGATCAATACATTTA
CGTGTTGGGAGGACATAACACGTGTACCGTCGAACGATATGATACGTGCA
ATGCATGTTGGGAATTGATGCCTGCCATGAGCACCAAGCGATTGAATTTC
GGAGCAGCCCAAGTCTGTGGTTTTATTTATGTCGTTGGTGGTCATGACGG
TCGTGAATATCTTCGAAGCATGGAAAGATTCGACCCAGTCTCTAGCGAAT
GGTCGGTTGTTTGTCCTATGCCGAGCGTGCGCAGCGGTATCGGAGTCACG
GCTGCTCAACATGAAATTTTCGTCTTCGGTGGACATAATGGATCACGTTA
TTTGAGCAGCGCGTACAAATATGATGTTTTTCAAGATAAGTGGACTTCTA
TACCTGATATGACTACTGCTAGATGTGACATGGCCGTTATTTCGATGGAC
TCGCCAGAAAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11816MSTRG.11816Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11816.1.p1MSTRG.11816.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11816.1.p1.exon1MSTRG.11816.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11816.1.p1.exon2MSTRG.11816.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11816.1.p1.exon3MSTRG.11816.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11816.1.p1.exon4MSTRG.11816.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11816.1.p1.exon5MSTRG.11816.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:188700..199855 +