MSTRG.11752.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11752.1.p1
Unique NameMSTRG.11752.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:577354..596641-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11752.1.p1 ID=MSTRG.11752.1.p1|Name=MSTRG.11752.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19288bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:577354..596641- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAATAGGCAAGATACATGGAGAACTAGCCCATAATTTGCAATCAAGACA TATGGACAGACAGAACACAACACTCGCCAGTACGAGCCTTCCTTCAACAA TTACAAAGAGCTCAAGGAAGGCAATTAAAAGGGTACAAGATGATCAAGTA TCTTGTTCTATTAGTCATTATTTTCTTTCTTCATTATGGCACTTCAAGCA TACATAATATCACAATTATGGTAAGATTTTTTTCTAGTGTTTTCTGTGTC CTCCACACCAGACGTCCGCGCTCGATAGGATCGATCATCGGGACGGCTCG ATGACGAATCGATATATGATCGATGGATTACTTAACGATCCAGATGGGAG ATCTAAAACCACTATCTGAGAGAGAACAATAGAACAAATCACCCTGAACG AACTGAATTTACGTCCGGGGTGGTGTAGCGAAAGGATACTTTTTGCCACC GGACAAATACACCGGACAGTCCGGTGCGTTTCGGACAAGGGTGACCCGGT GTCGGAAAAAATGTGAGTCCAATATTGGACTCACAGCTCGAACCCGTCAT CAAATTATAAAAAAACACACGACGGATCTCCTGTCTAGGTCGTCAGTAGT CCGACAGTAAAATTGACTTTCAGCAAGTTTTATTGACTGTCAAGAGCAAA TTCTATAAAAAATCTTTCTATAAAAAAAATATATTTTACATCGACTGTCA ATATTTCCCTTTTTTAAAGTCAATGTTTTGTATTGACTGTCAATATAAGT AATGAACAGTCAATGCAAAAAATTCACTGTTAATATTGACCATCAATATA TATTCTATTAGTTTTCAAGAAAATTGATTGACAGTCAATGTAAGATATTT TTTGTCAATAATTTGCATTCAACAGTCAATTGCTAACCTGTAACCAGTCA ATGAAAAACATTGAACATGGGCCTAATCAATGTTTTTTGACCTATGATTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:577354..596641-

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AAAGTTCCAAAGCAGGTCAAGTTTGATGACAATGCCTGGGCTTCCAATAT
GATCAAGTATCTTGTTCTATTAGTCATTATTTTCTTTCTTCATTATGGCA
CTTCAAGCATACATAATATCACAATTATGATCAACTTATTCTGGATTCAA
TGAAGGTCTAACGCGAGTCAACAGGGCTGATGTCAAAACGTGAGTTGAAA
TTTCGTCCAGTGAACGACAACCCATATCTTCATCTTCCACAAGCAGAAGA
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CAGAAATTTTGAATATGCATGACCTAACAATGATAGGATTTCACTTCAAC
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ACTTTGCAAAAGACAAAGTCTGATGGATTATCTTCTTACATGGATGATGG
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CAATTATGATCAACTTATTCTGGATTCAATGAAGGTCTAACGCGAGTCAA
CAGGGCTGATGTCAAAACGTGAGTTGAAATTTCGTCCAGTGAACGACAAC
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GACAGGTTGACGATACCGTTTCAACTGGTCTGGGTGTCAGAGATCGTTTG
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CATTTATCTGAAGCTGCAAAGACTGACGGGAAAGTTCAAAATTGTGTTAG
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TCTTGAACGTGACACAAACGATCATGGACTCCACCGAAGAAGGAAGTGCC
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CAGACAGTTTTACATCATGGTCAATAAAACATTTATCTGAAGCTGCAAAG
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GAGCAATACTATTGCCAGTCATTTGATCATCTTGAACGTGACACAAACGA
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TGGCAGGCTCTTGGTTGATCTGGTCAGCTTTAAGTTTAAAGTTCCAAAGC
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GTTCTATTAGTCATTATTTTCTTTCTTCATTATGGCACTTCAAGCATACA
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GGGCACTTATTTATCTGCTGGCCAGTTTGACATCACAATCAATTGCCCGA
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CAAAATTGTGTTAGCTGTCGATTTACTTTGTTGTGGAGCAATACTATTGC
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TTCGACCATTGTTTTGATTGGAACTGGTTACTTCTTCATTAAACATGTTT
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AACTGGTTACTTCTTCATTAAACATGTTTTATCCAGCAAAGAGAAGAAAA
TCTTTCTTATTGTCATTCCATTGCAACTCAATTACCATTTCACTGGAACG
AAAGGCATTCATATTGGAACATGGGTCATCTTATATTATGTTATTCACTT
AGAATGGGTTTACAAGATTCATTGGTTGATGGCAGTTGTTGTTTATTTGA
AAGCCTTATCTTTATTAACACATGGGATTCCATTGCCAACGTTATACTTC
TGGTTGAGTTTTGCATTTTTCATTGCTGCAGTTTGTTGGACTGTCTACCT
TAGAAAGAGAAGTTGAAAATCACAGAGAGAAATCAGGGCACTTATTTATC
TGCTGGCCAGTTTGACATCACAATCAATTGCCCGAATCAAGCTGGCTTGT
ACAACTTATATTTCCACAACTGCATGAATTACGATGTTGCAGAAGCAATC
AAGATAGATTTGAATTATCAATGTAAAGTTTTACTCAAAAGAAGATGAAG
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GCCTTTCGTCTCAAAGAAATGCCATGGAAAGGAATCGAATGAATCTCAAA
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AATGATAGGATTTCACTTCAACTTGAGTGCTGCAAGGAAAAGAGAATCCA
AAGAACATCCTAGTTTGGATTTACTTTGCAAAAGACAAAGTCTGATGGAT
TATCTTCTTACATGGATGATGGACGGAAGAATATTCCATTATCAACATTT
GGATTTTTTGAGAATGGCAGGCTCTTGGTTGATCTGGTCAGCTTTAAGTT
TAAAGTTCCAAAGCAGGTCAAGTTTGATGACAATGCCTGGGCTTCCAATA
TGATCAAGTATCTTGTTCTATTAGTCATTATTTTCTTTCTTCATTATGGC
ACTTCAAGCATACATAATATCACAATTATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11752MSTRG.11752Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11752.1.p1.exon20MSTRG.11752.1.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon19MSTRG.11752.1.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon18MSTRG.11752.1.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon17MSTRG.11752.1.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon16MSTRG.11752.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon15MSTRG.11752.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon14MSTRG.11752.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon13MSTRG.11752.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon12MSTRG.11752.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon11MSTRG.11752.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon10MSTRG.11752.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon9MSTRG.11752.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon8MSTRG.11752.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon7MSTRG.11752.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon6MSTRG.11752.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon5MSTRG.11752.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon4MSTRG.11752.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon3MSTRG.11752.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon2MSTRG.11752.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11752.1.p1.exon1MSTRG.11752.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11752.1.p1MSTRG.11752.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:577354..596641 -