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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000085_pilon:750996..761283- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11671.3.p1 ID=MSTRG.11671.3.p1|Name=MSTRG.11671.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10288bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:750996..761283- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCTATCGTTTGGTTGTGTGTCAAGGAAAACTTCAAACTCGAATGTACGT
ATGTCATTTTAGTTACTTTTTAGGAACAGTTTCAATGTATCATTTGTTTT
GTTTGAAGATTATTGTTTGTTGTTAGATTATGTCATATTTTCTCATGGCT
TGGTTGGTTGTGTTGCTTTTGGAATGACGTGTTGTGTGTTTTGTTTTGCT
CTACAGAGAAGTCTCGCTGTTCATGAAACTCTTTCACTTTCTAAGGGGTT
CGTTCTTTCGTGACATACACGCTTTTTTATAAGAATGTACTTTATAAGAA
TATTCATGATGAAATTGGCCAAAAAATTAAGAATATGCTAAGAATATCAC
CATCATAGAATTTGGCTAGTGAAGCTAAGAATGTCAATGTTAGAGCATTT
TCAATTATAAATTACCAATTAGCCCAAATTAAGGCTCACTACTTTCACAA
AAATATCATTTTATGCTTAAGACGTATGTATTAAATGTTAAATCTAGTCT
GAATTAGGATCCTAACCGTAGAATGTTGTAAGAATATTTTAGGATGATTT
TCCCAAAAAAGTTAATAATATCCATCATGAAATGAAAAAACACTAATTTT
ATAAAAAAACGTGTACACGTTTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGA
ACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACATTCTA
AGGCTTTGGAGACTTAAAAACATGCATTTTCTTAAGAAATTACATCAAAA
TGCTAAAAAAATGCTGAAAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTT
CAAATCCAAAAAACTAAGAACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTTTGACGTT
CTTATAAAAAAAAAAACGTGTATTACTGGGCAAGATCTCAGCCCTTGGGC
CAGACACAACGGATCTACCTTATTGCAGATTTTTTCTGCCATACACCCTT
CCTCTTAAGACCTAAAATATTAGACTTCCAATACTGGCAAGTCCATATGG
AAACAACTTTATGAATTCCTGTTAACTTCATGTCTCTGATATGCAGCTAT
TAGAGGCGCCAAAATGATCGAAATCACATACTGTTACACAGTTTCCTTCT
ACTCAAAATTGTTTGTTAAATGTTTCTTTATTTGTCTTTCTGAGCTTATT
TTTGGAAGAGGGAAAGGATTTGATATTTAATACGCCTATTTTGATGTTCA
CACACTTCAATCGAATTTCCATCGATAAATCAATGCATTGAAATCGTTCT
AATGAATTTGGCACCTTGAAAATCATTTATTTAGTAACTAAACCTCCTAT
AAATAACGGGAAATTCTTAATCAATGTTGTTTCTTGTATTTACTTCATGG
ACAATGAAAAAATGCAGAGTTTGAGCAGTATGATTCTGTCTGCAGAGAGG
GTTTACCATTTCACATTTTTGGCGTAGCATGAAAACCAAGCTAATCCTTT
CCTTTTCGTTTATTGATTTATTTAATTAAAGGTGGGTTTACACGGCATGT
TGTATTTAATATATCTGCTGTGTTATGTAGGTGGGAGGTAATTCTTTCGA
ATGTAGTAATAGTTGAATGATGTGGATCGTATACCTTTTTTGTCAAATAT
CTTTCTGTGCGTGGTTTCCATGGAAACATCGTTCATTGAGTTTTTGGTAC
CTTCGCGTGATGTTTTGATTGAATTCACAAGTGACTTTCCTCTTTCATTT
CATTAACGATCGGATAAAAACAGCCTTTTGCCGGAAAAGTGCCCCTTGTC
TTTATGACATTAGCCCTCTAGTACACTTAAACTAAGAAGTATCATAATAA
CCAAGCCCTGGCCCTCTCATGTATAACCGAACATTCTTGGTTGACATCTT
AAGTCTGCCGTTCAATAGCCTTTTCTAAATGAAAGACTTCTTTGATGAAG
CGTCGATATCTGCACTGATTACAGAATGATGTACTCTCCGAATAGGGAGT
CCATTACTTTTGATAAGTTTTCAGTCCAGTTGTCTTTTCAAAGTGCGCAT
GACTGTTTGAATGAAGTGTTGAGATATTCACTGATTACAGATGTTCTTCC
CGAATTCTCTTTAAGATTGGGTGGAATGTGACCCACATGGCGAATGTATA
ACCAGTACCTCCATGATTGGGATATGTACTTCAAAATATTTCCGGAGTGA
TTCACATTACGAGGCTTGCTCTTAGTGTATATATATCTAAAGTTTTTAAA
CTCTGCTATGGACCTTTTAACAGCAAAGCTTTCAGCTTAAGTTTACATAC
ACATAAAACCATTGACGGTTTATGTAAAAGTTATACGATTTCTCTAACAA
GTTGTTTAGACCACAATATTTCGAAGTTTCAAATCAATTTATATAAGGAA
CCAGCTTTGATTTGATAACATCCTTAATCTTTGAAAGGACATACACAAAA
CCCCTTTTGATCACGAAACTCTCGAAACTCTGCTCTGGTATGCGTACTGT
CAGTAGCTCTCTCCTGACCTTTTATTCGGTGTTAGAGAAATAGAGGGATA
GGGTGGGCGGTAAGTTGTCACAGTTAGATGAAGGGGCTTCAGGTGCTACC
CTTAGAAGCGAGATATGAATAGACTCATTCTTATTTGGTTTTAAAGAAAG
GTGAAAGGGGTTGTATGCGTTTTAATATTGGTTTCTTTGTCACTTCAATA
ATAATTAGAAATGTTTTATGAAAATGAAGAAGAAAAAGAATTTATGATGA
TATCGCGATATAAACTTTTGTTTTCATCTTTGCGCTTCTGTTTTGTATAT
TGAATTCTTCCTTCCTTCTTTCGCGCGCGCTGAAACTTCAAAGATCATTT
TCTTCAGACGAAAATCTGTGAGATATTGTGGAAGAAGAAAATTTTGAATA
AATCTTCCGACGGTTTCGAGTTGAGTATTTTATTCGATTTCTTGAGATTT
GTTTGATGATTTGTTTGCATGTTTCTTTCATAAACTCGAGGAAGAGATTT
TCATATTCAAGAGATATTGCTATTAATATGTCAGCCGGTTGTCTTGACTT
AAAAAGAAGCCTCTCGGGCTTATGTTTTGAAAACTTTCCAACAGACTGAT
TTTAAGTTCTCTGTAAGAGAAGTCTTCAAGATTTACCGAGTGGGAAATGA
TCGAATTTTTCTTGCATTCTCTACACTCGTTGAAAGAAATCTTCAGTAAG
TCAAATATTTAATTTCTGTTTTAAAATGCTTCGTATTGAAACGTTTCTGG
TAATGTTATGTCGTTCTCGTTTAGTTTTTCTCGGCTTTGAGCTAGTTTTT
TTAGCTATATGCGATAAGCTCTTCCTTCTCAGGCCTTGTTGATTTGATTT
AAGCTACCTCTCAACTATAGTAAACAATGTTTTTGGCTTCTTATCAATCC
TTTGTTTTGTTGGAGGTTTGGCTTGACGAAAAATATTTCAAGCTTTTTTA
TTCAATTTCAGTTCGTGATGTTTTTTGAAACACTTTTTAATTCTTTGTTT
TTATGACTCGTATCATTGCATACGTCTTTAGCTCGATAATTATACATCGA
TAGGAAATTGAAGAATTTTATGAAGTATTTGTGACGACGATACTCGTTCG
GTCTGTATCAGAAAAATGCTCACAATAGTACTTTGAGCATCTTTCATGCA
TGAGAGAATGCATTTTAAGATGATGCAAAGAGCTTGAGATGAGTCTAGAT
GACGAATATATTGACCACTTTGTGGCAGACCAACCTCCTTCCTGATATAC
TCATGCACACAAGTCGAACAATTTGTCAATATTCTATTCCAAGACATCAA
AACACAAAAACCATTGAAAGAAGAGGAGGGTGATTCAATGAGGTCAAATT
TCAAAACATCATTCATGATGCTAAAATGTACTTCAGATAGAGACAGAATG
GAGAATCCTACTTCATATTTCACTCTATACACGTTTTTTTTATAAGGAAC
CTTAACTTTGCTCTGAGGCTGGAGTTCCTTATTTTTACAGAGAATTTCAG
CTTCAAAGTTCCTTATCGAGTTCCTTATTTACATAGCTTACTGTTCCTTA
AAACTTGTTTTCTTATTCTCAGCCTGAGCAGCTCCTAAACAATTCCTTAT
TTTTTGGACCATTTTCAGCCTCGAGTTCCTTATAAACGTGTTCCTTATAT
ATATAAAAAACGTGTAGATCACCAAAGAGTGTTTGTCCCGTACAAAATCC
TTTCTTTTGCAATGCAGATAATTCGATAAACATTTTTTTATCTTTTTGTA
GCTTGACCTTTCTCTATACCTCTTGTCATTAGATTTCGCAATCACCTTTC
TTGAGCATTTTTGACACCATCATTTTGTTGCCCCATTTTTATTGAGTTTT
TAACAACTATTATAAACCCTGCCCCTAGCAAAACTTGAGATGATTTGTCA
AAAAAACCCTTAATTTTCAGGAAAAGTGACTTTTAAACTTAACTTTTAGC
TTATTTAGGAAAAATTCCATTGACCTTCTAATCGGAAGGGTCCTTCCTAC
TGGCTTCCTACACGCCCCTGTATCAATGATTGCTCTACTCAATTTACTTC
CACAGAATATAAATATCAAAATGTTGGACGGTGGAGTAAATTATCAGATT
TTACAATTACATTTTAGTATGATAAAGATCTTATACAGTGCTTTCTATCT
CTCAACAACAAAAGACAGTCGGTCAAATTTGTCGGTTTATTACATTCTGA
TATCCAGGAATTGAAATCTTTTTAAGATCTCTGAATGCAATTATTTCTTT
GGCTCCTGTTCTTAATCCTATACGTTGACTACGGATTTTCATCCAGCTCA
TATTTTCTCTCTTATAACCTTATTTTATATCCTGCTAGCTATTATGACGT
CATAAATATATCGACTTTGTTTTTGATGAAAATCAATTACAATTTTTTTC
TGCTTACAAGTTAACACAGTGTCTGATTAATTTCTCCTGAGATTCCATGC
TGTTATTTCGTCATCCTTCTGCGATGACAAAGAAAAAAAGTGCTCTCTAT
ACAAAAGCTTGTTAGAATGAAATTGTAAAAGATTGAAATTGGTTGTTAGC
CTTTGCAAGTTCAATATTTTTTACTCTTTGAAAGATTTGTATGGTTGATG
ATTTTCTACCGGACGATTGATAGATATTTTTTTCTTTCGACTTTTTTCTG
AGGTAAGATATCACTTTCCGTCTTATCTTGTTCAGAAAGCCTCAAAATTT
TCTTCTTTTTTTGCAGATCTTTTAATCCATGACAGGTCTGCTACAGATGA
ATTTACATTTTTGTTCGAGTTGTTTGGCATTAAGCTTACCAGTAACCGAC
CTTGCGGTTTACAAACTTTTTACTTCTTTCTGTAGAAAAGAAAATGTGTT
TTTATGTAACATGCTTTTGAAGTTATGAGATCATTGGCATAATACGGTTG
TTGATGCAACACTTCCTTATGTGACTCTCGCTATTTGGATATTTTATCAA
CCTTGTAGTCTTCCTGGGCTTCAATGCGAAAATCTTATTTATTTCTAGTA
AGCCGTAGGTTAAGTAATATCTCGTATGAATAACACCTGATTTGTGTCTT
TCGGCAAAACTTTGTCAATGTCCTCTCGAACATGTCGTTAGTTTTTGTCT
TGATCTTTTACAATATATTGAATTTCGATAATCCTTTCCAGTCATTCATT
AGTCATCCATCTCAAGATGTGTGTCCAAGCTCTCTTTATATCTCTTTTAT
ATTTTTCTCTTTTTACATTTAAAAGTTTTAATGGAAACATCTCTGTATAT
TGTCTCCCTAATTTGAATGTCAAGCAGAATTCAATATTCAATAATCTTTC
GAATTGCAGAGAATTTGAGTTATAGAGAGGCAAATTATCCTGGTTCGAGT
TATAGAGAGGCGAATTATCCTGGTTCGAGTTATAGAGACTCTACTATACT
TCCATTGTTTAACTTATTCTGTATCAAAAATAGGAAATATTTCTGAGGGA
AAAGCTTTTGCACCGACAGAACGTGACGTATAACAGTCTGTCCAGTCAAA
ATTTTTTGATGAGGAAATGAGTTTTAAGCGGTCTTTCTTGAACAAACTAC
TCTTCCTTTTATAGATTCCTGGTTCAGTAATTAATTTCGATCAAACTTTC
TAAACTATATACCGGGTGCACCAAAAAAAAGTATACAGGTTTGTCGAGAT
ATTGTGAGCTTAAGGATTTAAACTTTTTGTTCATTCTTTTTTATCGTATA
GAGGATGCTTTAACTTAAATTTTGAGCTATTATACATTAAATTTGAAAAA
GTAGTTCGAAAGTTATTTAAAAAAAACCATGTCGAAATTTCAAAAAATCA
TTAAAAACAGCAATCACGCTATAAATAAGACAAAATGACAAAAACACAAT
TTCATTGTTTTTCTGATTTTTTTTTCTTATTTATATTTTGCCAAAAGTTT
CTTTATTTTATTTGCACGTCATGAATATTTCCAACACGAGCAAACTCAAT
GCAGACCCAAGTTCTTTGAGCAACTAGTCTCTATACGATTAAAAAAGAAT
GAACAAAAAATTTAAATCCTGAAGCTCACAATATCTCAACAAACCTGTAT
ACTTTTTTTTGGTGCACCCGGTATACTATTTTTGTTACTTTTGCTTGCTA
CCAGTGGATACCCCTTAAAACCTACAAAGCTGGGTTTTGGACTCTCTTAA
CCACCAAACTTAATCTAATATTGTATAATTTACTTTTTTACAATCTCTAA
TATAAGGCACTTTCATGAAATACCTAATTTCAAGAATTTTAATCGTCGCA
AAGTGTCGTAAAATTTATTATTAAAAATTTTATTAAAGACCCCTTCAAAA
AAATTAAGTTTTTCGGACCTAGAGATTACACAAATGAATTTAAGGTCATA
AAACCTATACTTTTTAGGTACCTTTACTTATGGTAGGTACGAAAAAATCA
TTTTCTTCTCCATTGTTACACCCCAAAGAAATCTGTCCAGTCAAAAATTT
TTGATGAGGAAATGAGTTTTAAGCGGTCTTTCTTGGACAAACTACTCTTC
CTTTTATAGATTCCTGGTTCAGTAATTAATTTCGATCAGATTTTCTAAAC
TATATTTATACTTTTGCTTGCTATCACTTCAGGGGGCTTTTTTAAAGATT
TTGGCATCAACAGCGTTGAAATATTTCGATTTCCATCGCATTTTCTACAA
ACTTCTTGCCAACCGCACCAATTGGCTGATGAGGAAATTGAAAGATTCTA
ATGACTCTCCTTTAGATGGGACCACCCTTTCACCTCTAAAACGAGAAGAT
TTGCTCAACAATTGACAAGATACAATTTGCGAGTCAGTTTTGGATTTAAT
TTGTTAATGATGTTATTGGGTGGTTACCAGACCTCCTATTGATTGATTGT
TTTCGAAAGTTTTTTCACTGATTAATTTTTGGAATGAAGAAAAAAAAACA
AGTTTTGTAATTTTGGCAATCTAGAAATTTACTCTTTGTTCGAACACAAA
CACAAATTCAAAATTGTCATCGAATTTCATTATTATAGCTTTGTAGGCAT
TGACCTCCAAATTGACTTTCATTTTGAAATTTGAATCTTCACATAGACTT
TCGGAAGAGTTCTACCTTCAGGCAAATCAATCTATAGTATCTGAGAACTT
TTTAAGGGTCAAATTTCAGTCTGTTTGAAACATTAAACATTAAGAAGGGG
CTTTTTGGAGTATCGTTTCGTCATATCATCGATAACTCGTACATTTGTCT
GCTGACGTTTGCAGTGTGATTGATAAGTGATTCTTAAAGCGATTATTGTC
ATCAGATTTTTTACTGATTTATGATTTCGCATGTGTTTCTTTAGAGTGGT
CATGAGAAATCTTGTTTATGTCCTTTCAGCAAATCTTGTTATTGCTACAA
GTCGTGCTGTTGGTGTATTTTCCCTTATGATAGTCTACTTGTCAAGACAG
AAGGGTCTGGAATAAATATCGTTTACTCATATGGCCTGGTTGTTACGCGG
GAAGGGTCCTGTTGCTTCAAACACGCTGAGAAGGCATGAACGTCGTTTGG
CAAAAGAGACTTGAATAGAATCTTGGATATAATTTTTTCTAGCCAGCGAA
CGTGACTGTCATGAGGTCATCTTTTTATTGTGTTATTCTTAAGTTTGATG
TATTTTCATGTGTGGGAAAAAATAATCTCAGTTGACGAGGGATGTACATT
TTGCCAAAAAGATTCATGTCATGAAAGATATTGTTTGTCGGTTGAAGTCT
TCTTAGAGAGAAATTGTTATTGTTGAACACCTCACTCTACAAAGCCTCTT
GTTTGTCACCTCTTGCACTGGTCTGTGGGACAAAGTCCTTCTCAACCAAT
CAGAATTGAGCATTTGACTTCTCTCATCAAATGAGTTGTTCCACTTGATA
CAATTTCTCAAATGACGTCATCTCCGCTTCTCTCAGCGCTACTTATTATA
TAGATGGCAAGACAGCTTTTTGTTCATAAAATCATATTAAATTTGATATC
ACTTTGATAAGCTTATAGACGAGCCAGGAGCTGTTTTATGTCATTTCTTT
GTTTCAAATAATAAGGTAAATGATATGTTCTTGGTGGTCAAGTCATGAGT
ATTTCTCGGTTTGGTTGATGAGTTTTGTAAGGTGCGTAAGGTGTCGTAAC
TGATTGTAAAGTCCAAGCCAAAAAAGGGTTTTTACCTTGAGGAAAACGAG
TTGAACAAGTTTGTGCTTTTATGATAATTGGTCATGATAAGCATGGCGTA
ACTGCATGATATTGTTTTGTTTTGAGAACGTCAACTTTTGCATTGATGTC
ATTTAAATAGTGCATTGTATAACGACCACTAATTATTTTCCTCTATCGCC
TTGTGTTTATAACTTTCACTGTTTGTTTTTATAGGAGTTTATCCAGCAGC
CGTTGATTCAATCACTCTACAACACGAACTTGAAGAAGAAGATTATAAAA
AGAAGAAAAGACTTTTCATTCCTTGGAGCAAACGAGCTTCTTTCATAGCA
GCTACTTATATAGAGAATCCTGAAACACTCACTCAACCACCTGTAGTTAC
GACTTTCCAACGTCGAAAACAAGGACGTTTCGCATCTTTTCGTCGTACAC
GATCAACAATCACAACTGAAACGACCACACAAAGTGTTTCTTCGACCAGA
AAGTTCAATTTACGGCGCATGAATAGTTTAGATCGTAATACGATACGATC
GTTTCGAAGCAGCGCGTCCACTTTACGGAGACAAAACAGTGAGAATAACG
CTACTTGGAAAAAGAAGAGAATGAGCTCGGTTTCTTCTCTACAAAAACAA
CAGAGCTTTGATGCTGGCTCGATAAACCATCGGGACGCACGAGCTCTTAA
ACAACGAAAAAGTAATCGCTATAAAGTAGATGGCGCTCAAAGTTTCTTTG
ATAGATACCAAGATACTTTACGAGTTGATATGTTCTCCGTTGACTTGAAT
AAACTGACGATAAAAAGCAATAAAAGTGACGGTTCATCGACCACAAAATC
CGTCACCCCTACGACCCCTCTCACACCGAACTCTACCGACGATAAAGACT
CGGTTTTCGATTACAGCGACGAACATTTATCGAAAGAATTTGATTACAAA
CTTGTCGGTAAAACGTACCAACAACTATTTTACATTCGTTCAAGGCTTTC
AGCGAGTGCACGTAAAACTGAATTTATGTGTGATGGTTCGTTTGGATGTT
CTGCTTGTGATTTGCAATGTTACCCTGAATGGACGAATTCGTAAAAACTT
GAACAAGAGAAAGTGGTAGAATGAGATAATGTTATGACTTGTGGATCGCC
TTTGGTGAGATAAAACGGTGACCTGATTCAAAAAACTGTTTTTCTTTACG
GCAAGTGACTATACTTGAAACTAATGAGCGTGAGAAACGAAAGTACAATC
CAGTCTATAAGATCTTGTTTGTTTAGAAGGTTACCAAGGGGTCAATGGAC
GTTCTCAGTGAAAATGTTTTTGATCTCTCTACTTGATCCTAAATGAGGAA
GGAAATCAATTTATGGAATTAAAGAGAAAAGATGAACATAAATTTCTGAT
GGACTGTCAAGGAATTTTCTGTCAGCCATGTAAGTTGTTACAATGAATGT
ACGAATTTTCCTGTGAATCTTTATTTTGAGATGTTTCGATCTCAACTGTC
AAGTTACTATCAATATGAACCTTTGCTAACTAATTCATAAAAGAATTCGC
CATTTTACAAGAATTTCGATTTTTGTCCGAAATATTATTTATATCGTCCG
ATGTCTAACAATATCTGTAAATATATTTTTCGCAGTAATATTTTTCCTTT
GTAGTCATTTTCTATTGTACATAAATACGGAAAATAAATTTTGAAAATTT
GACAAGATAAAACACATACAAACTAATTTAAAAACAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:750996..761283- >MSTRG.11671.3.p1 ID=MSTRG.11671.3.p1|Name=MSTRG.11671.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:750996..761283- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATAGTTTAGATCGTAATACGATACGATCGTTTCGAAGCAGCGCGTC
CACTTTACGGAGACAAAACAGTGAGAATAACGCTACTTGGAAAAAGAAGA
GAATGAGCTCGGTTTCTTCTCTACAAAAACAACAGAGCTTTGATGCTGGC
TCGATAAACCATCGGGACGCACGAGCTCTTAAACAACGAAAAAGTAATCG
CTATAAAGTAGATGGCGCTCAAAGTTTCTTTGATAGATACCAAGATACTT
TACGAGTTGATATGTTCTCCGTTGACTTGAATAAACTGACGATAAAAAGC
AATAAAAGTGACGGTTCATCGACCACAAAATCCGTCACCCCTACGACCCC
TCTCACACCGAACTCTACCGACGATAAAGACTCGGTTTTCGATTACAGCG
ACGAACATTTATCGAAAGAATTTGATTACAAACTTGTCGGTAAAACGTAC
CAACAACTATTTTACATTCGTTCAAGGCTTTCAGCGAGTGCACGTAAAAC
TGAATTTATGTGTGATGGTTCGTTTGGATGTTCTGCTTGTGATTTGCAAT
GTTACCCTGAATGGACGAATTCGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000085_pilon | genome | sc0000085_pilon:750996..761283 - |
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