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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000085_pilon:386037..401767+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11642.1.p4 ID=MSTRG.11642.1.p4|Name=MSTRG.11642.1.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15731bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:386037..401767+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttttttttaagttagaaaaaattattgtatAAATTTGTAAGATGAGCG
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TTATGACAACTTTCAATGAGTTTGCTGATTCGTTAGAAGTAGGTGGTAGC
TTCAAGGGGGTCGAACTGCTAGAAGGACAGATTCTAAGCAAGAAAGGAAA
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gccgtcccccacccgctcattaatttttggggaaatgtttttgaaagttc
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aatgtttccaaccccccccccccgcttattccaaaccccccggctattag
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ggggggaaactaaaaaactgaaaagtcatagggggagaaaaaaaGCAAGG
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CGAAAGGAGGACCAGAAGCTATCGCAGAGTCTTTCTATAATTGCATGCGC
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AAAACTTGCGTGGTGCTTGCCATCCGTTGAAAATTGTGAGAAGATCATTA
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atcactttaaaagggtcacccccccccctcaaaattttcgggTATAGGCC
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tcaacttggagagggaatgtttgtaaacattgaattttttttcatagcag
ttatatTTGGGGGGTGGTCGGATTTAGggagggctgtcggatttaggacc
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GCTGCAGTAGGTGCAATACACCGTACAGTAATAGGACCAAGCCAGAAGTC
TGTTTTTCTTGTGGTTTTTTCCTTGGTGGTCACTTCAAAAAACCTGAAAC
TGCTCAGAAAGAAAAAGAACCGCTGAAAGTTGAGCTTTATAGCAAGGGGT
CGTCAACTTTGTTTACATTCAGGTCTACACCCAGAGGAGATAGACAATTA
ATCATCACttcaaataatttgaataaatgtttttttgaacAATGTTGTGA
ATTTAGAGGTGCCTCTGCAAACTCTGGGAAAGTAAACAAATTTTCATGCA
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TTTACTAATATAATGATTGACAATTTTACTCCTGACGTGAAATTGCGGTC
TGAGATGAAATTAATTCAGTCACAAAATATGACCATGCCCACATTGTTTA
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TTATTAATGGGGTATAATCACGTAAACCGTTTGGCTGGACAGAAGTACTG
GTCTTGCACCAGGAGAGAGTGCAAAACTAAAACAGGACGAACAAAACAGG
TATGAAAATGTTACATTGTGCTCCTCCGTTCATGACCCCCATGCATGATT
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CTGTAAGaggcaaaagtcaaaaaaaatttgaaataagggGGGACTTGCTC
CCTACTTGAAGGGGGAGTAATCTTGTCCCTTTCTGatccaatatttttta
ataatgtatgagctaaattttgaaaattattcgcgctcgcttcgcttgca
TAGAATTATTTTGCCTTGTATACAAAAGCTAGccttttattttgtattta
acTAAAAAGCCCTGTGGGACTTAAATCAGAATGAAAAGAAAGCGGTTTTT
TAGCTAATAAATAAAACGAGACAGTCAAAATTGGATTAAAAATTTTTGCT
CTGTTGGCATAAGTCACTACCGTAAGGTTACTTAAATGTTGTCAAACTTG
ATTTAATTCTTCAGCCATTTTGGAGAGATTGGAAGATTGGAAAGATACAA
GGGTAGAGTCGCTACTtataattttcaattaaaattcaaaaagacatagt
ttgcacccccccctttttaataggggggatgccaactttctggagggcct
ttgtagggggggtaccgagatctgccgaaaaaactaggggggatgggaat
gtagggggggggtcaaataaaaaagggggggacctgaagaactttcaaca
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acgctagttatattctgtcattgttggctcgtgactataatacttcatac
tctttcttgttgataattttgctggtaggtgggaaagcgagtttccttcg
aaacggattttctgtaaaaaaaaagggggggataagatttcattacaaaa
gggggggatggttttatagggggggatgaaataaacctaggggggttcgt
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tgttcgtccgtccgttcgtttgtTTGTTCCTCTCTTCCTAGCATTGCTCG
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gctataaaaatctgattttcttattttgggaaattcccttttgccatatt
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TCATACGACTTTAACCCCCATATAACCTAACAGGTTGATATTTatttgag
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atttgctcagtttttatctgattctcatcaCCAGGTTGCTTGTTTGTAAA
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tggaaaaagaaaaatacaaaggtGGGGTTTGTTGGGACAACAGCAAATTT
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TTAGTTTAACGATTGTCTAGGGGTataaataatctaattgtcaaaggaat
aaaaaatcgaaataaccagggaaaaaataatatattctCCACCCTCACCA
CCACCCTTCCCCAAAGAACAATTTCTTTCTAGAAGAACCCCTTGACtatt
taatatttatttccttttttgtaagagtaaaaattttattttaatttatc
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GATGCCGAACCAAATGAAATTAAAGCGTCAACGTATTCGAAGTCTCTCCT
TGTTCAAATGAAAAGACAAATCCCTTATGAAATGTCACCGGAAATGTTAA
GTGCTATTAACTGAAAAGTGTTATTTGCTGACGTATTCAAATCCCTTTTT
GGAAATCAAgatccgaattaaaaaatgtagaaacAAAAACTGTGGTGCGT
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GTTTTTAGAGATTTCGGACAAATTTTGAAACGAATTCAGAAACAAATTAG
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tgattaaattttttactgtcctttaatttaaaaaagatttttcactttCC
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GATTATGCTTGTTTTGTTTAGGATTGTTCAACATACGTAACAAATTTTTG
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ATTTCGGacctttaaaaatattcttcattgTTCAATAGGAAAGGCGACCA
GaggtttcaaaattcaaataccATTTAGAAATATTGTATGATGGTTATTA
TGGTTTCGAATGTATGACATTGAGAAGTCTTGATGATGTCATATGTGGGT
ATTGCGGTATTGCgggtaaaatttattttggcgacgGCAACGAGAAAAAT
TGTTGTGGCTTAAAAGGTGTAAGTAGCAAATTGTCATTGTcatttaaaaa
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TGACTCATCGAATCCTCCTGTCAGTCCATCGTCAAATGACGCCCTTTCAT
CAAATAACATACAATCCATGACAACTATGCTGGATGAAGTCAAGCTTCAC
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TAAATACGGAAGGTTATAAGAAGAGTGGATACCTAGAAAATCCTCAGAAT
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AGCAGAAATTTTtggggaaagaaaatttggtgtttttgccGAATTTGGCT
AAATTAGGGTCCcgttaaaacaatttttttccgtCATCCACCAAACTAAA
TTCCAGTTTTCTCATATATTTCGTTCGATTTTTCACTATTTAGGCCCTTA
ACTAGTgtaattttaacattttcaattgAGTTTTGAACCTTGAAGTCCAT
CGCCCGTCAAATCAATTTCTTACTTTTAGGTATTTATCTAAATCGTTTGA
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GAAAAGTCTTAAAGTTCTAGGGCATGTATTACAGGAGATGCAATCATGCT
CGAAAAGCTATTCAAAGACGGTAAAATTCAATCAATCGATGATGTTGAGT
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ACTATCCTTGTTGGCTCTTCTAATTGCCATCAATTTGTGAAAGCAGAAGG
ACACACCGGTGGATTCTACCATATTGTATGTCGTCACGGTGTAAGTTTAG
CAATAGCtttttacattttaccccttttgttttttagtctttttaTGtcg
ataaaatttcaaatcgtcGTATTATTTGGCAACCTTCCAGTGGTGACAAC
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tttaaaaacCAATAAGTTAAGCAAAGATACCTCAACCCATGCTCTTACTG
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GAAGAAAAGACTGTTTTAAATGGGATTAAATTTGATAAATGGATAGCGAG
ATTACCACATGTTGGACTTTTAATGAAATGAGACAACAAATTGTCAGCAT
TAACAAATTCAAATTATGCTGTCAAAATTTCCGCGAAAACGGACATGTGG
TTCTCCAGCAAGTGAACATTTGGGGTACAACACGACCAATGTCAATACCC
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CATACAGAAAGAGTCAAATATAAACTGGaataattttgaagaaaaatctg
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GAATTTGTTGTCACAATGTGTAGTATCACTTACTGTGACGAAATGAGCCc
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TTTAATTACAGGTGTTTGCGTTCATAAtttgttttatctttaaagTGTTT
ATAATTTTCTTCTAATTTTAGACAACTGTTGCATCAAAATTTATGGTCCT
TACGGAATCAGTCCGAGATGCTGCAGATTTATGGCTCTCTCTCAAGTATC
CACCTGTCCTTTTTGTATGTGATACGCCATGTACATTTACACGTCACATC
AACCAAAGAAGCCCTGATGAAGCTATTGCATACTGGGGTGAAAATGATGG
ATGTTTTGAAGTACCTACTCTCGGAAAAGATCCAGAACCTGTAAGCATTT
TTTATGATCATTAATTACttatattttgtacttttgaaaatcattagAGG
GACACCCTTAGCGAAGGGAGTGTTATTAATCACGAGCCTTTTATTTATGT
GCCTTTATTTTCAAGCACCCTTAAAATTGGGCACTTATTGACTGTTGATT
TTCGTGTGCCTCATTTTCacctttttcttaaaaattttaatttgaaatgt
tgATAATGAGTGTATGACAGACACCTAATTACTATTCAGATGTTGCTTAA
AAACTACTGCAAAAACGGGTTcatgaatgaaaattttaaattcataGTTC
AGAGTAAATTTTATTCTTTAGAACAAAAGTGTACCTGATATTGTACCAGG
AGAGCATAGCGACTCGAACACTGTTGCACATCTTTATTTGGACCAAAAAG
TTCACCCGGTGACAGGAAAAACACAAAGATATGTCTGTGGAGACCGTTTC
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TGATTTGTGccaacaggcaaaaacagtcaaaaccagctaccaagagtcgc
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TTTCTTCATCATATAATGTATAATTACCTGATGAACTTCTATGACAATGA
AAGAGTGGTGTTAAAGCAGCTGAACGATATCAAAGAAAGGACTGGACAAA
AGGAGGTTGTGAGAGATGAATTTGGACGATTTCAAGTATGAAACCGTGAA
AGTACttttttaggctacttttaatatttttttttggttacaatttgtct
tgtttttttattccaaactcGACCTTCCTCTCAATTGTACACTTGGTATC
TATATCCTCGGGCGACGGATTGCATTTTCTAATTCTGGAGACTTTAATGT
TAAAAtcactttttaatttcaaaaagatttctaCTGGCAAAACAAAAACG
ACTTGCGCCAGTGAACCAATTACCAAAACAATACGTTTAGATATAGGCTT
GGACTGTGTTCAGACCAGAAAGTTGCACAGTAAGtagccatagatttata
aagcccgaagagatagatgtcgtgctttggctgaaaagtgtgccgtggtt
aggtaggaaattctACCGAGGTCACGTAAcattaaaatagaatttcagcg
cttgatcAATCAGAAActttgcgggttttcgaaaacaatagcagcaatat
tttttgcgatattcacttttttttgcttggaagagcttaaaacACGACTT
AAATCTATGATTTATACAGTCTGGGAATTCCCTTCTAATCACATATCttt
ttttATCATAGATTAAATGTCCTCCTTTAAACTTGAAATCTTGTCAGAAT
CTCTCTTGGGAGACTTTGTAACAAAATAAATATCTGGGAATCTATCTGTA
AAATAGTGAATCATGCTCGTTATAGCCTTTAAACTACTAAACCTCCTCCG
ACCAGGTTTAGCTAATAGCTCTcgtatttttcttttataattaACAAAGA
CGTACCCTTGTCACTTGCAAATTCTGATAActtctatttaaaaaattgtg
atGAAATTGTAAAAACTGTTTCTTAAACCAGAAGTAGCTTGGGAATCCAA
GCtaataatcttagaaaaaacaaaaattacgtCACCTCAAAAAGTTCTAa
tattatagagcttggtgcagatAGATTAGTCTggcacagaatgttataaa
cagtctgtgtgtgaacccttgttgataGACTTTCTGATCTttgaaaccca
ggcaaacacacataatcatcTTAACATAAAAACTcattcacaagctctaa
agactttcaaaactactaaaaaccacatcaaaacatcagccagatgtatt
tagacttccagttaacagccattttgtttctaaatgaacttatcttttca
tttcattttcatttgtttctcttttttcgaaattatcaaaatacgCGCGA
gcctaagtaatacgccgaaagctggtcaatcaggccgaacctgcattaca
gggaaaaatctccctgcgggtgagttacctgcgccaagcgttaaacaagc
aacagaaatatcataaactagaatgtgaacaaagtttaacgcttggattc
ccaggctaaacCAGAAGTTTGTTCCTTTTTCAGCTTCGGTCTAGCTAATG
ACGAGTATACATttgaatacaataataaaataaaagaagcaTGTAGACTT
AGCCAGGTCTTCAAACTTCAAACCTAGGTCTTAACTGGTCTGAACACGAA
CGTATTGTTTTTTGtcacgtattttttttttaaatacctgGCATGAGGAT
TTTAGTTTATTTCTCCTTTTACAGTAGAAGTAAGATCGAGTTTGGCGTTT
CTTTTTGCCAATTACACAGTATAGTTACATTACAAGTATCGtttattttc
tattgtttatacgCGGCAAACAACAAAAATTCACTCTCTGCTTTTTAATC
ACATCATATGAACGTAggaatattcttttatttttttttcaaattgctaC
TATTTAATCACATATGGCAGTAGGTTTAAATGCTCCTGATGTATTTTGTA
TCAACTTTGTATCAAATGTAATGGTCAATGATCAAGTCGAACTTTATTGA
CATGCTACTTTGTACacaattgacttcaaataaatacaaacatacataca
tacacacATATACCTTATGCGTGAAAATAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:386037..401767+ >MSTRG.11642.1.p4 ID=MSTRG.11642.1.p4|Name=MSTRG.11642.1.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=678bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:386037..401767+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCATCTCGTGTCTCAAATCAGGCGGTTGTTATTGTCGCTCGAGACGC
CGAAGGGAACGTTTGTCCTGTTCCAGTTGCCGCtctcaaaatttacaaag
aGTGTGAACCAGCATCGTATGATCAACTTCGAGACCAGATGGTGGAGGAG
ATTAAAGAGAATTTTTCAACAGATATCTTTTCGAGATTGAGTGGTGTCAC
AGCTGATGGACCATATCAGACAAAGAACTTTCgctcatttttggtcaaat
atGACAATATCAATTTCGATGATACTTTAAGTCTACCAGTAACCTGGTAC
CCTGCTCATCTTCTCAATCTTGCAGCAACAGATGTGTAAATGCCATCTCG
TGTCTCAAATCAGGCGGTTGTTATTGTCGCTCGAGACGCCGAAGGGAACG
TTTGTCCTGTTCCAGTTGCCGCtctcaaaatttacaaagaGTGTGAACCA
GCATCGTATGATCAACTTCGAGACCAGATGGTGGAGGAGATTAAAGAGAA
TTTTTCAACAGATATCTTTTCGAGATTGAGTGGTGTCACAGCTGATGGAC
CATATCAGACAAAGAACTTTCgctcatttttggtcaaatatGACAATATC
AATTTCGATGATACTTTAAGTCTACCAGTAACCTGGTACCCTGCTCATCT
TCTCAATCTTGCAGCAACAGATGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000085_pilon | genome | sc0000085_pilon:386037..401767 + |
|
