MSTRG.11502.4.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.11502.4.p1
Unique Name	MSTRG.11502.4.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+
coding sequence from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+

mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.11502.4.p1 ID=MSTRG.11502.4.p1|Name=MSTRG.11502.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=24522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACAAAGTTACCGTTGAATTTCTCAACTATAACAACGAAGATTGGTAACC
GAACTTACGAATGTCTCAAACGGAAAGAGATGGTCCAGTTCATCAAAAAC
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tgccaacaaaaatcataaaaaagaaataagtttatactgtacctaaattt
ttttaagcgacgttcttcttcttttctcaCCTTAGCgtctttcttttcaa
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AAACCGACCAATCATTTTACAGCTATGGAAAGTATCGAATCCTTTAAATT
GTTGTTAATGGCTTACAAAAGTGATATTGAAAGCGATGAAGGAGACCAAG
GAAGCTCGATAGAAGATATCGTATCAATATTTGAAGACGGATTTTTAAAG
CAGTAAGTTTTCTTTGATTGAATAAGTACAATTAGTGACTACTCTACTTG
TCTCCCAAATAGGCGTcctccccccgctaattgtcgagagaaaaaaatcc
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tagaccttaaacttgctcaaattttccttttttggacctacctccgggta
ccccggtggaggtcctataaattaaccgttgttcgttcgttcgttcgttc
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tttgttgttgaaattgatatcagttaaacaaaattctgttttcaaattga
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AAAAATTGTGGGGCTTTaaaatcatagatttataaagcccgaaggtctag
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AAAACGTGGCTGTATATCTACGTAATGAGaattattagaattttaatctt
aaattaaccacataatgaataatatacaattaaaataaatattcataaac
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ACCACTGGGTAGCTTTTCTCGGAGGATGGACCATCTCCGGTCGTCTCACT
TCGGCTCTGTCGCGTCACTGCGTCATAACAACTGATTTTCGTCTTTAAAA
TCCGTCTAATAGGTCTACAAAAGTAGATGTATAATATTGCATCTGAGCAA
TACGCAACACATATGGACGCATTAAGGAGCAAACTTAACCAGTCAGGTTC
TGATTTCTTGGCGACTGCAAATCCAAAGAATACAATGTCAGCACTTGTCC
AGAAGATGAAGAAAGAGAAAACGATCAATTTTGGGACCAAAGTTGCTTTC
TTCATCCGCTCTTTGTATCTGTTGGATTCTGCGCCGTATAAATTTTGGCT
TCGATTGGCAATAGTTCTCAACATGAACAAATAACAGCATAGGAAGTTAA
TCAAGACAAGTCCATTCATGATTGGCCAATAGAACAAAGCTTTTGTCTCG
CTCAACTCACTTTTCGATTCTTGTGTAAAATACAGAATCAGTGTCACTGA
GATGGAGATTACAATATTTCCAATAAAAACTAGATTAGTGACCCTGTtcg
cttttttcattttatatttcaaGCTCAACCAAACAAACGCTGCACGGTCA
ATAGTCATTGTTATCAAAATCAACAACAGTTGAGTGCTTAGAAATCCAGT
TCTCACAATATCTAGGTAGAATGCAACATCTTTCTTCGTCACTTTTATGA
CTATCTTTGAAGTGTTCAGTAAGATCTCTATGGTACTCAACCAGAATAAA
TAGCGGCCTTGTATTCGTTGGTATCGCTTCATATAATTTACCGTCAGTAA
CAAGTAGATTCCAAACGAATGGAAGACAATGGGTAATACTCTGAATATGA
TAAAAACAACATCCAGCTCGTCAGCCATATTGAATGGTAAACTGTATTAC
AGTTCAGTGTACTGATTaaaaaaaCACCACTTACAGACTATTGCTTTGTT
GTCTTGAATCCCGTTAGATTCaggttttttttgaaatttctcctACTTTA
GTTTCctcaaaacgtttttttaatcTGACAACTTTGAACTCGAGTGTTGC
TAGTCTTTTTTCCTTTACAATTCAATTTCCTGGTTTCCGTATGTATTGAG
AACTTGTTGAAGTTGATCTTTCACCTCGTTTTTTGCATTAATATAACCAC
AACTTTCTCTTCCTTCCTCTTTATGACGATTAATTAAAGTGCACCTTTTT
AAATACTACTTcgttctaaaaaaaaatatagattGGACCATGCTTTGATT
AGATTGATTGAATTTTAATTGGCTCATGCCTCAGACTCGTTTACATCAAA
GAAATGCAGCATTTTTGTAAAGATAAGATCGGAACGAAAATTATGACATG
GAATGTGCTTCAACGTCACTTTCTATTAAACTTGTGAACTCTCCTCGAAA
TGTATTGGAAGTCATCGtaggcctcgttttcaaattaattgtaatacact
tttacttttttacttttttacaagagcatcaaaacaaaagtttttgaagc
cgtCGGATCTTCTTTGAGTTttattttaagcctaaagaaaatttggtgga
tttggctAATTCGGTCAAATCCGCccaattaagttcccgccaaatttaat
tttttctgtcatccgccaaattaaaatcCCGCAAAGTTTAAGTTACTCTA
TTTATTCtcccaaatgtgtgctatttcaggctttaaaacaggtttttcct
tttttaatggcattttttgacaaaaatatccttcgtccgccaaattaaag
AGCTAACAAAGCCTTTTTGAGTCATCACCTGacttaaagaaaataaaaac
aggaTTAAAATCTAGAGCTAAAAACGTGCATACATATCCTACAACAACTT
CTATCAAATGAAatcagaaattcaaattcacatCTGAACTCTATTTCCTT
CCATTGAGTTCCTTGaacattaaaaattaaaataaattaatGAAAAGTTT
ATGACTTTTGTACTCGTCTCGAGTACTAATGGTTGCTTTTAATTTCGCAA
TTAATAGTGCTTCTAATATCAAAAGATGATATTCTGAGCAGGTTCTTTAT
GCTAAAATTGATGCGCCTTCCATCCATTCATGTGTTTCGCAACTGGCTTT
CGGTTGACCGGGTTCTTTAAGTCAGCTGATCAGATGTCGGCGTGTACAAC
CTACATAGCACGTGTTATAATGTGGACACTGAATTTTATAGAATTTTATA
TTGTCTGTTCTCAAAGAAGAACGTTTATCACAAGATGTCGGTACAAAAGC
CCAAACGTTCGGTACAAAAGCTCAAACGTTCGGTACAAAAGCTCAAACGT
TCGGTACAAAAGCCCAAACGTTCAATAACAACAAATACTAGGTTACGAGG
TCCACAATATTTATATATGTATCTCGAGAAAATTGTATAGAGTTAGGTCT
GAAACAGTTGAACTCATGTTTGACAGTGGAACAAAATGGTTCCGATAATA
ATCACTCATTTACATTTCCTTCCTGGTTTCATGATATCATCTATCACCAG
ATATGGCAAAATCGATGATAATTGAATCTAGTTACTTGTTACCATCTCCT
ATCAAGAAATAGTGTCAAGTCCTGGTTTTTTAACTTGCtcgtaatttttg
tatttgaGTTTTAAATTTAATGTACTAGTTCAATATTTTGTACAAATATG
TATTTAACATGACCAAATAGACTGGGTATCAACTTCTCAAACCGATATTA
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acggtattcctAGGTTAGAATCCGAATTTGACACAAATTTGGCATGTAGT
ACGTACCTGAAgcttaaaatggcatttttggcaagttttaagccttactt
gcttaaagatattcttatatgaaaaagcgtgtaatgtttgaagcattttt
tctcattttctcttCGTTCATGATGGCGCCaccgtttttataagaataaa
ctgtttaagaacacgaggcttccATGGTCTTAACgaaaatgtcaagaaca
agttTAATGAGTATTTTAAGGCTTTCCCGGATTTTTAAACACTTTCTTTA
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aaGAACagtttaggcttaaatctcagaaaagataagaacatccaaaatgc
tTCAACATTTCTCCACGTCAGTaaagctagaatctgacaatgtatgtatg
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ttgttccttgggtgaatatctttATTTATAATCTGAtttaaactcagagt
ttcatggtgctcTGGCACCAATCATAAGTGAGATCACTGATGATTCATTT
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AGAAGATAAAAACCTCTACAATAatatgatttaaaaaagaaatttggtgG
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TTTAAGATAGGCCATAATACTTttccaatcaatcaatcaatcaatcaatc
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TTTACATCCCTACCAATTTTCGACCTTTGAACTACGATTCTGATATTAAT
GTAAAAATCTCCCGAGGTAGATATAGTCTACTAGCATAACTGAAGGGTTT
TATTTGCAATAAGTATATTTGCAATGGTTTCGATATCAAACATCTTGTAG
GCGAGACCTGTTATAGCTATCAATCAAAGGACCTTTTTTGGAGACCCTTC
TCTCCTTGACATATGCTTCCAAACAATCATGTACGCTATTCAACCTAGAA
ATAgggaataataaaattttataaacacATTGGGCGATATTCCTCTTAAT
ccagttttttaaaatttaatttttgaatcAGTTATTAATACTGATTTATA
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AAACCAGGAACTTCTAGGACTTGAAACTAGGATGTTGAAATGTTGGAAAA
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AAATTCGGAGATCCTTTTAAAGTTTAATTCACTCTGCACCAGTCACTTAT
CACCACAGCAAGAATCCAGGATAAGTTAgaagaaaacgagaaaaaaaatg
cCAGATGATCTCAAAATTGTATATACAATTTTCAGAGTATTACCTATTCT
TTGCCATTCGTTTGGAATCTACTTGTTACTGACGGTAAATTATATGAAGC
GATACCAACGGATACAAGGCCGCTATTTATTCTGGTTGAGTACCATAGAG
ATCTTACTGAACGCTTCAAAGATAGTCATAAAAGTGACGAAGAAAGATGT
TGCATTCTACATAGATATTGTGAGAACTGGATTTCTAAGCACTCTAATGT
TGTTGATTCTGATGACGATGACAATTGACCGTGCAGCGTTTGTTTGGTTG
AACTTGAactacaaaatgaaaaaagcaaacAGGGTCACTAATCTAGTTTT
TATTGGAAATATAGTAATCTCCATCTCAGTGACACTTATTCTGTATTTTA
CACAAGAATCGAAAAGTGAGTTGAGCGAGACAAAATCTTTGTTCTATTGG
CCAATCATGGACCAGCTTGTCATGGCCATCTTTCTATGCTGTTATTTGTT
CATATTGAGAACAATTGCTAATCGAAGCCAGAGTATGTTCGGCGCCGAAT
CCAACAGATACAAAGAGCGGATGAAGAAAGCAACTTTGGTCCCAAAATTG
ATCCTACTTTCCTTCTTCGTCTGTTGGGTGACTGTTGGTTATGTGTCGTT
TGGATTTGCAATTGCCAAGAAATCAGAACCTGACTGGTTAAGTGTGCTCC
TTAATTCGTCCATATGCGTTGCGTATTGCTCAGATGCAATATTTTATATC
TACTTTTGTAGACCTATTAGACGACATATAATGAGGAAGATCTGTTGGCG
TTGGTGTGAAGGTGTGACGGCGAACAGTCGAACCGAAACGACTGTAAATG
GACTCTCCTCCGAGAGAACTCAGCCATCTTCTGAAAGACCTCAACTCACC
TCCGAAAGAAACCAATCTTCCCTCATTAGAACTCAACCTTCTCCCGAGAG
GAATGAACTTTTGGTAGAAACGaccttttaatttttattaacgCCTagtc
ttttgtttgtttttctttatgcGAAGTCATTAACCCTTCCACCATCTTTG
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ATATTGATTTAGTGTATACTCTGTAGAATAATTATTACCGAATAGCAATT
ATGTATCAAGTTGTTAGATAAtacattttaatttcaatacTATTCAAATC
TGTGGGAGCAAATCCCGCCCGAAGCTTTAACATGACATTAATCGAGTTCC
GGTATGCCTGAAAAAGACTGGAAACTAGGTTTTGCACCTCGTGTTTTGTT
TTTCGGTACTACTCTTTGTCTGCTTTGACTGTTATGCCCAGTGAGCCTCT
GTCGAAATTTAGACAGTTCATGTACTTGGTATGaaaaaaaGCCCAGGATG
GAATTAGTCAAAATAACAATTGCTTCTATTTCTGAAATTCGGAGTATATC
TGATGCAGACAATACTTAATTTGGTATTCTTTTGATGTTTTCCAAATATT
CTTTCAGTTAAAGAACcgtaaaatatttaaaatattaaataGAGAGGGGA
TCGGGGTGTTACTATGGCTGATcctttaaatttgtattttaattcCATTG
AGCTTGATATAAGACCGTTTCTCACTCCCAGTCAACAAAACTCTACTTTG
ATCGcagttttttttgaaagcggTATCCTAATGACAGCACTACTCGAAAG
AGGTGTAAATGCATTGACATACTTGTCACGAGTTAGTGCCgtttgacgtt
aatttttaacactgcatgCAATGGCCTCTTTGTGGGGTACCCCTTTGAAA
AAACTCGGATCGAAGATGGACGATATAGCTCCAGGGTTTATATAGGTTAG
TGTTTTTCCCCAAGCAGTGAATGTCATTTCTACTGATATATTGTTATTAC
TTTAGGCGTCCAAACTTTTGCGAATCACGACATTAGAATGAAAATTccca
catgaaaaaatggctttaaagagagagaaaaagacttcttggattggctt
gaaacttttttctttcgcAAAAGTTTGGACGCCTAAAGTACATTGCCATT
ATACTATTTATTCAAGGGTTCTCGACACTCAACCAGAATCTATGGACGAT
CACGCTCTCTTTCGTTGTGTTATCTCTCTTTTCAATACTGTGATTCAATG
TGAGTACAAGAAAGATATTCCATCCTTTGACCATTACCTCATGTGTCCAA
CCATAATCAAGATGATTACTGGGTCGAATGGACAACCTCTGGATTCAAGT
ATTGTCAAAGAACAAAGGTAATCCTCGTCTGAATGTGGAATTTTTGTATT
TGACACAACATTAGAGATGAGTAACGTAATCTTAATGTCCACAGCTGACC
AAATTTCTCCCAAATAAATTTccctttccaattttttcctggACTTATTT
TCCGATTAGGTATAGAAACAGATGtcgaaaaaaaacttgtttGCATAAAT
GTAATCTTACACTACCCTTGTGAAGTGTACATGTCTGATATATTCCATTT
TCTATTTGTAGATTCTTAAAGCAATGTATCACAACATGTATTTCATCTTC
TTTGAACTCGAACAAGGGAAATGGGAACACAGCGTCCAAAAcaaatgaag
aatttttatCACGTTGTTGTGACACTATACAAGCCATCTATAAAAATCTT
TCCATAACGGGATCTGAATCTTACTACGATTTACCGTTGATGGAGTTTAT
GATGGAATGTATGATGCATTTAACCTCAAACCAAGGATGGAGTTTGAACA
TTGAAGAAGGGTGTTCGTTGTGCTTGGAAATGTTCAATTGGCTTTCACAA
GTTAGTATTCttaagtagtaagtaagtctgcgaccgcagactgctctttc
gatagctgtctacccgaaggtaggggagggccactctttctccctggatt
gctccacttacccttgatccttctcttaattgctgagcatcaggCAGAGA
GACtagtgttttcattttcaaatatcttCCTGAACCAGAGCAGAGGAATG
TGTCACATTAGAAGCCgcctatcattcctctccgatgcaATGAAATATCG
GCCCgtttctttagagctttagcgtgggcggccgccaatccaccATCGGG
ATTATCAGATATTAAGCGACTGGGTATAAGatttaacttttttctaaaat
tcctTAAATTGAATGTTATTCGGTTTTTCATACAGGTTCTCGTTTCATTT
CACATGGATCGAGTTGGAGCTGCCATCTCTTTCATGGGAAAGGGGATCGT
TCAAAAATGTGTCCTCTGTTTATGTCATTTGCTTCATGAAATTCAAGCTT
TCAGTGGTGCGAAGGTAAAAATTTAGATCTCCCCTGAAATCTTGGAAAAC
CTAACCCGAGATTAGTAGGTACCCGTATATTTACTAGATACACCAACATT
TCCTGTACCTGaactgattttatttttgtttcttatatttccccaaaata
aatttcccattttcaccAAAGAAAGTCAGAAAGTGTTGCTCAAGCTGATG
TTTTTTGGATACCATTTTGAGATAGGTTTCAGGTCTAGCTAAGTTGGAGC
TACGAGTATTTATAGTGCCTGAAATTTATCCCATCCGTCGAAACATACTT
TACCTAGAAAAATTTCACAGTGTAGAAATCGGAAGTTAGTCCTTTATTCA
TTGACCGTAAAAAgataacaataacaaaaataaattattttttttcagga
ttggGCACAAGGTTTAATCTCGGACTCAGACCTCTCCACCTCTGTCAATC
ACTCGCCAACAGTCCTCCCCAGTTCCCCGTTACCATGGCTACTACCGTTA
TTGTCGGACAGAATGATCGATGTCCGTTATTGCGGGTGGGCAGTCAGTTC
TGCACTTGTAACGAACACTACCGGACAGGAAATTGTCGTTAATGAATTTC
AAACTCTTCCTGGAGGTCTTTGGGCAGCAAGTCTTGGAGTCATTTTAGAT
AAGAAAGAATGCTATGCTGTTAGAGCACAGGTGGggtacattaaaggaag
aaattttggtggataggcaataaaattaattttggtgggaattcGATTTG
GTGGACTATGAGTTTGAAGGTTTCGAATCAGtgtgaaaatgttcaaaata
cgCCCATTTAGGGTCTAAATAGTGAAAAATCGAACGAAATATGAGAAAAC
TTAAATTTGGTGGAtgttggaaaaaataaatttcttcctgccaaaatttc
ttcctttaatgtaatcTTCGAATGTCTTGACGATTGTTTTTTAATGACAT
GGTGTTAAAAAGTGTTGGTTGTTTAATTCGTTTTGTGTGGATTTCACATC
ACACTACTGGCGTGTCTACAGTATCCTGAAAAGCTTGAAAGTGAACTCTC
CACTTTTACTACAAATCGCCTCCGACCTATATCGCTCAAtgaattttaat
gaatttaaacgttgaaaacgttgaaaaaaacacaataaatagccaaaaaa
actttcaaaatcaatttgaatttgatattaaaaaaacaaacctcGAAACC
TCGAAGTGTATTACGTGATAGATGGATAGTAACGGGTGAATTCAGCGAAG
ActattaaggccggtctccacttgtgcgCACTGTGATCGCCCCTttgggc
ttcaatcctttttgctttgaaaaaagattacggCATAAAAAAGtagcgcg
cgcttgaaaaaaaagttgaacatatttcaactttttcaaccgttacgtca
gatcgcgccaatggagttgctttaattttcttttgaccaatagcgtggaa
gctttacTCGAAAAAGTGAGATTGAGAGCgcgtgcaagtggagaccggcc
ttaactaTATGTAAACTTATGTGCATTGTTATTTTTTCAGGCTTCGTGTT
TGTTGTCGCACTTGATTCGAACGAAAACATATCAACCAAACGAAAGtgaa
gagaaagaagaatcGAACAGTTTATGGAATAGTATCGTCGTCCATGACAC
TTCGATCAAGGTTTGATTATGCTATTGTCATGTACGAGAATGCAATTGAA
AAATGTTTCCTTGGGCGAATAatttaatgataaaaagaaTAAGCAGAAGC
TTCATGTTTTGATGTTGGTAAAAACTTTATATTCGACGCTCACTACAAGA
GGTCATCTTCAGAGTGACTATGAATGCAATTATATTTAGTGATTTTTAAC
TACTGCTCGGTATTGGTATGATCTTCTGTTGAATCCTTCATGCTTGAAGG
AGTTGAACAATTCCTGtttgggtgtttttttttttcgattgagaGTTAGA
CCATGTTTGCAcatgacggttccgtttcgttTCGAAACGAAAttaagcca
ttctattggttgcATTCAggtgttacgtcacttctaaccaatagaatggc
ttcattccgtttcggagtgaaacggaaccgtcacgtgcgaacatggtctt
agtcATTGTTATCGTATTCAATGAACTGCCAATATCTCCTCTAAgataat
ctcataacagattaTCCATTCTGCGCACACCATGCACACCTTAAGAGGAG
ATGTGGGGATTGTGACGATCTGAACTGGTTGTTCAGTCAAAACAATTAAA
ACTGCGTTGCCGTTTTCTTTCAAAGGAAAGAGAAAGCGATTGGATTCTAA
TATTTATCTATGTGACTGACGTTTCAGTTTTGGTGCGATTGATTTGCTTT
AGCCTTTAGAGTAAAGGTTCCATGCGCTGAGTATTAGAATCTGCTGGGGG
AAGTTGCTCTAAAATCTTATCTTCTGCATatgacttttgatttttcaaat
aatgttttctttagATGGAGGTATCAGGCGTTAAAGCGTTCCTTCTACTT
CTtgatcattttgaatttttcaatgaGATTCGATATGTATTCACCACAAC
TAACAACAAAGATTCTTCAACCTTTCAAATCAACGCTTCAACTTCTATGC
AACGCAGTGAAGAATCTCAAGACACTTCGAACAGGCTTTCAAAGAATAGT
TCAACAAGTGTTAGGTAGTTAAAAGAGTTTaggatatttttatcaaatct
gTTTCTTGGATTAACTCAGAACTCAAACTAGATTCACTCCTGGGTTCACT
CGAACTTAACATAGTTTTAATACATATTAATCAATTAATAACGGCCTAGA
CTTTTCTTACCTGCTTACAAATCTTTTTGAATCCATTTTCGTGTGAATAG
AATCACGAGCCATTTTTCCATCAGCACTTTTATAAGAAGCaataattctt
tattttgacaCTTTTATCCTCAAGCTATACTTATTCTGCTCTTGATCTTA
TGACATTGTTAAAGAATTTTGTACTTCTACCTATTTTTACTCCTTTAACC
CTTTGTTTGCCTGAGATTTAGTTACTCCAGGGTTAGCTTTCTTAGGTTCT
TAAATTTCTCCTTTTTGTAGCCTTTTTGGGCCTCGTTATTCTTATCAAAG
TTCAGTCTGGTCCTGGACGAAATCATTTTTTACTAGcttgttgataattt
taaatttcagtgAGGTGAAGATGGAGAACTCGGAATTATTGAAGAGAACC
CTGTTGCACCTTCTTCGTCAATTGATCAATCTATCTCCACGGATAGTCTT
CCAAAAGCTCTTTGAAAACCAAGTATTTAACACGATATTGAGGTTAGGAG
TTATCTTATtatcttaaattttcttttaaacattTGACATATGTTTATTT
GGAATGGAGAGTGAATTTGTTGTCACCTCCTGGAATCGTGCACTTTACAG
CCCGGCCCAAATTTACCCTTGTTGTATAAAATTAAGCCTAGACTTATGTT
CTAAAATTTGATTGACccgaaattttgaccagtgttACATACTGATGTCT
TTGCAAGCAAAATTTCACaaactttgaattttggatgaaatACAAGCATG
TCGTTAAAATACCTACCACAGACGTGACCAAGCTGAAATTATGCACACAA
TCTTAGATGGTAAATTATCCATCTCTGATGAATTTCAAGTCAAGAGCTCC
AGTGGTTCTTAAAGCAGGGGGGTCGGCttgtattttgcagaccagtGTGC
AGTGTACCAAATGCTCATGGGATCAAATCTTTTGTAACTTATgctctttt
gtttgaaaaatcagCCTTTAGGAACAAATTTTAGCCACTATACAacactt
gtcaatcttgagattttgtTGAGCTCtactagaaaaaaaattgtaattga
GGCGGTGGAAGGATACAACAATTTTCATTGGTTTAACCTACCCCTGATAA
AACTTTGACCAACCCCCCTCCCTCAACCAAGCCATGCCTCATTAATCGAA
CCGGCTTTTCAACCGAACTGTGTCGTACTTTAATCGAGCCTCTACGGACG
TTTCTCCTCTAAtcttactttttaaaatttttccttcCAAGATCACATTT
TCAAGGGAGCTCGGGCGTGATGAATGCAGAAGTATTCACTTTATTGCGGC
AACTGTGGAAACACGATAAAACCCAATGGTGTAGTGTCATTGAACAACAT
GCTCTTTTGGACAAAATTCGCGAGCTCATGACTAAAGAAATTAGCGTCAA
TTTAGGTAAGATTTTCGCCTGTTTCGCCTGATATCTCATTCTCAAATGTA
TTATGGTTATCTTGAATCTAACTGTCCTGAGTAATGATAAAGGTTCTAAA
ATTGGTAAACAAGTTTAAGTACTAtttttttCGCACCTTTTAAAGGTTCG
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TATTATAGTATTTATAATACGAATGATAACATTAAGCAAATATTTATTAC
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GGTTTAGCCCCCACTGAACAAAAATATAATCACCGGATCAATGAAACAGC
ATTTTTGCCTACAGcaaaatac

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+

>MSTRG.11502.4.p1 ID=MSTRG.11502.4.p1|Name=MSTRG.11502.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=57798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1116532..1141053+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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tttcaatgaGATTCGATATGTATTCACCACAACTAACAACAAAGATTCTT
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CAAGACACTTCGAACAGGCTTTCAAAGAATAGTTCAACAAGTGTTAGtgA
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GGGCGTGATGAATGCAGAAGTATTCACTTTATTGCGGCAACTGTGGAAAC
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GTCCATTTTACCAACTTTCGAATCTGTTTTACGATTAATAATGTTATTAC
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CTGCGTCGGAGAACTATTATGTCAACGGCTCATCCTTTTATGGTGTAAAT
CCTATCATTTGAACACTCCTTCGTTGATTGGAAACACGCTGAAATGTTTG
TTCATGTGCAGCGACAGAGCTAAGGAAGTAGCCTTGGGGAAGGGTTTGGT
GGAGACACTTGTTGAAGAAGTTAAAGATCGATTGgtcaaattgaaaattg
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TTTGGACATGGTCAATCATTCATGGAACATTGAGATTAGAATTACTTCAC
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CTATGCTGTTAGAGCACAGGCTTCGTGTTTGTTGTCGCACTTGATTCGAA
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GAGAACTATTATGTCAACGGCTCATCCTTTTATGGTGTAAATCCTATCAT
TTGAACACTCCTTCGTTGATTGGAAACACGCTGAAATGTTTGTTCATGTG
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CATCTTGTTATGATGATTCTATCAAATTCATTGGTAAAATACCAgATCTC
CCTTCCACATTGTTGTCACTGGTGAATCAAAATAACATTGGTCGAAGGAA
GAAAGAATTCTCGTTAATGATCCTAAGGAATCTTATgtttgtttcaaatt
tcaagCAAACCTTATCCTGCAATAAGGACTTTGTCAAGACTTGCTTGGTT
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CCACATGATCATATACGACAATGAAAAGGGAAAAGGTATGCTGCGTAAAG
TACACTTGGAAGCTAAGTTAATAAACCTTCAAGAACAACTTCGGAATGGG
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ATTGATCGAAACTActcttcaaactttaaaatgaatgaaaatcgacGATT
TAACTGTCAGGGTTCTCGACACTCAACCAGAATCTATGGACGATCACGCT
CTCTTTCGTTGTGTTATCTCTCTTTTCAATACTGTGATTCAATGTGAGTA
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AAAGAACAAAGATTCTTAAAGCAATGTATCACAACATGTATTTCATCTTC
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GATGGAATGTATGATGCATTTAACCTCAAACCAAGGATGGAGTTTGAACA
TTGAAGAAGGGTGTTCGTTGTGCTTGGAAATGTTCAATTGGCTTTCACAA
GTTCTCGTTTCATTTCACATGGATCGAGTTGGAGCTGCCATCTCTTTCAT
GGGAAAGGGGATCGTTCAAAAATGTGTCCTCTGTTTATGTCATTTGCTTC
ATGAAATTCAAGCTTTCAGTGGTGCGAAGgattggGCACAAGGTTTAATC
TCGGACTCAGACCTCTCCACCTCTGTCAATCACTCGCCAACAGTCCTCCC
CAGTTCCCCGTTACCATGGCTACTACCGTTATTGTCGGACAGAATGATCG
ATGTCCGTTATTGCGGGTGGGCAGTCAGTTCTGCACTTGTAACGAACACT
ACCGGACAGGAAATTGTCGTTAATGAATTTCAAACTCTTCCTGGAGGTCT
TTGGGCAGCAAGTCTTGGAGTCATTTTAGATAAGAAAGAATGCTATGCTG
TTAGAGCACAGGCTTCGTGTTTGTTGTCGCACTTGATTCGAACGAAAACA
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AAGCGTTCCTTCTACTTCTtgatcattttgaatttttcaatgaGATTCGA
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CGCTTCAACTTCTATGCAACGCAGTGAAGAATCTCAAGACACTTCGAACA
GGCTTTCAAAGAATAGTTCAACAAGTGTTAGtgAGGTGAAGATGGAGAAC
TCGGAATTATTGAAGAGAACCCTGTTGCACCTTCTTCGTCAATTGATCAA
TCTATCTCCACGGATAGTCTTCCAAAAGCTCTTTGAAAACCAAGTATTTA
ACACGATATTGAGATCACATTTTCAAGGGAGCTCGGGCGTGATGAATGCA
GAAGTATTCACTTTATTGCGGCAACTGTGGAAACACGATAAAACCCAATG
GTGTAGTGTCATTGAACAACATGCTCTTTTGGACAAAATTCGCGAGCTCA
TGACTAAAGAAATTAGCGTCAATTTAGGTTCTTTCACCGTGGGATTGCAG
ATATGGAGAAGTGCGGTTGAATTCTTTTGCGTGGCACACCGGAACGAAAG
TTTCAAACCTTGGTTTCACCAACATGCTTTGGAGTTACTGTACTCTTTAA
GCCgcTTCCTTAACACTTTGGAAATCACAAAGAAGTCCATTTTACCAACT
TTCGAATCTGTTTTACGATTAATAATGTTATTACTGCAAGATACCGTGTC
TCGAGATGAAGACGTCCCTCTTGTAGATAAACCGTACAATTATTCAATGT
TTCACAACCAAGAAACAGATACTGATAGAATACTCTGCGTCGGAGAACTA
TTATGTCAACGGCTCATCCTTTTATGGTGTAAATCCTATCATTTGAACAC
TCCTTCGTTGATTGGAAACACGCTGAAATGTTTGTTCATGTGCAGCGACA
GAGCTAAGGAAGTAGCCTTGGGGAAGGGTTTGGTGGAGACACTTGTTGAA
GAAGTTAAAGATCGATTGgtcaaattgaaaattgaatccgCAATTGgtaa
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GCAGAAAATGATGACGTTGAAATTGCATGCTTTATCTCTCTTCCACATGA
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GAAGCTAAGTTAATAAACCTTCAAGAACAACTTCGGAATGGGAAATGTTT
ACTCGAAGATGCTGACTTAAAAACACAAGAACAATTAAAGACATTGATCG
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TTGTGTTATCTCTCTTTTCAATACTGTGATTCAATGTGAGTACAAGAAAG
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GCAACTGTGGAAACACGATAAAACCCAATGGTGTAGTGTCATTGAACAAC
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AATTTAGGTTCTTTCACCGTGGGATTGCAGATATGGAGAAGTGCGGTTGA
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AATAATGTTATTACTGCAAGATACCGTGTCTCGAGATGAAGACGTCCCTC
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ACTGATAGAATACTCTGCGTCGGAGAACTATTATGTCAACGGCTCATCCT
TTTATGGTGTAAATCCTATCATTTGAACACTCCTTCGTTGATTGGAAACA
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GGGAAGGGTTTGGTGGAGACACTTGTTGAAGAAGTTAAAGATCGATTGgt
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TTGCAAGGCACCAATGTGAAGttGGGATTTTTGAACAACAACATTGTAGC
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TAGAATTACTTCACGTGTTGATTGTAATCTCTGCTCACTGTAGAGAAGCT
TGCGTCGCTCTATCAACCACGACATCTCTACCTCAAAAACAATCAATAGA
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GATTAAAGCCAACACACCACAACTTTTCGAGCAATGCTACCAGCTGACGA
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TGGCTTCGGTTGTACGCGTGTGCATCTTGTTATGATGATTCTATCAAATT
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AACAATCACCAAAAGAAAGTCGCAAATCTGCTTTTGTTTTACTGGCTTCG
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gtttgtttcaaatttcaagCAAACCTTATCCTGCAATAAGGACTTTGTCA
AGACTTGCTTGGTTATATTGGAGCAGAAAATGATGACGTTGAAATTGCAT
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AACTTCGGAATGGGAAATGTTTACTCGAAGATGCTGACTTAAAAACACAA
GAACAATTAAAGACATTGATCGAAACTActcttcaaactttaaaatga

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11502	MSTRG.11502	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11502.4.p1.exon1	MSTRG.11502.4.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon2	MSTRG.11502.4.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
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MSTRG.11502.4.p1.exon4	MSTRG.11502.4.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon5	MSTRG.11502.4.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon6	MSTRG.11502.4.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon7	MSTRG.11502.4.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon8	MSTRG.11502.4.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon9	MSTRG.11502.4.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon10	MSTRG.11502.4.p1.exon10	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon11	MSTRG.11502.4.p1.exon11	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon12	MSTRG.11502.4.p1.exon12	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon13	MSTRG.11502.4.p1.exon13	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon14	MSTRG.11502.4.p1.exon14	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon15	MSTRG.11502.4.p1.exon15	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon16	MSTRG.11502.4.p1.exon16	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon17	MSTRG.11502.4.p1.exon17	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon18	MSTRG.11502.4.p1.exon18	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11502.4.p1.exon19	MSTRG.11502.4.p1.exon19	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11502.4.p1	MSTRG.11502.4.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000083_pilon	genome	sc0000083_pilon:1116532..1141053 +

You are here

MSTRG.11502.4.p1 (mRNA) -