MSTRG.11374.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11374.1.p1
Unique NameMSTRG.11374.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000082_pilon:486099..504396+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11374.1.p1 ID=MSTRG.11374.1.p1|Name=MSTRG.11374.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:486099..504396+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000082_pilon:486099..504396+

>MSTRG.11374.1.p1 ID=MSTRG.11374.1.p1|Name=MSTRG.11374.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2910bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:486099..504396+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACAAAATTCTTACCCCATTTCTCAACGCTGTTAGTAGGAGAAAG
TGAGGTCAATAGCCAGCAGCAGAATCTCATTTCAACCCAGTCACCATCTG
ATACGTTGGGCCCTTTAGAACCACCAGCGTTATTCACGACAGCACAACCT
TTGGGCAGTTTGAGCACGCAACAAGCTACATTTACATTGACTGCTGCCAG
CTTACGAGATAACCAACTTGATATTTCTGGTGTTGGTGATTTTCAGATAC
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CAGACAcaacaaattgaaatatcttccATCTCAAATACTGATGAACAAAC
AACCTCAGCCACCACAGACCACCAACCCTCAAAAACAACCGTAAAGAtag
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GACCAGCAACCCTAGAAAACGCTTACGTGAACATATCCGAAGAGTTCATT
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GTTTTCACGTGTAATGTACAATCGGAGCTGAAAGAACACTGTGAGAATAC
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tgttCTCGTCTCAATCGATTTATTCACATAGTTTACGTCATTCTGGGTCA
CGTGATTGGAAATGTGACGTATGTGGATCGGCATTCAAACGTAAACAAAT
CTTAGATCAACACATGAAAAGACATTCGAAAGATCGGAACATGTTCAGTT
GTGATAATTGTAGTAAAGATTTTACAACACGTTCGACATTGAAACAACAT
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GGTCTGCGGtaaatgcttcaaaaattgggCGAATTATAACCGACATGTCG
GTTTACACCCTAAAGTTAATGATACATCATTAAATAATGTCGAACGAGAT
GAGGGTGGTCAAGCTAAAGATTTTAACACGTCTGGAACGGATGATTTTAC
ATGTAATGTTTGTAAATCGCATCATGATACTTTGAGTCAGTTATTAGAGC
ATTTGCAACAACACCAAGTTGAAGAACAAAACGGTGTTGAGACTTCACTG
AAAGATTCCAAGGAAAGGAAATGCGACACGTGTCAAAAACTTCAAGAACG
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TGTGAATGAATACAAAATTCTTACCCCATTTCTCAACGCTGTTAGTAGGA
GAAAGTGAGGTCAATAGCCAGCAGCAGAATCTCATTTCAACCCAGTCACC
ATCTGATACGTTGGGCCCTTTAGAACCACCAGCGTTATTCACGACAGCAC
AACCTTTGGGCAGTTTGAGCACGCAACAAGCTACATTTACATTGACTGCT
GCCAGCTTACGAGATAACCAACTTGATATTTCTGGTGTTGGTGATTTTCA
GATACCCTTGTTTGAACAAACATCTCAGCCTGCTGCATTACAGCTCATTC
ATCAACAGACAcaacaaattgaaatatcttccATCTCAAATACTGATGAA
CAAACAACCTCAGCCACCACAGACCACCAACCCTCAAAAACAACCGTAAA
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CTACAAAGACAAATAAGCAGACAACTTGTGAAGAATGCAGTCGAGACTTC
TCTAAGACCAGCAACCCTAGAAAACGCTTACGTGAACATATCCGAAGAGT
TCATTTAAAGAATGGGAAATTCCATTGTACCGATTGTCCTAAAACATTTG
TATGCAGTCAAGGTCTTCGTGATCACGAGCCGGTGCATAGTAAAGAACGA
AAACATAGTTGTACTTATTGTGGACAGACTTTTCTGCGTTCATCACATCT
TTACATACATACCCGTACACACGaggaagagaaaaatttcagcTGTGAAG
GGTGTGTTTTCACGTGTAATGTACAATCGGAGCTGAAAGAACACTGTGAG
AATACTCACTCAGATATCACAATCGACATCAAGTGTAGTATatgtaaaca
aaatttgttCTCGTCTCAATCGATTTATTCACATAGTTTACGTCATTCTG
GGTCACGTGATTGGAAATGTGACGTATGTGGATCGGCATTCAAACGTAAA
CAAATCTTAGATCAACACATGAAAAGACATTCGAAAGATCGGAACATGTT
CAGTTGTGATAATTGTAGTAAAGATTTTACAACACGTTCGACATTGAAAC
AACATTTATATATCGTACATAATCGAACTATTGACGGCGCTGAACACAAA
TGTGAGGTCTGCGGtaaatgcttcaaaaattgggCGAATTATAACCGACA
TGTCGGTTTACACCCTAAAGTTAATGATACATCATTAAATAATGTCGAAC
GAGATGAGGGTGGTCAAGCTAAAGATTTTAACACGTCTGGAACGGATGAT
TTTACATGTAATGTTTGTAAATCGCATCATGATACTTTGAGTCAGTTATT
AGAGCATTTGCAACAACACCAAGTTGAAGAACAAAACGGTGTTGAGACTT
CACTGAAAGATTCCAAGGAAAGGAAATGCGACACGTGTCAAAAACTTCAA
GAACGAAAACAATTTAAAGAAACATTTAGAAATTCACGGCACGCTGGAAT
TGAAATGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11374MSTRG.11374Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11374.1.p1MSTRG.11374.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11374.1.p1.exon1MSTRG.11374.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11374.1.p1.exon2MSTRG.11374.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11374.1.p1.exon3MSTRG.11374.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000082_pilongenomesc0000082_pilon:486099..504396 +