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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1136.1.p1 ID=MSTRG.1136.1.p1|Name=MSTRG.1136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20753bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTATATGGTTATATGGGATATATGAGTTATGTGTGCGTAATCTGGAATT
TCTAGCTTTTTAAAATCTACTTGCAGAATCTAATGTTTTGAATACAAAGA
TCTAGGGAAAGCAGATTTTGGTATGACGAAAGTCACTATAGACTGTGTCA
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AGGGTTCGTGACGTCATAGTATTCTTTGACATTAATACTGAAACCTACAT
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GAGAATTTCATATTGGTTCAAGAAATTAAATCTAATGATAATCACTGATA
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ATGATTATACACGGTGACGGCGAATTGAGAATCATTAATCAGAGAACAAA
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AGTGCACTTTTGTGAAGCTTGAAAAAAGCTCCTTAAGGCCGTACGTACAG
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TCTCACTACACCGCTGCACCAGATCAAAATACAAGAACAGCAAGCATAGT
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ATGATTTACACGTACGGTTCATTATATAATGAGGATGCTAAAAATTATGA
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gaaaatcaacaataaaagcgcctaaaaagaaagaatttattTGTACTAAT
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TATAcaacttgaaaatatttggtACCTGAAAACGTATGAGATTTTAAAAG
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tccgctggtcagggtacctttttaaacctccacgagtcccaggtagggtc
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ggaaaatttggggaaaaagtagaaaatttgagaaaattttggaatttcag
tcccattcagggtcacttttttcgcaaatttcgagtcccacgtagggtcc
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gaaattgaaaatcaaccttattcatttaaaaacaatctAACGTATCATAA
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GTGATGCAGATAACAAAATCTATCATTTTTATGAACATGCGAAAACCTCA
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CGAAAACGTAAATAAATACACATATTGGACCCCCTCCTCCAAAAATAGTT
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ATTTTCGAAGTTTCTTTCCTTCCTTCCTGAGCAATGattattttatttac
atttttaatttgatcctttaaagaatatttcattttcgatttttcagcaC
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AAGACTAGCGAATTCAgctttacaattttttttcaaacggtatttctttc
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TTCTTATGCTTGTTTGCTTTTTTGCACAAAAGGCTTCGAATGGAATAaat
taacatttaaaggctttgtgCACTCAAGAACAtgcaaaattcttaaaaaa
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ttaataaaatcttattcaacattttgaaattttgataactTTATACATCT
CGTCATCAATATTaggaaatttttaattattttgaggGGAGTCTCTAAAC
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TTAGCGACCCggtaaatttgggttatcgagtttatttAGTCTTTCCTCCA
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ttacttCATTCCACCTTTACCTTCAAAAAATAACATGTTTTACAGTCCGG
ATAATAAAAGGCTCAAAACCGAGAAATACACCATATACTACTGGCTCACT
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GAGcacccagggggggggcacCTAGGCTAAATTGGTTACGGGACGTGGAG
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Gggcaattttcagggtggaaagtagaaaaactttcaatttttcgtctatt
ttcagtcatttttgcCTCGAAGTTTGCCACCTTTCGGAATGCAAAtggga
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TAACCATTGGTCCGATAGATTCAATGACCCTATGAATAGCAAGCTTATAT
GAAAAATTCATCAATTACAAGTCATTTTAGAAGAGCTGAGCTAGATATTC
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ttttcaaagaatatatcaacccacagatatctgtaaagcccgaagggcta
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aaatagcgtttgccgcctacgttttttgatctcgtgctccgaaaacaatt
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gcttcacttttttttgctggagaaagcttaaagttgcctatctagccctt
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TATCGTACATGtctcaatctaatcactgtagaaagaatcaaagatgaaga
gcaaatattaccttattaatgtttagcagactgtatcaataTACATGTTT
ACTATTGATGATTTCCCAAGAAACCACCAAGTGTAATTGAattgagtttc
tttcaaaagaaatcttctacatgattcccaaatgtataacagtaattact
aaacaaTTACTTATGGTAATattacttcaatggaatcgaaataatagaaa
aatattATGATTCTCTAttactgactctttttaaaaagcgttgATTATAT
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aatccaagatctcggattgtcgtcatggtttcttttctctgcgttgatta
cGTGCTGAATAGAAGGTTGATATATGATTTCGGAAAGTATATATGCGCAG
AGTTTACGCCATCAGGGCGGTTTATGGGAAAAAAGCGGCGGCAGAGTTTT
GAACAAACTATAAACActtccgccactgcttactccaccccgAGCTAACC
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cttttgtcactccaataattctttttatgacttggaaaaaatagcttgcc
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tctaaaattattagacacttttaagtcaaaatttagaaatattagtcgga
gttttgacaagctgacgatggttttgcctctgttatctttgttatgatat
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agcacatccaggctcagccaaattttaggtgtcctaataaaaaaaaacgt
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TGTTCTCACGATTGTTTCAAAATCTGTGAGAACTTAGACAAATGTTATTT
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TGTCGCCAATTAAGAAATATACGCTAAAcatgttttctttaaaaaacact
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tttgtttttttatctaaaagagATAGCGTAGGTCCCAAGGTTGAGTCTct
tttaagtaaaaagtaagtaagtcttcgaccgcagtcggaggcgatccgaa
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TTGTCCGCATAAACCAGAAGATTCTTCTTTCTCCAGCTCAACGTCCCTCT
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TTTTTTAAAGGTAATAGCGAAATTGCAATTTAAGTGCaaaaaatggaata
ttttaaggttagaaatttttattaatcgttgaaaataatgaataaaaatt
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GCTTTTTGATTGCTGACTGATAGTGTCAGATAATTCTCTGGTCTATCAGT
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TTCTTGCGTATGTAGTAGAATGGAAGTATAAAAGCTTTTATCATGTTGTT
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GCAGGGAGCTGCTTCTCCCGGCCGATTTTGAGGGGGCGCCAAAGGACAGG
GTGCGTAAAGGCTAATTACAGTGCATAATTACAGCTCCCCTTTCCTTTTT
GAGCATTTGAATTTAGCAGATTTCAGTCAAAAATAGAAAGAATATACCTA
GGATTTTTCAAGCTTACAACCCTTGCGTGAGTTTTACTGAGATATTATAC
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gcctattgttatattgtgctgatataagcaaaaaaatgtttttcttttcc
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AGCTTGGGTATTAAAAGAACGTAGTTTGTAAAAGTATTGTAACAACCCGT
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CGTGGTAGCGAGTCCTTAAAATTAAACTATTCCGATAGCATCTATCATCT
ATAAAAAAGTAATGCAGAAATGTGCTAAATAAGCTCCCATAGGtttgtca
attcatttttgatttgtatttgatttatgattcattttgatttatttttg
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CGTGGAGTTTACAGTCATTATTGTATAGTAACGGTGaaaaaaaaCCGTCA
AACCGaaaaactctaccgactgtaatcTCCTTTAGGCaaaaaaaCCTTTG
GCCCCTATTCGGGTCCTAATACCCTTACGcgtaaacctaaaaatatttcg
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ttcttatattttagcgataacacacacaaacttttctactcaatcgcatg
ttcaaactcgatacttttattagggacacccTgtAGTAGTACACTCGAAA
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tatttcaatagcgttttcccattttatattcattttattttatttttggg
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cttaacatattcttattttcgccatttttttgagtatctttgtccatttt
cttaagaaattgagtgttttagagtccgcgaagccttaaaatgttcttag
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GGGAGGGCTGACTAATACACTAATAAAACCGTAAAGTGTCTCAGTTTATG
CCGTCACCATATtctattgacattttaatcaaaTTGGTTAATATCATGTC
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TCCTCGAGGGTATTCTTAGGATATTcatacgatttggccaatttgttata
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TGTAGCGTGATCAAATTATTTTGTGTACTCCTGTGAATGCCCATGATTGA
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TGTTGCAACGTTTTTTAACGTTCACAAcctccatataacgttagatgaac
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ATGTAAGTATGTTTGTGTATGTGTGTAGCATTCTCAGAAATTGANGAGTC
CTCGGATATACTTGCTTTtcacttacacgttttttttattagaacgtcta
aaatttggctgagcctggatgtgcttaatttttttgcaattttcagtcta
aaatgttcttaaatgcgttcttaatttttgagactactctaaatcaacaa
tatcatgcaaaataaagagcacttaaaattggtaaaatttggacaacatt
tgactctcgattttagaaaatccgtccctaagttcggttaaaattGCTTa
ataagaggaaaaaattgtcgtgttttgtcatttttttcttacgatgttct
taatttttcgacgaatttaagactaaatgttcttataaactgggttctaa
taaaaaaaacgtgtagtatttCTTGAATGACTTTGCTATAGAGTtgacag
gcccggcggaacaaccgttaaagtggggaggctgaagactcaaaatgaga
taaaatttggtAGGAATTTGAGGGAAAAATCTCATTTACTCAAAAGTGGA
gtggctgaagtctccccagtctccccactTCCGCCGAGCCTGGTTGACCC
AAGAGAGTCAAGTCCCTATCAAATAAATTCAGGTCAAAAATAATTAGTAG
CAAAATCGTTTTATAGCTTAAGAATctttatcttcaaaaaaaaaccATGA
AGGGAAAAACTGAGTCAACAAGTTTAGACAATTCAAGTCGAAAAACgtct
ttttacattttctcaaaatgaattCCTCGGGGACTAGGTTTGGCAGATGT
GGGGTGTGTGTGGACGGTTCCTTCTAAAACTAACCCTTagagaaaacatt
ttgaaaatgttgtctttaattttcgaaaagtgtCCTACTCTTAGAGAGAT
TCCTTTATTATTTTCTAATGTTTGCAGCCCGTAGAGAGACTTTTGAACGT
TACAAATTACAAACTTAGCCTTCTCGTCTGCATATACTCTGCATTCATTT
TTGCCAAAGCATGTACCCCTCTTCTCCTGGAAACGAACTTATTGAACTTA
CCGGATATCTACTTTAGACGGAAGCATACAACACGAAACGGCCACAGAAA
AATACAAAGAGTCAATAATTTTGAACAAAACTATCCCGTTGGTACTGTAA
TACTAGGGACCGTTAGCATCTAGGACGGCAACTTGAATGAGGACGtgaag
taagttttttttttaaattgcaaCTTTTATATCCAATTTTATCTAGATTT
AATATCACATTGACAAATTCATTTAAATGTAGtcaagtttttgtaaaaaa
tgacgttataaTTCTCGAGTGATTCATATCATTTAAAACTCTTCCTTTAC
CTTCTTCATCCCAAAAACAGcgttaaaaaagaattttcaagacGTCTTGA
GATTTTAAAACGTCCATTAATTACCTTATCAAAATTCACTATTCTCATGA
GAAAATTGATACGAAAAGAATAGAACCTTGCTACGATCCAGATATCAATC
CCTAAGAGCTTTCTTCTTGTTCAATCTTGCCGTACTTTTTCAAAGTTGCC
GAACGTATAATCCAAAATGACTTGATTATGGAACCAATGAGATATGGCCG
ACAGCTAGAAGTagatacaatcatggtcgaaatatattgagatttttggg
tattttaacgtttttcagaatttagagTTCGGGCGAAAATTGCTacttta
gcacttccactttctttcattgagtatttcgattttagaggggttcggtg
gcttctaggctatgttaaaactctactttccaactgtagtttaaggcgct
taaaaaggCAGTCCTCGTGGCAAAATGCtttattgaaatcaaaatttaag
gccgaattttaagaaaagtgCCACTTAAAACGAATAATGCGCTAGACTCA
ATCTGTCATTCGGAATGAAGAACGAATATTTTGCTGCCTCTGGGAATGGT
TGATTATTGCTCCCTAGCATTTTGCTATATTTTATTGGTTAGGACAAAAT
AAGGTGTGAAAGCTGGCCTTCgtatacaaaaaaaattgatgtagtttctt
gtcagggtaaaattttcaatatttaaatgCATATTGCGCTGTTAGGacaa
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GCCTTGAAAGGTTGCCGTTGaagtgaaaaaagcaaaaaaaacggGGTTTT
TCGACTCTAATGAAAAAATTCTTGAGACTGTAACGTCCGATGAaggaatt
tcataggaaaagtGGACTATAATCAGGAGGCTTTAAAGCACTTTTCTTTA
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tcttcttcatagtCTTTTGAATTACTTTTCTCAGAAATTATAGTgttctg
aattatcttttcaacgatatAATGGCATGTTAAAATTGTGGAAATGGACT
TTAGATGCTTGTAAACGTAGGGTCGGAAAGTCTTTAGCCTGGAGTTATAT
TTGAATCGACAAAATACGCAGTGTTTCCGTCTGATGTTGGAATGTAAATC
GCTTAAGAAAGACCAGTTGGTAAACCAGAAACATCAAGAATAAAAACCTG
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TATTGCAGAATTGGCTTGAGCTGAGATAGGTAACCTGGAGAATAATATAG
ATATCCGACTCCCTGCTGGCATACAATGTTGCTTCAaagtttatctaatg
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ATACAGAGGGGtattgtaaattgaaattttgagtaTAACATAAACTgtgt
att Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ >MSTRG.1136.1.p1 ID=MSTRG.1136.1.p1|Name=MSTRG.1136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTACAAATCACTGGAGCAATGGGAACGTCAACGAAGTCACATGCT
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GCTATTATAGCGTGTCTAACATTCTTAACAGCTTTCTTACCATACATGGA
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tacttAGAATACGAAGTTTTATTTGTGAACGCTTTTGTTATGATTTTGTT
GATAGCATTCGTGTTTCGGAAGGATTCTTTTGTAAACCCTAAAGTTATTA
TCAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2773495..2794247 + |
|
