MSTRG.11314.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11314.1.p1
Unique NameMSTRG.11314.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:1046583..1088946-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11314.1.p1 ID=MSTRG.11314.1.p1|Name=MSTRG.11314.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=42364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1046583..1088946- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTCGGAGGGTATATTTATTCATACGCAGTGAAAGGAACGGTCAGCATGA CGTCAGATCAAGGTGCTTACCTGACTTCCATGTACTGGGTAAGTATATTA AGGGCTCTGACCATAGTCAGAAAATTGATTTAGTATCTGAACATAAAAGT TATGTTTTAGATTCTTTAACACTTTTAACAAAGAATTGCCTTTATAAATT GCTTTTCAATCAAACCCCTTAAGAGTAGTTAAGAACTTAATTGCAAAAAT GACGTTATGAACTTAAAAAGACGTTAATAATATGTTGCATCACCTTCTTT TATAAAAAGTGCTAAGTTTTAATGGGTAATACCCTTTTTGTTTCGAAATT TTTTCAAAACTGTCCGCAAAGAATTGAACTATCTTAAATTTTGCGGAAAA TTTTTTAAAAGGATGTGTCAAAAGTTATGACTGTTTTTTTAAGCAAAATC CAGATGCAAAATTGATGAAAAACCACTATTTTGAAGATTTTGAGACAAAG AAGCATTTACAAAAATTTTCCGCAAAAATGTTTATTGTTCGGTAAAAGAT ACACCATCTACTGCGAAAATATTTTCAAAATATTTTTTCTTCGCTGAAAC TAAGCTCTTCAAAGTTGAAATACTCTTCCTCGCTAAAGTCTTCATTTTCT TCTTCGTCAAATTTTTTCAATGCAATTTTTGAATTTTCAGATTCAGGAAT AGTTTGTCTAACAGAAAATGTATAACAGGCCATAGTTTTGTTGGTTACAT CAGTCAGAAAACACATTTTAAAACACGGCAATTATGAAAAATTCACTATG GTCAGAGCCCTTAAATTTCATTTCATTAAAATTTACTTTATTTCATAATG ATAAGCAGCGCGAAAAATCATTACCGTGCTCTAAAAATCACTAGCAACTT AATTAATATGCATGAGTTTTGCTGTGGGTGTAGCATAGATGTCAACCGCG 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TGTTGCCTGTGAAAATCTCTAAACATTTAACATTCCATACAGAGTCCGGC AAAAAGCGAAATATACGTTATGTCAATTGAAGTCCTCAACACTTATTAGC GAGTTTATGTGTCAGAGGATATCGAGGGTGATGATAAGTGAAGTCGACGG AAAAGAAAGTTGATAATTGATGTACGGCTCTATTTTTCCTTTGCTCACCT AAACAGACGACGGTATTTTTGTGTGTTTTAACGTCGTCGAGAATAAGTAG ACGGCGATTTTGGTTACATGTCAACTTTGCTTTATACCGTCTCCTTCGCT ATAAACTCTGTAGTACAGAATAATTAGAAAACGATAAAATTATATCTATA TGACATTTCATAATGTGAAATTATGTCCCAATTTTTCCGGAAACACTGTG TATCAGCCAAATTTTTGTAATATTTTGGGTCATTTTCTTTTATCGGGGTT ATGCATCAATTGAAAAATATAAAAAGAAAAAATGTAGGACGAAAATTGTT CTATTCAAATATACATTATTGTATTCTATGTTGTTTTTTGTTCCCAGTAG TCATCCTGTCTGGCATACAACGTTGTGGCCACAGATTTTTGTAAAGCCCG ATAGGCTAGATGGAGTGCCCCGGTGGGGGGGGGGCAATCGACTTCGAAAC GATGGTATGCGCTGCGCAAAATCTGCTTTTCAAAATCGTACCCTTACATA CAGTACAGTTCAATATGGTTGAAAATGAACCCTTTCAGTGCATTTTCTCA TGATTTACCGAACCCTTATATAGTGCACTATTTTTTTCAGCTGTAAATCT GCGTGAAAAAAGAAGCTTGGGAAATTTTCTGTTTCAAAGAAAAACTGAGA AAATTATTCTTGCTAGCTGTCAGCTAGAAACTTTTTCAAACAAACGAGAA GTAAAAACCTTTCTTTTTATCAACTATTTTAAATTTGTTTTAAAATTCGA CCCTTGCAGTACAATCTCACAGAAACAATCCCTTACAGTGCATTTTGGGA TGCTGAAAACCCCCACCCTTAAGCGCGGCACGTGACGTAAACAAGATCAT ATGAGTGCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCGGCTGGAGTGCTTTAAG CTTTTCGAAGCAAAAAAGGTATTGTTGATATTGTCTTGCTATTGTTTTTG AATCTTCGGATTCTTTTCGGGCTTTATAATTATAGATTTGTGGTTAAAGC TGTTTGATGCGAGCAATTTTGGTTTTCTACCTACTCATTCCAGCTCAATC ATTATTCTGAAAGATTTAAGACTGTACTTAGTTCTTCAGGGAAAGCTATT AAAACAATTTTTTTCACACAGTAACTCTTTAGTGATATCCACCAAGTTTA TTTTCTTCCTAAGGTCCTAAAATCAGCTTTGCTTTTTTATAGCATATTGC TCATGCTTGAGACTTTTGAAGTTCTTTCAGCTTAGAACCCAAATTAAAAA ACAATGGGTATGTTTTAAAGGGGAATTAACGTTTGGAATTAACCCTGAGA TTTTTTTTCGAAACATTAAAGAGGAAGAAAAATGTGATCGAACAAAAAAA GAACCACTTCATAATGTCTTTTATTCATTGAGTTATTCAATCTTTAATTT CTCACAATTTTGACTCTACAATGGAGAAAAACTCCCCCTCTGTTGATTTT GTGACGTCACATGTGCTCCAACTATTCTTACTGTTACACTCTATTTGGTT GTAAAAGAGATAAAAAACATAAGAAATTAATCTTTTTTAGAGTAGTTATA GCAAAACGTTGAAGAAATAATACTAGGAGAGTCTAGTTAGTATTCCAAAG GTGCAGTGAACTTTCTAACGGTAAAAAGAAACTCAAAAACTGCATTTTAA ATCATCATTCACCACTCTTCCCTTATAAAAAAGAGAAACACAGGGCGTAT 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ATGTTAATCCTCTCTTAAGGTACAAGCATGGCTTTGGGCATTTGCAATCA TCCTTTTGGATTGGTCTGGAAACAATGTATGAAATGACCAAACACAAAGA CCAAGAACTCCTTATTGTGCTTCAAGTAGGATCAACAATTAAAAGAGCAG TCTTCGATACCTTCTACGTTGGTAATGAAACCGAAGGCTACAAGTAAGTT CAAAAGGACCGTTTTGATGTTTTTTTTTTTCGATTGTGAATCTAAATATT AAGCTTAAAACCCAGAACAAGTTCTGAATCCCAATCTAAATTGCAAAACA CTCCACAGTATCTAAAAAATCACATGAGAAATATACCCTGAAATTTCACA CAATTTGAATTAGAAATGTTCCTCATTGGTAGAAACGCCGAAATATTGCT CATCCAAATCTCATTAACCTGTAAACATAATTTCTCAAAGAAAACCAATC CCTCTTTTATTTTTTCCTTCTGGCTACACATTCGTGTTTATTCATCTATG GTTAAGGACTCAAAGAACTGTTCGCCGACATAATACACTTTTTTCTCAAT TCTTTAGGTTGAACATTGGTGGCTATTCACAAACAGACTCAACAATGGCT GACAGTAATACAACAGACACTGTATTCGCTGAATTCCATAATGGCTTCCC TTTCACAGTTCCAGAGGCAAGTATCTCAAACAAAAAGTGCTCATAATCTC CTTATACATGTACCCACGGGGGAGGGGGGGTACTAGGGTTGCGGGCTGAC GGGGGGTGGGGTTGCCACCCGACTTTCAACCCTCGGACCCTTACCGGGAC TAAAAATGAGAAAACAAAGAAAAATTTTGTGAATTTTACGACCTTTACCG GGACAATTTTGACCAAATTTCTCCTACCCTTAGTGGGACTGAAATTTGAT TTTCTGATTTTCCGACCCTTAGCGGGACTTTGGAAATCCAAAAAAGGTAC CCTTATGGGCGGAACATACTGTACCCTCTATTTGCCTAAGTACCAAGCTC CCCCCAACCACGGGTACGTGCATTTGAAGTAAAGAAATATGTTTTCGTAA ATGTTTTTATGAGTATCAATATAGAAGAACTTGAAAAATAACTGGAGGAT CCCTTTTGAGGTTATCTGAGATCATCAGGGAAAAAGCGCGTTAAGTAGAA AGAAGACGGCTTCGTTAGTTTTTTTGTTGACGAAATATCGCCTGAAAATT CATAGCCCGTGGTCCACTTAGGGCTTTTTGATAGACTGGTTGGCGTGATT AAGTGGTAGTCTATGGCATAGTGCGGAAAGGGGTCTGACCCCCCCTTCTT AAATGATCCCCCCCTTCTTGATATCCCCCCCCCAACCTTTAAAAAACCTA TCCCCCAAGGTTTTCGGGCTAAATTTTTTATGGTAAAAAGGGAAGGGAAA CAGTAAAGAAAAATTAAATCTGGCAAATATATACCACTTTTTAGTGAAAA TAAAGAACTCTTCCTTTCATACAGACCAAATTTCATAACAGTGCTGGAAA ATAATCTACAATATATGTAAGCCCCCCCTTTTTAAACAATCCCCCCCTCC TTGCTATCCCCCCCCTTTTTAGTGAAAATTTCTGATCCTCCCCCCCTTCT TCACTTTTTTGGAAGGTGTCATCCCCCCCTTAAGAAAGGGGGGGGGGGTT CGAACTATGTATGATAGTTTCAAATTTTGAGTTTTTGCTTAGGTGGACTG TAAAACAACATGCTTAGTTTCCTTTATCTATTCAGGTTGATGGTACTAAT TGCGCTACAGCTTCTAAAGCTGGTTGGTGGTTTAATCCTAACCCCAGTGA TTGTTTCAGAGTATTCCTGAATGGACAACCAGATCTCAATATGTGCAGTC AAACAGCAAATGCTCATAAAAGTTTGATATGGAATTGGGCATCGACTACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:1046583..1088946-

>MSTRG.11314.1.p1 ID=MSTRG.11314.1.p1|Name=MSTRG.11314.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7002bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1046583..1088946- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTATTATCTCCACAATATGAGGCAACATCTTCACTTCAGCAAGCCAAAT
ATGCGTCATGCTCAAATGATAATTTCTATCTCCGAAAGTTCGAAAAAGTT
GGCATTATAATTCACTATCATAAAACTGAGATAGTCAATGACCCTGTGAC
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GAATGGACAACCAGATCTCAATATGTGCAGTCAAACAGCAAATGCTCATA
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ATGATGATCAGAAAAAGAAAATATTGAGTTGAACATTGGTGGCTATTCAC
AAACAGACTCAACAATGGCTGACAGTAATACAACAGACACTGTATTCGCT
GAATTCCATAATGGCTTCCCTTTCACAGTTCCAGAGGTACAAGCATGGCT
TTGGGCATTTGCAATCATCCTTTTGGATTGGTCTGGAAACAATGTATGAA
ATGACCAAACACAAAGACCAAGAACTCCTTATTGTGCTTCAAGTAGGATC
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GAAAGTTCGAAAAAGTTGGCATTATAATTCACTATCATAAAACTGAGATA
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TCACATGTCGATACTTTTTTACTGTACGCAACAGGTTGATGGTACTAATT
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CAGACACTGTATTCGCTGAATTCCATAATGGCTTCCCTTTCACAGTTCCA
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GCACGCATTTCCACACTTTCAAACTTCCAAATGACCTTTGTTCGAACAGA
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TGCTTTGGACAATACTTTCACATGTCGATACTTTTTTACTGTACGCAACA
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CTCAATATGTGCAGTCAAACAGCAAATGCTCATAAAAGTTTGATATGGAA
TTGGGCATCGACTACTTGCTTTGACCAATCAACAATGATGATCAGAAAAA
GAAAATATTGAGTTGAACATTGGTGGCTATTCACAAACAGACTCAACAAT
GGCTGACAGTAATACAACAGACACTGTATTCGCTGAATTCCATAATGGCT
TCCCTTTCACAGTTCCAGAGGTACAAGCATGGCTTTGGGCATTTGCAATC
ATCCTTTTGGATTGGTCTGGAAACAATGTATGAAATGACCAAACACAAAG
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ACCAAGTTGGCATATTTGATAAGTTATACGACGGTGAAAGTTACCAATAC
GTTTTATGTGAAATGAATGAAGAGGAATTCGGTGCCGGTTGGACAGTCAT
TCAAAGAAATTATGAAGCTGAAGATCGAACGAATTTCTGGGGAAGTTATC
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TGTGCCGGTGACATACGATGAAGCATCGACCTGCAACGATATACTTCAGA
CTGGTCAAACTAAATCAGATGGAGAAAAAGCTGTTAACGTCTCTACGAGC
TTTCTGGAAGAATTATGTCTTTAATAGCATGTACACTATATTCATAGTAT
CTCTATTATCTCCACAATATGAGGCAACATCTTCACTTCAGCAAGCCAAA
TATGCGTCATGCTCAAATGATAATTTCTATCTCCGAAAGTTCGAAAAAGT
TGGCATTATAATTCACTATCATAAAACTGAGATAGTCAATGACCCTGTGA
CAGATTGGAAAAAGTGTTTTCAACGATGTCGACTATTGAATTGTGTTATT
TTCACCGTTTGGAAGATTGCTTTGGACAATACTTTCACATGTCGATACTT
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AGCTGGTTGGTGGTTTAATCCTAACCCCAGTGATTGTTTCAGAGTATTCC
TGAATGGACAACCAGATCTCAATATGTGCAGTCAAACAGCAAATGCTCAT
AAAAGTTTGATATGGAATTGGGCATCGACTACTTGCTTTGACCAATCAAC
AATGATGATCAGAAAAAGAAAATATTGAGTTGAACATTGGTGGCTATTCA
CAAACAGACTCAACAATGGCTGACAGTAATACAACAGACACTGTATTCGC
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TTTGGGCATTTGCAATCATCCTTTTGGATTGGTCTGGAAACAATGTATGA
AATGACCAAACACAAAGACCAAGAACTCCTTATTGTGCTTCAAGTAGGAT
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GAAGGCTACAAGAATCTACCAAGTTGGCATATTTGATAAGTTATACGACG
GTGAAAGTTACCAATACGTTTTATGTGAAATGAATGAAGAGGAATTCGGT
GCCGGTTGGACAGTCATTCAAAGAAATTATGAAGCTGAAGATCGAACGAA
TTTCTGGGGAAGTTATCAAAAACTTCATCCTTGCGCACGCATTTCCACAC
TTTCAAACTTCCAAATGACCTTTGTTCGAACAGAGTGCAACCCTTCTACT
AACCCGAAAACACAATTTGTGCCGGTGACATACGATGAAGCATCGACCTG
CAACGATATACTTCAGACTGGTCAAACTAAATCAGATGGAGAAAAAGCTG
TTAACGTCTCTACGAGCTTTCTGGAAGAATTATGTCTTTAATAGCATGTA
CACTATATTCATAGTATCTCTATTATCTCCACAATATGAGGCAACATCTT
CACTTCAGCAAGCCAAATATGCGTCATGCTCAAATGATAATTTCTATCTC
CGAAAGTTCGAAAAAGTTGGCATTATAATTCACTATCATAAAACTGAGAT
AGTCAATGACCCTGTGACAGATTGGAAAAAGTGTTTTCAACGATGTCGAC
TATTGAATTGTGTTATTTTCACCGTTTGGAAGATTGCTTTGGACAATACT
TTCACATGTCGATACTTTTTTACTGTACGCAACAGGTTGATGGTACTAAT
TGCGCTACAGCTTCTAAAGCTGGTTGGTGGTTTAATCCTAACCCCAGTGA
TTGTTTCAGAGTATTCCTGAATGGACAACCAGATCTCAATATGTGCAGTC
AAACAGCAAATGCTCATAAAAGTTTGATATGGAATTGGGCATCGACTACT
TGCTTTGACCAATCAACAATGATGATCAGAAAAAGAAAATATTGAGTTGA
ACATTGGTGGCTATTCACAAACAGACTCAACAATGGCTGACAGTAATACA
ACAGACACTGTATTCGCTGAATTCCATAATGGCTTCCCTTTCACAGTTCC
AGAGGTACAAGCATGGCTTTGGGCATTTGCAATCATCCTTTTGGATTGGT
CTGGAAACAATGTATGAAATGACCAAACACAAAGACCAAGAACTCCTTAT
TGTGCTTCAAGTAGGATCAACAATTAAAAGAGCAGTCTTCGATACCTTCT
ACGTTGGTAATGAAACCGAAGGCTACAAGAATCTACCAAGTTGGCATATT
TGATAAGTTATACGACGGTGAAAGTTACCAATACGTTTTATGTGAAATGA
ATGAAGAGGAATTCGGTGCCGGTTGGACAGTCATTCAAAGAAATTATGAA
GCTGAAGATCGAACGAATTTCTGGGGAAGTTATCAAAAACTTCATCCTTG
CGCACGCATTTCCACACTTTCAAACTTCCAAATGACCTTTGTTCGAACAG
AGTGCAACCCTTCTACTAACCCGAAAACACAATTTGTGCCGGTGACATAC
GATGAAGCATCGACCTGCAACGATATACTTCAGACTGGTCAAACTAAATC
AGATGGAGAAAAAGCTGTTAACGTCTCTACGAGCTTTCTGGAAGAATTAT
GTCTTTAATAGCATGTACACTATATTCATAGTATCTCTATTATCTCCACA
ATATGAGGCAACATCTTCACTTCAGCAAGCCAAATATGCGTCATGCTCAA
ATGATAATTTCTATCTCCGAAAGTTCGAAAAAGTTGGCATTATAATTCAC
TATCATAAAACTGAGATAGTCAATGACCCTGTGACAGATTGGAAAAAGTG
TTTTCAACGATGTCGACTATTGAATTGTGTTATTTTCACCGTTTGGAAGA
TTGCTTTGGACAATACTTTCACATGTCGATACTTTTTTACTGTACGCAAC
AG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11314MSTRG.11314Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11314.1.p1.exon11MSTRG.11314.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon10MSTRG.11314.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon9MSTRG.11314.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon8MSTRG.11314.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon7MSTRG.11314.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon6MSTRG.11314.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon5MSTRG.11314.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon4MSTRG.11314.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon3MSTRG.11314.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon2MSTRG.11314.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11314.1.p1.exon1MSTRG.11314.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11314.1.p1MSTRG.11314.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:1046583..1088946 -