MSTRG.11277.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11277.1.p1
Unique NameMSTRG.11277.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:456278..462673+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11277.1.p1 ID=MSTRG.11277.1.p1|Name=MSTRG.11277.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6396bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:456278..462673+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttaaagaaaTGACAACACAATTCTGAAAAgtttaaacaatttttcttgCA ATTGATTAGATGATGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTCGCGATTTCTCT TTTACCAGGTAAGCTATAgtattcaaaatattcaatacaCAGGctacaaa attaaagtctgaagacaaatcacgcttttactcgaaatttttatgtgctt gttacatgacgtttatttctgattggtttcGAATTTATaaacactaataa agttatccgCTGTAaattgtaaagcaagtaacatgggaacaaaatcacgt gaactttttcgagtaatcacatgttttgactgcattgatttgattttgca aCCCGCGTATTTTCTGAATATCATCCCGATTATTCGATTGTAAGTAGAAG TAAGTCTGAAGCCGCAGTTGGCAGGTGACCCTAAGGCTCTCTTTCGATGT CTAACTATCCAAAGGTAGGGATTCATTTTTCTTGGATAGCTCCACTTATC ATTAACCTTTTCTGAGTATTAAGCAGAAAGGCATCAATTATCATTTTTGT ACTAAGATTGTACTAGGGTCAAAAGTTTTATTGGTGTTGAATTGTCAGAC agtcttttcaaaatttccttttttaaaaGCAGTGTCATACTCATTTGGAG actgaaaaagtgaccctgatgTTATATATGTCATATTTATGATGAGTGAC CCCCTTACTTTTGCAGAGTTGTCAATATTTATTATCTCTTCTTCCAAATG TTTCAGCATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGAT GAAGTCACCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGG TTATGCTGTGAAACACGTAACAAAAGGTATAAAAAAGTTTACGTTACATA AGCCTATATTGAAAAGCAAtaaattttggaatattttgaatttcagtGAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:456278..462673+

>MSTRG.11277.1.p1 ID=MSTRG.11277.1.p1|Name=MSTRG.11277.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=19908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:456278..462673+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGTTGGTTGGATACGCTCTTATTGTCGCGATTTCTCTTTTACCAGC
ATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATGAAGTCA
CCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGGTTATGCT
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GCTATACTTAACATTGGCTATTTTGATTCTATGTTTAGTTCATCATGGAT
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TTAGCTGCTTTATGCTTTCTGTGTGGAATAAACTTATTCTGGGCTTACAG
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CTTTTTTGACTATTGAAGTGGTGGCTTTGTTGACTCCAGTTGGGCTTTGT
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CAGCATCTTTGCAGAGGGAAGTATACGTATCTCCATTGGGGAAAGATGAA
GTCACCTGTGGAAAATCATTAACAATATCACCATGTCTATCGATAGGTTA
TGCTGTGAAACACGTAACAAAAGaTGACGATACCATCTATCTTGACAACA
CAGAAAAGCAACAGACATCAGGCCTAATAACGTACGTGGAGTCAGCTTCG
GTGATCGTCTCAAATAACTTGACCATTGATGTTGTCAATCATGAAGTCGA
TGCTGCTAAAGTACTGGTCAAAACAGATCGACATCCAGCGTTATTCTATA
TGCATTGTCGTTATTATTGTACCGTGAATATCAGGAACATCGATATCCAA
AGTCCTTTTACGGGCTTTTACCTCTCTACGACGTTTCATGGGAAAATAGC
GGTCACCAATAGTGCCATCCATTGTAGAGTTAGCATATTTGGGAAAACTA
TGAGAAGTGGAATTAATGCTGAAGTTATATTCAATAAGACTAAAAGTAAA
GGTTTTAACATTGTTGGCAACGTATTAGTAAAGGCGTATTCCTCGGTATT
TGATGCTGAAAATATATTCCTTAATGTGGACCCCATCAGCGGGAGAGATT
TTATCAGTGTTAGTTTCCATGATAGTATTCTGAAGAATGGAACGTTTATG
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GATGAGGAGGTTTCAGATGAGGATGAAAACGACTCTCAAGACTTACTAAT
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AATGCTACGAGTAGATTCACCTTTTAAGACGTCTTTGTCAGTTTCGATGA
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GATAACGACGCTAACTCATTTACCGTATGTCCTATAGAGCGCATGACAGC
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CCTTGTATCTTCTCAAACTGGTACATTGCATCGAAATCAATGGCATCAAT
GTTGTTTACGTGCAAGGAGATACCAAGTGTTACCAGAGCTGGCAGTACTT
AGCTATATCTATCATTGTTTGCTGGGTCGTACCATTTTCTGtctctttat
atttttcaagtcaaaTGCTTATGGATGCTGTTCTAACACCAAATGAATTT
CTAGCAACTCTCTTCATACCAGCATATATCATTGTCAAAAAGATTCAAAT
GAGAAGGAATAAAAATGTTAATAAAAGTTATGTTGATTCATTACTACACA
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ACCTATAAGCTTGGTCACCCGTTGGTGTTCTGGGAGAGCATAATGATTCT
TCGTCGTTTGATTTTATGCCTTATCTACGTCTACGTTAACAATGTGGTGA
TCAAGCTATACTTAACATTGGCTATTTTGATTCTATGTTTAGTTCATCAT
GGATTTATTAGAGCTTTTACCAAGAAACTTTTAAACATTGCTGAAACAGT
TTCTTTAGCTGCTTTATGCTTTCTGTGTGGAATAAACTTATTCTGGGCTT
ACAGTCATTCGATAGAAGCATCGTCAATGTCGAATTTTATGAATATTGGG
AATGCTTTTTTGACTATTGAAGTGGTGGCTTTGTTGACTCCAGTTGGGCT
TTGTTTGTTATTTGTATTTTATAGAATTTGtaataaaattaaacaaaaat
taacTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11277MSTRG.11277Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11277.1.p1MSTRG.11277.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11277.1.p1.exon1MSTRG.11277.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11277.1.p1.exon6MSTRG.11277.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:456278..462673 +