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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:1021932..1032822+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11212.2.p1 ID=MSTRG.11212.2.p1|Name=MSTRG.11212.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10891bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1021932..1032822+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atttttacccTTTCAGAAAAGTTTGGAGCGACATCAGTTTATGAATGAAA
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AATAAAGAATCAAGGCTCGGTAAGccctcttttaaaaaaatgagattttt
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GATTgtgacattttaaaaattttataaattgtaAGTGAGAGTGAGGCTTC
TTGTCTGAATTCGTTGCTCTATTTTAAAACATGCCTATAATATTAGTGTT
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TCCTTTAAATGCGACCACGAGTATAAATTTGAACGTAAGAATCTGCAGCC
TATCGTTTTCATCACATAGTGAAAATCTTATGTGCCTTTTTGGAATTAAA
TCTCGTTTCccctattttttaattttcagtgtgGCAGCTGTTGGTGAGTT
GAGTTTTAAGACACATTTGCCGGTTACAATGATAAGTAGGACCCTAAATG
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TATTTAAGCATATGTAATTTAGTGTGAAAAACCCTTAATCGAGTAGTCCa
ttaattttatattatattatttagGGCATTTGTTGGATCAGAGCAGATTG
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GAACTTTTGTCCTGTTCTCCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTG
CCTTGCACTTCAAtggcttgaaaaggtttgaACGTCAACTTTTTAAGAAG
ACAAGAAAACGATAATTGTGtactcttttttaaaaaaatcacgaaaacgT
TCTTGTACCAGCTTGTACCCACAATAAAATTACATAATTTTGCAATTAGA
CGTGAGTGATCATAAAACttatatgattttttgaatattCATAGAAGGGT
TGTAAGCTCCAAAAGGAGGTCACTATGAccatataaaaatgaagaaatag
cGATAATAAAAAACGACAATAAAAACGACATATTTACCTATCCCAACCAT
GGACCCCCGACCTTAGAAGTGATACAACCCCTACATTTCAAAACTTGGTG
atattagtagggggaaatttgtaaaatcgctcgatttttttagtcagagc
acttgttatacatttttggaaagctaaggggtaggggaatcaaaataact
tgggtgccaatttttttttcggacactggtgtgattttcggacaaatacg
acggtctcaggccaaaatcatagggtgaaaatttaatgaaaattttcgct
tgagaaaacggagacctgttgtttatttttggaaagctctcaaaaaatta
aggttagtgatatattgcgggtataggtgatttcagtacctaactcgaga
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gaaaaacactgaaaacactgtttttaaggattaatatctcgagttaggta
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ctttgtactagtaatctcatggttataagggaaattcgggataaatttcc
cgaggtcaattttgaaatcttttgaaatttcccgagtgcatcgagggaaa
tttaaaacatttcgaaatttgaccgagggtaatttatccagaatttcacg
aaaacaagcatgggattcctggttaatctcatggtttggattgaaattct
aacaattctgaaagacgtcaatttaacactggaaatcaatctgaaaattt
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AAATCTAgaagggaaattacaaaagctaggagggaaattacaagttcgcg
ggaaattacaaattaacgtaagcaaaaacgtcaatcgaatttaaatcaac
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tttccattaatttttcaccctatgatttttgcctgagaccgtcgtatttg
tccgaaaatcacaccaaagtgttcgaaaaaaaattggcacccaagttatt
ttgattcccctaccccttagcgttccaaaaatgtataacaagtgctttga
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atatGGAACATTTATACGCCCTTCAGAGctctagaattttttttcattgc
acATGCTAAACCTGGCTTAACAAATGCATTCGCGAGATCACCTCAAGTAC
CGCGGTCCTCTTTCGTTCGGCATTCTATAGAGCGTAGTACTAAATAGCGA
AACGATATTAGTTGCACATTTTGCGATTTTTATATGCAAGAAACTCTGAG
TATATGAAACTGTTCTTTTTAAAGTGTATTTACTTTTCATTCAATTTAAG
ACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACTACCCGTACGAAGAAAAAGA
TACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAGTGAGAAATCACAGAGGGTTTACAAC
TAAAACTTATGATTATATACCTCCTCTGATGATATTGAATAAACGTTATA
GAAGGGGTATATTTCCCGCTAGATTTTCTCAACtttagttgagctagaat
ctggtAATGTCTATATATGTCTTTCTGTTTGTATGTCTGtctgtccgaaa
actttggggcaggatggagacttcaaaaatggtctgattTAGCTAAGTTT
AATTAAGTTAGGCACACTTGCTCCTTGGGTTAATATAATaaggtattttt
tcattttttcaaagttttcatttttaagggcgtggtcactaGATTTagca
ccaaaacgaggctaaaaactttggacaggctggagacttcacaAATGGTC
AAATTGgctgaaattgtttttatacATCGATTTTACTATGTATGAGTGAA
TCATACAGGAGTGGTCAGATTTAGCGTTTAATattcctttaaaaaatttt
gatttttcaggaCAATGGAAGGCCCTCGTGTTGATGCAGTATGTGGGTGT
CAGAAGTGaggttttgacttttttatttcatttacagtattttgaaagtt
taaatttataaacacccccttctcacagacccggtaggattttcgcagcc
agtggggataaaaataacggactgaaactcgatgtgGATCGAtgttccca
tattttttatggctgggggtATAAATTATTtagttttcaagtcagaaaat
ccagTGGGCATGGAAAAacagcacaatattttgcattgaggattgtttta
tttgattattttcagtgggaacCAAAAtcggaggataattttccacctgA
GACGATATTTTGTAATtgtattgaaaacaaattaagtTAAAAGATTTATA
AgtataatgaaaattttgagaCACAACATTTTTCTCTGGCGGCTCCGGAA
ATTGTTTTTCCGTCAGCGGacgcagacctgatttagcggccgaaGGCCTG
AAtaaacggccgaagacctgaattaacggtcgaagacctgaatcaacggc
cgaagacctgtttcaacggccgaagacctgtttcaacggccgaagacctg
atttaacggccgaagacctgatttagTAAGTCACCGGCCGAATACCTGAT
AGATAAGTTAGGGTCAGTTAAACTAGCTTGAACCACTCGGCAAGGCATCA
GTTGCGATGGTCCAGTGGTTATTGCAGTGGTATCGAAAACGGATGGTGGG
TAGTTTGAGACGAGTTATTGGCATTAATTCTCattctttttagtttaaaa
tcttttaacttaatttgttttcactacatagtccgggagccaaacccaaa
aaatggcattttgcttaacccaagattctacaggataaactatacatttt
tggaatcctcaactatcctagttttggaaatggtcggtccccaaagctaa
ctcctggtcaattttttatactgggaccgagtttagggggtactttttac
cctttgtaaggatttgttaaggaaaatgccattccagggatgatataatt
gctgtatctagtcaatcagttgaccaattgctttgaaactttgcaaaaag
tttgaaggtaggctgatgattattttcggcaaaaaatttttgtgaaaaat
tgtttttataggtttgcctggggaaaaaagggggaaatttgggtatttta
actaaattttgaccctttttaagtctgggacctacccaaacaacttttaa
tgagacacaaactaggtgttatgatagactttgatgcaatacatcagaaa
aaatttcaaaacagacagtatttagtattatttcagggctgcagggggta
aaattgcccatttttatgggtttttaccttatttgagcaattttcaccac
taattttggttaaaacgtcatcaaaaatagttttaacttgattttcgtgt
aatatatcctgaaagattacaatgctgacttaaaactaacaaaaccaggg
tgcaaatggacaaaccagggggtaaaaatgcccattttaggcgattttta
tcgtttttggacctatttcacccataaagcggttttatggtgtaccaatt
ttatttctgaccactgaaacaagaataattttttagtaggagcaatggga
aagttatttgtggtttttattgtctgtaatcagggcACTGTGGGCAAATT
AGGGGGTAAATAtaccacttcttggtagttgttgcctgaatttggatgtt
tttattgtatggtagcctcaaatttatgaaattttgagatggaaaccagt
tatatacccttcagtcatttcttagtacttttgttgacaactacacaaaa
taatgacgggtttaaaacttaagttatggccaaattataacatttatttg
acgtaattttgtcactttttgctttgagattccactatgttgctattcag
agcttcccaAAATGGTCCCAGCTACTTGTAGAATTATTATCTTGAGACTA
GCTACTAATAAAAGGTCAGTAAAACgggcaaaaatgatcagtcaAATTAT
GAGTATGTAGTACATTATGAGTATGCAGAGGAccgttagttttgttttca
caaaacgattagaaatttttcatcaaacagGCCCTTAACAATGACACATC
ACTTTTATTTCTACCCaagttaacaatattttacaaattattaggctcca
aataactattctacttaaaaaccagtacagggaccatttttggaagctct
gaatagcaataaagtggaatttcaaagcaaaaactgacaaaattacgtca
aataaatgttataatttggccataacttaagttaaatccgtcattatttc
gtgtaggttgtcaacaaaagtactaagaatGACTGAAGGGTAAAATAACT
GGtttatctcaaaatttcataaatttgaggctaccatacaataaaaacat
ccaaattcaggcaacaactaccaagaagtggtgtatttaccccataattt
gcccacagtgaccctgattacagacaatgaaaaccacaaataactttccc
attgctcctactacaaaatgatccttgtttcagtggtcagaaataaaatg
gTACACCATAAACCGCTTTaatgggtgaaataggtccaaaaaataaaaat
cgcctaaaatgggcattttacaccccctggtttgtccatttaCACCCTGG
TTTTattagttttaagtcagcattgtaatctttcaggatatattacacga
aaatcaagttaaaactatttttgatgacgttttaaaCCAATAATTAGTGG
TGAAATTTGCTCAAaaggtaaaaacccataaaaatgggcaatttttaccc
cctgcagccctgaaataatactaaatactggtctgtttgaaatttttctg
atgtattgcatcaagtctatcataacacctagtttgtgtctcattaaaag
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cccaaatttttttttttccccaggcaaaccgaacaaaatattttcacaca
aaaaaatttttgccgaaaataatccaAGCCTACCTtcaaactttttgcaa
agtttcaaagccaATGGTCAACTGAAAATAGACAATACGCAAATTATATC
ACCCTGGAATGCAGTTTTCCTTAACAATcctacaaagggtaaaaagtacc
cccTAAACTCGGTCCCAGTataaaaaattgaccaggagttagctttgggg
accgaccatttccaaaactaggatagttgaggattccaaaaatgtatagt
ttgtcctgtagaatcttgggttaagcaaaagtgcttatttaaggacatat
aggatttggctcccggactaacaattacaatttgattgaatttataaaaa
agatttcacaaatttccacaattcattttctccaggtcttcggccgttaa
aaaAGGTATTCGACCACTGCACCAAGTCTTCGGtttttaattcaggtctt
cggccgctaaatcaggtctgtGACCGCTAATTCAGGTCTGCgtccgctga
cggaaaaaaaaatctgcGGCTACTCCATTTACTCTCTGCCTAGGTCAATT
TGCTACCCTATGTTATGTATTCGCTTGCATCTagataaaatttatttgtt
tttttcacagTTTGGTAAATAGAGAGGATGCTATGTTGAGAATTTTGGAT
CAAAAAGGACCATTGAGTGTCAATGTGGATGCAGTACAGTGGCATGACTA
CATAGGTTTGCATTCTTTGATTCTCCGCACTAgaatcagcgccgaaatat
attggcaattttgggtattttaacgtatttcagaatttaaaggtcgggcg
agaattgcagtttcagtactttcactttgcttcattagatttttcaattt
tggagggattaagtggcttccaggctatattctcagcctcattggaacat
ttttgagcttttagatcctgagatcttaaggtcctaagttttaagtctaa
tgttcaaactcagagttaaaactctacttccgaACTGTACTattcaaagc
acttaaaaatcacttgcgggtttaaagttttgagggaattccccttcaCA
TTTATTTTTGACAGAACAATCCTGGTTCAAGATTTAAGACAGTGTTATTG
AAACGTGAACCCTTTAGCGACGGGGATGTTTTTCCTGGATTTCTTAAAAA
CGAAAAAGGTCCAATTCTCAAAACTTGGAGGAAATGGAAACTCGTTTATA
GGGGACAAACTTGGGAAACGATTCGGGACCTCCGGACCTTGGGACCTTGG
GTTAGTAAGTTTTTTATTCAGATTAGAATATTGAGATTTTTATTTCAGGG
CACGGTTTTGATATAAATGTAGGTAGATAAGAAGAATCAGGCCTGATGTA
CAATGTATTATATATTCTCATTGGTTATAGAGTTAACGCGAAATCGGAAG
TGTGGGGATAATCTTATCAATGATAGAGCCAAAGTTTGATAAGACGTCAC
CATTATTCCTTGTCTTTTTTCAGGAGGAATAATTCAGCACCATTGTACGA
ACAAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGACCTCGTCAGT
GGTCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAAAATCTTTCGG
TGAAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAATGTGGTAAGC
CTTTATGCAAACTCGTCCCCAATCCCCCAGTTCGTTTTTTACGGCTCTGA
TGGCGCGCTCGCGATTCCACAAAGGGCGACGCATATTTCTTTCCTTAGAC
AGACGGAAATATCTTTGATAGATGGAAATATCCTAGGGTAATTGTCGGAA
ATATCGTCCTCTAAGGAAATAGGCAAGGGAGACAATTTACTTTAATGAGT
AATTTTCTGACATCAGAGTTTACTTcaaaagaactaattttggcgagaac
ttattttaatACAGGCAAGTAAAgtaattctttaatttttggcgagcaaa
gtttttttttttgggtggCTTATTTAGGTGGGTAACATAACCTAGTTacc
catttttttaattttggcgaaggGCAGGGTACATCAGTtcctttttgcct
aaaaatgagCGCTTATGCATAAATCAGGGGTTcatttagaaaattaaaaa
aaaatggctaGAACTTATTTTTGCGAGGCAGCAACTCGCAAAACTCGCCG
AAATTAGCTCCTGTATAAGctatcaaaaaatgatgaaattggtGTTTATA
CTTATGGTTCAGTGCTGAAGGTcccaaaaaaaatctataagGGGGGAGAC
TCCCGATACTTAGCAAGGATATACTCTTCATCTCACAAACCTAGTTACCC
ATCCCTCCAGGCACTGAAGTAACACACTAATCgtaaaataaaatgtaatt
cccttaagggaactaattttcgcggaacttTTCGCCCTTGTGTATCACAG
CCTTCATTTATGTTattgattgacgccagagaatattatctagcgctttc
agtaagcataaaaaagctgataatacgcaagGAACGGGGTTGGTTCCCAC
ataaattagttcccttaaggttagcctatactagacgttaCCCGGtgttt
agtgaggtgctcgctaccttaaggtagtatgcaaaacaaagagtttttca
ttttcattttaggtATCGCTCAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGA
TGAGAAGGTAACAAAAAGTCCATGAACACACACAagtaaatttatatttt
cgaaATTCGTGTTGACCAATTTCaccttcttttttcatttgacaGACATG
ACAGAACTTCAAGTTCGCCGTAAATTATTGAACATATCtgaacatattca
atttttttctatccaaaattttatacgcattttctattagattttttttt
ttaatttcatgtgAATTTCAATAGAGTTTTATATCATTTTCAATTGATAA
CGcagttatttattttgttgtcGATTATACACTCAGTAACCTCTCTTTAA
ACTTGGAGCTTTTCGGCTAACTTCTCGTTAATTCGGTTAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:1021932..1032822+ >MSTRG.11212.2.p1 ID=MSTRG.11212.2.p1|Name=MSTRG.11212.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3276bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1021932..1032822+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATTGGGCCATCAAAACAGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGA
ACTTTTGTCCTGTTCTCCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCC
TTGCACTTCAAtggcttgaaaagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAG
AACTACCCGTACGAAGAAAAAGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaC
AATGGAAGGCCCTCGTGTTGATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAA
ATAGAGAGGATGCTATGTTGAGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGT
GTCAATGTGGATGCAGTACAGTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCA
GCACCATTGTACGAACAAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTT
ACGACCTCGTCAGTGGTCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGG
GGAAAATCTTTCGGTGAAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAA
CCAATGTGgtATCGCTCAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGAATGT
ATTGGGCCATCAAAACAGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGAACTT
TTGTCCTGTTCTCCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCCTTGC
ACTTCAAtggcttgaaaagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACT
ACCCGTACGAAGAAAAAGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaCAATG
GAAGGCCCTCGTGTTGATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAAATAG
AGAGGATGCTATGTTGAGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGTGTCA
ATGTGGATGCAGTACAGTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCAGCAC
CATTGTACGAACAAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGA
CCTCGTCAGTGGTCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAA
AATCTTTCGGTGAAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAA
TGTGgtATCGCTCAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGAATGTATTG
GGCCATCAAAACAGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGAACTTTTGT
CCTGTTCTCCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCCTTGCACTT
CAAtggcttgaaaagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACTACCC
GTACGAAGAAAAAGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaCAATGGAAG
GCCCTCGTGTTGATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAAATAGAGAG
GATGCTATGTTGAGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGTGTCAATGT
GGATGCAGTACAGTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCAGCACCATT
GTACGAACAAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGACCTC
GTCAGTGGTCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAAAATC
TTTCGGTGAAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAATGTG
gtATCGCTCAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGAATGTATTGGGCC
ATCAAAACAGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGAACTTTTGTCCTG
TTCTCCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCCTTGCACTTCAAt
ggcttgaaaagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACTACCCGTAC
GAAGAAAAAGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaCAATGGAAGGCCC
TCGTGTTGATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAAATAGAGAGGATG
CTATGTTGAGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGTGTCAATGTGGAT
GCAGTACAGTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCAGCACCATTGTAC
GAACAAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGACCTCGTCA
GTGGTCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAAAATCTTTC
GGTGAAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAATGTGgtAT
CGCTCAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGAATGTATTGGGCCATCA
AAACAGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGAACTTTTGTCCTGTTCT
CCATCGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCCTTGCACTTCAAtggct
tgaaaagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACTACCCGTACGAAG
AAAAAGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaCAATGGAAGGCCCTCGT
GTTGATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAAATAGAGAGGATGCTAT
GTTGAGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGTGTCAATGTGGATGCAG
TACAGTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCAGCACCATTGTACGAAC
AAGAACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGACCTCGTCAGTGG
TCCAATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAAAATCTTTCGGTG
AAGATGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAATGTGgtATCGCT
CAACAGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGAATGTATTGGGCCATCAAAAC
AGGCACCCTGGTGGAGCGCAGTCCGCAAGAACTTTTGTCCTGTTCTCCAT
CGCTGGGTTGTGAAGGTGGAAACACTTGCCTTGCACTTCAAtggcttgaa
aagACTCGGATTGTTTTGGAAACAGAGAAGAACTACCCGTACGAAGAAAA
AGATACGGCTTGTCGACAAGTAAACAAgaCAATGGAAGGCCCTCGTGTTG
ATGCAGTATGTGGGTGTCAGAATTTGGTAAATAGAGAGGATGCTATGTTG
AGAATTTTGGATCAAAAAGGACCATTGAGTGTCAATGTGGATGCAGTACA
GTGGCATGACTACATAGGAGGAATAATTCAGCACCATTGTACGAACAAGA
ACATGAATCACGCCGTTCAACTTATCGGTTACGACCTCGTCAGTGGTCCA
ATCCCTTACTACATAGCGCGTAATCAATGGGGAAAATCTTTCGGTGAAGA
TGGTTACGTTCGAATCAAGTATGGTGATAACCAATGTGgtATCGCTCAAC
AGCCTTCGTTTATCCAAGTCGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:1021932..1032822 + |
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