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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2595120..2604005- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1121.2.p3 ID=MSTRG.1121.2.p3|Name=MSTRG.1121.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2595120..2604005- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATTTTTATTTTAAGGAAAATTAAAATTATGCAGTAATAATATCAAACA
AGGAAAATATTATCAAGTATGGAGTTTCCTAAAAAACGAAATGGTTCAAA
GATCAAATCAAAATGGATTGGTTTAAGGAAAAGAAAAACAAAAATTGCAG
GACCACCTAAAATTACTAACTTTAAAATTTCAAATGTTCCAGTTACTAAT
GATGATAATGGTTACGACTGTGATGTGGAAAATTTTGATGAACATGATGT
TGGAACTTATGATGAAGACTTTGTACCTAAAAAACAATGTTATGGTATTA
ACAAGGAGAAAGAATTAATTTGTTGGGACAAACATAACATTGATTATTGC
TTGATTTATGCAATGAAATTTAACACTTTCCCGAGCCATTGCTGCTTTTG
TAACGATGAAGTTATCACATCTTTTGTATGGTGTAAATCATGTGGACCAT
TGTCCTTTTATTGTCATGATTGCGCTTATAAAATTCACAAAAACACCCTC
TTTCATTCATTGGTTGAAGTCCAGGTTTGTTTGTTTTCTTCTGGTCTGTC
TATAATAGGCACCCTATTGGATTTTAATTGTGGTTGATATTTTTCAAATT
CGAAAGTTGGGGCTGGGTTGATGACAAGTTTCATATAGAGGTTTCCCTAT
GTGAGTGGGATGACTTTTTCCAGATGGAGGTCAGAGAGTTTATTGTTGAT
TTCAAAGTTGAGGGAGTTAAGGTTGAGGAATATTCTCGAATATTTATTAA
AAAGAACAAAAGGTCTGCTCATACTTCTGAAGAAATTTAGAAAGTTAAGT
GTTTAGATCTCTTTTGAAAACATTTTTGTCTCAAGTTTAGGCTTGGATAT
GTCCTCAAGATGTATTTTAAATGATTACAGGTTGATGGATGCAATGTCAA
ACCATTCAAAGTAAAATCTGTTCTGCAAACTGATCATGTAAAAGCATGTA
CTTCAGCTTATTCAAGAACATTGACTGTGATTTCAGAAACAGGTGAATTT
TATTTAGTTTGGCGTATACTTGTTGCAAAGTAATGACTGCCAGTACATTC
TTAAATACACTCTCCTTGGCTCAATCTAGGCTGCAAATAAGCATTGTTAG
TCTTCAGTCATGTCCCATTGCAAAAAATGGTGGAATGACTGAAAGTCCTT
TTGTGCACGTCAGTTTTTAATGCTTTATTCATATAGGGAGTTTCGGACTG
CGTTTAATAAAAATTCATAACAAACAGACTTGTACTTTTTATTTGCAACC
CTTGCCCAATTATTACAAATTTGGATTATAGTAAAATCGTTAGTATAATT
AGTATAATATTGTAGTTCTTTTTATTTCATATGAGTATCGACAAGCAACT
GTTTGAATATTATGGACTTTTTGGTTATTTTTATTCGAATAAAACATATA
TAGAGAGTATTTTTAATTACTGATATTTACCTTAGGATCAACTCATCAAT
GTCAAATTTATTTTTGTAAATGCACAGAAGAGTTCAATACTTTGGTACAT
CTGGATCTATGGCCAGTAACACCGATAAAGCCAAATACAGTTATTTCAAT
GAATTTGTTACACCTTTTTGTTGCATTACAGTTGGAAGGGAAAATATCTT
TTTCGTCTTTTTGTGATGGTTTCTCTTGGAAAAGTGGAGTGGTTGATCAT
GACCTGGTAAGATACTATATGGGTGAAGAAATTTCTAAAATTTTTGTCCA
ACTATCTTCTACCAGGGGATTGGGTGGCAGAGCAACATATGTAATGCATG
CATTTTGTTCTTATTAGGACTCTAGTACTGTATATATTCTCATTTCATAA
GAAACATTATAATACCCAACTTCAAAATTGAGATTTATTGAAAAATATTG
ATTAGAGATCTATTTTTAAGGTCACTTTTTGTTTTGAACCAATGAAGCAA
AAGCTGTCCTTCCCAGGCAAAACAAATTGACATCTTAACTATTTTCAATC
TGGCGTTTGTACAAAAACCAGGCAAGCCGTGCAACTTTGATGTAATTTAA
CTCGTTTCAAATTCTACCATACATATTCCACTCTAGCCCCTGGCTATACC
TCATTTGCTTGAACGGAGCAAACACAAAAAAATCTACACAATTCTATAAT
CCAAAAAAAATGTTACAAGTAAAAACCGTACAGTAAATTCTCTTGATGTT
GATCCTGATCTCTACTTTTCCCTTTTTTCTATATCAAGTATTTTGAGAAA
AAACAATCAACAATCAGCATTTCAAAAGGCATCTCCACTGTGATAATTTT
TAGTCGTTCAGTTAGGAGAGAAATATATTTTGAAAAAAAACTACTTTTTA
GAAGAGATACCTGAACCGCATGACCCAAACGGATTCATTAGATCAATTCA
GACATTTCCGTCGACAATTAACAAGTCTGAAGACAATATGCCCGAACTAT
GATGGTTTGGAAAAGTGTGCATCTTGCCCCAAGGTATTAAAAAATTTAAG
TCTTTACTTTTTTTAAACATAAACAAGCTACCGTATGTCCATTTTGATCA
AGTGATTCCCTATATCTCCCTCAGTAATTTTTGAATTTTTATGTAACTTT
GCTTGTCTCGAAAGATTGTGGTGTCAAACAAAACATTGGGGACTGTTTGT
AAACTGCTGTAAGATATTTATTTTGCATCGTAGAATATGAAATTACACAT
ATAAATCAAAATATTTTTAAATTGGACAATTTGATTCTTTTAAGGAGAAT
GGAAGTATTTTCTACTGCTTTGACGCCAACTTTGGACTTGTGTTAAAAAG
CTCTGCTTCTAAATCAAAGAGACTCGCTATGCGGTCGGAAAATCTATTTA
TCCTTGATGAGGAAGTAAAAACCTTTATGGAAAGCTACGATGATACTTTG
AAGACAAAGGTACAGGATTTAATTACGTTGTGAACTTTTATTAAAAGATT
AAAATATTTTTCAAGTCCGTTAAAGGCTTTTTATTGACAATCAATGTTTT
GAAATAATAAACTAACTCCAAATTGCTACACAGTGTTTCATGCTATGCAG
TCGTCAGATAATTCGTTTGTGGTTGTTTTTTGCAACCATTCAGACATTCT
TCAGCACTGTGTGACTCTATTTTTCTTTTTTACTTAATGTATCAACAAAT
AGAAAATTTCAAGGTAAATTTTTCATTCAAACGAATATAAACTTGAGCCG
AAAGGCGTGTGTTTTCATTCAGTTGTTCTGATTGTTGATAAAATAGACGA
TTAATAATAACATCTTAAGAAATTGATTTTGTAATGATTTGTAGAATGAA
ATTTTGGGAATCTGCTCAAAATTTGCGAATTTGTGAAATTCTATTTTAAT
AAAGTAATTTTTTTCAATTGGCTTAGGATTGCAGCAATTTCCAAGCTGGC
AACAATTTACGGTCAAAACGAAAAACGAAGAAACTCAGTGTAACTGGAGT
ATTTGGTACATTAAGTGGATTAATTTTCACGTGGACTTTTTTTTGCGAAT
TAGGCTCTTTTTTACCTGATTTTTTTCATTTAGCTGATGATTTTAAATTT
TTTCATAGAGGACTAATTTTGGCAAAGATGGCTGAAATTCGCGAAAATCG
CAAAAATTAATCCACGTGAAATTTAATCCACTTAAGGTATGTCTTGTCGT
CATGAGTTCCCGAAGCTTTTCTTGAATATGCAACACGGTGAAAGGTAATG
ATTCAGAATTGCAGTAATGCATAAACGAGCAGTTTTTATTCTCAACTTCA
AGCGTGCTAGAATCTTAGAACAGTGAATACCTAGGGTACTTTAGTTTTTT
GGCCTTGGAACAGTTTTTACGTCGAAACAAAGATGACAGCATTGAGATAA
ATTTTTTGTTAAAAATCTTAAATTTGTTCTATCTTAGCAATAGAGAACAG
CTAGCCGATATCTAGTTTGAAATTAGAAAATGGGTCCAATATAACACGGA
AACACTTCTTATAATACATAATCTTCAAGTTTACAATTTGTCAAGCTTTT
AAAACCAGAATTTGAGACGGATAGAACTCCAGTGGTTGTGTAACACAAGG
AGTGTTGATAAGATTTTTTTATTGTTTTATCATCATCAGAAATAGTAGTT
GCATTGTTGTTTTAGATTGGGCTACGCCGTTCTTCTCCTTGATCAGATAC
TGAACGATACAGAAAAAAAGAGGTTGGATGTGCACATCATATATGATATT
GCATGCGTTTTGAAGTCACATTTGCAGGTAGAAAATTAGGAAAACTTTTT
TTTCTAATGATCATACCTCATTTAAAATTTCTTTTTTCAAAAGAGTGCAA
ATAACTCTATATAATAACTCTCTAAGACTTTTTGTTTTATGTAAATCACT
GTAACATTTCTTTGTAGATATTGACTTAGATCACCGACCTACCTCTCCCA
TCTAATTTTAGCCTATTACACGTAAGACTGTATGTTAATATTTTTTACGT
TATCTTTAGAAAAAGAATACTTTTACCAAGTATCAAGATTTCAAATTTGG
CATCCCTGTTTTTCATTCGTATGGTCACAGAGGAGACTGTCAGGTGATTA
TTGAATTCTATGATGGTTTTTCTGCTTTCAGAATTTTGAAAATTTTGCGA
TTTCCGCGAATTTTGAACAGATTCGCGAAAATTTATTCTCGCAAAAACAC
TTTTCAATAAAGTCTACGCTCGACCATAAATTCTCCAACAGCTTGGAATG
TAATTTTGGGATACCTTTTGTGTTGATGGTTTTGAAAAATCTCAGGCTTC
AACGCTCTATCTTACAAAAAATAGTGAAAATCACAAATAAAAACAAAAGT
CGACAAATTTTCTTTTCTCGCTTCATTTTTTTGAAAGTTAATTTGTTATT
TTTAGGTGAAAAATTCAATCAGAAGATTAGATTCTTTTGGCCTTATGGAT
GGTGAATTGATGGAACGCCCTCTGGTCATATCTTCGATCATTCTCAAAGA
TTACCAAGGAGATGACTCCAGCTCACCGCACGGATTTACTTAGTGATGCT
CTGCTGCATTTTGGCTCAAAGAAAATGGGAAATATCGGTATGATTACTTT
GAAAAGTTCTATACTAGTGTTACATAATTATGATATTTTTAAGCTGATTA
ATCACTTGGTGTCATCTATTAAAGCTTTGTTTATCACTGGTAACGCGAAA
CATGATTGGATTTTTAAATCTTTACTTAGGCTTTACTTTTATTTTCTTTT
AGGAAAATATCTCGTGTTTCTATTTCAAAAAGCAACAAGAACTTTGAATT
CTTGCGATTCAGAAATTAAAACGATTTGCTCTAAACTGCCTGGTAAGTTA
TAATTTTTTGATTTAGAATAACTTATTCTAGTAAGCATGAAGCTTAGCGA
ATTGAGGTCTGCTTTAATAAGTTCTCGTCAAAATCTATATTAGTTCAATT
CTTAAAACAAGCTCTCGCTAAAAGTCATTTCGATACAGTCGGTTGGTTCT
AAAATTCTTCTTTAGAAAAACATTGTAAATTTAGAAGAATTTAAAAGAAA
ACAGTTCAAAAAGGCCAGTCAAATTTTAACACTTTTTCAACACTATTCTA
GTTAATTTGAAAATTCTATCATGACTGATTCATGATACCTTTTATAAAAT
TCCTAAAAGAATTGTTCAAAACATTTAGCTCATGTGGATGAAGAAATTAT
CAAATCATGGAAAAAAGAGGAGGATAACGCCGTAAGCCAAAATGGAAAAC
TTATACAGAAAAGTTAGTATTTTGCAACGTCATCTTTTTCTCGTTACTGG
AATGACTAAGTAGAAATCTGTCGAACCAATAAGGTATAAGCCCCGAAGGG
GCCAGAGTGGAATCTGGTGGTAGGATTTGAAGCCAGTTAAATCCTACCAA
ATTATTTTTTTGCCGATCCCCCATATTGAATTCCTGTACTGAAAAAACTT
GGGTCAACCGCTAAATTATTTTTTTGGCAAAATTTCTTCCTTTAAGGTTG
AGTTATGGGGACTTAAATGTATTTAAAAATATTTCGATTTTTGTACGTGC
TGGAGTGCTTCAAAAATGAAGAATAACTCTTTTTTATTATTCTTTAGAAA
AACTGACCCATTTGATTGACATGACAATTGACATGACAAACGACAAATGT
CTGTAAGTAACAACGACTACGGACAACAAGATAATGACTGTACTCTGCTG
ACGACTTACATTTCTGAATATATATTGAGGTGTTGAGGATTTCTTTTTTT
TTTACCGCAGTAGCCATAAATTTATTTGAGACGTACGATACTTGAACACA
AAGACTACTGACTCATAAGACAACTAACAACTTGTAAATTTGTTTTCCTG
TTCTTTTGACCAACTTTTCACTAGCATTGTGGAGTTAATATAGTTTTGAA
TGAGTAATTACTGCTTTGTGTATATTTTCAGCTCCTTCTGATTGGAAGCA
AGTCTACTACCTTAAACTGAAAGACTTTTACAAAGAATCTGCACTGGTTT
TAATGAGCGAAAAAGTATGCGATGCTGCATCGCATCAACGAAAGGCAAAC
AGGTAAAACTTGCTTAAATAACGAAGAATATGTTTACCCGTTGGTCTTTA
CCCCGCTGAAAGCTGAAAAAAGAAAATGATTGGAAGGCAAGCCAACGAAA
TGTGTTGAGCTTTACTCTTTCAGACTTGAATTCAGTTTCAAACTTTAAGG
GGATAATCAGATGATTTTCGATATTTGGCCTACAGATTCAAGCAATGGCT
CTGAGAGAAACCTCCAAATTTTTTGGCCCAGTTATTTTCCAAAGCTGATA
TAAGGGGCTAGGACTGTCATCACGAGTATACTGTTTTAGCCTAATCTCAG
AGTGAGAGTCCTACTATTTCGGCTATTTTCAAAGCGCAATATCTCAGCTT
AGGAAAATGATTGGGTCAAAAAATGGGCCATGGAGTGAGCCTATTGGCCA
AATATAAAAAATCATGTGATTATCCCTTTAACATTACATAGATTTCTCGA
AATAAAAGAAATTATTTTCCGAGATTTTTCGATCCAATTGAGTGTAATTA
TGTTGTTATTTCATTCATTAGACTGAAACGAAACTTGACATCGTTTGAAA
AGCTTCATAAAGTGAATACGAGATGGAAAACAACAGATCGCGACTTTCGA
AGTCAACATATGACATTTTTGCGTGTGAAGTCAAACGAAACAGCATCCAC
ACTATATAGCAGATGTTCTGAAAGAATGATGCTCTTAACATTAAAGAAGC
GATATGCAGGTATGTTCGATTCTGAAAACACATTTTCATCAATTTACGCC
GGCTACAGATCAGATTAGTAGATTTTACTTGTAGGCCCCACCATGGTTGT
GCTACACAGGGAAAACTTTTGAAATTCGGTCACTTATAATGGCCTGGAGA
TATTCGGTTTCAATTTCAACTAAACACCTAACGTATTTTATCCTGTGCCC
CTTTAAAAGTAGATTTATTAATAAATCTAAATATAATAGAATTCCAGAAC
TTTCAGACAAATTATCGAAATCCAATCTCAAAAAAAAAATTGTAAAAGGT
AAACTCTGACTTCAAAGCAGAGAAGGTTAGAAATAATGGCTGCTCAAACG
ATCTATCAATCAATAAGAGGAAATAATATCAGCAACAAAAAGGACTCAAA
ATTTCTTAAGATATTCAGAAATATCCTCTACGAAAACTTTTTAGTAAATC
CATCTCCCTAAAAAAATCCAAGAATAAAAAATCCAAGTAGAAATTTTTAT
TCCTTACGCTTCTAATTTTCTCTCACTTCAGATGGTTCGGCGATCGCGAC
GAGATTGAGCAAACAGATAAATAAAGTATGTAAAGAAATCAAGAACCTGC
TTGCCTCATACAATTCAATGAGATTGGAAATGTCACCAAATTTCAAAACT
ATAGATTACAAAGATGCCCTCAACACAGAGGCTCCATATATAATGAAGTG
AACTTTGTATCCAACGTCAATGAGGTTGGTGATATTATATTCCCAAGAAA
TTTCTTTTTTTTAATGTTTTTGGTTTTATGATGCGAAGGGTGCAGTGACA
AAATTAACCGGAAAAAGAAAATTGTTTCACGAAATAGACATCGAGTTTTT
ATTACCTATGAACTCATGCATTGGAAGAAAGGATATGACTCAATTTTCTG
TAAACATGCTAAAGCAAAAGAGAATTGAAAATGTTTATGTGTCTTGTAGA
GTGCAACCAACGATTTATTGCGCTCCAAGTAGAAGCGCCAATTAGGGGTA
GCTCATTGGGTAATTGAAGTTGTATTAAAGTAATAATTTTTTTTCTACTC
TCTTTCTCTCTCTTTCTTAGGTAAGAAGCTCGTCAATCCCTACGAATGTT
GTGAAAACATTGGTTCAATTCTATTTGAGAAAACAAAGAGCACAGGAGGA
GATCGTTATAGTTCAAGAAGAAATGAAAGCAACGTTGTCCTATTGGAGAG
ACCAGTTAAATTTTCTTGTTGAATGTGCTTCGCAGCAAACGTCCTTTGGG
TTGAAATATTTACTTCAAGAAAGAATATTCATTGTTAACAGCTTGACAAA
GGAATTAGAACAATTATTTAATTCTGTTACGAACATTGAGCTTCAGACAG
AATATGTTAATCGTAACTTGGATGTTTGTATCGATGAAATGGACGGTATT
TACAGTGACAGTGATTGTTCAAGTGAGGACGAAGAAGATTTATGTTCGAG
TGGGAGCGACATTGAGGATTCAGATTTTAATGGTTTATACATTTAGGCTT
GATATTGCAACTTATGTTCATGTAAAAAGTTGTTTTTAATCCTTAAAAAT
ATGTTATTATCTAGATTTTTTTACATTTGACATTTTTATAGATTCATCAA
CCAAGGGTATCATCTAGAATTAGTCCGTTAGATTTTAAAGTTTTAGCCTC
CTAATTGACAAAAAAATTAGGTTTTCTTTCAAGCTTAGCTTGTAATGTCG
GAACTCTGGAACTTAACTACTTTTTATTTCCTTTCG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2595120..2604005- >MSTRG.1121.2.p3 ID=MSTRG.1121.2.p3|Name=MSTRG.1121.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2595120..2604005- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGCAACGTTGTCCTATTGGAGAGACCAGTTAAATTTTCTTGTTGA
ATGTGCTTCGCAGCAAACGTCCTTTGGGTTGAAATATTTACTTCAAGAAA
GAATATTCATTGTTAACAGCTTGACAAAGGAATTAGAACAATTATTTAAT
TCTGTTACGAACATTGAGCTTCAGACAGAATATGTTAATCGTAACTTGGA
TGTTTGTATCGATGAAATGGACGGTATTTACAGTGACAGTGATTGTTCAA
GTGAGGACGAAGAAGATTTATGTTCGAGTGGGAGCGACATTGAGGATTCA
GATTTTAATGGTTTATACATTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2595120..2604005 - |
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