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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11201.1.p1 ID=MSTRG.11201.1.p1|Name=MSTRG.11201.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTATGTATGTTTACAATAACGTCAGCAAATAAGAATATaattaaatgg
aatatttttaaaattttatgataACTTCaggagaattttttaaaataaag
aatgtgtcaaaatttcatttgtcttttcTGTTGGAATTGACCCATCATTG
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taaagcatttccaatcataaattgccaattacccccaagtaaggctcact
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atctagtctgaattaggatcctaacctaagaatactgtaagaatatttta
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caccattcttataaaaaaaagcgtgtgtaCAAATTTAATCTCTAGCAAAC
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atccacctgtattactcgtaatccattcttatctacacttttcacacatt
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ttttcacacatttagacGGAAAGGCTTTTCCTGAgatcgaaagtgacgta
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tcttatctacgcttttcacacatttagacGGAAAGGCTTTTCCTGAgatc
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ctcgtaatccattcttatctacgcttttcacacatttaagacGGAAAGGA
TTttcctgaaatcgaaagtgacgtaatggtgTGAGATCTATCACATTGTA
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gcttttcacacatttaagacGGAAAGGATTttcctgaaatcgaaagtgac
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tccacctgtattactcgttatacaatcttatctacgcttttcacacattt
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ttatctacgcttttcacacattCAGGAAGGAAATGATTTTCcgtgaaatc
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ATCCACTTGTACTACTCGTAATCCATTCTTATCTacacttttcacacatt
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CTATCACCgtgtatccacctgtattactcgttatacatcattatctacgc
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tcttatctacgcttttcacacatttaagactgaaaggattatcgggaaat
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ccacctgtattactcgttatacattcttatctacgcttttcacacattta
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tttcacacatttaagactgaaaggattatcgggaaatcgaaagtgacgta
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cttatctacgcttttcacacatttaggAAGGAAAGGAttgttttgaaatc
gaaagtggcgTAATGGAAGAGCTCTTGGATGCGgacaaaacatatcaaaa
cgaacattttaagttttagaatttttaaattttgtaagaactttttgtag
agctgaaaagtcatatttttaatgtttttgaaagaggTATTTCTCGACTA
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CGAGTGTGATAAGAtgttattaagggtgaaaggatgtgactagatttcca
ctttcgatttctcaaatttctagtttctttcaaacctgtgaatagtgtag
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cactttccatttctcaaatttctagtttcttcgaaacctgtgaatagtgt
agatagagtgtgataagatgttattaagggtgacagagggtgactagatt
tccactttctatttctcaaatttctagtttattccaaacctgtgaatagt
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gtgtagatagagtgtgataagacgttattaagggtgagagagggcgacta
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aaatttccactttcgatttctcaaatttctagtttcttccaaacctgtga
atagtgtagacagagtgtgataagacgttattaagggtgaaagggggtga
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gactagatttccactttcgatttctcaaatttctagtttcttccaaacct
gtgaatagtgtagacagagtgtgataagacgttattaagggtgaaagggg
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GGGTGACTAGATTTCAACTTTCGTTTTCCCAAATTTCTAGTTATTTctaa
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gtgagagagggtgactagatttccactttcgttttctcaaatttctagtt
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gggtgaaagggggccacaaaattttcactttcgattACTCAAAAttctag
tttcttccaaacctgtgaatagtctAGATAGGGTGTGATAAGAtgttatt
aagggtgaaagggggtgacaagatttccactttcgatttctcaaatttct
agttattTCCAAActtgtgaatagtgtagatagagtgtaATAAGACGTTA
TTGAGGGTGAGAGAGGGTGACTagattttcactttcgttttctcaaattt
ctagttattgtcaaacctgtgaatagtgtagatagagtgtgataagacgt
tattgaGGGTGAGAGAGGGTGACTagattttcactttcgttttctcaaat
ttccaGTTTCtgtcaaacctgtgaatagtgcagatagagtgtgataagac
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atgttcttaatgttGATGAATAGTATATAATAAATGTTTATATGAAATTT
ACAACTAATTGtagtaattaaaaaaattcaaaaaaagttaatttaaataa
ttttttatatagtTCAACTAGTAAATATTCTAAGAAATCAAGTTTTTAGC
TTTTGCTCTTGTCATGAGAGTAGCGTTTGTTCGTGAAGGGTGAAAACAAA
ATTCTGGATCTTTAAGAATGCGCGTCCATTTGCCTTGGCCATACTTCCTC
AGTCCTTTAAGAATAAAATCGTCTTCTTCTGCTGTGAAAGAGCTTTTTGG
CTTTCGTTCGGTTGGTGAGCGTTGCGTGCTTTTTGGAGGTTTGGCTGTTG
ATGTAGGTTTCTTAGGTTTTTGAGATTCGACATTTGGTGATTCGTCGTCT
GGTTGAGAATTATCGTTAGACATGTCAATTGTGTTTTCAACGCTTACCTT
CCTATTGTCCTGATCGTCGGTGATGGTAGAGCTAGGACTGTTATTGATCA
GTATTTTCATGCATTCGCTGGCCTTTCGCGCAACATCTcgagatttttgt
ttttgatagtgGACTTTTGCAACGTTTGATGTGTGTTTTTGGTCCAAGCT
GATGATTGCCTGTTCTTCTGTAGTCAAACGTTCTGCGCTCTCAGTTTCAA
TAATTTGTCGATATCTCGTTGGATTCACATATTTTCCAATCGCTTGATAG
ACCATTCTGCCAAAGATATCACCAAGATTCTTCAGCTGTGTACCATTTCC
GTTCACTAAAAGATACTGACAACATGGTTTGAAAGTTGGTCTCACAATTT
CAACATactgtttcactttttctaaaacagttttttcaaatAGTAGAGAG
TCAAATGCATATGTTgagtttgttttaaattttgtttggtCAATCATACC
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TTGGCCTACTTGACTTTACTCTCAGGAACAGCATTGCAACGATAAATGAA
GTGGCAAATGACAAATCCCTAGAGGAATGGTTTTTAGTTGTTATCAGTTT
CAGTATCTGTTCATATCTAGTTTCGTGGTATGACAAAACTGTTTGAAGCT
CTGCCAAAGTGGCCCAGCTGTTTTTGCTCTCAAGTGTTTCAATACTGAAT
AACGTGTTCCACTCCACTCGCATTTGTCTCCGTAGGCATTGTTTAGCACG
AGATAGAAATACTTCACTCGTCATGAAAACTGAAAGTTTTGTAGGGTCTA
CTCCCTTGTATCTCATAAAGTCAAGGCAATGAGAAAGAGATTGTAAATAT
GAAATGATACCTGGTTTACCCATTTTGCATTCGTTTCAATAAACACAACA
AATCTCTCGATAAACTGGACGCAACCAATGCAATATTCCATCATGACTTT
GGTCAGTTCACACGAGTCATCAAGATCTGAACAAcagtattttgcaaatt
tgagtATTCTCTTGACGATTTGTTCAGCTTGAACTTTGTCTTTTCCACCA
CCACCAGCACTGCAAATCCAATTAACGAAGTCTTGAGCTAATCCACACTT
GTTTGAAAAGGATGGCATATCCCAGGTCTTTGTTCTCAACGGTGAAAGTT
TGGTTGCTGGATTCAAAAGCTTCTCTGGAAATTTATCTTCTATCTtgggt
ttttcgtcaaaaaagaaaaaccagcCGTGTTTTTCTGTGACGTGTTTCCG
GCAACCTCTCTGACTTTTGTAAGCGTTGCTGTCACATTCACTGAGTGGAC
AAAGATAAATACCATTGATATCTGGTTGTAATTTCAGTCGTTTGGCTTTT
TCGCTGGCACCCTCAACATTCTTCCACTCTTTTTTATGAAACGTCCTCTT
CATATTGACTGAGTCTAATGATTAGAAAGAACGAATGATCCCTCTATTTA
TGCACAAAATTCCTTTTGTTTGATTGCACGATTTCATTGGTTCTTTTCAA
TGGGTTCAAAGTCTAAATGATACCATTAGTTCCATTTAACATCGTTCCAC
TTTAAATTGGCACTATCAAGTCCCCGCCAAAATTTGCCTTTTTCCATTGG
TTCTTTTCCAAGAGCTACAATTGCGCTGATTGTTAACGGACCAATCAGaa
cccaattttgtatttctctttttgttttggGAAAATAGGAATAAACCTAA
TAATATTCCTTATTTTTGACAATGATATTAAAATCCTTCTctctaaaaaa
ttatttagtgtttatagttttttaaatatGAATAATACAAATATAAAGTA
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AAGGAACAACACTTATATACAGCATAATATGTTCCTTATAAAAGGAATAT
ATCATTGTATAATATTATTTATTGTAATAATCTTTAAATTGTTCCTTTTC
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ATCATatgatccttataaaaaaggaatACATATATAGTGTATGatatgtt
tcttataaaaaggaataTATCATTGTATaaatttaattattgtaataatt
tttaaatcattccttttaaaaatttctctttatattcaattttaaaggaa
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ATAGATATAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaacaacacttatat
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tgACATgttccttttaaaaattgaataaaacatTGTATAAAAATACTTAT
TGTAATAATCTTTAAATCattccttttaaaattttctctttatattcaat
tttaaaggaacaacacttatatacagtatgagatattccttataaaaaag
gaatATGCAAATAGATACAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaaca
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ATAGTGTATGACATgttccttttaaaaattgaataaaacatTGTATAAAA
ATACTTATTGTAATAATCTTTAAATCATTCCTTTTAAATATTActcttta
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taaaaaaggaatATGCATATAGATATAGTGTATGAtctgttccttataaa
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TGTATATATAGTGTATGACATGTTCCTTTTAAAAATGAATATACCCTTGT
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CATTACCCTTTGTTCTCTCGTAAAAGAATTTCCTTAttcatattaaattt
ttttccttcaattttaaATGAATATTATGTTctcttttaaatgaaaaaga
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TTGTTCAATCAAAGGGAACTCATTGAATACTTTTGAAGGACCATATTCAC
GTGCACTGTTGGCCAAATTGTTCCCTTGAGAGAGCATTGCAGAATATAAT
TTGTCAGAGAATCCTTTGTTCCTCCGAATCAGTTCTGAATTATCAATTAG
GAACCTATTCCAAGATCAAAGGGGGGTAATCCCATTGATTTTAGGTAGTT
TTCACAAATCCATAATTATGTTTATGTAGATAAAGGGTCATTTAGATTGT
TTGAGTAGAGTCTGTGGAGTCTTGATTTTCATCTCAAACAAACGCTTGAA
ATAAAAAGGGTTTACTACTTTTGATTCCAATCAAAGTGCAGCAAGACATG
GTAATATTAGCTTTTTTCTCACTcttgattatcttttcaacgaacaCAAT
ACGGCTAGAGGTTCTATTAAAAGTTATACCAATTTCTCTGTCGTGAATTA
AATTAAGACAGACTTAACTTATTTGACTTTTTCACTACAGaaaacaaaac
ttgaaaaaatctcttactgggccaaataactttgaataaaaatgtaaaaa
aaaataaaatactataTGTGTTGTATGTGCATTGTGATCATGATGAAAAG
AAGTcatcgaaacgtcaaaaaaatgcaaaaatctaTATTTTTCGTCTTCG
CATTTTTATTTACAGACAACAAAGTTTAAGAAATCGATACAACATAAAGA
TGGGCGGCGATTCAGAGGAAAACACCAACAAACAACTTAACGAGTGCATC
AGAAATGCAAGACAGATGCTAGATGTGTCCATCAAAGTCGctaataaaaa
attcaatgaatCAATCATTAATGCTAGAATGAAATTTGAAGAATCCATTG
CTAGTTCCAAACATATTCTAAACACCTCAGTAACCATCGCTAAACAGGCA
TTAGAAGACTCGATAAACGAAGTGAAAATGCATTCAACAACGACAGATAA
TGAAAGTTTTAAGATGAATTCCTCCAAGTCCTTCCAACAGAACACACAAA
CAAGAAATGAGGGAAATTCAAATGCGCCACACCATTCTAATAGTGAATCC
AGTATTTCAACCTCGAATATCATACCTAACAGTGCTGACAACGGTAATAT
TTGTGACAAAATTAAGAGAGAAATAATCGATTATGCTAACGATGGAACCA
TCGAAAGAAGAATTTTATTCAGCCAAAGAAATGACTGCAATAAAGAATCA
CCAATGAACAACATAAAAATGGAAACTGAAGACAATGTTTGTGGGATGAA
CAACCCATTTTTAACTGTTCAGCCACAAGAAGTAAATAGGCTGCAAGAGA
ATCTAAATTGTCGTAATTTCGAGGTACCTACTACTGTTCAAACACCATCA
AAAAGCAACTATATCGATGTTGATCAGGACAAACTACAAGAAAGATTAAA
ATGTACTACATGTGGTATCGCATTTCTCACAAAATATCTTCTGGATAAAC
ATACTTGTCGCCctttgattttaaataaaaatctttctaGACCTCATCTT
CGCAGTGACACAAAGCGGTTGGGCCAAAAACAGAATACTTCAGTTTTAGA
ATCTTTCGCTGCTATTGATCGGAAGTTCAAATGTGATTTCTGTAAAAATG
TGTTCCCAAACCAAAAATTTCTCAATAACCATGTAAAAAGAAAGCATAAC
CCGAAAGTACAATTCAAATGTGACATTTGTGAAAAGTCTTTTGTTAAACA
AGCTAGACTTAATCGACACCTGAACGTGCATAAAGGAATTAATTTCACGT
GCAAGGTTTGTGGTAGCTCCTTTGCACGAAAGGTCCATCTTAACATCCAT
AAGGGTATTAAGCCATTTAAATGTAAATTCTGTGGTGATTCCTTTCGAAA
GAAGAAGGCTTTaaaaaaaCATGAAGAGATGCATGCAGAATTAAAACAGG
GTCAAGTCGATAGTAAATTGGCGAATACTTAAAGCACTTGATGGATGATT
CTACTAGAGGTGAAATGTTTGTGGTAAATCGTTCTCCTCAGAAATGGGCA
TATGGGAAGCATTCATTTCATGTACAAGAAATTCCGAAAGATCAGCTCGT
TTCGAATATGATAGTGTCAAAAACCTTTCGTGTATATTTTCTTCAATTCG
CGttattatatataaatttaTCAGTTTTTCGAGTTCAATCTACATGTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ >MSTRG.11201.1.p1 ID=MSTRG.11201.1.p1|Name=MSTRG.11201.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1233bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCGGCGATTCAGAGGAAAACACCAACAAACAACTTAACGAGTGCAT
CAGAAATGCAAGACAGATGCTAGATGTGTCCATCAAAGTCGctaataaaa
aattcaatgaatCAATCATTAATGCTAGAATGAAATTTGAAGAATCCATT
GCTAGTTCCAAACATATTCTAAACACCTCAGTAACCATCGCTAAACAGGC
ATTAGAAGACTCGATAAACGAAGTGAAAATGCATTCAACAACGACAGATA
ATGAAAGTTTTAAGATGAATTCCTCCAAGTCCTTCCAACAGAACACACAA
ACAAGAAATGAGGGAAATTCAAATGCGCCACACCATTCTAATAGTGAATC
CAGTATTTCAACCTCGAATATCATACCTAACAGTGCTGACAACGGTAATA
TTTGTGACAAAATTAAGAGAGAAATAATCGATTATGCTAACGATGGAACC
ATCGAAAGAAGAATTTTATTCAGCCAAAGAAATGACTGCAATAAAGAATC
ACCAATGAACAACATAAAAATGGAAACTGAAGACAATGTTTGTGGGATGA
ACAACCCATTTTTAACTGTTCAGCCACAAGAAGTAAATAGGCTGCAAGAG
AATCTAAATTGTCGTAATTTCGAGGTACCTACTACTGTTCAAACACCATC
AAAAAGCAACTATATCGATGTTGATCAGGACAAACTACAAGAAAGATTAA
AATGTACTACATGTGGTATCGCATTTCTCACAAAATATCTTCTGGATAAA
CATACTTGTCGCCctttgattttaaataaaaatctttctaGACCTCATCT
TCGCAGTGACACAAAGCGGTTGGGCCAAAAACAGAATACTTCAGTTTTAG
AATCTTTCGCTGCTATTGATCGGAAGTTCAAATGTGATTTCTGTAAAAAT
GTGTTCCCAAACCAAAAATTTCTCAATAACCATGTAAAAAGAAAGCATAA
CCCGAAAGTACAATTCAAATGTGACATTTGTGAAAAGTCTTTTGTTAAAC
AAGCTAGACTTAATCGACACCTGAACGTGCATAAAGGAATTAATTTCACG
TGCAAGGTTTGTGGTAGCTCCTTTGCACGAAAGGTCCATCTTAACATCCA
TAAGGGTATTAAGCCATTTAAATGTAAATTCTGTGGTGATTCCTTTCGAA
AGAAGAAGGCTTTaaaaaaaCATGAAGAGATGCATGCAGAATTAAAACAG
GGTCAAGTCGATAGTAAATTGGCGAATACTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:952072..963319 + |
|
