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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11201 ID=MSTRG.11201|Name=MSTRG.11201|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:952072..963319+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTATGTATGTTTACAATAACGTCAGCAAATAAGAATATaattaaatgg
aatatttttaaaattttatgataACTTCaggagaattttttaaaataaag
aatgtgtcaaaatttcatttgtcttttcTGTTGGAATTGACCCATCATTG
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taaagcatttccaatcataaattgccaattacccccaagtaaggctcact
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tccacctgtattactcgttatacaatcttatctacgcttttcacacattt
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ttttcacacatttaagactgaaaggattatcgggaaatcgaaagtgacgt
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tcttatctacgcttttcacacatttaagactgaaaggattatcgggaaat
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tttcacacatttaagactgaaaggattatcgggaaatcgaaagtgacgta
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agatagagtgtgataagatgttattaagggtgacagagggtgactagatt
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agttattTCCAAActtgtgaatagtgtagatagagtgtaATAAGACGTTA
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ctagttattgtcaaacctgtgaatagtgtagatagagtgtgataagacgt
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ATTCTGGATCTTTAAGAATGCGCGTCCATTTGCCTTGGCCATACTTCCTC
AGTCCTTTAAGAATAAAATCGTCTTCTTCTGCTGTGAAAGAGCTTTTTGG
CTTTCGTTCGGTTGGTGAGCGTTGCGTGCTTTTTGGAGGTTTGGCTGTTG
ATGTAGGTTTCTTAGGTTTTTGAGATTCGACATTTGGTGATTCGTCGTCT
GGTTGAGAATTATCGTTAGACATGTCAATTGTGTTTTCAACGCTTACCTT
CCTATTGTCCTGATCGTCGGTGATGGTAGAGCTAGGACTGTTATTGATCA
GTATTTTCATGCATTCGCTGGCCTTTCGCGCAACATCTcgagatttttgt
ttttgatagtgGACTTTTGCAACGTTTGATGTGTGTTTTTGGTCCAAGCT
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TAATTTGTCGATATCTCGTTGGATTCACATATTTTCCAATCGCTTGATAG
ACCATTCTGCCAAAGATATCACCAAGATTCTTCAGCTGTGTACCATTTCC
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CAACATactgtttcactttttctaaaacagttttttcaaatAGTAGAGAG
TCAAATGCATATGTTgagtttgttttaaattttgtttggtCAATCATACC
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TTGGCCTACTTGACTTTACTCTCAGGAACAGCATTGCAACGATAAATGAA
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CAGTATCTGTTCATATCTAGTTTCGTGGTATGACAAAACTGTTTGAAGCT
CTGCCAAAGTGGCCCAGCTGTTTTTGCTCTCAAGTGTTTCAATACTGAAT
AACGTGTTCCACTCCACTCGCATTTGTCTCCGTAGGCATTGTTTAGCACG
AGATAGAAATACTTCACTCGTCATGAAAACTGAAAGTTTTGTAGGGTCTA
CTCCCTTGTATCTCATAAAGTCAAGGCAATGAGAAAGAGATTGTAAATAT
GAAATGATACCTGGTTTACCCATTTTGCATTCGTTTCAATAAACACAACA
AATCTCTCGATAAACTGGACGCAACCAATGCAATATTCCATCATGACTTT
GGTCAGTTCACACGAGTCATCAAGATCTGAACAAcagtattttgcaaatt
tgagtATTCTCTTGACGATTTGTTCAGCTTGAACTTTGTCTTTTCCACCA
CCACCAGCACTGCAAATCCAATTAACGAAGTCTTGAGCTAATCCACACTT
GTTTGAAAAGGATGGCATATCCCAGGTCTTTGTTCTCAACGGTGAAAGTT
TGGTTGCTGGATTCAAAAGCTTCTCTGGAAATTTATCTTCTATCTtgggt
ttttcgtcaaaaaagaaaaaccagcCGTGTTTTTCTGTGACGTGTTTCCG
GCAACCTCTCTGACTTTTGTAAGCGTTGCTGTCACATTCACTGAGTGGAC
AAAGATAAATACCATTGATATCTGGTTGTAATTTCAGTCGTTTGGCTTTT
TCGCTGGCACCCTCAACATTCTTCCACTCTTTTTTATGAAACGTCCTCTT
CATATTGACTGAGTCTAATGATTAGAAAGAACGAATGATCCCTCTATTTA
TGCACAAAATTCCTTTTGTTTGATTGCACGATTTCATTGGTTCTTTTCAA
TGGGTTCAAAGTCTAAATGATACCATTAGTTCCATTTAACATCGTTCCAC
TTTAAATTGGCACTATCAAGTCCCCGCCAAAATTTGCCTTTTTCCATTGG
TTCTTTTCCAAGAGCTACAATTGCGCTGATTGTTAACGGACCAATCAGaa
cccaattttgtatttctctttttgttttggGAAAATAGGAATAAACCTAA
TAATATTCCTTATTTTTGACAATGATATTAAAATCCTTCTctctaaaaaa
ttatttagtgtttatagttttttaaatatGAATAATACAAATATAAAGTA
CAAACAGTTACTTTATAATTACAACatataaaattatttattgtaaaaat
cttaaaattaattGTTCCTTTTTAAATTTACCCTTTATATTCCTTTTAAA
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ATCATatgatccttataaaaaaggaatACATATATAGTGTATGatatgtt
tcttataaaaaggaataTATCATTGTATaaatttaattattgtaataatt
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ATAGATATAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaacaacacttatat
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tgACATgttccttttaaaaattgaataaaacatTGTATAAAAATACTTAT
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tttaaaggaacaacacttatatacagtatgagatattccttataaaaaag
gaatATGCAAATAGATACAGTGTATGAtctgttccttataaaaaggaaca
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ATAGTGTATGACATgttccttttaaaaattgaataaaacatTGTATAAAA
ATACTTATTGTAATAATCTTTAAATCATTCCTTTTAAATATTActcttta
tattcaattttaaaggaaCAACACTCATATACAGTATGAgatattcctta
taaaaaaggaatATGCATATAGATATAGTGTATGAtctgttccttataaa
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TGTATATATAGTGTATGACATGTTCCTTTTAAAAATGAATATACCCTTGT
AGAACATGATTTATGGTTATAATCCTCAAATCATTGTTATAATCTTCAAA
CATTACCCTTTGTTCTCTCGTAAAAGAATTTCCTTAttcatattaaattt
ttttccttcaattttaaATGAATATTATGTTctcttttaaatgaaaaaga
acattttgttCTAATTTGAAAAGTTCCCAATCAAACAATACCAGCACTAT
TTGTTCAATCAAAGGGAACTCATTGAATACTTTTGAAGGACCATATTCAC
GTGCACTGTTGGCCAAATTGTTCCCTTGAGAGAGCATTGCAGAATATAAT
TTGTCAGAGAATCCTTTGTTCCTCCGAATCAGTTCTGAATTATCAATTAG
GAACCTATTCCAAGATCAAAGGGGGGTAATCCCATTGATTTTAGGTAGTT
TTCACAAATCCATAATTATGTTTATGTAGATAAAGGGTCATTTAGATTGT
TTGAGTAGAGTCTGTGGAGTCTTGATTTTCATCTCAAACAAACGCTTGAA
ATAAAAAGGGTTTACTACTTTTGATTCCAATCAAAGTGCAGCAAGACATG
GTAATATTAGCTTTTTTCTCACTcttgattatcttttcaacgaacaCAAT
ACGGCTAGAGGTTCTATTAAAAGTTATACCAATTTCTCTGTCGTGAATTA
AATTAAGACAGACTTAACTTATTTGACTTTTTCACTACAGaaaacaaaac
ttgaaaaaatctcttactgggccaaataactttgaataaaaatgtaaaaa
aaaataaaatactataTGTGTTGTATGTGCATTGTGATCATGATGAAAAG
AAGTcatcgaaacgtcaaaaaaatgcaaaaatctaTATTTTTCGTCTTCG
CATTTTTATTTACAGACAACAAAGTTTAAGAAATCGATACAACATAAAGA
TGGGCGGCGATTCAGAGGAAAACACCAACAAACAACTTAACGAGTGCATC
AGAAATGCAAGACAGATGCTAGATGTGTCCATCAAAGTCGctaataaaaa
attcaatgaatCAATCATTAATGCTAGAATGAAATTTGAAGAATCCATTG
CTAGTTCCAAACATATTCTAAACACCTCAGTAACCATCGCTAAACAGGCA
TTAGAAGACTCGATAAACGAAGTGAAAATGCATTCAACAACGACAGATAA
TGAAAGTTTTAAGATGAATTCCTCCAAGTCCTTCCAACAGAACACACAAA
CAAGAAATGAGGGAAATTCAAATGCGCCACACCATTCTAATAGTGAATCC
AGTATTTCAACCTCGAATATCATACCTAACAGTGCTGACAACGGTAATAT
TTGTGACAAAATTAAGAGAGAAATAATCGATTATGCTAACGATGGAACCA
TCGAAAGAAGAATTTTATTCAGCCAAAGAAATGACTGCAATAAAGAATCA
CCAATGAACAACATAAAAATGGAAACTGAAGACAATGTTTGTGGGATGAA
CAACCCATTTTTAACTGTTCAGCCACAAGAAGTAAATAGGCTGCAAGAGA
ATCTAAATTGTCGTAATTTCGAGGTACCTACTACTGTTCAAACACCATCA
AAAAGCAACTATATCGATGTTGATCAGGACAAACTACAAGAAAGATTAAA
ATGTACTACATGTGGTATCGCATTTCTCACAAAATATCTTCTGGATAAAC
ATACTTGTCGCCctttgattttaaataaaaatctttctaGACCTCATCTT
CGCAGTGACACAAAGCGGTTGGGCCAAAAACAGAATACTTCAGTTTTAGA
ATCTTTCGCTGCTATTGATCGGAAGTTCAAATGTGATTTCTGTAAAAATG
TGTTCCCAAACCAAAAATTTCTCAATAACCATGTAAAAAGAAAGCATAAC
CCGAAAGTACAATTCAAATGTGACATTTGTGAAAAGTCTTTTGTTAAACA
AGCTAGACTTAATCGACACCTGAACGTGCATAAAGGAATTAATTTCACGT
GCAAGGTTTGTGGTAGCTCCTTTGCACGAAAGGTCCATCTTAACATCCAT
AAGGGTATTAAGCCATTTAAATGTAAATTCTGTGGTGATTCCTTTCGAAA
GAAGAAGGCTTTaaaaaaaCATGAAGAGATGCATGCAGAATTAAAACAGG
GTCAAGTCGATAGTAAATTGGCGAATACTTAAAGCACTTGATGGATGATT
CTACTAGAGGTGAAATGTTTGTGGTAAATCGTTCTCCTCAGAAATGGGCA
TATGGGAAGCATTCATTTCATGTACAAGAAATTCCGAAAGATCAGCTCGT
TTCGAATATGATAGTGTCAAAAACCTTTCGTGTATATTTTCTTCAATTCG
CGttattatatataaatttaTCAGTTTTTCGAGTTCAATCTACATGTT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:952072..963319 + |
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