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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:401045..411483+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11155.5.p1 ID=MSTRG.11155.5.p1|Name=MSTRG.11155.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10439bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:401045..411483+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttaacGAACAAAAGTGATTATCAAAAGACGACAAACGATGcacttttt
taaatacttttccCCTCTAAGTAATACATGGTTGTTTCTTGATGATTTAA
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GTACCCGAGTAGGCTCATAACACGAGGTTTCGTGGAATTAATGATGTTTA
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GTACATAAGTTGGCCGTCCTACGTAAATTTACTACATGACAAACTCTCCT
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CGAGGTGGTTTTGTGCCCAACAAAATAAGAGGATACCTAGGTGAAACTTT
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GTGTTATATGCGTTGAAATGACACTATTTCAGACTAACTTTGCCCAGAAA
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AGAGTAATTCCATTACTTTTGGCACCTATTGTAACTTTATCAGATCGCCT
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GTGGGTTTACATCTGTAGGGGAGAATCGATTAACAACacacaaaaaaact
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CATTGTTACAAAAGGTAGGTTTGGGTACCTCTAAAGACAAAGGACGTAAC
GATGAGAAAATCcattaagttttaaaaataaattgtgtaaagaaattttc
caattccTTTTAAATGAGTAAATAATTGGAAAATGATTTCGATGACGATG
ATGACAACTACGCAAATGACTTTTTCAATAAAGCGTTACTATGCAACAtg
gtggtttttcactgagactgtctggcgaaaatcgattagctgaaacaaag
aaaattgataggaaagcattactgactcccaaaacagttgtctaagcgtt
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actctatcggggaaaaaaaaacttttcccatacgaccaattttttacaaa
agaatcccactgcacattctgctacttttatgACAATCAATTTATTTATG
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cttggagaacaaaaggtttaatgaccaattttcgacgttaaatctggaat
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agggtgtccctaattaaagtatcgagtcgaaacacaactatgagtagaaa
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ctttgtcattacgattaatttgtacgttgtaactaccttttgtaataagc
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GGGAAAATTAACTATGACTTAAAAAAGGAATTGGGATGGAATCAAAAGAA
AACGTGCGATTATCATTGTATTccttacagtatgtggcccccaaaacggc
gatcaaatttgaaatttctctcaaatctagaggaaaagagattttacaaa
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ttatttttcaaaattttcaatttcaacaatatttttcaatcgcttaaaga
tagatagcttttttctaatggcccccaaaacggaggtttgaaattttagc
gatttctcgagatatctttaagatatgaatacaaaattttgaccatagtt
ttgaaatatgatttagagggttttgggtataaatttatttgataaaatct
ttacagtatacccctggttgtcaaaatgcaggtttggggcccccaaattg
gaggtgtagttaaaatcaaattattaagcccagtcgtaatagggggaaaa
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aaatttatgattttcatgaaatatttcaagattttcgatattgcaaagtc
caaactgaaaaattagaaattttcaaaatgacaattttgatttaacaacg
tcttaattaagtttttgaaaacaaatcttatttgaaaatagttccattca
tgtatggaataagctgtgaaaattttagaaaaaaagcttaactgaaactg
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taattttttgttataaactattacctcaaggtgataggaatagaattcca
agattttttgctttttctcatatttagaattttcggttttgtcaatgctg
attcgagggctccaaaatactggttgaccttcaagatgctatatctttta
cccagcctctaaagtcacagatatatttggattttctgaacggcattagg
tgtagaaagtttcctatacccagttttcataacttattttcaatatccaa
ggagctagagtgagttatatgcaatttttatctaatttgggtgttaaaat
atttcctttagacgcaaaatatgttattttgaatctgtctcaaaccatca
aaaacatgctcattttttagtatagctatcattttttcaaaataaacaaa
aatcgtttaattctgataaatctacaagtcagaatcttcattttaatgaa
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GATTCTCTCCTAGATGTAAACCCACCCTTAACCCTTTGGTTTGATCgatt
taatttgatttaaaattgatCATTTCATCTAAATTACTTGTTAcagcatg
aaggtaataaagatatagatggagagaaaacgtctcggtaatgatctaaa
tggtcgttgaaatcttttataaatctattcaaagcggcttttctttgatg
taccatcattggaagcaaaaaacatcaggggggtttcaggggttaCCAGA
TTCCGCAATcccgccaattttttcttccgatttccgtcaaaccgtcttaa
attgaaccaaaattccgtcaccgaaaattcctttgaaattcaatattttt
gtcgaaaattccgcaaatttggaatatcttttaccaattccgaaattccg
caattttttttgctaaattccgtttttccacactaaaattgtctaatttt
ccgtctccgtcagagaacccaatttccgtaattccgtctaaattttcgcc
aaattccgtcactccgtccgaaaaaagggccgattccgctcctctgCCAA
ACGTGAAACAGAAAgagactgtttggttgattttgaaaaacttaatttta
gcCTCTATCGATgactttatgggcagcttcccctagaagtttggagtatt
gtgcttattagagcttattatgtgaagtttttttcaatttttcatgacaa
ggctattatatttcaatattatacttgttaaaaatgtaatgtcttttcat
tcatcttaaatattcccacgagtatacccaaaattaatcatcttattccc
aaagcaaccaaacagctctttgcttccgatgataaatcagaatagaacaa
aaggcattgactctccatctatctttattaccttcatggttaTAGTACAA
GCAACCACTTTTgtactagcctggatatccaagctaaaaattttagaaaa
aataagttttacctcagccagacaaagttctaaaataataaagcTTGGAA
TTAGGTGAACCcatgttgacagattttcctgcatgaatcccatggctgca
aataaatatatgcacataatgacatgcataatttcaagatggtaccccag
cagtgataaatcaatttagaatggcagccttgaccataaaacatagacag
tgtggtggagtCTATTAGacagaaagtgcaaagtgaattttggagaaaaa
gaatcatcaaaacaaaactttcaacccaaaacagcactacaaaattggca
aacagaaaagaagaattgaagcaaaataaagatataccttttatagtttt
agttctttacacggtGCAACAAAGtcaataagaaaattaaaacatgatat
ctaagcaagtatgaaaagaaaacaaccagaacatctaaaaattcccatct
tttgatcttcccacttcttccctaccattattgttatttttatttggatg
cgtggtcaaacacccaagggagataattaggcattctattgttatttgct
tcgaagaagaaaaatcagggagatttgcaaagcagcatACACGCCTTTCT
GATCGCCTGCGCGATCCATCCAAATACTTAGGCGGacacttcaagtcggc
tcgcataatttctataCGCtcgccaccattcagatctctgatttgCTTGg
acccaaccaatcagaatatctgcataatcatcctcagataatcctcagat
cagaatgcacacgatctaggtaaaccagaccgtaaatataagaaatcaaa
aagaaaattacgggctggatatctaGGCTACTTTTGTCCATGCAACAGAT
AGATAATGAAATTTCGAtatttattttacaatttttactcTGCCTGCGCT
ATTGATAGAAAACATAGCTTCAACATATTTATTCTAGACGTTGGGATTTA
AATTTTACTAGATGTAATAGTTAAAACAATTTCTGATCTAAAATTTATCA
CTGATTTAAAATGTGTTGTGATAGTGAAGTGGAGACCCCCTTTTACCACC
GTTgaaggaggggggggggcagtaaGATTCCACTTCCCAGACTAGATTCT
AACGTAGGGTTTACTACATAAACCTTAACCACTTACAATCAGGGTtctaa
tatttgagaaaaaaaagggaaattcccacgaaatcttgtGGCCACAAACG
ATTcggaagcgctctaacttatGTTGAAAGGGTTTTAACGCTAGTTTTAG
GACTTGAAGatatccaaaagttcaaaaatggtccaataagactcagaata
tagcttggaagtcaatgaaCCCTTCCGAACTGAAATATTTGATTACATTT
AACAAATAGCCCAAAAGCAACTTTCTCACCCGagcttcaaatttcgaaaa
acgaggaaataaccaATATGCTCAATACAGTGTGTTCTGCAAAATAGTAt
actcaaaaaagtaaaatagaattatgaaaagtttttaagCTTAACCAACT
TAAATTCTAAATTTGCTGAAGACACATTTATTCAGCGTTCTACAGTGCGA
GAAGTCTTTGTTTTACAGATATAAAGCTTCAAGCACACCAAGTTGGagat
ttaaaaagatagaagaatagaaaagagattttcaaagcaaaaagctaaaa
cttttGATTGATAGCTCTCTCTATCTCTTatgtcattttgataaaaattt
cccaTTTTAATGGTCAAACTTATTCACCTTCCGAGTCGAATTTCTCGTTA
GTGAAAAGCTGGTTGAATATAATTCTTTCAGCAATGAAAAGAAGGGACAT
TTTTCTTTCTGCTGCATATAAAATTAACTGTCTTAGACATTTCTACCTTT
TGCAAATTAACGTTAGTTATGACTTATCATAGCTTACTCTGGAGTAACTT
ACTCCATTTTcaatgtttaaaagttttgcaCCCTTGAGTACTTAAAACTT
GATATCTCTTAAACTAAAAAACCTTctgaagaacatttttaagcacAGAG
AGCTGAATAGCTACACTTTCAGCTATACCAAGAATTGAAATTATTTGttt
agtcatttttttcaaagaactaCCTTAGTTTTTAAACATACTTTTTTGCG
GAACACGCTGTATATTTCAAAGCAGATTGTAGGAGGCTCAGAAAACCCGA
AGTTAGAGAGACCCCCGAATTAGAAAAACCCAAGCTACGACAAATATGTC
CCCCAAAAATATACTCAAAAATGTGAAAACTAACTTTTGAAAGaactttt
cgagtttttttgaatttatgacgtcatattttggCACAAGTCATTAGACa
aaaaaaaGATCAGAATAGTGAGTATCTATAGATAAATCGCGTCGACGGAC
GAATTTTCTCTAGCCTTCTTTCGCACCACGCCACTGTTTTACAGGCTGAT
CGGAAAGCAAGCTAGACTTTCCCCGCAATGAAATGAACTTTGCTTCCAGA
ACGAATTTCCGCTTGATTTTCCGCTTGATTTTCCCTTCTAGAAGCAAAGC
AGATATAATACACGGGATAAGTTTAGCTTGCTTTCCGATCAGCCTGTAAA
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atttatcTATAGATACTTAACCTATCGATATTAACTTCACTATTGACAGT
CGTTCCTCTACCAAACTTGTTATAGGCTTAGCTAACATTAACATAGggaa
attatattttcttcCATCACTCTGCATAATCATTGACGTATTTTGTACCA
GATTGTATCTAACGTAAACGTAGCATaactctacggcaatgaattttaaa
gttttcgTAGATATCGAGCCTGTTTAAGACAACTTTTGGTGTTTAAATTG
AATTAAAGGCTGGGAAATGTTTACCAGATAGGCATATCAAATAATTTTac
tttcagctcaaaaaatatAGGTGTAACGGCGTAACCGTTTTGCGGTAATA
TTATAGGAATATGTAGTGACGTAACTACTCTCCCTTTATTGTTTCAGGTA
CGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCACTTGTGTTCCCTTCA
ACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAATACGCTTATTCAAAGAGTGG
ACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAGAAAGACGATCGAAGC
TTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCGTGTAAGAATAATAAT
CGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGATGCATGGGCACATATGGCAAA
ATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATATGGATCGCTGATCGGAGCGG
AGAGAGATCGTAAGTATTCTTTAACCTGAACTGAAAATATTCGGTATTGA
AGTAACTGTAACTTATTTATCTAAGAGCGACACGAAAAATTTTAGTACAA
ATCTTTTATcgcgtcatccagtctatcaaaaagctttaagtggaccccgg
gctaatcATGAATACAATAGACCACTAAAGAATCAACCAGAGCAACGTAT
TTCAACTGTATTGGACCACTTACATTACAACCAGTTAATAAAGCTTTGTA
tggcaattttgttttgatgatgagCGCATGGAGGAAGTCAAGAAAGAATT
CTGGACAAAGAAGCTTCAAATAAGGCTCTATAATcgttaaaatcttaaaa
tatataGTTTGGTTgatagacaggagacccgttctgtatttttttataat
cttctatatacaggacgggtatgacctaTGAGgaagatttctgcctcaaa
aaatttatagcgggaaattcgaatttagcgctgtcctcacttactaaaat
aaaaaccaaatttagGACCTTGCGCTTTCTCTATGAATGTGACCAGTAAC
AGAATAACAAATTTTGATtagctgtgttttcaaccgtcattTGGATCTAA
GAAATTCAAACTCctagcccataccatgctatgtATTTCGCtatcagtat
ataaaataagaaatcatagcatggatctccaggctaagaTATCTAATATT
CTAAATTCCTAAATATAATTTCCATTATTACTACAGGTAACATCGTCCCG
TATGATTTAGACGACGACGTTATGATGTCAGAAGATGAGGTGccaaaact
ccaaaaaatgATAGATGATAATTTCTCAGTCGGTGATAACAAGATTCATC
TTCGCATCCATCCAGAATATAAGACACATTGGCGAAAACGTACCAAGATT
TGTTGTAATGGCAAAGTCAGCCATGGACCAAACAGTAACACGTGTTGGGA
CCAATGTGCAGTACCCAATCCTCTAGGTCGTCTCATACTAGGCCCAGTAC
TGCATATAGGAATTATAGGTTACAAACTGATTAAAAATAATACTGTTTTG
AAAATGACATGTCATGAAGAATATGGTTTTAAAACTGAGTTTAATTGGAA
AGATTTAGCACCTCGTGATTGTGAATTTCTTGGACATAAGACATACTGTC
CAACAAATGCCAATTTGATAAACACGGAAGTCTATGGTAAACATTGGAAA
GATccatactcttaggtgccaaataaacgggggggttcg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:401045..411483+ >MSTRG.11155.5.p1 ID=MSTRG.11155.5.p1|Name=MSTRG.11155.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3303bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:401045..411483+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGcacttttttaaatacttttccCCTCTAAGTAATACATGGTTGTTTCT
TGATGATTTAAGAGAAGAGAAACAAGAAACAGAGGGAAGGAAATTGGTAG
AAAAGATGTTGCgaccaaaaaaatttattggtaTTGCCATATTGTTATTA
TTGggattttatcatattttttacaCTGGTGCTAATGTTGATTTGACTCT
ATTCAAAACTTCCAAAGCAATAAAAAATGTGAAGTTCGTTGAAAAAGAAC
GAATACACGAGTCATACAAGGCAAAAAAGAAGATTGTTAATGAAGTTGCT
GCAAAGAAAGGTACGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCACT
TGTGTTCCCTTCAACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAATACGCTT
ATTCAAAGAGTGGACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAGAA
AGACGATCGAAGCTTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCGTG
TAAGAATAATAATCGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGATGCATGGG
CACATATGGCAAAATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATATGGATCG
CTGATCGGAGCGGAGAGAGATCGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGACGA
CGACGTTATGATGTCAGAAGATGAGGTGccaaaactccaaaaaatgATAG
ATGATAATTTCTCAGTCGGTGATAACAAGATTCATCTTCGCATCCATCCA
GAATATAAGACACATTGGCGAAAACGTACCAAGATTTGTTGTAATGGCAA
AGTCAGCCATGGACCAAACAGTAACACGTGTTGGGACCAATGTGCAGTAC
CCAATCCTCTAGGTCGTCTCATACTAGGCCCAGTACTGCATATAGGAATT
ATAGGTTACAAACTGATTAAAAATAATACTGTTTTGAAAATGACATGTCA
TGAAGAATATGGTTTTAAAACTGAGTTTAATTGGAAAGATTTAGCACCTC
GTGATTGTGAATTTCTTGGACATAAGACATACTGTCCAACAAATGCCAAT
TTGATAAACACGGAAGTCTATGGTAAACATTGGAAAGATccatactctta
gATGcacttttttaaatacttttccCCTCTAAGTAATACATGGTTGTTTC
TTGATGATTTAAGAGAAGAGAAACAAGAAACAGAGGGAAGGAAATTGGTA
GAAAAGATGTTGCgaccaaaaaaatttattggtaTTGCCATATTGTTATT
ATTGggattttatcatattttttacaCTGGTGCTAATGTTGATTTGACTC
TATTCAAAACTTCCAAAGCAATAAAAAATGTGAAGTTCGTTGAAAAAGAA
CGAATACACGAGTCATACAAGGCAAAAAAGAAGATTGTTAATGAAGTTGC
TGCAAAGAAAGGTACGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCAC
TTGTGTTCCCTTCAACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAATACGCT
TATTCAAAGAGTGGACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAGA
AAGACGATCGAAGCTTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCGT
GTAAGAATAATAATCGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGATGCATGG
GCACATATGGCAAAATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATATGGATC
GCTGATCGGAGCGGAGAGAGATCGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGACG
ACGACGTTATGATGTCAGAAGATGAGGTGccaaaactccaaaaaatgATA
GATGATAATTTCTCAGTCGGTGATAACAAGATTCATCTTCGCATCCATCC
AGAATATAAGACACATTGGCGAAAACGTACCAAGATTTGTTGTAATGGCA
AAGTCAGCCATGGACCAAACAGTAACACGTGTTGGGACCAATGTGCAGTA
CCCAATCCTCTAGGTCGTCTCATACTAGGCCCAGTACTGCATATAGGAAT
TATAGGTTACAAACTGATTAAAAATAATACTGTTTTGAAAATGACATGTC
ATGAAGAATATGGTTTTAAAACTGAGTTTAATTGGAAAGATTTAGCACCT
CGTGATTGTGAATTTCTTGGACATAAGACATACTGTCCAACAAATGCCAA
TTTGATAAACACGGAAGTCTATGGTAAACATTGGAAAGATccatactctt
agATGcacttttttaaatacttttccCCTCTAAGTAATACATGGTTGTTT
CTTGATGATTTAAGAGAAGAGAAACAAGAAACAGAGGGAAGGAAATTGGT
AGAAAAGATGTTGCgaccaaaaaaatttattggtaTTGCCATATTGTTAT
TATTGggattttatcatattttttacaCTGGTGCTAATGTTGATTTGACT
CTATTCAAAACTTCCAAAGCAATAAAAAATGTGAAGTTCGTTGAAAAAGA
ACGAATACACGAGTCATACAAGGCAAAAAAGAAGATTGTTAATGAAGTTG
CTGCAAAGAAAGGTACGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCA
CTTGTGTTCCCTTCAACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAATACGC
TTATTCAAAGAGTGGACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAG
AAAGACGATCGAAGCTTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCG
TGTAAGAATAATAATCGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGATGCATG
GGCACATATGGCAAAATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATATGGAT
CGCTGATCGGAGCGGAGAGAGATCGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGAC
GACGACGTTATGATGTCAGAAGATGAGGTGccaaaactccaaaaaatgAT
AGATGATAATTTCTCAGTCGGTGATAACAAGATTCATCTTCGCATCCATC
CAGAATATAAGACACATTGGCGAAAACGTACCAAGATTTGTTGTAATGGC
AAAGTCAGCCATGGACCAAACAGTAACACGTGTTGGGACCAATGTGCAGT
ACCCAATCCTCTAGGTCGTCTCATACTAGGCCCAGTACTGCATATAGGAA
TTATAGGTTACAAACTGATTAAAAATAATACTGTTTTGAAAATGACATGT
CATGAAGAATATGGTTTTAAAACTGAGTTTAATTGGAAAGATTTAGCACC
TCGTGATTGTGAATTTCTTGGACATAAGACATACTGTCCAACAAATGCCA
ATTTGATAAACACGGAAGTCTATGGTAAACATTGGAAAGATccatactct
tag
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:401045..411483 + |
|
