MSTRG.11119.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11119.1.p2
Unique NameMSTRG.11119.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000079_pilon:1195244..1212854-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11119.1.p2 ID=MSTRG.11119.1.p2|Name=MSTRG.11119.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17611bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:1195244..1212854- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:1195244..1212854-

>MSTRG.11119.1.p2 ID=MSTRG.11119.1.p2|Name=MSTRG.11119.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1740bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:1195244..1212854- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACCATAAACGGATCAACATCACATGTTTGACTTGCAATAACAAAAAGAGA
GTACATATTAGAAATAAGAAGAGACAAAAAGGTGCAAAGAAGACCAACAA
ACCAACTGAAGAAACCGATGAAACAGCAAAGGGAAAAAGCTGAGACAAAC
GAAATGAAGCGCAGTATTTGTAAAGGCTGTAACATGATACTGGTGCCTGG
AGTGACAACCAGAGTTAGAGTTGGAGGCTGCACAATTGAATCTGAGAATC
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TGTCAAAGAGAAAAAATGCTTATCACTATGAATAATTCCAATAATAAAAC
AAAAGGGAAGAAGAACAAGACAAAGGACAAGAAAGGAAACTTTCCCAAAA
GAGATGCATATGAACGAGTTGAGTTTCTCAAACAGACCATAAACGGATCA
ACATCACATGTTTGACTTGCAATAACAAAAAGAGAGTACATATTAGAAAT
AAGAAGAGACAAAAAGGTGCAAAGAAGACCAACAAACCAACTGAAGAAAC
CGATGAAACAGCAAAGGGAAAAAGCTGAGACAAACGAAATGAAGCGCAGT
ATTTGTAAAGGCTGTAACATGATACTGGTGCCTGGAGTGACAACCAGAGT
TAGAGTTGGAGGCTGCACAATTGAATCTGAGAATCAACCCACACAATGAG
GAGCTATCCAGGCACTATGTCAAATGTTTGAGATCTGTCAAAGAGAAAAA
ATGCTTATCACTATGAATAATTCCAATAATAAAACAAAAGGGAAGAAGAA
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GAGTTGAGTTTCTCAAACAGACCATAAACGGATCAACATCACATGTTTGA
CTTGCAATAACAAAAAGAGAGTACATATTAGAAATAAGAAGAGACAAAAA
GGTGCAAAGAAGACCAACAAACCAACTGAAGAAACCGATGAAACAGCAAA
GGGAAAAAGCTGAGACAAACGAAATGAAGCGCAGTATTTGTAAAGGCTGT
AACATGATACTGGTGCCTGGAGTGACAACCAGAGTTAGAGTTGGAGGCTG
CACAATTGAATCTGAGAATCAACCCACACAATGAGGAGCTATCCAGGCAC
TATGTCAAATGTTTGAGATCTGTCAAAGAGAAAAAATGCTTATCACTATG
AATAATTCCAATAATAAAACAAAAGGGAAGAAGAACAAGACAAAGGACAA
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AACAGACCATAAACGGATCAACATCACATGTTTGACTTGCAATAACAAAA
AGAGAGTACATATTAGAAATAAGAAGAGACAAAAAGGTGCAAAGAAGACC
AACAAACCAACTGAAGAAACCGATGAAACAGCAAAGGGAAAAAGCTGAGA
CAAACGAAATGAAGCGCAGTATTTGTAAAGGCTGTAACATGATACTGGTG
CCTGGAGTGACAACCAGAGTTAGAGTTGGAGGCTGCACAATTGAATCTGA
GAATCAACCCACACAATGAGGAGCTATCCAGGCACTATGTCAAATGTTTG
AGATCTGTCAAAGAGAAAAAATGCTTATCACTATGAATAATTCCAATAAT
AAAACAAAAGGGAAGAAGAACAAGACAAAGGACAAGAAAGGAAACTTTCC
CAAAAGAGATGCATATGAACGAGTTGAGTTTCTCAAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11119MSTRG.11119Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11119.1.p2MSTRG.11119.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11119.1.p2.exon6MSTRG.11119.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11119.1.p2.exon5MSTRG.11119.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11119.1.p2.exon4MSTRG.11119.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11119.1.p2.exon3MSTRG.11119.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11119.1.p2.exon2MSTRG.11119.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11119.1.p2.exon1MSTRG.11119.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000079_pilongenomesc0000079_pilon:1195244..1212854 -